Alteromonas australica DE170: EP12_07070
Help
Entry
EP12_07070 CDS
T03858
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
aaus
Alteromonas australica DE170
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Calx-beta
LRR_4
Reprolysin_4
Reprolysin_3
LRR_14
LRR_8
Reprolysin_5
LRR_EndoS
LRR_R13L1-DRL21
LRR_Zer-1
Reprolysin
Peptidase_M66
Peptidase_M10
TSP3_bac
Peptidase_M43
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJP43478
LinkDB
All DBs
Position
1525287..1529189
Genome browser
AA seq
1300 aa
AA seq
DB search
MKYVYFALVFTMWVIQPVAAKTQLFTSYSNQLDEKSVSSFSHISVHTKHLFSAATLDVDA
LKRLQKGDALLMNLPDEAVESQVVNIVKGASGSRHIILRSYVGGLPVSSVITLGESAFRL
ELVTSHGLLSGLGSEAGVVLSNPSEVFHAKGFTQDDFIVASAIQNGKNTALSQGVMSAQQ
EHSAIDESLQSNASQDDEAIMKAVSTETGEIAYIDVLFVYSNNVTDVIDDIHTTIDHFIA
YTNQAFEDSGIFAKVRFKGSVAVDYDYANGSDALDDLSQGNPPFEEIDVHRYQFGADAVA
LLTPNLTGDSSAGIAFQNGHIKYSGANSMYSQSDVDSSASTFAHELGHNLGLGHSRPQGE
TGSDFDYGVGYRIPIPDGVGFSTIMSYWIGNTSEVPYFSNPAKLCGELPCGVSKTDANYG
ADAVAAVNAVRHIVSAYVDENTVRTPFADALSNVSDSNLRQCLESMNHEGYGFAEQLTSL
WCYDPVTSLSGLESFTNLDYISINQLQATDLSALASLTKLTNLALYDVIATDFSSLSSLT
GLKQLRIGGNNFDNDAATILQDLPQLEELLLDSENLTSLPDTFGSASLSDVTINAPITSL
GGLSKAKALLYLKIESDGLGSLPSTLDWPMLETLRLFDISIDDVSFVQGFPNLTSLEIAR
STLSSIDAIAQLHGLTSLSLYDNNIDDIGALASLTSLVKLNIAFNPITDFSAIAGLVNLK
ELDAGTYFAGNIHSWAELKEITTLESLTLYGVSASAIPYISASNSTLTSLSLYDVNAVDL
SHFFSAFRLRSLSLYSASDATFYCWQINYLRTLLSGNAYLDFDCSTDDDSNDFDQDGISN
IDELSAGTNPTENDLNPSVIQFDVSSLTFFEVKNTTSYTGVVRRTGNSALTASVDIATSG
GTATFYNDYYGPNETLEFSKGENALQFSLNIYDDVKIEGEETFQITLTDAVDAQLGELDT
IDVSINDNKDGSDFEVDSGDSGTPSIGWDTLFESAFNQNGAIEIVLNRPVGLEGAFSVEI
SPLALTDASEDTFTLAQTKIEFAGSDSFRTVTLNYDVLEDEFENRYIVLRLVNPEGVLVN
PANGALTVEINNEESIQRQINFEKGYQLAVENDGELQLKLVRNATDSESRTVTIVTNNGT
ASENDDFSLPESTVTFAPNDTEKLVTFTIHDDDEAEENEYVTLRLDGLPSNLYGDFRMTV
IEITDNDSETGVVSFDTAASTVNEADGTFTINVYREGSIAGPLAIDVRTQVGSASGDDFT
AIEQVVYFEENQTIAEIQVAIIDDAIEEEDESFSIVIRCG
NT seq
3903 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaaatacgtgtattttgcgctcgtcttcacgatgtgggtgatacaacctgtcgcagct
aaaactcaattgtttacgtcgtactcaaatcagctagacgaaaaaagcgtgtctagcttt
tctcatatttctgttcacactaagcacctcttttcagcagctaccctcgacgttgatgca
ctcaaaagattgcagaaaggcgatgccctgttaatgaacctgccagacgaggcagttgaa
agtcaggtggttaatattgtaaaaggcgcgagcggttcgcgtcatattatccttcgctct
tatgtaggtggtttaccggtatcatcggtgatcacgcttggtgaaagcgctttccgttta
gagttggtgacctcacatggcctcttgtcgggtttgggctctgaagctggtgttgtattg
agcaacccaagtgaagtctttcatgcaaaagggtttactcaagatgattttatcgtagcg
tctgctattcagaatggtaaaaacaccgctttatcccaaggtgttatgtctgcacaacaa
gaacactcagccatagatgaatcgctccaaagtaatgcttcacaggacgacgaagcaatc
atgaaagccgtctcaactgagacgggcgaaattgcttatattgatgtgttatttgtttac
tctaacaatgtcactgacgtcattgatgatattcacactaccatcgaccattttattgcc
tataccaatcaagcgtttgaagattcaggtatttttgcgaaagtcaggtttaaaggttcg
gtagcagtggactatgattatgcaaatggctctgatgccttagatgacctttctcaaggt
aaccccccattcgaggaaattgatgtacaccgctatcaattcggggcagatgcggtggcg
ctgctcacaccgaatttaaccggtgattcttcagccggtatcgcattccaaaacggtcat
atcaaatattccggtgcaaatagcatgtacagtcagtctgatgttgattcatcggcgtct
