Aceticella autotrophica: ACETAC_01295
Help
Entry
ACETAC_01295 CDS
T09086
Name
(GenBank) RHS repeat protein
Organism
aaut
Aceticella autotrophica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
TEN_YD-shell
DUF6531
Flg_new_2
Beta-prop_EML_2
Peptidase_S13
ThuA
COG4_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QSZ27579
UniProt:
A0A975GAK8
LinkDB
All DBs
Position
300957..306728
Genome browser
AA seq
1923 aa
AA seq
DB search
MFADTKKRFPKIIALIIAILIIMQSISLTAFAESNNLLTIQSTQSTTKIFNQGSLMSAAP
KIVTGGDGGGTVSVPVVYNKLKKAYSVNSPMSPPTTYGITVNNAVYANVYTDKQAAPAGG
TVTINISDIKPGYQFKSITVKDSSGSQVATTEVKAGQQYTFTMPASAVIVSAEIEPTTYG
ITVNNAVYANVYTDKQAAPAGDTVTINISDIKPGYQFKSITVKDSSGSQVATTEVKPGQQ
YTFTMPASAVIVSAEIEPTTYGITVNNAVYANVYTDNQKASAGDTVTINISDIKPGYQFK
SITVKDSSGSQVATTEVKPGQQYTFIMPGSAVTVEIILQNNNPLQVLNGSSRNVGIICNN
YNIQSISNGFEIHFSDSNSSLRSTDYPNQKFEVIDHSKVSSDILKKYDTLLLFMCNPSSL
TAIQKQNITDWIKGGGKLIIWDSDAVPEGESWDYTWLGYPFKSNCPGQTGSTGLGLHIVE
ENQLSSNDPNSPYYIDTNVINSRTDAVGDSNVMVTYSPGWFIDMLGENNNKVKGPVHAYA
FLGSGLIIYSGLDWDDVTGIGYGLGLGDRYGVYMLKKILMLELNVVPGKTVLPCSISGKD
AVDNLMRQYPGWFNKDKGPKPDSRVAEPINTATGAHELRLTMLSVKGTQPISLDVCYNSL
LLNKGPIGKGWDHNFETYLEVEPSGDVIIHWDANHKNTFVEYGKDQFAPQDISMRFNTLR
KNIDGSYVLTCKDQTTYTFNSNGQMIQKANGHGQSLEMTYDSNGHLATVKDSLSGQGFNF
HYNTDGLIDNISDTLNRKVLFVYDVSQNLLSITDAEGKTVHYSYNEDGRILTSTDADGKQ
IFSNTYDDKGRVIAQDDGVTGNQIAHLNYDETSDPGKLITTYTNRNGKTVVYTYDQNYNM
LSLKNELGLTTIFDYDASGNLIKVTDSAGKVSKYIYDTYGNLTGVTDPAGNTTKMTYDDR
NNLTSVENTAGKKIIYTYDANNNPISITDPFGNITSLTYDTNGMLQTVKKPGSGIYTIAY
QNGLVKMLTDPVGNTITYGYDAAGRPIKITDAAGKAVNIAYDNCDRITSIIDPMGNKRTY
SYDSRGNMLNVTDPNGNVTHFSYNGNNKLTNVKDALGNVTKYEYDGEDRLIKITDAYGNV
FTLTRDEKGRIVGITDPTGRTQGFQYDNVDNLLSMTDANGAKVIEFGYDMLNNPVTIKDA
LGNTVTNRYDNLNRLIESIDQLGRKAQYIYDDLNRLVSSLDAVGGSSSQSFDADGNKINM
VDPNGNKISFKYDKAGRLIEATSADGCKSSFAYNNRGLISESTNGRGQKTTYNYDDNGRL
VSFTDQEGTVSYTYDANGNVLTVSDANGISVREYDALNRVVKYTDGRGNTIHYVYDAAGN
LITLAYPDGKEVHYQYDAANRLTKVTDWANRTTTYQYDNNGRLMKALQADGSILTMDYDS
AGHLIKQTDVSANGNVIAQYDYTYDAAGNLKTEDSAAIKPPTSSSNTSITYTAGNRITAF
NGRTVQYDDDGNMTYGPLKGLMVKYSYNSRNQLVSVGGTSYIYDAEGNRIALIEGNNRTD
YIINPEATLSQVLVKKDSQGRQTYYIYGIGLIGQEEADGTYHTYHYDMRGSTIALTDQTG
KVTDEFSYAPYGELSYHKGNTFTPFLYNGRDGVMTDENGLYYMRNRYYNTDIKRFINQDY
LIGSIIYGQTLNRYAYVNGNPVLYIDPNGNFWGYDDLVVFLAGGVANASFDYIFDYIDDN
ISDSSFKPDYRQIIGSFILGGIGALAAYDLHVPILKGPVTDGIIGLLSSIKDQYFKSHTV
NWKDALLDAGISILGGISERGAIKRIKKGNIKRFFKELEKNVSTYLDAIKDKDFINLTLK
SFIITSKQKLIENGIEYLFEQCYKSILKNLGDYYKDAQKSLNELVESMIEYSDVVNPIGS
TTK
NT seq
5772 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttgccgacacaaaaaagcggtttccaaagataatagcattaattattgctatatta
ataataatgcaaagtatttcgctaaccgcatttgctgaatctaataacttgttgactata
caatccacacaatcgacaaccaaaatatttaaccagggttctttaatgtcagcagctcca
aagattgtaacagggggggatggtggaggtacagtaagtgtacccgttgtttataacaaa
ttaaaaaaagcatatagtgtaaatagcccaatgtcgccaccaacgacatatggaataacg
gtaaataatgcagtatatgcaaatgtatatacagacaagcaggcagcgccagcaggaggt
