Aliarcobacter butzleri ED-1: ABED_0976 Help Entry ABED_0976         CDS       T01823                                  Name (GenBank) conserved hypothetical protein   KO K21449   trimeric autotransporter adhesin Organism abt  Aliarcobacter butzleri ED-1 Brite KEGG Orthology (KO) [BR:abt00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02000 Transporters [BR:abt02000]     ABED_0976 Transporters [BR:abt02000]  Other transporters   Pores ion channels [TC:1]    ABED_0976 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  DUF4347 Cadherin_4 He_PIG Cadherin Big_9 Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  BAK70693 LinkDB All DBs Position 996612..1004159 Genome browser AA seq 2515 aa AA seqDB search MKRRNLKKPVISVLEQRVLFDGAAVATAVDVLDNSSFSSSTTKDSTTVNDVTNNSAENSV HKAQAVQGFEKDRREVAFVDITVKDYQTLVDGVGQGVETYLVSSMDEIKSILQNQTNIDS IHILSHGKTGEITVGNDILNKNTLQNFDEVLESMKSSLTQDGDILLYGCNVGNDGKGQEF IDLLASETQADIAASNDITGSNNLGGDWDLEAKSGTIETTAIVVNEYNHSLAYLTTDSDG GFTSSSEISGSIATTDKINYARGPGYYNDLYTLSGVANGTQVKLYIAQGTLSDPYIQVTD SNGTIIAQDDDSGDSGAANGYDAYVKFTWNNSYTIRATTYSTGAVGTYTIYTDTGTLVIK PDTTPTFTSSPVTLNISDTPDDNSIPTSSGSFTATDAENDALNFSGGGTNSFGTLSVSSN GSWTWSPNNAYINSLTSNATTSYTVSVSDGINIRNQTFTVNIVSATNDAPVITSSNSVSF QENTATNVAAYTITATDAENNTLTYSISGTDSQYFNINSTTGQITFKNSPDYETKTSYSL MITALETNGTGLSASKMVTISIANVNEPPIIESSNISNYTENGSPVVLSPSLTIDKGETS TLASAQISISSGFISGDILNFVNDGSTMGNIVASYNSATGILTLTSSGATATLAQWQSAL RSISYHSTSETLSLTQMTRTISWKVSDGNLESTVDTSTLKVTGVNDAPTISVSTPSGFTE TTTMDKQTLSQNGTVTFSDVDNNVNITYSYNNNISWSGGTLNSTLSSALIAGFNTSATNV SSGTTSWSYNVNNVDLNFLAAGETITLSYNVIATDIAGATAMTTITFTITGTNDAPVFGT VTTGSTTITAPTAGTTNPNAGIETFNNGLLRFGNGSIDSVNASTGMLEQPFYYKDGNWYQ LTYSTYQLNMAIAADYNNGSAKTDVDWNLEGTVNLTPTFTNTTVNNSGFNSSTGTGTIVW TGEIVVGSAHLKVTNVYTLEAGAKYIKANTYIENIGSTSTENLRFWVGTRDDYVAGSDSP AKQKGNIVDGEFQMISNSSEQAKAIKIYTGTGANATAVLFYSTNSNVNTVIAPRYGWSTS NEYSPGIDPLNSVYNQSYSDGGYAMFTNLNNVATGQTVMFDWYYAAGAVSELSDITSSLE QATSTNLQENSSSLVLADDYTITDLDSTDSVNVTVSSVQINTPTGLTLPANYTDDVIKNM LQITSNPVITSGSTTGTVSWNFNSGSDYTFNFLGRGQTLTLLYTLTATDSNGATATTVVT ISIDGANDAPRVVVDSQDSDIATISETNSTISTNGTLSIADPDMIDTSFSVSKSSVVVSG MTNGLTANTAALLNMLTVNTQNFDINWAFNSGNQYFNYLSAGETLTITYTIAVSDSSNAV TNKTITINITGTNDSVSLNTPATIYYTDTDGNDVFSATTSQLTASDLDKNTTFTYGIDNG TISGTTVTKTGTYGVLTLNTATGVYTYTPNSNAINALTSNSSETFTVTVNDGNGSIDTKS LVIQIESVNDAPLLGGNSSPNTFVENGSAVQVDSNITVTDLEGTSYDEGYVSFDIKTNKG ALDNLSISSIGGISLAGANVKYGNTVIGTVDSILNGQNGKELRIHLNDNAYSLQVQALAR AITFSNPSDNFNDSARSIDIKVNDGGNGGETSARYSIKTVTVNLQSVNDLPTINLGNSTF LVEKIIGQNDNGTLSLGNILSVADLDNNSLTVTIQTTNYGLITINSSILNGVNSSQIIGN GSRTVTITGTIEQINNTLNASNGITYVAGFGNDYITPGADYLKITAKDTLNGESSSQKLV MVLPAIPNIFSDNVVGKEDDVSNIIVNINNLVTDINDNGGTYVFGTGTPDITNSSGNITT NGSLTPFDNSTYIYDNSGKVIGYQLEHGKIILNEGKNRVDNTDFAKFTFIPNENWYGVQT FLYQFTSNDGEVSNIAQIAIFVTPVNDAPVISIVNNNITIDEDNPFVFENSNLITLLDLD