Acinetobacter baumannii ATCC 17978: A1S_1055
Help
Entry
A1S_1055 CDS
T00486
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
acb
Acinetobacter baumannii ATCC 17978
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LysM
SLT
LysM3_LYK4_5
LysM1_NFP_LYK
Fer2_4
SLT_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABO11487
LinkDB
All DBs
Position
1217130..1220345
Genome browser
AA seq
1071 aa
AA seq
DB search
MYKPTTFVWQPSAASLFKITVLSSALAALGITTGCSSTPQSAKTSKTKQVSGAGYLDASS
LDSLEDLLSATDMRAVEGDRLLILKHGDVWKRMAVGFKMDLNHWDPRIEAQRSWFISRQP
YLDRLSARASRYLYHTVKEAERRGLPTELALLPVIESSYDPAATSSAAAAGLWQFIPSTG
RIYGLQQTGMYDGRRDVVESTRAAYEFLGSLYNQFGSWELALAAYNAGPGRIQQAINRNQ
AAGLPTDYWSLKLPQETMNYVPRFLAVAQIIKNPRAYGVSLPPIANRPHFREVTLSAPLS
LNEIASVTGLSRAELYALNPGYRGETVDPASPMRILIPADISPSVDNKLKGMKAGGSSGW
WASVTSPSKPTTTTSTSVTVRTTPSTPAQPVRPSTPAKTSSSSVTVKTATPRGSDALAAF
AASADVPSAPRIPVAVTPAANIKPVRTEPPISATEREKILAAVRAEGEKETVDQALEPQA
TQAEKDQVVAELKALAPQGTEIVDPYDGKIKLTAIQTSQSVAEQQGKEVSKGFAYPKTLA
EDATLANSEDAQRNKDKPYIKTDTDVVVVQPKGKRSTYTVQPGDTLAVIAMKNGVNWRDV
AKWNQIDPEKTLFVGTSLYLYDAKPQEAETTAKSAAKPDVYVVQANDSLTGVANQFNLSV
KQLAEYNDLSVTDGLFVGQKLQLKEPKGNRAAKVEPKAIQASTRRIATKSYTVKRGEYLK
LIADRYALSNQELADLTPGLTAGSNLIVGQKINVPAKEITVDEVDDSKASGKYEKLAAGP
SYKTESYKVQRGDTLSSIATKSKISLAELAELNNLKANSHVQLGQTLKVPAGASVPDQYV
VQSGDSLNAIAAKYNLQTSYLADLNGLSRTAGLRAGQRLKLTGEVETTSKVSAKNTKEET
PETYTVKSGDSLGNIANRYHLQLDYLAALNGLSRNSNVRVGQRLKLTGDLPTVETAKTDT
AKSSPKAVVAGKNTEKYTVKAGESLNAIASRAGISVRELAEMNALKANANLQRGQNIVIP
KTVVEYKVKRGDTLIGLASKYGLETTLLAELNNLTPSTQLRIGDIIKVPNL
NT seq
3216 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtataaaccaaccacatttgtgtggcagccatctgcagcatcattattcaaaattaca
gtccttagctctgctttagctgcgttgggtattacaacaggctgttcttcgactccgcaa
tctgcaaaaacctcgaaaacaaaacaggtgagtggagcaggctatcttgatgcaagcagt
ctggactctttagaagacttactttcagcaacagatatgcgtgctgtagagggcgaccgt
ttacttattttaaaacacggtgatgtctggaagcgtatggccgtaggcttcaaaatggac
cttaatcattgggatccacgtattgaagcacagcgtagttggtttatctcacgtcagccc
taccttgaccgcttaagtgctcgcgcaagtcgttatttatatcatactgttaaagaagca
gaacgccgtggtcttccaaccgaacttgcgttattaccagtgattgaaagttcatatgac
ccagctgcaacaagtagtgcggcggcggcgggtttatggcaatttattccaagtactggt
cgtatttatggtttacaacaaacgggtatgtacgacggacgccgtgatgttgtggaatct
actcgtgctgcctatgagtttttaggaagcttatataaccagttcggttcatgggaatta
gctttggctgcctataacgctggtccgggtcgtattcaacaggcgattaaccgaaatcag
gctgctggtttgccaacagactattggtcactaaaattaccgcaagaaaccatgaactat
gttccgcgtttcttggctgttgcacaaattattaaaaacccacgcgcttatggggtttcg