acagtgacgataaacataagcgatataaagccaggataccaattcaaatcaataacggtg
aaagatagcagcgggagccaagtagcaacaacagaagtaaaagcaggacagcaatataca
ttcacaatgcctgcaagtgcagtaatagtatctgcggaaattgaaccaacgacatatgga
ataacggtaaataatgcagtatatgcaaatgtatatacagacaagcaggcagcgccagca
ggagatacagtgacgataaacataagcgatataaagccaggataccaattcaaatcaata
acggtgaaagatagcagcgggagccaagtagcaacaacagaagtaaaaccaggacagcaa
tatacctttacaatgcctgcaagcgcagtaatagtatctgcggaaattgaaccaacgaca
tatggaataacggtaaataatgcagtatatgcaaatgtatatacagacaaccagaaagcg
tcagcaggagatacagtgacgataaacataagcgatataaagccaggataccaattcaaa
tcaataacggtgaaagatagcagcgggagccaagtagcaacaacagaagtaaaaccagga
cagcaatatacctttataatgcctggaagtgcagtaacagtagaaataattttacaaaac
aataatcctttacaagtactaaatggaagtagtagaaatgttggtataatatgtaataac
tataatatccaaagtatatcgaacggttttgagatacatttttctgattctaattcgtct
ctgagaagtactgattatcctaatcagaaatttgaagtaattgatcattccaaagtttca
agcgatattcttaaaaaatatgacactcttttgctttttatgtgcaatccatcatcttta
actgcaattcaaaagcaaaacattacagactggataaaaggcggagggaaattaattata
tgggattcagatgcggtacctgaaggtgagtcatgggattacacttggttaggttatcca
tttaaaagtaattgtcctggtcagacaggttccactggtcttggcttgcatatagtcgag
gaaaaccaactttctagtaatgatcctaactctccttattatatagatacaaatgttata
aatagtagaacagatgcggtaggagattccaatgtaatggttacttatagtccgggatgg
tttatagatatgttaggagaaaataataataaagtgaaggggccggttcatgcttatgca
tttttaggttctggactaattatttacagcggtcttgactgggatgatgtgacgggaatt
ggttatgggctcggtcttggggatcgttatggagtttatatgttaaaaaaaatacttatg
ctggaactgaatgttgttccaggcaaaactgtacttccttgcagcatttcaggaaaggat
gcagtcgataatttgatgaggcaataccccgggtggtttaataaagataaaggtccaaaa
ccagattcaagagtagctgaaccgataaatactgcaacaggtgcacatgaacttagattg
acaatgttgagtgttaaaggtacacaaccaatatctttagacgtatgttataatagtttg
cttctaaataaaggtccgattggaaagggatgggatcataattttgaaacctatcttgaa
gtagagccaagcggtgatgtaattattcattgggatgctaatcataagaatacttttgtt
gagtatggtaaggaccagtttgcaccccaggatatttcgatgcgttttaatacattacgc
aagaatattgatggaagttatgttttgacttgtaaagatcaaacaacttatacttttaac
agtaatggacaaatgattcagaaagctaatggtcatgggcagtctttagaaatgacttat
gatagtaatggtcatcttgcaacagtaaaagattcgcttagtggtcaaggttttaacttc
cattataatacagatggtttgattgataatataagcgatactttaaaccggaaagtgtta
tttgtctatgatgtcagtcaaaacttgctcagcattacggatgcagaagggaaaacagtt
cattactcatataatgaggatgggcgcattttgaccagcactgatgccgacggaaaacag
attttcagtaatacttatgatgataaaggacgcgtaattgctcaggatgacggtgttacc
gggaaccaaatagctcatttaaattatgatgaaaccagcgatccaggcaaacttatcaca
acatatacgaaccgcaacggtaaaacagtcgtatatacttatgaccaaaattacaatatg
ctaagtttaaaaaatgagcttggtttaaccacaatttttgattacgacgcttctggcaat
ttaatcaaagtaactgattcggctggaaaagtaagcaaatacatctacgacacatatggt
aatttaacaggagtaactgatccggcaggaaatacgacaaagatgacatatgatgataga
aataatctcacatcggtagaaaatacagccggaaagaaaattatttacacctatgatgct
aacaataatccgattagcattactgacccgtttgggaatatcacatctttgacatatgat
acaaacgggatgttgcagactgtaaaaaaaccaggttcagggatttacaccattgcttat
