KEGG   Acinetobacter chenhuanii: ABLB96_08515
Entry
ABLB96_08515      CDS       T11543                                 
Symbol
hrpA
Name
(GenBank) ATP-dependent RNA helicase HrpA
  KO
K03578  ATP-dependent RNA helicase HrpA [EC:5.6.2.6]
Organism
achu  Acinetobacter chenhuanii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:achu00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:achu03019]
    ABLB96_08515 (hrpA)
Enzymes [BR:achu01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.6  RNA 3'-5' helicase
     ABLB96_08515 (hrpA)
Messenger RNA biogenesis [BR:achu03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   Other RNA degradation factors
    Others
     ABLB96_08515 (hrpA)
SSDB
Motif
Pfam: DUF3418 OB_NTP_bind Helicase_C HA2_C DEAD WHD_HA2 AAA_22 AAA_19 nSTAND_NTPase5 T2SSE NACHT nSTAND3 PhoH SLFN-g3_helicase AAA_30 TsaE PI-PLC_cat
Other DBs
NCBI-ProteinID: XDO77482
LinkDB
Position
1792763..1796620
AA seq 1285 aa
MQNDLNIDQWVMARDRYRLNRLRKDKKADTSEIEKLFEQSNAKVRQRFERLPKIKLNQDL
PVSQYADRLIEAIQKHQVIIVAGETGSGKTTQLPQIAMLAGRGLTGMIGHSQPRRLAARS
VSQRIAEEVGEKLGESIGFKIRFNEQGSQDSIVRLMTDGILLAELGNDRFLSKYDTIIID
EAHERSLNIDFIMGYLKQLLPKRPDLKVIVTSATLDVNRFSNYFNDAPIFEVEGRSYPVE
VRYRPISEMNIGGSDDDEFDDFEENLPRAVVQAVEECFADAEAKGHPEHADILIFSSTEQ
EIRELQETLQKHGPRHTEILPLYARLAVSEQQKIFSPGGKGRRIIIATNVAETALTVPNI
RYVIDSGFARISRYNYRSRVQRLPIEAISQAAANQRKGRCGRIAAGVCIRLYSEEDFLSR
PEFTEPEIKRTNLASVILQMHSLGLGELENFDFIEPPDFRLVNDGRKLLIELGALNEKKN
ELTKVGQTMARMPIDPRLARMIVGGAHFGVLKEILVVVSALAVQDPRERPADKQMQADQK
HALFKEADSDFLFYLKLWETLNPKGEAGMSENKRRQFAKQHFLSWLRLREWKQTHKQLVE
LAEGLKLSFNEKPANYENLHRALLTGLLSFIANKTDERNIFMAVRQQKAKVFPASTLHKT
NTAWVMAFEMVETSQVYLRTLAKIDPEWILLAARDLLKYHYFEPHWSKKAGIVNAYAQIS
LFGLIIEPKRLINFEKVDQPAAHEIFLRDALTTGNLGTVPPFLKHNLLKLEEVERVEDKL
RRRDLVVDEETIYQFYASKIPEEIASRSSFEDWRATVEAKNPRYLFVEDDALWLNDRPTT
QQFPDHLHNGQLRLATSYRFDPSHDEDGATVQIPVQALPQVDENIWSWGIPGWRQDLIEA
LLKALPKDKRRNVVPIPDTARKLMHGVDAVHLRQHIFSYLAFALRGEQITDKDFSFERID
PYLVPFIKVIDEKGKLIAKGRDLPELKARCRVETHRPVKQQKGEFKTFPENFIFEASQKV
TGVVVKQYQALVPIKAFADLDAKDETGVVIQTFNDQSEAIKQHREGIIRLVHMQLGDLVR
QLKKQISKPLSLAYSPLGDKAKLEQMLVYATLQMAITTLPINADEFHKLLEQVKKQFLSY
GQQALEQLSDIYIQWQQIRRQLLVLDAGVFGRSIDDIEDQLDLMSLGNFVYCQPVDLWQE
YPRYLKALLLRLDRLPNNLQRDHAAIDDVDPWMDKVFKFKNDPRIKELYLMLEEFRISLF
SQPMKTKMPISPTRLQKLWDRLGIS
NT seq 3858 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
gtgcagaatgatttaaatattgatcaatgggtgatggcaagagatcgttaccgtttaaat
cgtttacgtaaagataaaaaagccgatacttcagagattgaaaaattatttgaacagtct
aatgccaaagttagacagcgttttgaacgtttacctaaaattaagctgaatcaagattta
cctgtttctcaatatgcagaccgtttaattgaagcgattcaaaagcatcaagttattatt
gtggcaggtgaaacgggttcgggtaaaaccactcagctccctcaaattgcaatgctagca
ggtcgtggcttaacaggtatgattggtcatagccagccacgtcgtttagctgcacgtagt
gtttcacagcgtattgcagaagaagtcggcgaaaaactcggcgaatcgattggttttaaa
atccgatttaatgaacaaggttcgcaagactcgattgtacggttaatgaccgatggtatt
ttgcttgccgagttaggcaatgaccgtttcttgtctaaatatgacacgatcattattgat
gaagcacatgaacgctcactcaatattgattttattatgggctacttaaagcaattactg
ccaaaacgcccagatctaaaagtgattgtgacttcggcaactttagacgtaaatcgtttt
agtaattactttaatgacgcgccaatttttgaagtagaaggtcgtagctatccggttgaa
gtacgttatcgcccaatttcagagatgaatattggtggcagtgatgacgatgagtttgat
gattttgaagaaaacctccctcgtgcagttgtacaagcggtagaagaatgttttgctgat
