Actinobacillus arthritidis: NYR89_07115
Help
Entry
NYR89_07115 CDS
T09025
Name
(GenBank) autotransporter domain-containing protein
Organism
aart
Actinobacillus arthritidis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
OMP_b-brl
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WGE88858
LinkDB
All DBs
Position
1533901..1537449
Genome browser
AA seq
1182 aa
AA seq
DB search
MTFTKNRIALAILFGIPTVSVVMPTVAVAQSRFDVTDQLQFQQALNAAKINQTLTVISLL
NDIVISTYNTAANDKRALPLEMGNVTIEGNNRSLTVRAAPISLTGNVVMSNLKLILPPAT
GEINLDVTAKSQEEVTQFIYQNGKDLTLNNVDTQINQNAKSLATIVMGNGTDTSGEGNGT
LTLSGVVGKPHFTKVKEVIAGNTNNKEKTTASTINIEENADVSTITFGKEANPVSGSVVV
NSDNNSVDVFQGGSATNTTVNLKKANEATIKDIKNVTVETKKAISANQISNVDTLTLKSG
AVVTATAATTPLTINKIVSEGNNEVRISPNNEIQLTEGVTDNNLKVSLTGAGIINKPYVT
ISDDKPDNVTVADTNNGTFEFKDKAFKLIDTQQTTDITVPVIRFEKDTNNDGVLTTNEEA
SNTTNITISFNEPDQLYGDETIEVVIIRNGKQETIPVTLEDHDYHNPITIPISRNEKEAV
EIFAVTKDPKNVRSPKSSTLTINAKNITPPTPVEQRNGSSVTAETKPAITIEQQNGSSLT
AEAKPEIAIVQKNGSGVTTETKPEIAIEQQNGSGVTAEAKPEITVEQQNGSGVTAEAKPA
ITIIEQQNGSSVTTEAKPAITIEQQNGSSITTEVKPAITIEQQNGSGVTAEAKPAITIIE
QQNGSSVTTEAKPAITIEQQNGSSVTTEAKPAITIEQQNGSSVTTEAKPAITIEQQNGSS
LTAEAKPAITIEQQNGSGVTAEAKPEITIEQKNGSSVTTEVKPAITIEQQNGSSVTTEAK
PAITIEQQNGSSLTAEAKPEITIEQKNGSSLTTEAKPAITIEQQNGSSVTTNTKPEITVE
KQNGSSVTAEEKPTTETPVVQTKGTSVTTEEKPTIAIQIEPDNSKTLVLLESQRIANIPL
SNLATQTHDIATISADLAQAVIEKFPENGNNYRVWSKNTLANSKHYANFHKGYESDSFRT
QLGISGLINERTQVGWILNDMRSDNDFADNAKSENKFLMSSIFMKYQTPTGNFVAIDVGL
GRIKNELKTNGEEIDLRRKVWQAGLTFGKELKWKQIEITPKAGIRYSHLESANYQLNGNQ
IQEEAVGFVSYLVGLDAGYRFNLAEHYSLKPFVSLEHWWNKGNSDVKVNGYNFNFNASNQ
YHYLGGLEFAYKNFKLKASAGITNGSQMAKQNLARLHLSYDF
NT seq
3549 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacatttacgaaaaatcgtattgcactagcaattttatttggcatacctacggtttca
gtcgtgatgcctactgtagcagtagcacaatctcgctttgatgttacggatcagttgcaa
ttccaacaggcattaaatgccgcaaaaattaatcaaacacttacagttatttcgctgtta
aatgatattgtaatttccacttataacacagcggcaaatgataaaagagctttaccatta
gaaatgggcaatgtcaccattgaaggtaacaatcgttcattaaccgtgcgtgcggctccg
atttctttaaccggtaatgttgtaatgagtaatctcaaattaattttaccacctgctacc
ggggaaattaatcttgacgtcaccgccaaaagtcaggaagaagtcacacaatttatttat
caaaacggcaaagatctcacgctcaataatgttgatactcaaatcaaccaaaatgcaaag
agtcttgcaacgattgtgatgggtaacggcacagatacatctggtgaaggtaatggtaca
ttaaccttaagcggtgttgttggaaaaccacattttaccaaagtaaaagaagtgattgca
ggtaatacgaataataaggaaaaaactaccgcatcaacaatcaatattgaagaaaatgcc
gatgttagcactattacttttggtaaagaagcgaatccggtgagtggctcagttgttgtt
aatagtgataataatagtgttgatgtattccaaggtggaagtgcaacaaataccacagtt
aatctcaaaaaggctaatgaggcaacaattaaagacatcaaaaatgttacggttgaaacg
aaaaaagctatctctgctaatcaaattagcaatgtagacacactcacattaaaaagtggt
gctgtcgtaacagcaacggccgcaacaacacctcttacgatcaataaaattgtttcggag
