Acinetobacter sp. Z1: NGC85_17010
Help
Entry
NGC85_17010 CDS
T11442
Name
(GenBank) strawberry notch C-terminal domain-containing protein
KO
K26273
protein strawberry notch
Organism
acik Acinetobacter sp. Z1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
acik00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
acik03036
]
NGC85_17010
Chromosome and associated proteins [BR:
acik03036
]
Eukaryotic type
Chromatin remodeling factors
Other chromatin remodeling factors
NGC85_17010
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Helicase_C_4
AAA_34
N6_Mtase
Eco57I
MTS
Methyltransf_15
UPF0020
Cons_hypoth95
DUF7453
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UTO21286
LinkDB
All DBs
Position
unnamed2:complement(11069..16990)
Genome browser
AA seq
1973 aa
AA seq
DB search
MNQTANNFTWVNLNNEGFYTRPAKRHHNGKDFFGIEVADLFNKLDRSAVQKSNIEIHKIN
KTNVLNIYFLNTNINSFVNFLGLNNHQLMFYKTTVGQLNDSYVRAVNDVSTYRYHEAIRN
ATKIGLNADGLHVYATPYARFFTSDPKKFSDLNNSSFEGQIPNNELWKVFKAGQEHILKR
GNISKCALGYAKYILQSNTTVHEHDIDQALKFILNNNQDQNYDLEINPTQKQFFYEQLET
AFNVLASKFEATVEKDYFEIVKLHKNQPIKKIIGASELQLQQFSTPITISAICQKLLLDE
TNGSNPKSILEPTIGNGSLITQFIDSPFLNVVATEIDSNRVKNLQTFFNANSIESNIKVF
EGDFTKIPLLNLNSHQKFDYVIANPPFGSIDREHISLISADGQPIQFPTQRLDHKILLET
LNLRSDNGRSVYIIGSDSVYDKGLVKGGSKTLLNYLYDNYNVECALELDGSLYKRQGTKV
NVRLLVIGEQLQQSRKFDVPDHLEIIKTEMDLWKVSEDILLQRNASIQINQSKQIDSIDK
ETSLSIPDKNSAESASELGFFDEISAQAEDENPFELYAETAAKEENINVIPTEVKQHSLD
LSLPESETSPPLSDTTVKDEKEIENEQETFEAKSLQVMYVPVSQVSISNSMIPSDQALLI
KESQDEQIKTILLKAENNEELAQAIESASGNPFDGFILHTLQYNDVASLAKAYSAEQIDA
LTSAILTFEHGRSYILGDQTGIGKGRTLAGVLRYSLLNNERPVFFTRNAQLFSDLWRDIV
DTDTARLIKNPFIFNVDGAISYNNEILYNPIKTSELASLSEIDKSYDVIFTTYTQFSGRN
QTKENLLLRSCDHSTRLLLDESHVAASGESNISYFLNVLKSNTGETYYSSATSLKKSKNY
NFYSDIFPTQFQGQLKSILENQPSNEILEAISMALAKDGVFMRREHDFSKLEFRTYDSPS
HYQTATRELSDQLASVLSRMAYLSGDVDEKVAKINAEIKANIERSKESGWQENRLQVNSM
NFASRMHNISRQIILAVTTPLVIDQALEALKENRKPVIGLENTGESLLKMLLVKDDKAIS
LIDDINEIKGKQEFVQLLNQLSSGEISHAEYSKNPLVLNINNLEQKLAEYNHTEKILAKP
PNIADLLESMLDRLDTIQIRDRYGSVRSETIIDEKYLEFKEIIRDEIKKLPDIPLCPLDQ
MTIALEEKGYKVGEISGREFCLRKISNNDGVVYKVEKRTENSPVEKTKACNEFQSGKLDV
MILSRSGSTGLSLHAIPVNGGNLANSDHLRQREFLTAQAPQAIDEFLQLIGRVDRKGQVS
HPIISQFDTGLPIQRKFLMMHNAKLSELSANITSNRENVNKQVTDVDLLNKYGDDVAYEY
LKNNRALANMLIIDVPEREDKANTDGLIKKIFNRLNFVSISMQEKIIDDLTFAYSEKIQK
LNELGINPFVVKVCDWKAKTLDSQEIKTGLGISNVKNKSAFFEPAFYQRVEYESSITPLT
SIDVNLLVEKGSKLMTTQLAKHLDNYDPKMFDGIEIEPKDLPLSRLLKLYHEVQKVILTK
ELYESVKHSATQGFLKNDLDNDVFADITNRLKQNIDLDGLKSIISLNSKVFSHVAYQLEK
AMTVVDFVNKLSHLADEHNSISLNFAIKTAPSLFDLKERDSFENALIRVTFPKLTSVCLA
SQNYEVKYTYPSLDAIKSDKLKYLIEDANTTESHQRNVGTALFLRSDTQKLSLMKVFERL
EMLNDESSLLHRFDEFEPIKKIKEATLLTGNIISALTVASVSKVHSQSINYTDVNGNRQR
ALLMSSDIDFRTLTDKIQGLSTIQEAITYLKAIEESRENKISCKLPEFQITKSNSAGNPV
LQISIKPFNSVLDNYCLLVQGNRSQIKQFSENENLFRQKNANIEKGMNLVLVGDLSQGSR
STQQANFSFKELRAVLTHLSSEFSTVKINNIDETVLNKIREVEPSDLINSLKN
NT seq
5922 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatcaaactgcaaataattttacttgggtaaacctgaataacgagggtttttatact
cggcctgcgaaaagacatcataatggcaaagactttttcggcattgaagtcgcagatctt