gctgaagcaaaaggtcacccagaacatgctgatattctgattttctcaagtacagagcaa
gaaatccgtgagttacaggaaaccttgcaaaagcatggacctagacatactgaaatttta
ccgttgtatgcacgtttagctgtttctgaacaacaaaagatttttagtccaggtggcaaa
gggcgtcgtattattattgcgaccaacgttgccgaaactgcacttacagttccaaacatc
cgttatgtgattgacagtggttttgcacgtatatcgcgctataactatcgttcacgcgta
caacgtttaccaattgaagcaatttctcaagctgctgccaaccagcgtaaaggacgttgt
ggtcgtattgctgcgggtgtgtgtattcgtttatatagcgaagaagacttcttaagccgt
cctgaatttaccgaacctgaaattaaacgaaccaacttggcttcggtcattttgcaaatg
cacagtttaggtttaggtgagttagaaaactttgattttattgagccgccagattttcgt
cttgtaaacgatggccgtaagttgctgattgagttgggtgcactcaatgagaagaaaaat
gagctgactaaggtcggtcaaacaatggctcgtatgccaatcgacccacgacttgcacgt
atgatcgtgggtggtgctcattttggtgtacttaaagaaattttagtagttgtcagtgcg
cttgcagtgcaagatccgcgtgagcgtccggcagataaacagatgcaagctgaccaaaag
catgcattattcaaagaagcagattcagattttctgttttatttgaaactttgggagact
ttaaatcctaaaggcgaagcaggcatgtctgaaaataaacgacgtcaatttgccaagcag
cattttttgagttggttacgtttacgtgaatggaaacagacgcataaacaattggtcgag
ttagctgaagggttaaaactgagttttaatgaaaaacctgcgaactatgaaaacttgcat
cgtgcgttattgacaggtttattgtcttttattgccaataaaactgatgagcgtaatatt
tttatggcagtgcgtcagcaaaaggcgaaagtctttcctgccagtactttacataaaact
aatactgcttgggtaatggcttttgagatggtggaaacctctcaagtgtacttacgtact
ttagccaaaattgaccctgaatggattttgcttgccgcacgtgatttattgaaatatcac
tattttgagccgcattggtctaaaaaagcaggcattgtaaatgcgtatgcgcaaatttcc
ttgtttggtttaattattgaaccgaagcgattgatcaattttgaaaaagttgatcagcct
gctgctcatgagattttcttgcgtgatgcattaaccactggtaatttgggtacagttccg
ccatttttaaaacacaacttgcttaaacttgaagaagttgaacgagttgaagataaattg
cgtcgccgtgatttggtcgttgatgaagaaacaatttatcagttctatgcttctaaaatt
cctgaagaaattgcgagtcgaagcagttttgaagactggagagcaacggttgaagcaaaa
aatccacgctacttatttgtagaagatgatgcactttggctgaatgacagaccaacaacc
cagcaattcccagatcatttacataatggtcagctacgtttggcaacgtcatatcgcttt
gacccaagtcatgatgaagatggtgcaacggttcaaattccggtacaggctttaccacaa
gtcgatgaaaatatctggtcttggggtattcccggttggcgtcaagatttaattgaagct
ttacttaaagcgttaccaaaagataaacgccgtaatgtggttcctattccggataccgcc
cgtaagctcatgcatggtgtcgatgctgtacatttaagacagcatatttttagctacctt
gcgtttgcgttgcgcggtgaacaaattacggataaggatttttcgtttgaacgaatagat
ccatatttggtgccttttattaaagtgattgatgaaaaaggtaaattgattgcgaaaggt
cgtgatttacctgagttaaaagcgcgctgccgtgtagaaacacatcgtcctgttaaacag
caaaagggtgagtttaaaactttccctgaaaacttcatatttgaagcgtctcaaaaggta
acaggtgttgttgttaagcaatatcaggcattagtacccatcaaagcctttgctgatctt
gatgcgaaagatgagactggggttgttattcagacctttaatgatcagtcagaagccatt
aagcagcatcgtgaagggattattcgtctggttcatatgcagcttggtgacttggttcgt
cagttgaaaaagcagatttcaaaaccactctcattggcttattcacctctgggtgataaa
gctaaacttgagcaaatgttggtctatgctaccttgcagatggcaattacaactttgcca
attaatgcagatgaatttcataaactgcttgaacaagtcaaaaagcaatttttgagctac
gggcagcaagcacttgagcaattaagtgatatttatattcaatggcaacaaatccgccgt
cagcttttggtacttgatgcaggtgtgtttgggcgcagtatcgatgatattgaagatcag
ctagatctcatgtcacttggtaattttgtttactgccaacccgtcgatctttggcaggaa
tacccgcgttatttaaaagcgctgctattgcgtttagaccgattgccaaataatctacag
cgagatcatgccgctattgatgatgtcgatccatggatggacaaggtatttaaattcaaa
aacgatccaagaatcaaagaattgtatttgatgttggaagaattccgcatttctttattt
tctcaaccgatgaaaaccaagatgcctatttcgccaactcgactgcaaaagttatgggat
cgtttgggaatcagttaa

DBGET integrated database retrieval system