Anaerocolumna cellulosilytica: acsn021_20970
Help
Entry
acsn021_20970 CDS
T06764
Name
(GenBank) germination protein
Organism
acel
Anaerocolumna cellulosilytica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LysM
Glyco_hydro_18
LysM_RLK
LysM3_LYK4_5
HTH_19
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCJ94528
UniProt:
A0A6S6R683
LinkDB
All DBs
Position
complement(2583417..2584700)
Genome browser
AA seq
427 aa
AA seq
DB search
MEIHVVQPGDTLTSIAAQYGVTRERLIVDNELPNPDNLLVGQSIIALTPEVTHTVVEGDT
LYQIANQYGVTPTQILQNNPWLANQEGLIPGDNLVIRFQRDEVLGNIIINGYAYTFIDRT
VLRKTLPFLTYLSVFTYGFTPEGELNTIDDEELIQLALDYGVAPLMVLAPMDASGSFSNE
IAHQMFINPEAQDRLVNNILANIQTKGYQGLDIDFEFVLPEDRQLFIDFISRAKAKLEPE
GYIVTVALAPKTSAGQVGLLYQAHDYPVIGGIADKVLLMTYEWGYTFGPPMATAPLNSVR
RVLEYGISEIDPDKILMGIPNYAYDWALPFVRGETKAESLSNVAALERGVENGVTIQFDE
DSQTPFYYYTAPDSREHVVWFEDARSMNAKYRLIPEYGLSGSGIWQIMNFFPQSWIVVTQ
LFNITKV
NT seq
1284 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaatacatgtcgtacagcctggcgataccttgacttcaatcgccgcacaatatgga
gtcacacgtgaaaggctcattgtagataatgaactgccaaacccagataatttattagtt
gggcaaagtatcattgctttaactccagaagtaacccataccgttgtagagggcgacact
ttgtaccaaatagctaatcaatacggcgtcacacctactcagattttacaaaacaacccc
tggcttgcaaaccaggagggattaatccccggggataacttagttattcgttttcaacgc
gatgaagttttaggtaatattattattaatggatatgcttatacctttatagaccgtact
gttctaagaaaaacactcccttttcttacgtacctttctgtttttacttatgggtttact
ccggaaggtgaacttaatacaatcgatgacgaagagttgattcagcttgctcttgattac
ggtgttgcccctctaatggtgctcgccccaatggacgccagtggttcttttagtaatgaa
attgcccatcaaatgttcattaatccggaagctcaagaccggcttgttaataacattctt
gctaatattcagacaaagggataccaaggactagatattgatttcgagtttgtattacca
gaagacagacaattattcatagatttcatatcaagagcaaaagccaaactagaacccgaa
ggctatattgttaccgtagcactagcaccaaaaacttcggcaggccaagttggactctta
tatcaggctcatgattatcccgttattggtggaattgcagataaagtgctgttaatgacc
tatgagtggggatatacatttggccctcccatggcaacagctcccctaaatagtgtacgc
agagtacttgaatacggtatatctgaaattgatcctgataaaatattgatgggaattcct
aattatgcatatgattgggcgctgccctttgtcagaggtgaaacaaaagcggaatcctta
agtaacgttgctgcattagagcgtggtgttgaaaacggcgttaccattcaattcgatgaa
gactcacaaacaccattttactattatactgctcctgacagcagggagcatgttgtatgg
tttgaggatgccagaagtatgaatgcaaaatatcgattaataccagaatatggactaagt
ggttcaggaatctggcagattatgaattttttcccacagagctggattgtagtaacacaa
ctttttaatattaccaaggtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