acgtttgcacatgaacttgggcataaccttggtttagggcactctcgccctcaaggggag
acaggatcagactttgattacggtgttgggtatcgcattcccatcccagatggcgttggc
ttcagtactatcatgtcttattggattggcaataccagtgaagttccttatttctcaaac
ccagcaaagctgtgtggggaactcccgtgtggggtatctaaaacagatgccaactatggc
gcggatgcggtagcagcggttaatgcagtgcgccatattgtttctgcttacgtagatgaa
aatacggttcgcactccctttgctgatgcgttaagtaatgtctcagacagtaatttacga
caatgtttagaaagcatgaatcatgaggggtacggtttcgctgaacagctcacttcgttg
tggtgttatgacccagtcacgtccttatcggggctagagagttttaccaaccttgattat
atttctattaaccaattgcaagccactgacctatctgcactcgccagccttactaagctg
actaacttggccctttatgacgtcatcgccaccgatttttcgtcgctctcttctcttact
gggttaaagcaattgcgtattggtgggaacaattttgacaacgatgccgctaccatctta
caagacctacctcaattagaagaactgcttttagatagcgaaaatctgacttcactaccc
gatacttttgggtcggcaagcttatcagatgtcaccattaatgcgcctattacttcttta
ggcggcctatcgaaggcaaaggcgttactttaccttaaaattgaaagtgacgggcttggc
agtcttccgtctacccttgattggcctatgttggaaacgttaaggttatttgatatctcc
atcgacgatgtgtcttttgttcaaggttttcccaatcttacttctttagagattgcgcgc
tcaacactttcttctattgacgcaatagcgcagcttcatggtctaacatcactttccctt
tatgacaacaatatagacgatattggcgcgctagcgtctttgacaagcctggttaaattg
aatattgcctttaacccaataaccgacttttcagctattgcagggctagtaaacttaaag
gaactagatgcgggtacatactttgcgggtaacattcatagttgggccgagttaaaagaa
ataaccacattagagtcacttacactttacggtgttagtgccagtgccattccttatatc
agtgcgagcaactcaacactcacttcactgtcactatacgacgtgaatgctgtggatcta
tctcatttttttagcgcgtttcgattaagaagcctttctttgtattcggcttcagatgct
acgttttattgctggcaaattaattaccttcgtacacttctctcaggcaatgcctattta
gattttgattgttcaacagacgatgacagcaacgattttgaccaagacggtatcagtaac
attgatgaattatctgcgggcaccaaccctactgaaaatgatctgaacccttcggtgatc
cagtttgatgtatcaagcctgacattttttgaggtgaaaaatacgacatcctacacgggt
gtggtaagacgtacgggcaactctgcattaactgcaagtgtcgacattgcaacatcaggt
ggcacggcaaccttttacaatgactattatggacccaacgaaacactcgaattttcaaag
ggcgagaatgcactgcagtttagcctaaacatctacgatgacgttaaaattgaaggtgaa
gaaacctttcaaataacgctaacagacgcggtagatgctcaactaggagagttggacact
atcgatgtgagcataaacgataataaagatggaagtgactttgaagttgatagtggcgat
agtggtacgccatctatcggttgggataccttatttgagtcggcctttaatcagaacggt
gctattgaaattgtgctcaaccgcccggtaggacttgagggggcattttctgtggaaatt
tcacccttagcgcttacagacgcctctgaagataccttcacattagcgcaaaccaaaatt
gaatttgcaggttctgattcatttagaacggttacgttaaattatgatgtattggaggat
gaatttgaaaaccgctatatcgtcttgcgcttggttaaccctgaaggtgtgctggttaac
ccagccaacggtgcgttaaccgttgagataaacaacgaagaatctattcaacgtcaaatt
aattttgaaaaaggctatcaactggctgttgaaaatgacggcgaattacaactaaaactg
gtgagaaacgccaccgatagcgagtctcgtaccgtcacaatagtgactaataatggcacg
gcatcggaaaatgatgactttagtttgcctgagagcacggtgacatttgcgccgaacgat
accgaaaaattagtgactttcaccattcatgatgacgatgaggcggaagaaaatgaatat
gtaacattaaggttagatggcttaccttcaaatttgtacggtgattttcgaatgacagtc
attgaaataacagataacgattcagaaactggtgtggtgtcttttgatactgcggcctca
acagtaaacgaagctgatggcacttttactatcaatgtgtatcgtgaggggagcattgcc
ggacctcttgcgattgatgttcgaacgcaagtagggtcagcttcaggcgacgatttcacc
gccattgagcaagttgtttattttgaagagaatcagactatcgcagaaatacaggtggcc
attattgatgatgctatcgaagaagaagatgaatcgttcagtattgttatcagatgcgga
tga
DBGET
integrated database retrieval system