Aciduliprofundum boonei: Aboo_0794
Help
Entry
Aboo_0794 CDS
T01180
Name
(GenBank) extracellular solute-binding protein family 5
Organism
abi
Aciduliprofundum boonei
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SBP_bac_5
Big_1
MG4
DUF4198
CarboxypepD_reg
ZirS_C
BIg21
DUF3169
Spc29
SlyX
Fib_alpha
EMP24_GP25L
CoV_S2
COG3_N
HEF_HK
Bap31_Bap29_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADD08603
UniProt:
B5IAN6
LinkDB
All DBs
Position
756867..761180
Genome browser
AA seq
1437 aa
AA seq
DB search
MNERSMKKILLVTLVLAAMVLSGFSVMSGNAAAAAPKVSAANNGNLVVAFQNDISNLNIF
DPTTNTVWKADALGWAFESLYSYTPDLIPYPNLALSATPDASGLNVTVQLRHNVTFQDGQ
PMTAEDVVFSYQTLYWDSLYKTTLQCLYWPTPKWPLWNGNGTSHIGVVATGKYTVVFHLY
QPYPLFYQVTLGNTIIPEHIWVKHLVSAGTGDSDDMTIDTSWNAPGATIGTGPFKFVEWK
PGNYVKIEVYKNYWGKGLSTPWRGKNWPWYPEYVRTITFRIYNTLDTAVLALKRGEVQFI
DWSLPPGYYNQLKTDPNIGATIVNDQGFFYLAFNMRKEPMSDLAFRTAVAHCINKDYIVT
TLMQGYGTKGTVPISITSGAYVNTSAIPPGFDLNAAQQVLDQAGYKVGSDGWRHAPDGSP
IKETILTPPKDYDPIRAEAGIMIQANLQKVKLNIQSIPTNFDTIVSKAFVQVQFDMYILG
WGVGAFPETYLEDFFASWNAAPVGDNTPGYHNPKVDKLLIEIRTDMNTQDRINKIKEIEG
ILVHDLPYDVLYYRKNIMAYRQDMWQGWVAAYGTIWNGFSLGVLHPPTSGGGGGGGGGGH
HPGPITNVTGSGLVGAVGHLYTPNIAYAGHSINGVFYLTDQNGIPIPNAKVSIYASNGVW
ANGTTGSSGGLAFNVPLKFEDYGKVNITYSYSVKIGGHVYNGSGTNSVTVYLPKNVAKLK
LSIDKPILTPGASATITAKVTDIYAHPLAGVNVTILSEETSGSITPGYGITNSDGIATFH
YTAPTMVTNINPVDIVKAQIKVNNTILTNLQTATLFVPIQSHGSSWYKVQITHVSSYGIT
AGQSTQVTVKVVNINGNPVANHKVYMAAYYSNATDPNWYGQQLVPAWGITMDSNEKTTDS
NGEATFTITANENANIPVILKAYTQDTYMAYDTVQIYVGNNTGFDPYIGPWTGLYAMDMQ
LNKVTAGVGQQVQVTMTVYNAATGAPLPNATVFMAVFGTDYGFGADWANNVGTYVWWAGQ
SVIWGTTDANGQFSYTLNTSALRADQPIYVSGWMDAYGYGANAIWTGLGFDFPYLFGVKD
GFILQRAPIMGISNIMVNEFYLSNSLWTTMMTLKVVDINGPLANVTVSADWTLGNYENNI
NVTTNAQGIAQFNITIEPTTADSIVSVSIMLSSPDHAMNLNYEYYIPFLSGASQLSKIQT
FDCVKILTESSNVGLVPYEGKATIRLHLIGGLLGTPISGEQVHLYVPAGTLDNSSVFTDE
NGTAVFTYNAPDVLTPKHYVFVATTPEGGIYFFGVEVAGKYNNTLEWANEINSLNQKIAD
QSSQIQDLQNKYNNLNTEYKNLQDKYNSLQTNYTNLGKQKDNAVTMQYVWLSLFIIMIII
AIVMYYAGKKSGAKSAPSEEESTEEEIEEEEEPTEEIEEETEEGSEEETSEEENTEE
NT seq
4314 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacgaaagaagtatgaagaaaatattgttagtgactttagtgttagcagcgatggta
ctcagtggcttttcagtgatgtccgggaatgctgctgcggcagctcccaaagtttcagca
gccaataacggtaatctagtggtagcttttcagaatgacatatcaaacctgaacatattt
gacccaacaacgaacactgtttggaaagctgatgctcttgggtgggcatttgagagtctg
tattcttatactccggacttaataccctatccaaacttggcattgagtgccacgcctgac
gcaagtggcttgaatgtaactgttcagctaaggcacaatgtgactttccaagatggacag
ccaatgaccgcagaggatgttgtatttagttatcagaccttgtattgggattctctgtat
aagacaacccttcagtgcctttactggcccactcctaagtggcctctttggaatggaaat
ggcacatcccacataggtgttgttgccacaggcaaatacactgttgtcttccatctatat
caaccatatcctctgttctatcaggttacacttggtaatactatcatacccgagcacata
tgggtaaagcacttggtatctgcaggtacaggtgatagtgatgatatgacaatagataca
tcttggaatgctccaggagcaactattggtactggtccatttaagtttgtagaatggaag
ccaggtaactatgtgaagattgaagtttacaagaattactggggtaagggactgtctact
ccatggagaggtaaaaattggccttggtatcccgagtatgtgagaacaataacattcaga
atttacaacaccttggatactgcagttcttgcactgaagagaggtgaggttcagtttatt
gactggtcattgcctccaggctattataaccagttgaagactgatccaaatataggtgct
acaattgttaatgaccaggggttcttctatttggcattcaatatgagaaaagagcccatg
agcgatttggccttcaggaccgctgttgcccactgtattaataaggactacatagtgact
acccttatgcagggttatggtacgaagggtaccgtgcctatatcaattacatctggtgca
tatgtcaatacatctgctatacccccaggtttcgatttgaatgctgctcagcaggttctt
