KEGG   Alteromonas stellipolaris R10SW13: AVL56_04550
Entry
AVL56_04550       CDS       T04403                                 
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
  KO
K02014  iron complex outermembrane recepter protein
Organism
aaw  Alteromonas stellipolaris R10SW13
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:aaw00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:aaw02000]
    AVL56_04550
Transporters [BR:aaw02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   AVL56_04550
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec_b-barrel OMP_b-brl_3 Plug
Other DBs
NCBI-ProteinID: AMJ93643
LinkDB
Position
1082994..1085951
AA seq 985 aa
MGHKLSKITLAMLSATSLSFATSTLAQEAQQEAEKDVEVIQVSGIRASLASALNEKRFTN
NLVEVIEAEDIGKLPDQNLAEVLENITGIQITREAGVGTGVQIRGTDANRTEINGVSTVG
SGAGRSGIDFEDVSAAIIAGLEVTKSPDAKTIEGSVGGTINLKTIRPLQLTERLTSIRVQ
GENSSLSTDSGFQPRLSATYGDNWENDHGKFGVVVSGSYSEQDVSAFRPRADRDNLIASD
SGVASAQSFDFLPIQFFVQDYDNYEYETKNFVGTFEWQPNDNTKFFFDAIINDQERLQES
SRVQASGVSALNDISVPDAFETINFGSLGGTDLGSMQAALRGVIPVNLDNDDDDPNLRLS
TDTNSRITESQIFRLGGEWQGEKWFVSAEVASSSSDTTTPSFNTTLNFINPNAPLDAGGG
NDNSVPFEYDLSGGSLAFGIASGAEYAPTVEQLLDPSNVVLRDVNIGRDTTENSEDAIRF
DFSYYVDSMITSVDFGYRYNKSTSTRDDVSTSVGLRSMEDSPRGDLFSELLVAGPNNFND
ADGRELFVRDFLIINPELVASDPDGVLASLQQAMDAHGSTATLNAPTSSSSGFFDIEEET
HALYAQANFEYEMFRGNFGVRYLQTDVTSVGNSITVDGDGNELVSQVTNTGDYDFILPRL
NIVADVADDVVLRFGAGKDIRRPNFDDLSTSVTFSTSPNPNVAIGNPGLEPEEVTSFDLA
AEWYFAEASVLSVGIFHKTRKALHVDQIVSPFEDPVTGYRDLTDPCEGGGVFNPIADINV
FGPDLGTGICVGTETKINDAGETTQKGIEIAVQYDLSSFEKELGWASGFGVLANYTIQEF
DGGDSENTATSRAANVFAASTGIDDIEVSAVQGLLNLSENAYNFTLYYEKFGLSARMRYT
WREAYRSDDFGSTSSFPWGFPVVQEDRGQLNASINYDVNEDFNIGIEAVNITESEVEQSC
INEGALLCFQGLTDRRVTLGANYRF
NT seq 2958 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgggacacaaattatctaaaatcacattagcgatgttgtctgcaacatcgttgagtttt
gccacttctacccttgctcaagaagctcaacaagaagccgaaaaagacgtagaagttatt
caggtttctggtattcgcgcctcgttagccagtgctctaaatgaaaaacgttttacaaac
aatttagtagaagtcattgaagctgaggatattggtaaattgcctgaccaaaacttagcg
gaagtgttagaaaacatcacgggtattcaaatcactcgtgaagcaggtgttggtacgggt
gttcaaatccgtggtacagatgccaaccgaacagagattaacggcgtatcaacggtaggc
tcaggcgcaggccgaagtggtatcgattttgaagatgtgtcagcagcaatcattgcgggc
ttggaagttaccaagtcaccagatgcgaaaacaattgaaggttctgttggtggtaccatc
aatcttaagacaattcgtcctctacaattgactgagcgattgacgtcgattcgtgttcaa
ggtgaaaacagtagtttatctacagatagcggtttccagcctcgtctttcagcgacttat
ggtgataactgggaaaacgaccacggtaaatttggtgttgtagtgagtggtagttattca