ggcaacaatgaagtgagaatttcaccaaacaatgaaattcagctcaccgagggcgtgact
gataataatctgaaagtgtcccttactggagccggtattattaacaagccgtatgtaact
atttcggacgataagccggacaatgttacggttgccgatactaacaacggtacatttgaa
tttaaagataaagcctttaagttaattgatactcaacaaacgacagatattaccgtacca
gttattcgattcgagaaagatacaaataatgatggagtcttaaccactaacgaagaagca
tccaatacgacaaatatcacgatttcttttaatgagcctgatcagctttacggtgatgaa
acaattgaagttgtgatcattcgaaacggtaaacaagaaacaatcccagtaacattagag
gatcatgattaccataacccaatcaccataccgatttcaagaaatgaaaaagaagcggta
gagatttttgccgttactaaggatccgaaaaacgtaagatcgccgaaatcatcaacactt
actataaatgcgaagaatattactccacctactccggtagaacagagaaacggaagttct
gtaaccgccgaaactaaaccggctattacaattgaacagcaaaatggaagtagtttaacc
gccgaggcaaaaccggaaatcgctattgttcagaaaaatggaagtggcgtaaccactgag
actaaaccggaaattgctattgaacagcaaaacggaagtggcgtaactgctgaagctaaa
ccggaaatcactgttgaacagcaaaacggaagtggcgtaactgctgaagctaaaccggct
attactattattgaacagcaaaatggaagttctgttactaccgaagctaaaccggcgatt
actattgaacagcaaaacggaagctctattaccaccgaagttaaaccggctattactatt
gaacagcaaaacggaagtggcgtaactgctgaagctaaaccggctattactattattgaa
cagcaaaatggaagttctgttaccaccgaagctaaaccggcgattactattgaacagcaa
aatggaagttctgttaccaccgaagctaaaccggcgattactattgaacagcaaaatgga
agttctgttaccaccgaagctaaaccggcgattactattgaacagcaaaatggaagtagt
ttaaccgccgaggcaaaaccggctattactattgaacagcaaaacggaagtggcgtaact
gctgaagctaaaccggagattacgattgaacagaaaaacggaagttctgtaaccaccgaa
gttaaaccggctattactattgaacagcaaaacggaagttctgttaccaccgaagctaaa
ccggctattactattgaacagcaaaatggaagtagtttaaccgccgaggcaaaaccggaa
atcactattgaacagaaaaatggaagtagtttaaccaccgaggcaaaaccggctattact
attgaacagcaaaacggaagttctgttaccaccaatacgaaacctgaaattactgttgaa
aaacaaaacggaagttctgtaaccgctgaagagaagccaactacagaaacacctgttgtt
caaacaaaaggaaccagcgtaactacagaagaaaaaccgactatagcgattcaaattgag
ccggataatagtaaaacattagtcctattagaaagccagcgtattgcaaatataccgtta
tcaaatcttgcaactcaaacacatgatatagcaactatcagtgccgatttggctcaagct
gtgattgagaaattccctgaaaacggtaataactatcgtgtttggtcgaaaaatacctta
gcaaatagtaaacactatgcgaatttccataaaggttacgaaagtgatagtttccgcact
caattaggaattagcggcttaatcaatgaacgtactcaggtgggttggatcctaaacgat
atgcgtagcgataacgattttgccgataatgcgaaaagcgaaaataaattcttaatgagt
tctatttttatgaaatatcaaacaccgaccggaaactttgtcgcgattgacgttggatta
ggccgtattaaaaatgagcttaaaacaaatggcgaagaaattgacttacgccgtaaggta
tggcaagccggcttaacattcggtaaagagcttaaatggaagcaaattgaaatcacacct
aaagcaggtatccgttatagccatttagaatccgcaaattaccagcttaatggtaatcaa
atacaagaggaagcggtcggatttgttagttatcttgtaggattggatgcaggttatcgt
tttaacctagcagaacattacagcctaaaaccttttgtatccttagagcattggtggaat
aaaggtaatagcgatgtaaaagtgaacggttataacttcaattttaacgcaagtaaccaa
taccactacctcggtggtcttgagtttgcctataaaaactttaaactcaaagcatctgct
ggaatcactaatggctcacaaatggcgaagcaaaatctagcaagattacatttaagctac
gatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
