Aquarana catesbeiana (American bullfrog): 141107789
Help
Entry
141107789 CDS
T11018
Name
(RefSeq) fibrillin-2-like
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
acat Aquarana catesbeiana (American bullfrog)
Pathway
acat04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
acat00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
141107789
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
acat00536
]
141107789
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
acat00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
141107789
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
TB
hEGF
FXa_inhibition
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_Teneurin
EGF_MSP1_1
Cadherin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
141107789
NCBI-ProteinID:
XP_073454868
LinkDB
All DBs
Position
LG01:complement(600764737..600988565)
Genome browser
AA seq
2875 aa
AA seq
DB search
MGVVWLAKFMLGCTALWCVEKAQGQLEVGDHQVDRFAGYEDRQALRVRRRGQDTLRGPNV
CGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNSCGDGFCSRPNMCTCLNGQLSPTCGAGAVLN
CNVRCMNGGTCNEDSCVCQKGYSGTHCGQPVCENGCQNGGRCIGPNRCACVYGFTGPQCE
RDYRTGPCFTQISNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATIGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRGFIPN
IRTGACQDVDECQAIPGLCQGGNCLNTVGSYECKCPAGHKQSETSQKCEDIDECSTIPNV
CDGGECTNTAGSYVCICPRGFTTSPDGSRCIDQRKGSCFSALIGGRCAGELPGQYTKGQC
CCETGRCWAIGQTPEMCPVRGSDEYRRLCIESLPLGPSYPGTYPVGPGGVGPGGVGPGGN
GQGGFGPNGFGPVVVGPNGQGTINGLPSVGTDIGTATLNQTGDICKHFTNLCQNGRCIPT
PNSYRCECNMGYKQDSRVECIDFDECASSPCIHGDCVNTQGSYHCRCHEGFQSNPTKQAC
IDIDECIMNGVMCRNGRCVNTEGSFQCICNAGFETTPDGKNCVDHDECATTNMCLNGMCI
NEDGSFKCICKPGFVLAPNGRYCVDVDECQTPGICMNGRCINTEGSFRCECLGGLTIGID
GRVCVDTHMRSTCYGGIKKGTCARPFPGAVTKSECCCANPDHGFGEPCQPCPAKNAAEFQ
ALCSSGIGITADGRDINECALNSEICPNGICENLRGSYRCICNVGYESDTSGKNCVDVDE
CAVNRLLCDNGLCRNTPGSYTCTCPKGYVFKSESETCEDVNECASNPCVNGVCRNNAGSF
VCECSFGSKLDPTGTICVDSMKGTCWLNIQDGRCEVNINGATLKSECCATLGAAWGSPCE
RCEIDSACPRGYSRKKGVACEDVNECEVFPGVCPNGRCVNTAGSFKCECPEGLTLDSSGR
TCVDIRAEQCYMKWDEDECAAPLPGKYRMDMCCCSVGAAWGVECEECPKPGSEEFKNICP
RGPGFANRGDVLSGRPFFKDVNECKVFNSLCTHGTCRNSIGSFRCICDNGFALDAEERNC
TDIDECRISPDLCGHGTCVNTPGSFECECFEGYESGFMMMKNCMDIDECERDPLLCRGGS
CINTEGSFECICPHGHELTAEGNACVDINECSLSDNLCKNGRCVNMIGTYQCSCDSGFQS
TPDRQGCMDIDECSIMNGGCDTQCTNSEGSYECSCSEGYALMPDTRSCADIDECEDNPDI
CDGGQCTNIPGEYRCLCFDGFMASLDMKTCIDVNECDLNPNICLHGECENTKGSFICHCQ
LGYFVKKGTTGCTDVDECEIGAHNCDVHASCVNVPGSFKCKCRTGWVGDGLKCVDLNECT
TEDHNCNINANCVNTPGSYRCTCNEGFNGDGFTCSDVDECADNVNLCDNGHCLNAPGGYR
CECEMGFTPTEDSKACQDIDECTFQNICVFGTCQNLPGMFRCVCDDGYELDRSGGNCTDV