gaacaagatgtatctgcatttagaccacgtgctgaccgagataacctaattgcttctgac
agcggcgtagcaagtgcccagtcattcgacttccttcccattcagtttttcgtacaagat
tacgacaactacgaatatgaaacgaaaaacttcgtaggtacctttgaatggcagcctaac
gacaacactaagtttttcttcgacgccatcattaatgaccaagaacgtttgcaagaaagt
tcacgtgttcaggcatcaggcgtaagtgcacttaacgatatttcagtacctgatgcattt
gaaacgatcaacttcggttcattaggtggtactgatttaggttcaatgcaggctgcgctt
cgcggtgttattccagtgaatcttgataacgatgacgacgatcctaaccttcgtttgtcg
accgatacaaactctcgtattacagagagccagatctttagattaggtggtgaatggcaa
ggcgagaaatggtttgtaagtgctgaagttgcatcttcatcttcagatactaccacacct
agctttaatactacgcttaacttcatcaaccctaatgcaccattagatgctggtggcggt
aacgataacagtgttccgtttgaatatgatttatctggcggctcattagcgttcggtatt
gcatctggtgcggaatatgcgccaacagtagagcagcttttagacccttcaaatgttgtt
ctacgtgatgtaaacattggtagagataccactgaaaactcagaagatgcgattcgtttt
gacttttcatactacgtagactcgatgattacgtcagttgactttggttatcgctataac
aaatcaactagcacccgtgatgatgttagtactagcgttggtttgagaagcatggaagac
agccctcgaggcgatttgttctctgaattgctagtcgcaggacctaacaacttcaatgat
gcggatggtcgcgaacttttcgttcgagacttcttaatcattaatcctgaattagtggct
tcagatccagatggtgttttagcttcattacagcaagctatggacgcacatggctctaca
gctacattaaacgcaccaacatctagctcgtctggtttcttcgacatcgaagaagaaaca
catgctctttatgcgcaagcgaactttgaatatgaaatgttccgcggtaatttcggcgta
cgttatttgcaaacagacgttacctctgtgggtaactcaattacggtagacggtgacgga
aacgaattggtatcgcaagtaactaataccggtgattacgatttcattctacctcgctta
aatattgttgctgatgtggctgatgatgttgtacttcgctttggtgccggtaaagatata
cgccgtcctaactttgatgacttatctacgtcagtaacattcagtaccagccctaaccca
aatgtggctattggtaacccagggctagagcctgaagaagtaacatctttcgacttagcg
gctgaatggtattttgctgaagcaagtgtgttaagtgttggtatattccacaaaacacgt
aaagcattgcacgttgaccaaatcgtgagcccgtttgaagatccggtaacaggttatcgt
gacttaaccgacccttgtgaaggtggcggtgtgtttaaccccattgctgatatcaacgtt
tttggacctgacctaggtacaggtatttgtgtcggtacagagactaagattaacgatgct
ggcgaaactacgcaaaaaggtatcgaaattgccgttcaatatgacctttcaagctttgaa
aaagagctaggttgggcttcaggtttcggtgtacttgctaactacactattcaagagttt
gacggtggtgattctgaaaatacagcaacaagtcgtgcggcaaatgtattcgcagcctct
acaggtattgatgatattgaagtgtcagcagttcaaggtctactgaacttatctgaaaat
gcgtataacttcaccttgtactatgagaagtttggtttatcggcgcgtatgcgttacaca
tggcgtgaagcgtatcgttcggatgacttcggtagcacatcaagcttcccttggggcttc
ccagtggttcaggaagatcgtggtcagcttaatgcaagtattaactacgacgtgaacgaa
gacttcaacataggtattgaggcggtgaatattactgaatcagaagttgaacagtcttgt
atcaatgaaggtgcgttattgtgcttccaaggtcttaccgaccgccgagtgactttaggt
gctaactaccgcttctaa

DBGET integrated database retrieval system