Aliarcobacter butzleri ED-1: ABED_0314
Help
Entry
ABED_0314 CDS
T01823
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor protein
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
abt
Aliarcobacter butzleri ED-1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
abt00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
abt02000
]
ABED_0314
Transporters [BR:
abt02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
ABED_0314
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CbiG-like_linker
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAK70031
LinkDB
All DBs
Position
complement(316448..318445)
Genome browser
AA seq
665 aa
AA seq
DB search
MIKSKTINLSFLAFILLTNNLIAKEETTTLEAITVTAQKKEENVQKVPISVSVFDEMSIE
DKSIDSLEDIAKYTPNLMLYNTGQEGLIVPSIRGISGNVLSYSTPVGLYVDGVPTTSAFG
FDDAIGDIERIEVLRGPQGTLYGKNSEAGVINIITKQPNNETRGKISSTIGNEGRKDIGL
NVSGPIIKDKFYAGVAYKHKGKDGFIKNTVTNEYVNDKKSDYGKLILRATPTDNLDVSLI
SSINKEDNGDHNWVSSINNKKEVTSNLKGSSTPKDTTFALNVNYNIDENSKIKSITTKKE
YKDKAIVDADFTPLTLRHIYKNNELNTISQEFRYETIFNKTELISGIYLDKKDDDLYTRI
FAPFNPTGFANPQDMSSRSIGIFTNIIHPLNDFWVLNAGIRYDREKKEMEVKNTTIDLEN
SYSSVSPKIGVQYNINENQMSYFTIAKGYRSGGFNPFATSNAQAYDEENLISYELGYKGM
FFDNRLKFNTNIYFMDIKDMQVEETPMLGTTYMVNAATATSKGFEVEIEGVISDEISLFA
SAGVNETTFDDFKDLAGDYSGNYNPLAPKYNFNIGTLYRANNGLYARADFNGYGKTYFDK
ANTTSQKAYNLVDTKIGYEANDFDIYFYVNNLFDKDYDAIGAYFSGTTTILRPEQEFGIK
LAYRF
NT seq
1998 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaaatcaaaaactattaatctatcttttttagcttttatattattaacaaataac
ctaatagcaaaagaagaaactacaactttagaggcaatcactgtaacagctcaaaaaaaa
gaagaaaatgtacaaaaagtacctatttctgtctctgtttttgatgaaatgtcaatagaa
gataaatctattgatagtttagaagatattgcaaaatatactcccaacttgatgctttac
aatactggacaagaaggcttaatagttccttctattagaggaataagtggaaatgtttta
tcttattcaacccctgttgggctctatgttgatggagttcctactactagtgcttttggt
tttgatgatgcaattggtgatattgaaagaatagaagttttaagaggaccacaaggaact
ttatatggtaaaaatagcgaagcaggagttataaatatcataacaaaacaaccaaataat
gaaaccagagggaaaatttcttcaacaataggtaatgaaggtagaaaagatattggatta
aatgtaagtggtccaataataaaagataaattttatgcaggagtagcttataaacataaa
ggaaaagatggatttataaaaaatacagttacaaatgaatatgtaaatgacaaaaaaagc
gattatggaaaactcattttaagagctacaccaacagataatttagatgtatcactaata
tcttcaattaacaaagaagataatggtgaccataattgggtgagttcaataaacaacaaa
aaagaagttacttcaaatttaaaaggaagttctactccaaaagatacaacttttgcttta
aatgtaaattataatattgatgaaaactctaaaataaaatcaataactacaaaaaaagag
tataaagataaagcgatagtagatgccgattttactcctttgactttaagacatatttat
aaaaataatgaattaaacacaatctctcaagagtttagatatgaaactatatttaataaa
acagaactaatttcaggaatttatttagataaaaaagatgatgacttatatacaagaata
tttgcaccttttaatccaacaggatttgcaaatccacaggatatgagttctagaagtata
ggaatttttacaaatatcattcatcctttaaatgatttttgggttttgaatgcaggaatt
agatatgacagagaaaaaaaagagatggaagttaaaaacacaactattgacttagaaaat
agttatagcagtgtttctccaaaaatcggagttcaatacaatataaatgaaaatcaaatg
agctattttacaatagcaaaaggttatagaagtggaggatttaatccttttgctacatca
aacgcacaagcatatgatgaagaaaatttaatctcttatgaacttggatataaaggaatg
ttttttgataatcgtttaaaatttaacacaaatatctattttatggacataaaagatatg
caagtagaagaaacaccaatgcttggtactacttatatggtaaatgcagcaactgcaact
tcaaaaggttttgaagtagaaatagaaggtgtaattagtgatgaaataagcttatttgca
agtgcaggagtaaatgaaacaacttttgatgattttaaagatttggctggtgattatagt
ggaaattataaccctcttgctccaaaatataacttcaatattggaactttatatagagca
aacaatggtttatatgcaagagccgattttaatggttatggaaaaacatattttgacaag
gcaaatacgacttcacaaaaagcttataacttagttgatacaaaaattggttatgaagca
aatgattttgatatatatttttatgtaaataatttatttgataaagattatgatgcaata
ggtgcatattttagtggaacaacaactattttaagaccagaacaagagtttggtatcaaa
ttagcatatagattttaa
DBGET
integrated database retrieval system