Aristolochia californica: 137949479
Help
Entry
137949479 CDS
T10486
Name
(GenBank) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
acak Aristolochia californica
Pathway
acak03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
acak00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
137949479
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
acak03019
]
137949479
Messenger RNA biogenesis [BR:
acak03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
137949479
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
137949479
NCBI-ProteinID:
XP_068651628
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
450 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFVGGISWDTSEDRLNEYFGKYGEVLQTVIMRDKNTGRPRGFGFVVFADPSIL
DRVLQDKHTIDGRMVEAKRALSREEQHTSSRPGSNSNTGRSYTGAGNIKTKKIFVGGLPP
TLNEEGFRQYFENYGLVTDVVIMYDQTTQRPRGFGFISFDAEDAVDRVLHKTFHELNGKL
VEVKRALPKDANPGSTGRSGGAYPGYGGSGVNTNSYDGRMDGNRYMQPQAAGGGYPAYGS
SGYGAPGYGYGTAGNGVGYGYGVGGYGGTNAGYSGTPGAYGNPNAHSAGYVGGPPGAPRS
PWNTQAPSSYGSTGYGAGAGYGAVAGWGGSAGGGGAGSAPAGQSPSGAPGYGYGGYGGNE
GTYGNQTGYGLVGGRGSSVPNSSTGGEQQGGGAGYMGGGYGDANGNSGYTNAVWRSDTSQ
GAGFGSSQGNGQVGYGSGYGGHQSRQAQQQ
NT seq
1353 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcaaggaaagcttttcgttggggggatttcatgggatacatcagaggat
aggcttaatgagtattttggtaagtatggggaagtcttacagactgttataatgagggat
aaaaatacaggaaggccgaggggtttcgggtttgtggtttttgcagatccttcgattcta
gatagggttcttcaggacaaacatacaatcgatggccgaatggtggaagctaagagggct
ttgtcgagagaggaacagcacacctcctctagacctgggagcaactctaatacagggaga
agttacactggagctggcaatattaaaaccaagaagatttttgttgggggccttcctcct
actttaaatgaggaaggatttcgccagtattttgagaattatggacttgtaactgatgta
gtcataatgtatgatcagaccacccagcgacctagggggtttgggtttatctcatttgat
gcagaggatgctgttgatagagttctacacaaaactttccatgaactgaatggtaaactc
gtggaagttaaacgtgctcttcctaaagatgctaatcctggaagcacgggtcgttctggt
ggggcctatccaggttatggtggttctggtgtgaataccaattcttatgatggtagaatg
gatggcaacagatacatgcagcctcaggcagctggaggtggctatcctgcttatggatct
tctggctatggagcacctggttatgggtatggtactgcaggtaatggtgttggatatggt
tatggtgtaggtggctacggtggcacaaatgctggctacagtggcactccgggagcctat
ggaaatccaaatgctcatagtgcaggttatgttggtggcccacctggtgctccaagaagt
ccatggaatactcaagccccttcaagctatggctctactggctatggtgctggtgcaggc
tatggagctgtggcaggctggggtggctctgctggtggcggtggggctggttctgcacct
gctggtcaatcacctagtggagctcctggatatggttatggtggctatggaggtaatgag
ggaacatatgggaaccagactggttatgggctggttggtgggcgtggttctagtgtccct
aatagcagcactggtggagagcaacaaggtggaggggctggttatatgggtggtggatat
ggtgatgctaatggaaattcaggatacactaatgcagtttggaggtctgatacttcacaa
ggggcaggttttgggtcttctcagggaaatggtcaggttggatatggtagtgggtatggt
ggtcatcagtcaaggcaggcccagcagcaataa
DBGET
integrated database retrieval system
