Candidatus Nanopelagicus limnae: B1s21122_02515
Help
Entry
B1s21122_02515 CDS
T05073
Name
(GenBank) solute:Na+ symporter, SSS family
Organism
abam
Candidatus Nanopelagicus limnae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
3HCDH_N
ECH_1
ECH_2
3HCDH
RE_Alw26IDE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASY09224
UniProt:
A0A249JXH5
LinkDB
All DBs
Position
785845..787947
Genome browser
AA seq
700 aa
AA seq
DB search
MSDVLAAAPDEVVTNAIVQMVSLSAFGATGNLALITLDNGADHNRPNTFGPASLAALSAA
IDEAQKSDAVAIAVTGKPFIFAAGADLSAMSFLKDKSQAVAIGDLGHEVFLKLHESKKPT
FAFINGLALGGGLEVGLNCHYRTLATTAFTGLPECFLGLVPGWGGATLLPKLIGPENAVQ
VIILNALNNNTMMKAKDALSLGVVDAVYEPSDFIEHSVKFAADVLSAKKKIERKDFSKDS
AGFEKAIATGKAAIAKKYSGAQIPSPLAALDLIKAAQSNSVRDGFAAETKVLADLVMSDS
LRASLYSFNLIQKKRKKVEGAPKPALARKITRVGVVGAGLMASQLALLMLRNLKVPVVIT
DLDQERVDKGLAWIKNEIQKLVDKKRLSPESAARLLTNISGSVDKKIFANADFVIEAIFE
ELSLKQKLFKELEAIVTPECILATNTSSLSVEAMSEGLKNPERVVGFHFFNPVAIMPLLE
VARTTKTDDATTATAINIGKDLKKTMVIVKDAPAFVVNRLLTRFMGEVTDAMDEGTPYEV
ADAAMAPLGFPMSSLELLGLVGPGVALHVAETLNKNLGPRYKISPTMQRFVKDGVKTFYV
KDSNGVNTVNPAALALLEKGSTPSTAEQVRKRALEALATEAKMMLDEGVVSTPQEIDICM
LLGSGWPMHLGGILPYLDREGISEAVCGARFHPKGVASLP
NT seq
2103 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctgatgttttagcagccgcacctgatgaagtagtaaccaatgcaattgtgcagatg
gtttcactctctgcctttggcgctaccggtaaccttgccttaatcacactagataatggc
gcagaccataatcgcccaaatacttttggaccagcatccttagcagcactttctgctgca
attgatgaggcgcaaaaatcagatgcagtagcaattgccgtaactggtaagccatttata
tttgctgctggcgctgatctttcggcgatgagttttctaaaggataaatctcaagcagtt
gcaatcggagatttaggccatgaggtctttctaaaattgcatgagagtaagaagccaacc
tttgcttttataaatggattagcactaggtggtggcttagaggttggacttaactgtcac
tatcgaaccttggcaacaactgccttcaccggcttaccagagtgtttcctaggtttagtt
ccaggttggggtggggcaacacttctgccaaaactaattggaccagaaaatgcggttcaa
gtaattattttaaatgcactaaataacaacacaatgatgaaagcaaaggacgcactttca
ttgggcgtagtagacgctgtttatgaaccatctgattttattgaacactcagttaaattt
gccgctgatgttttaagtgcaaagaagaagattgaacgcaaagattttagtaaggattct
gctggctttgaaaaagcaatcgcaacgggtaaagcagcgattgccaagaaatatagtggc
gcccagatcccatccccacttgcagcccttgatttaatcaaagcagcgcaaagtaattca
gtaagagatggctttgctgctgaaactaaggttctagctgatttagtaatgagtgattca
ttacgcgcatccctttactcatttaatctaattcagaaaaaacgcaagaaggttgaagga
gctccaaaaccagcacttgctagaaagataactcgagttggcgtcgttggcgctggtctt
atggcatctcaattggcattgctaatgcttcgaaatcttaaggtcccagttgtaatcacc
gatcttgaccaagagcgagttgataaaggattggcttggattaaaaatgagattcaaaaa
ttagttgataagaagcgattatcccctgaatcagcagctagattgttaacaaatatctct
ggctcagttgataagaagatctttgcaaatgctgactttgtaattgaagcaatctttgaa
gagttgtcattaaagcaaaagttatttaaagagcttgaggcgattgttacaccagagtgc
atcttggcaacaaatacctcttccctttcagttgaggcgatgagtgaaggattgaagaat
ccagagcgagttgttggatttcacttctttaatccagttgcaattatgccgctgcttgag
gtggcaagaactactaaaacagatgatgccaccacagccacagcaataaatattggtaaa
gatttaaagaagacaatggtgattgttaaagatgcgccagcttttgtggttaatcgtcta
ttaactcgttttatgggcgaggtaacagatgcaatggatgaaggcacgccatatgaggta
gcagatgctgcaatggctcccctaggttttccaatgtcatcccttgaattacttggttta
gttggcccaggagttgcattgcatgtggctgaaactttaaataaaaaccttggtccacgt
tacaaaatttcgccaactatgcagcggtttgtaaaagatggggtaaaaacattttatgta
aaggattcaaatggtgttaacacggttaatcctgcagcactggctctgcttgaaaaagga
agcacaccatcaacagctgagcaggtcagaaagcgcgctcttgaagcattagcaactgag
gcaaagatgatgctggacgaaggggtggtttcaactccacaagagattgatatttgcatg
ttgctaggttcaggatggccaatgcaccttggtggaattttgccttacttagatcgagaa
ggaattagcgaagcggtttgcggcgctcgttttcatccaaagggcgtggcatcacttcct
taa
DBGET
integrated database retrieval system