caaaacggtttagttaaaatgcttactgatccagttggtaatactattacttatggttat
gatgcggcaggacgaccaataaaaataacagatgctgcaggcaaagctgttaacatagct
tatgataattgcgacagaataacaagcattattgatcctatgggtaataagaggacatat
tcttatgatagccgtggcaatatgcttaatgtgacggatccaaatggtaatgttactcat
ttttcctataatggaaataataaactaacaaatgtcaaggatgctcttgggaatgtgaca
aaatacgaatatgacggggaagatcgtttgattaagattactgatgcatatggtaatgta
tttacattaacgcgtgatgaaaaaggcaggattgttggcataaccgatccgacaggaaga
acccaaggttttcaatatgacaatgtagacaatctgttaagtatgacagatgccaatgga
gcaaaggtaattgaatttggatatgatatgttaaataatcctgttactattaaagatgct
ttgggcaataccgttacaaaccgttatgataatctaaaccgcctaatagaaagtatcgac
cagcttggacgaaaggctcagtatatttatgatgacttgaaccgtttggtttcatcttta
gatgcagttggcggatcgagtagtcagagttttgatgcggatggcaataagataaacatg
gttgatcctaacggcaataaaataagttttaaatatgacaaagccgggagattaatagaa
gcaacatcggcagatggttgcaaatcaagttttgcttataacaacagaggattaatctcc
gaatcgacaaacgggcgtggtcaaaaaacgacttacaactatgacgacaatggaaggtta
gttagtttcacagaccaggaaggaacagtgtcttatacctatgatgcaaatggaaacgtc
ttgacagtaagcgatgcaaatgggatatctgtgcgcgaatatgatgcgctgaatcgagta
gtaaaatacactgatgggcgtggcaataccattcattatgtctacgatgccgcaggtaat
ctgattacccttgcatatcctgacggcaaagaagttcactatcagtatgatgccgctaac
cgtctgacaaaggttactgactgggctaatcgtactacaacttaccagtatgataataac
ggtcgtcttatgaaagcattacaagccgatggcagtattttaacaatggattatgatagt
gccggacatttgattaaacagacagatgtaagcgccaatgggaatgtgatagctcagtat
gattatacttacgatgctgcaggaaatttaaaaactgaagattcagctgcaataaagcca
ccgacttcaagttcaaacacatcaataacctatactgcaggtaaccgtattactgcgttc
aatggtcgaaccgttcaatatgatgatgacggcaacatgacttacggacctttgaaaggc
ttaatggtgaagtatagctataactctcgcaatcagcttgttagtgtaggtggaacaagt
tacatctatgatgcagaaggcaaccgtattgcacttattgaagggaataacaggacagac
tatattattaacccggaagctacattgagtcaagttcttgtaaaaaaagattctcaaggt
cgacagacatattacatttatggtataggtcttatcgggcaggaggaagctgacggtacc
tatcatacttaccattatgacatgcgtggaagcactatagctttgactgatcaaacaggg
aaagtaaccgatgagttttcttatgcaccttacggagaactgtcgtatcacaaaggtaat
acattcacaccgtttttatacaatggtcgcgatggtgtaatgaccgatgaaaatggcttg
tattacatgcgaaataggtactataacaccgatatcaaacgatttatcaatcaggattat
ctgattggaagcataatctacggtcagacattaaaccgctatgcatatgttaatggaaat
cctgttctatatatagatcctaatggtaatttttggggatatgatgatttagttgtattc
cttgccggtggtgttgcaaatgcaagttttgattatatttttgattatattgacgacaac
atttcggatagttcttttaagccagattaccgtcaaattattggtagttttattttagga
ggaataggtgcccttgcggcgtatgaccttcatgtccctatccttaaaggacctgttacg
gatggtattattggtttactaagtagcataaaagatcaatattttaaatctcacacggta
aattggaaagatgcgctattggatgcaggtataagtattcttggaggcatttcagaaaga
ggagcaataaaaagaataaagaaaggtaatataaaaagattctttaaagaattagagaag
aatgtctctacttatttagatgctataaaagataaagattttataaatttaacattaaaa
tcttttataattacatcaaagcaaaaattaatagaaaatggaatagaatatttatttgaa
caatgttataaatcaatattgaaaaatttaggtgactattataaggatgctcaaaaatct
cttaatgaattggtggaatccatgatagaatattcagatgtagtaaacccaataggaagt
actacaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system