gaccaagcgggctataaagttggctctgatggttggagacacgccccagatggctcacca
attaaggagacaattctcacgccgccaaaggattacgatcctataagggctgaagctggc
ataatgatacaggcaaaccttcagaaagtaaaattgaatattcagagtattcctacaaac
tttgatacgatagtttcaaaggcattcgtgcaggtgcagttcgatatgtacatccttgga
tggggtgtcggtgcattccctgagacatacctcgaggacttctttgcaagctggaatgca
gcacctgttggtgataacacacctggttaccacaatcctaaggtggataaattgctcatt
gagattagaacagatatgaacactcaggatagaattaacaagattaaggagattgaaggc
atattggtgcatgatttgccttacgatgtgctttattacagaaagaacataatggcttac
aggcaggatatgtggcagggctgggttgcagcctatggtactatttggaatggattctca
cttggcgtactccatccgccgacatctggaggcggcggtggaggcggtggcggtggccac
cacccaggacctataactaatgttacagggagtggattagttggtgcagttggacatctt
tatacccctaacatagcgtatgctgggcactctataaatggagtattctatctcactgat
cagaatggcattcctatccctaatgcaaaggttagcatctatgcatccaatggagtatgg
gcaaatggcaccactggcagctcgggtggacttgcatttaatgtgcctctgaagttcgag
gattatggtaaagtgaatattacatattcttattcggttaaaattgggggccatgtgtat
aatggctccggtacgaactctgtaaccgtttacctgccaaagaatgttgcaaagctgaag
ctaagtattgataagccaatacttacccctggtgcaagtgctactattactgccaaagtt
actgacatctacgctcatccacttgcgggagtgaatgttaccatactctcagaagagacc
tctggttctataacaccaggttatggtataacaaatagtgatggtattgccacattccat
tacactgcaccaacgatggtaactaacataaatcctgtagatatagtaaaggcccagatt
aaggtcaacaacacaatactaacaaatctacagactgccactctcttcgttccaatacag
agccatggaagcagctggtacaaggtgcagataactcatgtgagcagttatggaataact
gctggtcagagtacccaagtaaccgttaaggttgtgaatataaatggaaatcctgtggca
aatcataaggtttatatggccgcctactactcaaatgcaactgatcctaactggtatggc
cagcagctcgtacctgcatggggaataacaatggattcaaatgaaaagacaacagatagc
aatggtgaggcgactttcaccataactgcaaatgagaacgcaaatattcctgtgatatta
aaggcttacacacaggatacttatatggcgtatgacactgtgcagatttatgtaggtaac
aatactggctttgatccttacattggtccttggactggcttgtatgcaatggatatgcag
ctcaacaaggtaactgctggtgttggacagcaggtgcaggttacaatgactgtatataat
gcagccacaggtgcaccgctgccaaatgctacagtgttcatggccgtattcggtactgat
tatggattcggtgctgattgggcaaacaatgtaggtacatatgtatggtgggcaggccag
agtgttatctggggaacaactgatgcaaatggtcagtttagctacacattgaacacaagt
gcccttagggcagatcagcccatctatgtaagcggttggatggatgcatatgggtatgga
gccaatgctatatggactggtcttggatttgacttcccgtacctctttggcgtgaaggat
ggcttcatacttcagagagcaccaataatgggtatatctaacataatggttaacgagttc
tatctaagtaactctctgtggactacaatgatgaccttgaaggttgttgatatcaatggt
cctctagctaatgttacagtgtctgctgattggactcttggtaactatgaaaataacata
aatgtaaccactaatgctcagggtattgctcagtttaatataacaatagagccaacaacg
gcagatagtattgtatctgtctcaattatgctctcctcgcctgaccatgcaatgaatctc
aactatgagtactatataccattcttatcaggagcatcacagctttcaaagatacaaaca
tttgactgtgtgaaaatattaactgaatcctcgaatgtaggtctagtgccttacgaagga
aaggcaactattagattgcatcttataggaggacttttgggaacacctatttcaggtgaa
caagtacatctttatgtaccagcaggtacattagacaattctagcgtgtttactgatgaa
aatggtacagcggtatttacatacaatgctcccgatgtacttacaccaaaacattatgtt
ttcgttgcaactacccctgaaggtggaatatacttcttcggagtggaagttgctggcaaa
tacaacaataccttagaatgggctaatgaaattaacagccttaatcagaagattgcagac
cagagctcacagatacaggatctacagaacaagtacaataatctcaataccgaatacaag
aacttgcaggacaagtataatagcttgcagacaaactacacaaatctaggcaagcagaaa
gataatgcagtgacaatgcagtatgtatggctctctctgttcatcataatgataatcata
gcaatagtgatgtactatgcaggcaagaagagcggagcaaagagtgcacctagtgaagaa
gagagtacagaagaggaaatcgaggaagaagaggagcctacagaagaaatagaggaagaa
accgaagagggctctgaggaagagacctcagaggaggaaaatacagaggagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
