Acinetobacter calcoaceticus: BUM88_05145
Help
Entry
BUM88_05145 CDS
T05452
Name
(GenBank) TonB-dependent siderophore receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
acal
Acinetobacter calcoaceticus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
acal00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
acal02000
]
BUM88_05145
Transporters [BR:
acal02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
BUM88_05145
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AQZ81040
LinkDB
All DBs
Position
complement(1070837..1072957)
Genome browser
AA seq
706 aa
AA seq
DB search
MDLKLRLLPLSIAQICCLSPAFAETNHSSTTLATIKIKAQQASDQTYKVDSSNSATRSEI
ALKDTPQSVSVVTQKVIEDIGATRLIEALDLAGGVGRANNFGGQGLTGFNLRGFTSGEFY
RNGFPVNRGYPNAPDSNTIERIDVLRGPSSSLYGRGDPGGTFNLISKTPKSEQQTTLGAQ
LNSEGLYRTTVDTTGTIPNAENIGYRLNVIAEGGDSYRDHVESKRYGIAPVIQWQVSDAT
KVTFEADILRNQHPLDRGHTRYPAQKSFNSSPETYLWETGKYNNRIYNDNNMTQLRVEHD
LGNDWKLNAGIQYLNGKLHGYAVEANGIQNDGETLGRNYNYRELKWQDTDAQINLTGNFQ
LLGLAHTLVTGLEYENYDYKSYIIRSSGDIGSYPINIYDPVLGQPLPELKTVTTHDRENL
KTTAIFVQDQIDLNERLSALLGLRFEHYEHDYKDFRPDKPNWNTSHDAFIPRLGVVFKAR
DDLSIYSNAAKSFKPNTGASHSGEGFDPEEGMAYELGFKWLALDNMLSVDSAIFYAEKEN
VLTDDPLYPNQNKKVAAGEVRSQGIELNIAGQITPAWKIIGGYAYTDAEVTKDNTLQKGT
ALANIPKNSFNLLNIYEFQGGALQGLGLGVNQKYIDKRAGQTANSTYTMKGYAVTDLVSY
YQATPKLRLNLDLKNIFDKVYDESAFNLYAYPGEPRTVQFGMSYTF
NT seq
2121 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatcttaagcttcgcctcctccccctgagcattgctcaaatttgctgtttatcacct
gcttttgcagaaacaaatcattcttcaacgactcttgcaacgattaaaattaaagctcaa
caagcatctgaccaaacttacaaagtcgatagctctaatagcgcaacacgtagcgaaatt
gcattaaaagacacgccacaatcagtgagtgttgtaacccaaaaggtaattgaagatatc
ggtgcaacacgcttaattgaagctcttgatttagcaggtggcgttggacgagcgaataac
tttggtggtcaaggcttaactggttttaaccttcgtggtttcaccagtggtgaattttat
cgtaacggatttccagttaaccgtggttatccaaatgcaccagatagcaacaccattgaa
cgtatagacgttttacgtggcccctcttctagcttatatggccgtggtgatccaggcggt
acgtttaacttaatttctaaaacaccgaagtctgagcaacaaaccactttaggtgctcag
cttaacagtgaaggtttataccgtaccactgtagacactacaggcactattccaaatgca
gaaaatattggttatcgcctaaatgtgattgcagaaggtggtgatagttatcgtgaccat
gtcgaatctaaacgatacggaattgcacctgtcattcaatggcaagtttctgacgccact
aaagtcacttttgaggccgatattttacggaatcaacatccacttgaccgtggacatacg
cgttatcctgcacaaaagtcttttaatagttcaccagaaacatatttgtgggaaacaggt
aaatataacaaccgaatctacaatgataacaatatgactcaattacgagtcgaacatgat
cttggaaatgactggaagctcaatgcgggtatccaatacttaaatggcaaattgcatggc
tatgcagtagaagcaaatggcattcaaaatgacggcgaaactttaggccgaaattacaac
taccgcgaattaaaatggcaagacactgatgcacaaattaacctaacaggtaatttccaa
cttttaggtttagcacatactttagtgactgggcttgaatatgaaaactatgattacaag
tcatacattattcgctcaagtggagatatcggtagctaccctattaatatttatgatcca
gttttagggcaaccactacccgaacttaaaaccgttaccacccatgaccgtgaaaactta
aaaacaaccgccatttttgtacaagatcaaatcgatttaaatgaacgtttaagcgcgcta
ttaggtttacgttttgaacactatgaacatgactataaagattttcgaccagataaacca
aactggaataccagtcatgatgcctttattcctcgtttaggggtagtttttaaagcccgt
gatgacctttcaatctatagtaacgcagcaaaatcatttaagccaaatacaggtgcaagt
catagtggcgaaggctttgaccctgaagaaggtatggcttatgagctagggtttaaatgg
ctagctctcgacaatatgttgtcggttgactctgctattttttatgcagaaaaagaaaat
gtcttaacggatgatcctttatacccaaatcaaaataaaaaagttgctgctggtgaagtt
cgcagccaaggtattgaattaaatattgcagggcaaattacgcctgcttggaaaattatt
ggtggatacgcatatacagatgctgaagtgactaaagacaatactttgcaaaaaggaacc
gctttagccaatattccaaagaatagttttaaccttttaaatatttatgaatttcagggt
ggagctttacaaggtttaggtctaggggttaatcaaaaatatattgataagcgcgcagga
caaacagccaatagtacctacaccatgaaaggctatgcggttacagatttggtttcttat
tatcaagcaacaccaaaacttcgtcttaacttagatttgaagaatatttttgacaaagtt
tatgatgaaagtgcctttaatttatatgcttatccaggtgaaccacgtactgttcagttt
ggcatgagctatacgttctaa
DBGET
integrated database retrieval system