Arcobacter aquimarinus: AAQM_0445
Help
Entry
AAQM_0445 CDS
T06604
Name
(GenBank) multi-sensor domain-containing diguanylate cyclase/phosphodiesterase
Organism
aaqi
Arcobacter aquimarinus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
PAS_9
CBS
PAS
PAS_8
PAS_3
PAS_13
PAS_4
LIAS_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QKE25218
UniProt:
A0AAE7B0L6
LinkDB
All DBs
Position
complement(442140..445280)
Genome browser
AA seq
1046 aa
AA seq
DB search
MSLNNLISPIKDSINCKATLQDILDAMIENHTKHFVLIENKKPVGIITERDILLLYTNHV
NLNLKAINYAKKNLISAKSNRKTNYILGLMLNHKIRRIIVTDNENNYIGSILQEKIIYEF
EQDIFKTNIKAIDLVKNKQKAIFVNKDSSIQDALNIMNKHNIGSILVFDDLIPIGILTES
DIINLAQKHIDTSLKIDEYSHKNLIVFDSKKPLFEIVKILKEKDIRRAVIFDDEKKEYFI
ITSKDILNNIKGNYNLFLESKLKDVKNTFNSLNEAVIELFDNEEEQIIYWFNDKAKKLFD
IRIDQNIDSIIPFQKWDYIYKKIKNNNFNENEIIEIGDNIFQLTVIVTKILDNSIIKLLF
TNISEIANTNIQIENSFKLLYEQMPYPYQSLNHLGQITNVNNKWLELTGYSKDEVINQKF
SKFTDETHETLKGLFSIFLKNKTIKDERIKIKKKNGETLIASFTGNISSVNGNIKTHCVF
KDITLEEKIQKKLKLSDIVFENTTEGIIITNEKGEIISVNNAFTKITGYEFEEVKNKNPK
ILKSGKHSKDFYKNLWENLLKNDSYKCEIWNRKKNGEIYPEWLNLSIVKDTNGNILNYVA
LFSDISKIKNSSAKIEFLAHHDPLTNLPNRLLLKARLNKSIEKANELQQRLAVFFIDIDN
FKIINDTYGHSIGDNIINLVATRLSKNIRKNDTISRIGGDEFIIVIEDILEISDIESIAK
KILFDFKEPIKMEEYLFDVTISIGISIFPNNGFDVEDLIKHADTAMYSAKNAGKNQFHFY
KNEMTSEIYEKVIMKQELNDAIQNNEFEVYYQPQIDLKTNKIIGAEALVRWNHKSLGVVY
PSDFISHAEETKQIIPIGEFVLKEACAFMKKLNESKILEKGIISVNISSIQIKHGNLLNK
VTEELKVSKLNPANLDIELTETYIMENIQESILILNELKNLGVKLSIDDFGTGYSSLSYL
KLFPIDKLKIDKSFSSSLPNDKKDVAITRSIIALGKGLEVKVIAEGVETLEQKEFLEKEN
CDEIQGWFYSKALKEEDFIKLVKEFN
NT seq
3141 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtccttaaataatcttatttccccaataaaagattctattaattgtaaagcaacttta
caagatattctagatgcaatgatagaaaatcatacaaaacattttgttttgattgaaaat
aaaaaaccagttggaataattacagaaagagatattttacttttatatacaaatcatgtt
aatttaaatttaaaagctataaattacgcaaaaaaaaacctaataagtgcaaaatcaaat
cgaaaaacaaattatattttaggacttatgctaaatcataaaattagaagaattattgtt
acagataatgaaaataattacattggttcaattttacaagaaaaaattatttatgaattt
gaacaagatatttttaaaacaaatataaaggctatagatttagtaaaaaacaaacaaaaa
gcaatttttgtaaataaagattcttctattcaagatgctttaaatattatgaataagcat
aatataggttcaattttagtttttgatgatttaattcctattggtattttgactgaaagt
gatattataaatctcgcacaaaaacatatagatacttcattaaaaatagatgaatatagt
cataaaaacctaatcgtttttgatagtaaaaaacctctatttgaaatagtaaaaatttta
aaagaaaaagatattagaagggctgtaatttttgatgatgaaaaaaaagaatattttatt
atcacatctaaagatattttaaataatataaaaggaaactacaatctattcttagaatct