ttcaataaactagatcgatcagctgtccagaaatccaatattgaaattcataagattaac
aagactaatgttttaaatatttattttttaaatacaaatattaattcttttgtaaatttt
cttggtctgaacaatcatcaactcatgttttataaaactacagttggtcaattaaatgat
tcctatgtccgagcagtgaatgacgtaagtacataccgttaccatgaggcaattcgtaac
gccactaaaatcgggcttaacgccgatgggcttcacgtttacgctactccttacgctcgg
ttttttacaagtgatccaaagaagttttcagacttaaataattccagttttgagggtcaa
attccaaataatgaactttggaaagtttttaaagcaggtcaagagcacatcttaaaacgt
gggaatatttctaagtgtgcattgggttacgctaaatacattttacaaagcaatacgact
gttcacgaacatgacattgatcaagctttgaaatttattctcaacaataatcaagatcaa
aattacgatcttgaaattaaccctacacagaaacaatttttctatgaacaactggaaaca
gcatttaatgttttggcctcaaagtttgaggcaacggtagaaaaagattattttgagatt
gttaaattacataaaaatcaaccaatcaaaaaaattatcggtgcaagtgaactacagtta
caacagttttctactccaatcactatttcggcaatatgtcagaaattactacttgatgaa
acaaatggatctaatccaaaaagtattttagaacctaccattggcaatggttctctcatt
actcaatttattgactccccttttctgaatgttgttgcaactgaaattgattctaatcga
gttaagaatcttcaaacattttttaatgcgaattcaattgaatcaaatattaaagtgttt
gagggtgatttcaccaaaattccattattgaatctgaacagtcaccagaagtttgattac
gttatagctaacccaccttttggaagtattgatcgagaacatatttcgctgatctcagct
gacggtcaaccaattcaattccctacacaaaggttagatcataaaattcttttagaaaca
ctaaatttaagatctgataatggacgcagtgtttacatcattggatctgatagtgtctat
gataaaggtttagttaaagggggaagcaaaactctcttaaattatctttatgataactac
aacgtagaatgtgcattagaactagatggttctttgtataaaagacaaggtactaaagtc
aatgtaagacttctagtaattggagaacaactccaacaatctaggaaatttgatgtacct
gatcacctagagattatcaaaaccgaaatggatttatggaaagtctcggaagatatttta
ttgcaacgaaatgcttctattcagatcaaccagtcaaagcaaattgattcaattgataaa
gagacttcgctctctataccagataaaaattcggctgagagtgcttctgagttgggtttc
tttgatgagattagtgctcaagctgaagatgaaaatccgttcgaactttatgctgaaacg
gctgcgaaagaagaaaacattaatgttattccaactgaagtaaaacaacatagtttagat
cttagcttacctgaatcagaaacatctcctcccctctcagacactaccgtcaaggacgag
aaagaaattgaaaatgagcaagaaacttttgaggctaaatcattgcaggtaatgtatgtt
cctgtttctcaagtttcaatttctaattctatgattccaagcgatcaggccttgttaatc
aaagagtctcaagatgaacagatcaaaacaattttattgaaagcagaaaataacgaagaa
ttggctcaagctattgagagtgcaagtggaaacccttttgatgggtttattttacataca
cttcaatataatgatgttgcttctttggctaaagcttatagtgctgaacagattgatgct
cttacaagtgcaatccttacatttgaacacggtagatcctatatacttggtgatcaaact
ggaattggaaaagggagaacattagcaggagtattaagatactctcttttgaacaatgaa
cgacctgtattcttcactagaaatgcacaattatttagtgatctctggagagatattgtt
gacacggatactgctcgcctgattaaaaatccttttatttttaatgttgatggtgcaata
agttacaataatgagattctttataatccaattaaaaccagtgaattggctagtctgtct
gaaattgataaatcatacgatgtaatttttactacatacactcaattttctggacgaaat
cagaccaaagaaaatcttttactccgtagctgtgaccattcaactcgattactgttagat
gagtctcatgtcgctgcaagtggtgagtctaacatcagctattttttaaatgtattaaaa
tcgaacactggtgaaacttactattcatcagctacaagtttgaaaaaatctaaaaattat
aatttttactcagatattttccctacacaatttcaaggacagttaaaaagcattcttgaa
aatcaaccatcaaatgagatccttgaagctatttctatggcacttgctaaagatggtgtt
ttcatgcggagagaacatgacttttctaaacttgagtttagaacgtatgactcaccaagt
cattatcagacagcaacacgggagttgtcagaccaattagcatcagttttatcaagaatg
gcttacctttcaggtgatgttgatgagaaagtcgcaaaaattaatgctgaaattaaagcg
aacatcgaacgttcaaaagaatcagggtggcaagagaaccgattacaggttaactctatg