NECADPVNCINGLCVNTPGSYLCNCPQDFELNPTGVGCVDTRVGNCYLETLTRGDASLAC
SAEIGVGVTRASCCCSLGRAWGNPCESCPLANSTEYKTLCPGGEGFRPNPITVILEDIDE
CQELPGLCQGGNCVNTFGSFQCECPLGYYLNEETRICEDIDECSAHIGICGPGTCYNTLG
NYTCVCPPEYMQVNGGNNCMDMRKSVCYRNYNDTCENELSTNMTKKMCCCSYNIGKAWNK
PCEPCPVPASADYQVLCGNQAPGFIIDIRTGKPMDIDECSEIPAICTNGVCINQIGSFRC
ECPMGFSYNNILLICEDIDECSSGENLCQMNADCINIPGSYRCECSSGYKLSPSGACVGR
NECNEIPNVCSHGTCKDTPGSYICICHNGFKASGDETMCMDIDECDRQPCGNGTCKNTVG
SYNCLCFPGFELTHNNDCMDIDECSSLVGQVCRNGQCINNIGSFQCLCQEGYEITPDGKN
CIDINECVSLPGTCAPGTCQNLEGSFRCICPPGYAVQNDNCIDIDECDEEPNICLFGTCS
NTPGSFQCICPPGFILSDNGRRCFDTRQSFCFTQFDNGKCSVPKAFNTTKSKCCCSTMAG
EGWGDPCELCPQEGTVAFQELCPYGLGSIPNAGDTREDVNECAENPGVCVNGVCINTDGS
FRCECPFGYNLDYTGVNCVDTDECSIGNPCGNGTCSNVVGGFECACDEGFEPGPMMTCED
INECTNPLLCAFRCINTYGSYECTCPSGYTLREDRRMCKDLDECAEGLHDCESRGMMCKN
LIGTFMCICPPGMQRRPDGEGCMDENECRTKPGICPNGRCVNTIGSYRCDCNEGFQVSAS
GTECIDTRQGSCFTEVLQTMCQLSSTNRNMVTKSECCCNVGRGWGNQCELCPLPGTGPFK
KMCPHGPGFTTDGRDIDECKVLPNLCKNGQCINTIGSFRCHCNLGYTTDITGTTCVDLDE
CSQSPKPCNFICKNTEGSYQCSCPRGYILQEDGKTCKDLDECSTKQHNCQFLCVNTIGSF
NCKCPPGFTQHQSSCIDNNECSAQPTLCGSRGMCQNNPGSYVCECQKGFSLDNSGSNCED
VDECDGNHRCQHGCQNVLGGYRCGCPQGYVQHYQWNQCVDENECSSQSSCGSASCYNTLG
SFKCICPSGFDFDQSFGGCQDVDECSSGASPCSYGCSNTDGGYQCGCPGGYFRVGQGHCV
SGLGFGKGSYLPAPVEEDEENILSPENCYECKINGYPKRGRQRRSTNSTSEHENHNMNSL
DIDRPVKMSFNISHLTIKEHIMDLMPALQPLMNHVRYVISQGNEDNNFRINQKEGQSFLH
LGRKKVTPGLYNLEITSVPLYRKKELQKLEDEKDFNYLNGEIGQTLKMKLQIQLN
NT seq
8628 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggggtggtatggctggccaagttcatgctgggatgtacagcactatggtgtgtggag
aaagctcaaggccagctggaagttggggaccatcaagtggacagatttgcaggctatgaa
gacagacaagcacttagagtgagaagaagaggacaggacacactaagaggaccaaatgtt
tgtggatctcggttccattcctactgttgcccaggatggaaaacgttaccagggggaaac
cagtgcattgttccaatctgtcggaattcatgtggagatggattttgctcgcgaccaaac
atgtgtacatgtttaaatggacagctttctcctacttgtggggctggtgcagttctcaac
tgtaatgttcgctgcatgaatggagggacctgcaacgaagattcatgtgtttgtcaaaaa
ggatatagtggaactcactgtggacaaccggtctgtgaaaatggttgtcagaatggagga
cgttgcattggacccaatagatgtgcctgtgtctatggttttacaggacctcagtgcgaa
agagattaccgaactgggccttgcttcacacaaatcagcaaccagatgtgccagggccag
ctcagtggtattgtgtgtacaaagacattgtgttgtgccaccattggccgtgcctggggt
cacccatgtgaaatgtgccctgctcaaccccacccatgccgcagaggattcattccaaat
attcgaactggagcctgccaagatgttgatgaatgtcaagccatacctggtctgtgccag
ggcggtaactgccttaacacagttggttcttatgagtgtaaatgcccagctggacacaaa
cagagcgagacctcccagaagtgtgaagatattgatgagtgcagtacaatacctaatgtg
tgtgatggaggggaatgcaccaatactgctgggagctatgtctgcatctgtcctagagga
tttaccacgagccctgatggatctcgctgcattgatcagaggaaaggcagctgtttctct
gctttaattgggggccgatgtgctggggaacttcctggccagtacacaaaaggacaatgc
tgctgtgaaactgggcgatgctgggccataggtcaaaccccagaaatgtgcccagtcagg