aaattaaaagatgtaaaaaatacattcaactctttaaatgaagcagtaattgaacttttt
gacaatgaagaagaacagataatttattggtttaatgataaagcaaaaaaattatttgat
ataagaatagaccaaaatatagactcaattattccttttcaaaaatgggattatatttat
aaaaaaataaaaaataataattttaatgaaaatgaaataatagaaattggtgataatatc
tttcaattaacagttattgttacaaaaattttagataattctattataaaacttcttttt
acaaatatctcagaaatagcaaatacaaatatacaaatagaaaattcttttaaactttta
tatgaacaaatgccttatccttatcaatctttaaatcatttaggtcaaattacaaatgta
aataataaatggcttgaacttacaggctatagtaaagatgaagttataaatcaaaaattt
agtaaattcacagatgaaactcatgaaactttaaaaggtttgttttcaatatttttaaaa
aataaaactataaaagatgaacgaattaaaataaaaaagaaaaatggtgagacattaata
gctagctttacaggaaatatctcaagtgtaaatggaaatattaaaactcattgtgttttt
aaagatatcactttagaagaaaaaatccaaaaaaaactaaaactttcagatatagttttt
gaaaatacaactgaaggcattatcattaccaatgaaaaaggtgaaattatctcagttaat
aatgcttttacaaaaatcactggttatgaatttgaagaggtaaaaaataaaaatcctaaa
attttaaaatcaggaaaacatagtaaggatttttataaaaatctttgggaaaatttattg
aaaaatgattcctacaaatgtgaaatttggaatagaaagaaaaatggtgaaatttatcct
gaatggctaaatttaagtattgtaaaagatacaaatggaaatattttaaactatgttgca
ctattttcagatattagtaaaatcaaaaattctagtgcaaaaattgaatttttagcacat
catgacccacttacaaatctaccaaatagacttttattaaaagctagattaaataaatct
attgaaaaagcaaatgaattacaacaaagacttgctgtattttttatagatattgataat
tttaaaataataaatgacacgtatggtcattctataggggataatataataaatttagtt
gcaactagactttcaaaaaatattagaaaaaatgacactatttcaagaattggtggagat
gaatttattattgtaattgaagatattttagaaataagtgatattgaatcaatagcaaaa
aaaattctttttgattttaaagaaccaataaaaatggaagagtatttgtttgatgtgaca
ataagtattggtatttctatttttccaaataatggttttgatgtagaagatttaataaaa
catgcagatacagcaatgtatagtgcaaaaaatgcaggaaaaaatcaatttcatttttat
aaaaatgaaatgactagtgaaatttatgaaaaagttattatgaaacaagagttaaatgat
gctattcaaaataatgaatttgaagtatattatcaacctcaaattgatttaaaaacaaat
aaaataataggtgctgaagctcttgtaagatggaatcataaaagtttaggtgttgtttat
ccaagtgattttatatctcatgctgaagaaacaaaacagattattcctattggtgaattt
gttttaaaagaagcgtgtgcttttatgaaaaaattaaatgaatcaaaaattttagaaaaa
ggtattatctcagttaatatttcaagtattcagataaaacatggaaatttactaaataaa
gtcactgaagaacttaaagtatctaaattaaatcctgctaatttagatatagaattaaca
gaaacatatataatggaaaatattcaagaatctattttgattttaaatgagttaaaaaac
ttaggggtaaaactatctattgatgattttgggacaggttattcttctcttagttattta
aaactatttccaattgataaattaaaaatagacaaatctttttcaagctctttgccaaat
gataaaaaagatgtggcaattacaagaagtataatagctttaggtaaaggcttagaagta
aaagttattgctgaaggtgtggaaactcttgaacaaaaagagttcttagaaaaagaaaat
tgtgatgaaattcaaggatggttttattctaaagctttaaaagaagaagattttataaaa
ttagtaaaagaatttaattaa
DBGET
integrated database retrieval system