aactttgcttctagaatgcacaacattagtagacaaattatattagcagtaactacacca
ttggttatagaccaagctttggaagctctaaaggaaaatcgtaaacctgtaattggtctt
gaaaatacaggtgagtccttgctcaaaatgcttttggttaaagatgacaaagcaatttct
cttattgatgatattaatgagataaagggaaaacaagaatttgttcaactacttaatcag
ttatcttctggagaaatctcacatgctgaatacagtaaaaaccctttagtacttaatatt
aataatctcgaacaaaagctcgctgagtataatcacactgagaagattctagctaagcca
cccaatattgctgatcttttagaaagtatgttggatcgtttggatacaattcaaataaga
gatcgttatggttcagttagatctgaaaccatcattgatgaaaagtacttagagttcaaa
gaaattataagagatgaaattaaaaagcttcctgatatacctttatgccctttagatcaa
atgaccattgctttagaagaaaaaggttataaggttggagaaatctctggccgtgaattt
tgtttacgcaaaattagtaacaacgatggtgtagtttacaaagtagaaaaaagaactgaa
aactcaccagttgaaaaaactaaggcttgtaatgaatttcaatctggaaaattagacgta
atgattttgtctagatctggatcaacaggattatcgcttcatgccattcctgtgaatggt
gggaatcttgcaaactctgatcatttacgtcaacgtgaatttttgactgctcaagctcca
caagccattgatgaatttttgcaattaattggtcgagtagatagaaaagggcaagtaagt
catccaatcatttctcaatttgatacaggattacctattcagcgtaagtttcttatgatg
cacaatgccaaactttcggaattgagtgcaaacataaccagtaatcgtgagaatgttaat
aagcaagtgacagatgtagatctactaaataaatatggtgatgacgttgcttatgaatat
ctcaaaaacaatcgtgcattagcaaatatgctaatcatagatgtgccagaaagggaagat
aaagcaaatactgatggcctcattaagaaaatattcaacagacttaatttcgtatcaata
agtatgcaagagaagattattgatgatcttacatttgcatacagtgaaaaaatccaaaaa
ctcaatgagcttggtatcaatccattcgtagttaaagtttgcgattggaaagccaaaaca
cttgatagccaagaaataaaaactggtttaggcatatcaaatgttaaaaataaaagtgcg
ttctttgaacctgctttttatcaacgtgttgagtatgagtcatcgatcactcccctaacc
tctattgatgtcaatctattggtagaaaagggttctaaattaatgacaactcaacttgca
aaacatttggataactatgatcccaaaatgtttgatggaatcgaaattgaacctaaagat
ttgcctttgtccagacttcttaaactctatcatgaagtgcaaaaagtaattctgacaaaa
gaactatatgagtcagttaaacattctgctacgcaaggttttttgaagaacgatctggat
aatgatgtttttgcagacataacaaatagattaaaacaaaacatcgatttagatggtttg
aaatcgataatttcgctcaattcaaaagttttttcacacgtagcttatcagctcgaaaaa
gcgatgactgttgttgattttgtcaataaattatctcatttagcagatgagcataattcc
attagtctaaacttcgccattaagacagctccatcactttttgatttgaaagaaagggat
agttttgagaacgcacttattagagttacttttcctaaattaacatcggtttgtcttgct
tctcaaaactatgaagttaaatacacatacccaagtttggatgcaatcaaaagtgacaag
ttgaaatatttaatcgaagatgcgaataccactgaatcccatcaacggaatgtaggtact
gcgctatttttacgctctgatactcaaaaactttcattaatgaaagtttttgagagatta
gagatgcttaatgacgaaagttcactactccatagatttgatgagtttgaaccaattaaa
aaaattaaagaggctacattgctcactggcaatattattagtgctctaacagtggcatct
gtatcaaaagttcattctcaatcaattaactatacagatgtaaatggtaatagacagaga
gccttactgatgtcttcagatatagatttcagaactctaactgacaagattcaagggcta
tcgactattcaagaagcaatcacatatttaaaagcgattgaagaatcccgtgagaataag
attagctgcaaactgcctgagttccagattacaaaatcaaattcagcaggtaatcctgtc
ctgcaaatttctataaagccatttaacagcgtgttagataattattgcttattggttcaa
ggaaatcgttcacaaataaaacaattttctgaaaatgagaatctgtttagacagaaaaat
gcaaatatcgaaaaaggtatgaatcttgtgctagtgggtgatctatcacaaggatctcga
tctacgcagcaggccaatttttcgttcaaagagttgagagcagtattaacacatttgtct
tctgagttttcaacagtgaagattaacaatatcgatgaaactgttttaaataaaattcgt
gaggtagaaccaagcgatctaataaattcattaaaaaattga
DBGET
integrated database retrieval system