VIDNTQILDLTLNVTNGKLELSQMTDLTILEGANNSSIIKIRGSLASLQNAISGLKYTPN QDYNGSDTLSIKLNDNTNIGEGNSLEDIKTINFVINPVNDAPEFTDQTDSVTEGEQISGI LPASDIDSSSITFSINGNAPTGFVLHNDGSYSFDSSSYDYIGRGETDTIIIPVTVTDAEG LTKTANFSITITGTNDAPTVSVENIDAKIPFGDTYTKDISNLFDDKDLSNVFTYQASNLP SGLTIDPNTGIISGRVSQSGNFVISITAIDSEGAKVTRTYNMLVVAPAQNQPAKPDSTPT IITNNPTGENPNNGTKLNNYADNSNNSAGVINFSSSDGFVVDTGKGFLDTKTSNNQETLS QNNSASDKNLANANNNNSNDSRTIQANVDLNVSTTGKVLFGQGSQDSFSIVGITIEDIKV QSDFIKVKVVDTNIAQSYVVTQIDGTALPVGLSFDPKTGNISGKIPADLDELKISIKAIN SDGTTRVLNLKLDLKQLKQKTQAEVNERFVGFKEQIAFENQKLDSYGSHLAKLFA NT seq 7548 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaaaagaagaaatttaaaaaaaccagtaattagtgtgttagagcaaagagttcttttt gatggtgcagcagttgcaactgctgttgatgttcttgataatagtagtttttcttcatca actacaaaagattcaacaacagtaaatgatgttacaaataatagtgctgaaaatagtgtt cataaagcacaagcagttcaaggatttgaaaaagatagaagagaagttgcttttgtagat ataacagtaaaagattaccaaactttagttgatggagttgggcagggtgttgaaacatat ctagtaagttctatggatgaaataaaatctattttacaaaatcaaactaatattgattca atccatattttatctcatggaaaaactggtgaaataacagtaggaaatgatatcttaaat aaaaatacactacaaaattttgatgaagttttagaaagtatgaaatcttctctaactcaa gatggtgatattttactttatggttgtaatgtaggaaatgatggaaaaggtcaagagttt atagatttattagcaagtgaaactcaagcagatattgcagcatctaatgatataactggt tcaaataatttaggtggtgattgggatttagaagctaaaagtggaactattgagacaaca gcaattgttgttaatgagtataaccatagtttggcttatcttacaacagatagtgatgga ggatttacctctagttctgaaataagtggttcaattgctactactgataaaataaattat gcaagaggtcctggttattataatgatttatataccttaagtggtgttgcaaatggaaca caagtaaaactttatattgcacaaggaacattaagtgacccttatattcaagtaacagat agcaatggaactataattgcacaagatgatgattcaggtgatagtggagctgcaaatggc tatgatgcatatgtaaaatttacttggaataatagttatactattagagcaactacatac agtactggtgcggtgggtacatatactatttatactgatacaggaacattagttataaaa ccagatacaactcccacattcacttcaagccctgtaactttaaatatttcagatacacca gatgataatagtatacctactagttcaggttcatttacggcaacagatgcagaaaatgat gctttaaattttagtggtggaggtacaaatagctttggtactttatctgtttcatcaaat ggttcttggacttggtcgccaaacaatgcttatataaattctcttacttctaatgctact acttcttatactgtttcagttagtgatgggattaatattagaaatcaaacatttactgta aatatagtatcagcaacaaatgatgcgccggttataacgtcatcaaactctgttagtttc caagaaaatacagctacaaatgtagctgcatatacaattactgcaactgatgctgaaaat aatactttaacatatagtatttcaggaactgattctcaatattttaatataaactctact actggtcaaataacattcaaaaatagccctgattatgagacaaaaacatcatatagtttg atgattactgctcttgaaactaatggcactggattatcagcaagcaaaatggttactatt tctattgctaatgtaaacgaaccacctattatagaatcaagtaatatctcaaattataca gaaaatggttctcctgttgttctttctccttctcttactatagataagggagaaacttca actttagcaagcgctcaaataagtattagttctggatttataagtggagatattttaaat tttgtaaatgatggttctacaatgggaaatattgtagcttcttacaatagtgcaacagga attcttactttaacatcttcaggtgcaactgcaacacttgctcaatggcaaagtgcatta agaagtatttcttatcattcaactagtgaaacattaagtttgacacaaatgacacgaact atttcttggaaagtaagtgatggaaatttagaaagtacagttgatacttctacattgaaa gtaacgggagttaatgatgctccaacaatttcggtttcaactccttctggatttacagaa