Apilactobacillus apisilvae: MOO46_07290
Help
Entry
MOO46_07290 CDS
T08479
Name
(GenBank) RNA-binding transcriptional accessory protein
KO
K06959
protein Tex
Organism
aapi
Apilactobacillus apisilvae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aapi00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09192 Unclassified: genetic information processing
99973 Transcription
MOO46_07290
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Tex_YqgF
HHH_3
Tex_N
Tex_central_region
HHH_9
S1
HHH_7
YqgF
T2SSK
S1_RRP5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UQS85025
LinkDB
All DBs
Position
1466072..1468231
Genome browser
AA seq
719 aa
AA seq
DB search
MNVEIIKAVANNLKDYSIKQINAVITMLDAGNTVPFIARYRKEKTNSLDEVQIRLIEDEN
IRINHLFNRQDEVIKLIEEQNNLTKELSSKIRSANNLQQVEDLYLPYKKKRKTKADIAKE
QGLEPLAQKVLSYDNSFEQHSADFINEDLNNKSDVLNGVHEILAEKFGNIAEYREWVRQY
TFQTGSLNSKNKKNSKDEEQVYKNYYEFEVPIKKLKSYQVLAINRGENDKILTVKVVVNK
DKILRYLFNQVNHNKRGKAVEFIENSIKDAYNRFIGPAINREIRNQITSTADEHAIKIFG
KNLYKLLMQSPLKGKTVMGFDPAYRTGCKLAVVDNNGKFLDKLVIYPHKPASNHQREQAL
KLFLDFIKKNHVEMIAIGNGTASRESEQFVINAIKKIPWDLYYVIVNEAGASVYSASQNA
RDEFPEFNVEERSAVSIGRRLQDPLAELIKIDPKSVGVGQYQHDLPEKQLDQSLNRVVET
AVNNVGVNVNTASVELLTHISGMNQNVAKKLVKYRNENGRFNNRVSLSKVPRLGKKTYEQ
SVGFLRIIDGDNKLDNTDIHPESYPIAEKIIKLTNIDINNLGSDFMLDKLNQININEFIS
ANHFGKETVYDIFNGLKKPGRDFRENMPKPKLKQDILKIEDLSVNMKLQGTVRNVVDFGA
FVDIGLKQDGLIHISNMSDSFISDPNTIVSIGDVVTVWVKDIDVNRNRIQLTMMDPEKN
NT seq
2160 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaatgtagaaattattaaagcggttgctaataatttaaaagattattcaatcaagcaa
ataaatgctgttataacaatgctggacgctggtaacacagttccttttattgctcgatat
cgaaaagaaaaaactaacagtttagatgaagtgcaaattcgattaattgaagatgagaat
attagaattaatcatttgtttaatcgtcaagatgaagtaattaaattaattgaagaacaa
aataatttaactaaggaattatctagtaaaattaggtctgcaaataatttacaacaagta
gaggatttgtacttaccatataaaaagaaacgtaaaacaaaagctgatatcgccaaagaa
caggggttagaaccattagctcaaaaggttttatcttatgataactcttttgaacaacat
tcagctgattttattaacgaagacttaaataataaaagtgacgttttgaatggtgtgcat
gaaattttagcagaaaaatttggcaatattgctgaatatcgagaatgggttcgtcaatac
acttttcaaactggttctttgaatagcaagaacaagaaaaattcgaaagatgaagaacaa
gtttataaaaattattatgaatttgaagttcccattaaaaaattaaaaagttatcaagtc
ctagcaattaatcgtggtgaaaacgataaaattttgacagttaaagtagttgttaataaa
gacaaaattctaagatatttatttaatcaagtcaatcataataagcgcggaaaagctgtg
gagtttattgagaatagcattaaagatgcttataatcgatttattggtcctgcaattaat
cgtgaaattaggaaccaaataacttctactgccgatgagcatgcaattaaaatttttggt
aaaaatttatataagttattaatgcaatcgcccttaaaaggtaagacagtaatgggcttt
gaccctgcatatcgaacaggttgtaagttagcagttgtcgataataacggtaaatttctg
gataaattagtaatttatccgcataaaccagctagtaatcatcaacgagaacaagcatta
aaattatttctagattttattaaaaaaaatcatgttgaaatgatagcaattggtaacggt
acagctagtcgtgaatctgaacaatttgtaattaatgcaattaagaaaataccgtgggat
ttatattacgtaattgttaatgaagcaggtgcttcggtttattctgctagtcaaaacgca
cgtgatgaatttcctgaatttaatgttgaagagcgttcggcggtaagtattggcagaaga
ttacaggatccgttagctgaattaattaaaattgatcctaagtcagtgggtgtcggtcaa
tatcaacatgatttgcctgaaaagcaactcgatcaaagcttaaatcgagttgtcgaaaca
gctgtgaataacgttggtgttaatgttaatactgctagtgtagaattattaacccatatt
tctggaatgaatcaaaatgtagctaaaaaattagttaaatatcgtaatgaaaatggtcgt
ttcaataatcgtgtctctttatcaaaggttccaagattaggtaaaaaaacttatgaacaa
tcagttggctttttgagaattattgatggtgataataagttagataataccgatattcat
ccagagagttatccaattgctgaaaaaattatcaaattaaccaatattgatattaataac
ttgggttcagactttatgcttgataaattaaatcaaattaatattaatgaatttatcagt
gctaatcattttggaaaagaaacagtttatgatatttttaatgggttaaaaaagccaggc
cgtgattttcgtgaaaatatgcctaagcctaaattaaaacaagatattttaaaaattgaa
gatttatcagtaaatatgaaattacaaggaactgttagaaatgtggttgattttggtgct
tttgttgatattggtttaaaacaagatggactaattcatatttctaatatgagtgatagt
tttatttcagatccaaatactattgtttcaattggtgatgtagtgactgtttgggttaaa
gacattgatgttaatcgtaatcgtattcagttaacaatgatggatccagaaaagaattga
DBGET
integrated database retrieval system