gggtctgatgaatatcgaagactttgcattgaaagcctgcccttaggcccttcatatcca
ggaacttatcctgttggccctggtggcgttgggcctggaggtgttggccctggtggaaat
ggacaaggaggttttggacctaatggatttggaccagttgtagttggacccaatgggcaa
ggaacaataaatggtttacctagtgtgggtactgatattggaactgctacattaaatcag
acaggagatatctgcaagcacttcaccaacttgtgccaaaatggacgctgcatccctaca
ccaaatagttatcggtgtgagtgcaacatgggttacaaacaggacagccgggtggaatgt
atagattttgatgaatgtgccagcagtccatgcattcacggagactgtgtgaacacacaa
ggatcataccactgcagatgccacgaggggttccaaagcaaccccaccaaacaagcttgc
attgacattgatgaatgtataatgaatggagtgatgtgtcgtaatggacgctgtgtgaac
acagagggcagcttccagtgtatctgtaatgctggctttgagactactcctgatggaaag
aattgtgtagatcacgatgagtgtgcaaccacaaacatgtgcctgaatgggatgtgcatt
aacgaggatggcagctttaagtgcatctgtaaacctggctttgtgctggcacccaatgga
cgctattgtgttgatgtggatgaatgccaaacaccaggaatctgcatgaatgggcgctgc
ataaacacggagggttctttccgttgtgagtgcctcggtggcctgacaattggtattgat
ggccgagtatgtgtggatacccatatgcgaagtacctgctatggaggtattaaaaagggc
acctgtgcccgccccttccctggcgctgtcaccaaatctgaatgctgctgtgctaaccct
gaccatggatttggagagccctgtcagccttgccctgccaaaaatgctgctgaattccag
gctctttgtagcagtggaattggaatcactgcagatggtagagatattaatgaatgtgcc
ctgaactctgaaatctgtcccaatggcatttgtgaaaacttgcgtggcagctatcgctgt
atatgtaatgtgggctatgaatcagatactagcggaaaaaactgcgtagatgttgatgaa
tgtgctgtgaaccgcctgctttgtgacaacggcctgtgcaggaacacgcctggcagctac
acatgcacctgccctaagggttacgtcttcaaatccgagtcagaaacctgtgaagatgtc
aatgaatgtgcatccaacccctgcgttaatggggtctgcaggaacaatgctggctccttt
gtgtgcgagtgttcattcggaagcaaactggatcctactgggactatttgtgtggacagc
atgaagggaacttgttggttaaacatccaagatggtcgatgtgaggtgaacatcaatgga
gctacccttaaatccgaatgttgtgcaactctaggagctgcctggggaagcccttgtgag
cgctgtgagattgactctgcttgcccaagaggatattccaggaagaagggggttgcttgt
gaagatgttaatgaatgtgaagtcttccctggagtatgtcccaatggacgctgtgtgaat
actgctggttcctttaaatgcgagtgtcctgaggggctgaccttggatagctcagggaga
acttgtgttgatatacgtgctgagcagtgctacatgaaatgggatgaggatgagtgtgca
gctcctttgcctggtaaatacaggatggatatgtgctgctgctctgtgggtgctgcctgg
ggtgttgagtgtgaagaatgtcctaaacctggaagcgaggaatttaagaacatctgtcca
agaggacctggctttgctaatagaggagatgttctttctggtcgtccattcttcaaagat
gtgaatgagtgtaaggtattcaacagcctttgtactcatggaacatgtcgtaacagcatt
ggaagcttcaggtgtatctgtgacaatggttttgctttggatgctgaagagaggaattgt
actgacatagatgaatgccgaatttctcctgacctatgtggacatggaacatgtgtgaac
acacctgggagctttgaatgcgaatgctttgagggttatgagagtggtttcatgatgatg
aaaaattgcatggacattgatgagtgtgagagagacccgctactgtgcagaggaggatca
tgtattaacactgaaggcagctttgaatgtatatgtccacatggtcatgagctaactgca
gaaggcaacgcctgtgtggatataaatgagtgttccttgagtgataacctgtgtaaaaat
ggacgatgtgtgaacatgattggaacataccagtgttcttgcgattctggtttccagtca
acacctgaccggcagggttgtatggacatcgatgagtgttcgatcatgaatggaggatgt