ttacctccgattgcaaacagaccccatttccgtgaagtcaccttatctgcaccattatct
ttaaatgaaatcgcgtcggtgacgggtcttagccgtgctgagttatatgcattaaaccca
ggctatcgtggtgaaacagtagacccagcaagtccaatgcgtattttgattccagctgat
ataagtccttcagtggataacaagttaaaaggaatgaaagcaggtggaagttcaggctgg
tgggcaagtgttacttcgccgtctaaaccgaccacaacgacttcaacttcagtcacagtt
agaactactccatcaactccagctcagccagtaagaccatcgacacctgctaaaacaagt
agcagctcggtaacggtaaaaactgcaacacctcgtggttctgatgcgctagctgctttt
gcagcgtcagctgatgtaccaagtgcaccacgtattcctgttgctgtcactccggctgca
aatatcaaacctgtgagaacggaaccaccaatttcagcaactgaacgtgagaaaatttta
gcggcagtgcgtgctgaaggggaaaaggaaacagttgatcaggctttggaaccacaagct
actcaagctgaaaaagaccaagttgttgccgagttaaaagcacttgcacctcagggtaca
gaaattgtcgatccgtatgatggcaaaattaagttaaccgcaattcagaccagccaatct
gttgctgagcagcaaggtaaagaagtaagtaaaggttttgcttatccaaaaactttagct
gaagatgcaactcttgcaaactctgaagatgctcagcgcaataaagataagccttatatc
aagactgatacagatgttgtggttgtacaacctaaaggtaagcgtagtacttatacagta
caaccgggcgatactttagcagttattgccatgaagaatggtgtgaactggcgtgatgta
gctaaatggaaccagattgaccctgaaaagactttatttgtaggaaccagtctatatctc
tatgatgctaagcctcaagaggcggaaactacggcaaaatcggcagctaaacctgatgtc
tatgttgttcaagcaaatgacagtttaacaggagtggcaaatcaatttaatttgtcagtg
aaacagctagctgaatataacgatttgtctgtaacagatggcttgtttgtagggcaaaaa
ttacagttaaaagaacctaaaggtaatcgtgctgctaaagtagagccaaaggcaattcaa
gcaagtacacgtcgtattgcaacgaagagttatacggttaaacgtggcgaatacttgaaa
ttaattgcagaccgttatgcattatctaatcaagagttggcagacctaacaccagggtta
acagctggtagtaatttaattgtaggccaaaaaattaatgtacctgcaaaagaaatcact
gttgatgaagttgatgacagcaaggcttctggtaaatatgaaaagcttgcagcaggtcca
tcatataaaactgaaagttataaagtgcagcgtggcgatacattatcaagcattgcgacc
aaatctaaaattagcctagctgagcttgctgaactgaacaacttaaaagccaacagtcat
gtccaactgggacaaactctaaaagttccggctggtgcatcagttcctgatcaatatgtt
gtgcagtcaggcgatagcttaaatgcaattgcagctaaatataacttacaaaccagttat
ttggcggatttgaatggcttgtcacgtactgcaggccttcgtgctggtcagcgtttaaaa
ttaactggtgaagttgaaacaactagcaaagtttcggctaaaaataccaaagaagaaaca
ccagagacctacacagttaaatctggtgatagcctaggaaatatcgctaaccgctatcat
ttacagttagattacctcgctgcattgaacggtttgtctcgcaacagtaatgttcgtgtt
ggtcaacgcttaaaattaacaggtgatttaccaacagtagaaacagctaaaacggataca
gcaaaatcgtctccaaaagctgtagttgcaggaaaaaatactgaaaagtacacggttaag
gctggtgagtcgttaaatgctattgcgagtcgtgcaggtatttcagttcgtgaacttgct
gaaatgaatgcattaaaagcaaatgccaatttacagcgtggacaaaatattgtgattcca
aaaactgtagtggaatacaaagtcaaacgtggtgataccttaattggtcttgcgagtaaa
tatggtttagaaaccactttactggcggaacttaacaacctaacaccgtcgactcaattg
cgtattggcgatatcattaaagtgcctaatttatag
DBGET
integrated database retrieval system
