Acinetobacter baumannii 1656-2: ABK1_3000
Help
Entry
ABK1_3000 CDS
T01819
Name
(GenBank) putative cell-surface adhesin
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
abx
Acinetobacter baumannii 1656-2
Pathway
abx02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
abx00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
ABK1_3000
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_13
Big_6
Glucodextran_B
Big_3_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADX04634
LinkDB
All DBs
Position
complement(3168635..3173098)
Genome browser
AA seq
1487 aa
AA seq
DB search
MPEIQIIAKDNHKTLVTTEGTSAKLSEASVVLVKVAASDVLVVNREGTNAVIRLKNGETI
VIEGFFSGTAEPKDNSLVFQDENGQLIWAKFKDAENDADADSDADADADSDVEPQALLGE
DLPAALPAEAPQELVSDVIYQPISSIEPLLYHDAGVNPWLWAAIPLVAGGIIAAASNHDS
DDDSSAPVDTTPPSTDGVTFSVDPVTSDNVINASEASGNVTITGVLKNIPADAANTAVTV
VINGVTYNATVDKAAGTWTVSVPGSGLVADADKTIDAKVTFTDAAGNSSSVNDTQTYTLD
TTAPNTPVIDPVNGTDPITGTAEPGSTVTVTYPDGSTKTVVAGPDGTWTVPNPGLNDGDE
VTAVATDPAGNTSGPGTAIVDAVGPNTDGVNFAVDSVTADNVINASEAAGNVTITGILKN
VPSDAAATAVTIVINGVTYTATVDSAAGTWTVSVPGSGLVADTDKTIDAKVTFTDAAGNS
STVNDTQTYTLDTAAPSAPVIDPVNGTDPITGTAEPGSTVTVTYPNGDTATVVAGPDGSW
SVPNPGLNDGDEVEAIATDPAGNPSLPGTAIVDAVGPNTDGVNFTVDSVTADNVINASEA
SGNVTVTGVLKNVPADAANTVVTVVINGQTYTATVDSTAGTWTVSVPGSDLTADADKTID
AKVTFTDAAGNSSSVNDTQTYTLDTTAPDAPVINPVNGTDPITGTAEPGSTVTVTYPNGD
TATVVAGPDGSWSVPNPGLNDGDEVEAIATDPAGNPSLPGTAIVDAVGPNTDGVNFTVDS
VTADNVINASEASGNVTVTGVLKNVPADAANTVVTVVINGQTYTATVDSAAGTWTVSVPG
SGLVADTDKTIDAKVTFTDAAGNSSSVNDTQTYTVDTTAPDAPVINPVNGTDPITGTAEP
GSTVTVTYPDGTTATVVAGTDGSWSVPNPGNLVDGDTVTATATDPAGNTSLPGTGTVSAD
ITAPVVALDDVLTNDSTPALTGTVNDPTATVVVNVDGVDYPAVNNGDGTWTLADNTLPTL
ADGPHTITVTATDAAGNVGNDTAVVTIDTVAPNAPVLDPINATDPVSGQAEPGSTVTVTY
PDGTTATVVAGTDGSWSVPNPGNLVDGDTVTATATDPAGNTSLPGTGTVSADITAPVVAL
DDVLTNDSTPALTGTVNDPTATVVVNVDGVDYPAVNNGDGTWTLADNTLPALTDGPHTIT
VTATDAAGNVGNDTAVVTIDTVAPNAPVLDPINATDPVSGQAEPGSTVTVTYPDGTTATV
VAGPDGSWSVPNPGNLVDGDTVTATATDPAGNTSLPGTGTVSADITAPVVALDDVLTNDS
TPALTGTVNDPTATVVVNVDGVDYPAVNNGDGTWTLADNTLPTLADGPHTITVTATDAAG
NVGNDTAVVTIDTVAPNAPVLDPINATDPVSGQAEPGSTVTVTYPDGTTATVVAGTDGSW
SVPNPGNLVDGDTVTATATDPAGNTSLPGTGTVQQTSQHLWLRWMTC
NT seq
4464 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcctgagatacaaattattgccaaggataatcataaaaccttggtaaccacagaggga
acttctgcaaaactttcagaagcgtcagttgtgttggtgaaagtggctgccagcgatgta
ttggtagtaaatagggagggtaccaatgcagtcatacgtctgaaaaatggcgagactatt
gttattgaaggcttctttagtggaacagctgagcctaaagataatagtctggttttccaa
gatgaaaatggacagttgatttgggcaaaattcaaagatgctgaaaatgatgcagatgct
gatagtgatgcggacgcagatgctgacagtgacgtcgaaccacaagcacttttaggtgaa
gatttaccagcagctctaccagcagaagctccacaagagttggtatctgatgttatttac
cagcctatttcttcaattgaacctctactttatcatgatgcaggcgtgaacccatggtta
tgggctgctattccactagttgcaggcggtattatcgctgcagcatcaaatcatgatagt
gatgatgattcttcagcacctgttgataccactccaccaagtaccgatggcgtaactttc
tcggttgaccctgttacttctgataatgtgattaatgcatcagaagcatccggtaatgtc
actattacaggtgttttgaaaaacattccagcagatgcggccaacacggccgttacagtt
gttattaatggggtaacttataatgcgactgtagataaagcagcaggtacatggacagta
agtgtaccgggcagtggcttagttgcggatgcagataagacgattgatgccaaagtaacg
tttacagatgcagcaggtaacagcagcagtgttaacgatacacaaacttatacacttgat
accactgcaccaaatacaccagtgattgacccagttaacgggacagacccgattacaggt
acagcagaacctggttcaacagtgactgtgacttatccggacggtagtacgaaaactgtt
gttgcaggaccagatggtacttggactgtgccaaacccaggtttgaatgatggcgatgaa
gttacagctgtagcaacggaccctgctggcaatacatcaggaccaggaacagctattgtt
gatgcagttggtccaaatacggatggtgttaattttgctgttgattcggtaacagctgat