gacactcaatgtaccaattcagagggcagctatgagtgcagctgtagtgagggatatgca
ctgatgccagacacgagatcctgtgcagatattgatgaatgtgaggacaacccagatatc
tgtgatggagggcagtgtaccaatatccctggagagtatcgctgcttgtgctttgatggc
ttcatggcttctctagacatgaagacgtgtatagatgttaatgagtgtgacctgaacccc
aacatctgcctgcatggagagtgtgagaacactaaaggttcttttatctgtcactgtcag
ttgggttactttgtgaagaagggaaccacgggatgcacagatgtcgatgaatgtgaaata
ggagcacacaactgtgatgtacacgcatcttgcgtcaatgtacccggaagctttaaatgc
aaatgtcgaacaggttgggttggagatggccttaaatgtgttgatcttaatgaatgcacc
acagaggaccataactgtaacataaatgccaactgcgtgaacactcctggctcatacaga
tgcacatgcaatgaaggtttcaatggagatggctttacttgctcagatgttgatgagtgt
gcggacaatgtaaacctgtgtgataacggtcactgcctaaatgcgcccggagggtaccgc
tgtgagtgtgaaatgggatttactcctactgaggacagcaaggcttgtcaagatattgat
gagtgcacgtttcagaacatttgtgtctttgggacatgccagaatctgccaggaatgttc
cgatgtgtctgtgatgatggttatgagcttgacagaagtggaggaaactgtacagatgtt
aatgaatgtgctgacccagtgaactgtatcaatggcttgtgtgtgaacactccaggaagc
tacttgtgcaactgcccacaggactttgaactaaatcccactggagttggttgtgttgat
actcgtgttggaaactgctatttggaaacactgacaagaggagatgctagcctagcttgt
agtgctgagattggagttggcgttactcgagcatcctgctgttgctccttgggacgtgcc
tggggtaacccttgtgaaagctgccctcttgccaactctactgagtataaaacactctgc
ccaggaggagagggattcaggccaaatcctataacagttattttagaagatattgatgaa
tgccaggaacttccgggcctgtgtcagggtggcaactgtgtaaacacttttggaagtttc
cagtgcgagtgtccacttggctactacctgaatgaggaaacccgcatctgtgaagacatt
gatgagtgctctgctcacattggaatctgtggaccgggtacttgttataacacacttggg
aactatacctgtgtttgccctccagagtatatgcaagtcaacggaggaaacaattgcatg
gatatgaggaagagcgtctgttatcgcaactacaatgatacatgtgagaatgaactgtct
acaaacatgacaaagaaaatgtgctgctgttcctacaacattggaaaagcctggaataaa
ccttgtgagccatgtccggtgccagccagtgctgattaccaggttctctgtggaaaccaa
gcacctggttttattattgatatccgaactggtaaacctatggatattgatgagtgcagt
gaaatcccagcaatttgcaccaatggtgtctgcatcaaccagattggaagcttccgctgt
gaatgtccaatgggattcagctacaacaacattcttctcatctgtgaagacattgatgag
tgcagcagtggagagaacctgtgccagatgaatgcagattgcattaacatcccaggctca
taccgctgtgaatgttcaagtggatacaagctctcacctagtggagcttgtgttggccga
aatgaatgtaatgagatcccaaatgtgtgcagtcatggaacatgtaaggatacacccgga
agctatatttgcatctgtcacaatggatttaaagcaagtggcgacgaaaccatgtgtatg
gatattgatgagtgtgatcgccagccttgtggcaatggtacttgcaagaacactgtgggc
tcttataactgcctctgcttccccggcttcgaactgactcacaacaatgactgcatggac
atagatgaatgctcttcccttgtgggacaagtatgcagaaatggacagtgcatcaacaac
attggctccttccagtgtctgtgtcaagaaggctatgaaatcaccccagatgggaaaaat
tgtattgatattaacgagtgtgttagtttacctgggacctgcgctccaggcacatgtcaa
aatctggaaggatccttccgctgtatctgccctccaggttatgcggtacagaatgacaac
tgcattgatattgatgaatgtgatgaggaacccaacatctgtctctttggaacctgtagt
aacacccctggcagcttccagtgcatttgtcctccaggatttatcttgtctgataatggg