actactactatggacaaacaaacactatcacaaaatggaacagtaacatttagtgatgtt gataataatgttaatataacttatagctacaataataatatttcatggagtggtggtaca cttaattctactctttcatctgcattaattgctggttttaatacaagtgcaacaaatgta tcttctggtactacatcgtggagttacaacgtaaataatgttgatttaaattttttagca gcaggagagacaatcactcttagttataatgtaattgctactgatattgcaggtgctact gctatgactacaattacttttacaataacaggaacaaatgatgctccagtatttggaaca gttacaactggctctactactataactgctccaactgctgggacaacaaatccaaatgca ggaatagaaacttttaataatggattgcttagatttggaaatggttcaattgattcagtt aatgcaagtacaggtatgttagaacaacctttttattacaaagatggaaattggtatcaa ttaacatatagtacatatcaattaaatatggcgattgctgctgattataacaatggaagc gctaaaacagatgtagattggaatttagaaggtacagttaatcttactccaacatttaca aatacaactgttaataactcaggatttaattcatcaactggtacaggaactatcgtttgg acaggagaaatagtagttggaagtgcacacttaaaagttactaatgtttatactttagaa gcaggtgctaaatatattaaagcaaatacatatatcgaaaatataggttctacttcaact gagaatttaagattctgggtaggaacaagagatgattatgtagcaggaagtgatagtcca gctaaacaaaaaggtaatattgtagatggtgaattccagatgatttcaaattcatctgaa caagcaaaagctattaaaatatatacaggtacaggagcaaatgcaacagcagtattattt tattcaactaattcaaatgtaaatacagttattgctccaagatatggatggagtacatca aatgaatattcaccaggaattgatcctttaaattcggtttataatcagtcttattctgat ggtggatatgcaatgtttacaaacttaaataatgttgcaactggtcaaacagttatgttt gactggtattatgcagctggagcagtatctgaattatcagatattacttctagtttggaa caagcaacatcgacaaatcttcaagaaaatagctcttctttagttttagcagatgactat acaataacagatttagattcaactgatagtgtaaatgtaacagtaagttctgttcaaatt aatacgccaactggattaacactaccagcaaattatactgatgatgtaataaaaaatatg ttacaaataacatctaatccagttataactagtggttcaacaacgggaacagtatcttgg aactttaattcaggaagtgattatacatttaatttcttaggtagaggacaaacattaact ttattatatactttaactgcaacagatagtaatggtgcaacagctacaacagtagttacc atctcaattgatggagctaatgatgctccaagagtagttgttgattctcaagatagcgat attgcaactattagtgaaacaaattctactatttctacaaatggtactttaagtatagct gatccagatatgattgatacgagtttttcagtaagtaaatcaagtgtagttgtttctggt atgacaaatggattaactgcaaatacagcggcattattaaatatgctaacagtaaataca caaaattttgatataaattgggcatttaactctggaaatcaatattttaactatttatct gcaggagaaacattaactataacttatacgattgcagtttcagattcaagtaatgcagtt acaaataaaacaattactattaacataacaggaactaacgatagtgtttctttaaatact cctgcaacaatatattatacagatacagatggtaatgatgtatttagtgctactacttca caattaactgcaagtgatcttgataaaaatacaacatttacttatggaatagataatgga actatatctggaacaacagttacaaaaactggaacttatggagttttaactttaaacaca gcaactggagtatatacatatacacctaattctaatgctataaatgctttaacatcaaat agttcagaaacatttactgttacagtaaatgatggaaatggttctattgatactaaaagt ttagtaattcaaatagaatcagtaaatgatgcgccattattaggtggaaattcatcacca aatacttttgtagaaaatggaagtgctgtacaagttgattcaaatattacagtaacagat ttagaaggtactagttatgatgaaggttatgtatcatttgatataaaaacaaataaagga gctttggataatttatcaatctcttctattggtgggatttcacttgctggagcaaatgta aaatatggaaatactgtaattggaacagtagattctattttaaatggtcaaaatggaaaa gagttaagaatccatttaaatgacaatgcatactctttacaagttcaagcattagctaga