aatgtgattaatgcatcagaagcggctggcaatgtcacgattacaggtatattgaaaaac
gttccttcagatgcggctgctacagccgttacaattgttattaatggggtaacttatact
gcaactgtagacagtgcagcaggtacatggacagtaagtgtaccaggtagcggtttggtt
gctgatactgataaaacgattgatgctaaagtaaccttcactgatgcagcaggtaatagc
agcacagttaacgatacacaaacttatacactggatacagctgctccttcagcgccagta
attgaccctgttaacgggacagacccgattacaggtactgcagaacctggttcaaccgta
acagtaacctatcctaatggtgacacagcaacagttgtagcaggacctgatggcagctgg
tcagtaccaaacccaggtttaaatgatggtgacgaagttgaggcaattgctacagatcca
gcaggcaacccatctttaccaggtacagctattgttgatgcagttggtccaaataccgat
ggcgttaacttcacggttgattcagtaacagctgacaatgtgattaatgcatcagaagcg
tcaggcaacgttactgttacaggcgtattgaaaaatgttccggcagatgcagcaaataca
gtggtcactgttgtgatcaatggccagacgtatactgcaactgtagatagcacagcgggc
acatggacagtaagcgtaccaggtagtgacttgactgcggatgcagataagacaattgat
gccaaagtaacgtttacagatgcagcaggtaatagcagcagtgttaacgatacacaaact
tatacacttgataccactgcacctgatgcaccagtaattaacccggttaacgggacagat
ccaattacaggtactgcagagcctggttcaaccgtaacagtaacctatcctaatggtgac
acagcaacagttgtagcaggacctgatggcagctggtcagtaccaaacccaggtttaaat
gatggtgacgaagttgaggcaattgctacagatccagcaggcaacccatctttaccaggt
acagctattgttgatgcagttggtccaaataccgatggcgttaacttcacggttgattca
gtaacagctgacaatgtgattaatgcatcagaagcgtcaggcaacgttactgttacaggc
gtattgaaaaacgttccggcagatgcagcaaatacagtggtcactgttgtaatcaatggt
cagacgtatactgcaactgtagacagtgcagcaggtacatggacagtaagtgtaccaggt
agcggtttggttgctgatactgataaaacgattgatgccaaagtaacgtttacagatgcg
gcaggtaatagcagcagtgttaacgatacacaaacatatacagttgataccactgcacct
gatgcaccagtaattaacccggttaacgggacagacccgattacaggtacagcagagcct
ggttcaaccgtgactgtgacttaccctgatggcaccactgcaacagtggtagcaggcaca
gatggtagctggtcagtaccaaacccgggtaacctggtggatggcgatacagtgactgca
acagcaactgaccctgcaggcaacacttcattgccaggtacaggcacagtttcagcagac
atcacagcacctgtggttgcgctggatgacgtgttgacgaatgacagcacaccagcactt
actggtacagtgaacgatccgacagccactgtagttgtcaatgtggatggcgttgactat
ccggcagtgaacaatggtgacggcacctggacgcttgcagacaatacacttccaacactc
gcagacggtccacacaccattaccgtgactgcaacagatgcagcaggtaacgtaggtaac
gatactgcagtggtgaccattgatacggttgcaccaaatgcaccggtgcttgatccgatc
aatgcaacagacccagtgagcggtcaggcagagcctggttcaaccgtgactgtgacttat
cctgatggcaccactgcaacagtggtagcaggcacagatggcagctggtcagtaccaaac
ccaggtaacctggtggatggcgatacagtgactgcaacagcaactgaccctgcaggcaac
acttcattgccaggtacaggcacagtttcagcagacatcacagcacctgtggttgcgctg
gatgacgtgttgacgaatgacagcacaccagcacttactggtacagtgaacgatccgaca
gccactgtagttgtcaatgtggatggcgttgactatccggcagtgaacaatggtgacggc
acctggacgcttgcagacaatacacttcctgcgttaactgatggtccacacaccattacc
gtgactgcaacagatgcagcaggtaacgtaggtaacgatactgcagtggtgaccattgat
acggttgcaccaaatgcaccggtgcttgatccgatcaatgcaacagacccagtgagcggt
caggcagagcctggttcaaccgtgactgtgacttatcctgatggcaccactgcaacagtg
gtagcaggaccggatggtagctggtcagtaccaaacccaggtaacctggtggatggcgat
acagtgactgcaacagcgactgaccctgcaggcaacacttcattgccaggtacaggcaca
gtttcagcagacatcacagcacctgtggttgcgctggatgacgtgttgacgaatgacagc
acaccagcacttactggtacagtgaacgacccgacagcaactgtagttgtcaatgtggat
ggcgttgactatccggcagtgaacaatggtgacggcacctggacgcttgcagacaataca
cttccaacactcgcagacggtccacataccattaccgtgactgcaacagatgcagcaggt
aacgtaggtaacgatactgcagtggtgaccattgatacggttgcaccaaatgcaccagta
cttgatccgatcaatgcaacagacccagtgagcggtcaggcagagcctggttcaaccgtg
actgtgacttatcctgatggcaccactgcaacagtggtagcaggcacagatggtagctgg
tcagtaccaaacccaggtaacctggtggatggcgatacagtgactgcaacagcaactgac
cctgcaggcaacacttcattgccaggtacaggcacagttcagcagacatcacagcacctg
tggttgcgctggatgacgtgttga
DBGET
integrated database retrieval system
