KEGG   Agaricus bisporus var. bisporus H97: AGABI2DRAFT80008
Entry
AGABI2DRAFT80008  CDS       T03140                                 
Symbol
AGABI2DRAFT_80008
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K14411  RNA-binding protein Musashi
Organism
abv  Agaricus bisporus var. bisporus H97
Pathway
abv03015  mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:abv00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03015 mRNA surveillance pathway
    AGABI2DRAFT80008 (AGABI2DRAFT_80008)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:abv03019]
    AGABI2DRAFT80008 (AGABI2DRAFT_80008)
Messenger RNA biogenesis [BR:abv03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Other transport factors
     AGABI2DRAFT80008 (AGABI2DRAFT_80008)
SSDB
Motif
Pfam: RRM_1 RRM_7 RRM_PARP14_3
Other DBs
NCBI-GeneID: 18086769
NCBI-ProteinID: XP_006457568
JGI: Agabi_varbisH97_2_80008
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 354 aa
MFIGGLNWDTTDDTLRDYFTQFGKVDACTIMRDAAGRSRCFAFLTFEDPASVNAVMVREH
VLDGKIIDPKRAIPRQEHQRATKLFIGGLPGSVTSESMREFFSQFGKVIDSTVMLDRETG
RSKGFGFVSFENTDVSSFLGFGNLEIDGKLLAQPRYQRDSQFSEDGQPEQATGGTFQSGS
GGQTRFANAGGQQGNFSGAAGGGGGAPQTPFDPQALATLYTRMMQMAGGGMNPAMMGGMG
GMNPMMGGMGGPGFNNGMRPGMGMGMGGMGMGGMPAGMGGMGQAAMGGMGRGMMQGNAGA
GAGGAGGNMGGNIPRGPRGGSGGPGAGGSMPSNASVGPQRTGQRGQHNFHPYAR
NT seq 1065 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgttcatcggtggacttaattgggatacgacagatgacactctcagagactactttact
cagtttggcaaagtcgatgcttgtacaatcatgagagatgctgcgggtcgttctcgatgc
tttgctttcctgacctttgaagacccagcaagtgtaaatgctgtcatggtacgcgaacat
gtactcgacggtaaaattattgaccccaaacgggcgattccgaggcaagagcatcaacga
gccactaagcttttcatcggtggccttccgggaagtgtcacatcagagtctatgcgcgaa
ttcttctcgcaatttggcaaagtcattgattcaacagttatgctggatagagagacagga
cgaagtaaaggttttggtttcgtttcatttgagaatacggacgtttcctcgttcctcggt
tttgggaatcttgaaattgatgggaaattgcttgctcaacctcgatatcaacgtgacagc
caatttagtgaagatggtcaaccagagcaagctacgggcggcactttccaaagtggcagt
ggaggacaaactcgtttcgcgaatgccggtggtcaacaagggaactttagcggtgcagcg
ggtggtggtggaggcgcaccacaaacaccgttcgatcctcaagctttagccacgctatat
acacgtatgatgcagatggctggtggagggatgaatcccgctatgatgggtggtatgggt
ggtatgaatcctatgatgggcggaatgggtggaccgggatttaataatggtatgagacct
ggtatggggatggggatgggggggatggggatgggtggtatgcctgctggtatgggggga
atgggacaggctgctatgggtggaatgggtagaggtatgatgcagggtaatgctggtgca
ggtgcgggtggtgcgggtggtaatatgggtggtaacataccgagaggaccgagaggtgga
tctggaggacctggtgctggtggtagtatgccatctaatgcgagtgtgggaccacagaga
acaggtcaaagaggtcaacataactttcatccatacgctcggtaa

DBGET integrated database retrieval system