cgtcgttgctttgatactcgtcagagtttctgcttcacgcagtttgataatggaaagtgc
tcagtgcctaaagccttcaacactacaaaatcaaagtgctgctgtagcacaatggctggt
gagggctggggagatccttgtgagctctgtcctcaggaaggaactgtggcatttcaggaa
ctctgtccatatggtttgggctctatacctaacgctggagataccagagaagatgtcaat
gaatgtgcagagaaccctggagtttgcgtcaatggagtctgtattaatacagatggctct
ttccgatgtgaatgcccatttgggtataatctagactacacaggagttaactgtgttgat
acggatgagtgctccattgggaacccatgtggaaatggaacatgctccaatgtggttgga
ggatttgagtgtgcttgtgatgaaggtttcgaaccaggaccaatgatgacttgtgaagat
atcaatgagtgcacaaacccacttctgtgtgctttccgctgcataaacacttatggatca
tatgaatgcacgtgtccatctggatatactctgagagaagaccgcaggatgtgcaaagat
ttggatgaatgtgcagaaggtctacatgactgtgaatcccgaggaatgatgtgcaagaac
ctgataggtacattcatgtgtatctgcccaccaggcatgcagcggcgcccagatggggaa
ggttgcatggatgaaaatgaatgtcgtacaaagcctggaatctgtcccaatggacgctgt
gtgaatactattggaagttacaggtgtgattgtaatgaaggtttccaggttagcgcctct
gggacagaatgtattgacacacgccaaggatcttgcttcactgaagtgcttcaaactatg
tgccaactttcatctacaaatcgcaacatggtcaccaagtcagaatgctgctgtaatgtg
gggcgaggctggggtaaccagtgtgaactctgtccccttcctggaactggaccatttaag
aagatgtgtccacatggccctggctttactactgatggcagagatattgatgaatgtaaa
gtgcttcctaacctgtgcaaaaatggacagtgcataaataccattgggtctttccgctgt
cactgcaacttgggctataccacagatattactggaacaacttgcgttgatctggatgaa
tgttctcagtctcctaaaccttgcaactttatatgcaaaaatacagagggcagctaccag
tgctcttgtccaagaggctacatcttgcaagaagatggcaagacctgcaaagatctggat
gaatgttccaccaagcagcacaactgccaattcctgtgcgttaacacgattggaagcttc
aactgcaaatgtccacctggctttactcagcatcaatcctcctgcattgataacaatgag
tgcagtgctcaaccaaccttgtgtggctcccgtggtatgtgccagaacaaccctggtagc
tacgtttgtgagtgccagaaaggcttttcactggataacagtggcagcaactgtgaagat
gtggatgagtgtgatggcaaccaccgctgtcaacatgggtgccagaatgtccttggagga
tatcgctgtggttgtccacaaggctatgttcagcactatcagtggaaccagtgcgttgat
gagaatgaatgttcgagccagtccagctgcggttctgcctcctgctacaacactttggga
agcttcaagtgcatatgtccgtctggatttgattttgaccaatcttttggagggtgccag
gatgttgatgaatgttcatcgggagcaagcccttgtagctatggttgttccaacaccgat
ggtggctaccaatgtggatgccctggaggatacttccgagttggccaagggcattgcgtg
tctggcttgggatttggcaagggttcttatctaccagctcctgtggaagaagatgaggaa
aatatcttgtccccagaaaactgctatgagtgcaagatcaatgggtatccaaagagagga
aggcagcgacgcagcaccaattccacctcagagcatgagaatcacaacatgaatagcctt
gatattgacagaccagttaagatgagcttcaacatttcccacctgacaatcaaagaacat
atcatggatttaatgccagctttgcaaccactgatgaaccatgtacgatatgtcatctct
cagggtaatgaggataacaacttccgcattaatcaaaaggagggtcaaagtttcttgcat
cttggccgcaaaaaggtaactccaggtttgtataacctggagattaccagcgtgcctcta
taccgcaagaaggaactgcagaaattagaggatgaaaaagacttcaactacctcaatggt
gaaataggccaaacactcaagatgaaacttcagatccaacttaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