gcaataacttttagtaatccatctgataattttaatgatagtgcaagaagcatagatatt aaagtaaatgatggaggaaacggtggtgaaacatctgctagatatagtataaaaactgtt acagttaatcttcaatctgtaaatgatttaccaactataaatttaggtaattctacattc ttagttgaaaaaataattggacaaaatgataatggaactttatcattaggtaatatttta agtgtagcagatttagataacaattctttgactgtaacaattcaaacaactaattatgga ctaattacaataaatagttcaattttaaatggagttaattctagtcaaattataggaaat ggttcaagaactgtaacaataactggtacaattgaacaaattaataatacattaaatgct tctaatggtataacttatgttgctggatttggaaatgattatatcactcctggtgctgat tatcttaaaattacagcaaaagatacattaaatggagaatcttcttctcaaaaattagtt atggtattacctgcaattccaaatatctttagtgataatgttgttggtaaagaagatgat gtttcaaatataattgtaaacataaataatctagttactgatataaatgataatggagga acttatgtatttggtacaggaactcctgatataactaactcaagtggaaatataacaaca aatggaagtttaacaccatttgataatagtacatatatttatgacaattcaggaaaagtt ataggatatcagttagaacatggaaaaataatattaaatgaaggtaaaaatagggtagat aatacagattttgctaaatttacatttattcctaatgaaaattggtatggtgtacaaaca ttcttatatcaatttacttcaaatgatggtgaagtaagtaacattgcacaaattgcaata tttgtaactcctgtaaatgatgctcctgttattagtattgtaaataataatattacaata gatgaagataatccttttgtatttgaaaatagtaatttaataacgctattagatttagat gttattgataatactcaaatattagatttaacgttaaatgtaactaatggtaaattagaa ctatctcaaatgacagatttaacaattttagaaggagctaataattcatctattattaaa attagaggaagtttagctagtttacaaaatgcaatttcaggattgaaatatactccaaat caagattataatggtagtgatactttatcaataaaactaaatgataacacaaatattgga gaaggaaatagtttagaagatataaaaactatcaattttgtaatcaatcctgttaatgat gctcctgaatttacagatcaaactgatagtgtaacagaaggagaacaaatctctggtatt ttaccagcaagtgatattgatagtagttcaatcacatttagtataaatggaaatgctcct acaggatttgtattacataatgatggttcttatagttttgattcttcaagttatgattat attggaagaggagaaacagatacaattattattcctgtaactgttacagatgcggaaggt ttaacaaaaacagcaaatttctcaataacaattactggaacaaacgatgctccaacagtt tctgtggaaaatattgatgctaaaattccttttggagacacttatacaaaagatatttca aatttatttgatgataaagatttatctaatgtatttacttatcaagcatcaaatttacca tcaggtttaacgattgatccaaatacaggtattatttcaggaagagtttctcaatcagga aattttgttatatcaataactgcaattgattctgaaggtgcaaaagtaacaagaacatat aatatgttagtagttgcacctgcacaaaatcaaccagcaaaacctgattctacacctaca ataattacaaataatccaacaggtgaaaatccaaataatggaactaaattaaataattac gcagataattcaaataatagtgctggagttattaattttagttcaagtgatggatttgtt gttgatactggaaaaggtttcttagatacaaaaacaagtaataatcaagaaactttatct caaaataacagtgcttcagataaaaatttggcaaatgcaaataataacaattcaaatgat tcaagaactattcaagcaaatgttgatttaaatgtatcaacaactggtaaagttttattt ggacaaggaagtcaagattctttctctattgttgggattacgattgaagatataaaagtt caaagtgattttattaaagtaaaagttgttgatacaaatattgctcaaagttatgttgtg acacaaattgatggaacagctcttcctgttggactatcttttgatccaaaaactggtaat ataagtggaaaaattcctgctgatttagatgagctaaaaattagtattaaagctataaat tcagatggaacaacaagagtgttgaacttaaaacttgatttaaaacagttaaaacaaaaa acacaagctgaagttaatgaaagatttgtaggatttaaagaacaaatagcttttgaaaat caaaagttagatagttatggttctcatcttgctaaactttttgcctaa

DBGET integrated database retrieval system