Arcobacter cloacae: ACLO_1536
Help
Entry
ACLO_1536 CDS
T06845
Name
(GenBank) Dystroglycan-type cadherin-like domain-containing protein (DUF4347 domain)
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
aclo
Arcobacter cloacae
Pathway
aclo02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aclo00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
ACLO_1536
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF4347
He_PIG
Big_9
Cadherin_4
Cadherin_5
IG_AIR9
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QKF90027
LinkDB
All DBs
Position
complement(1515743..1523617)
Genome browser
AA seq
2624 aa
AA seq
DB search
MKRKNFKKPMISALEQRILFDGAAVATAVDVLDESSFSSNNNTQTTTNSNDVTQNNAENS
VHEAQAVQGFERPRREVAFVDVTVSDYQTLVDGVGEGVEVYLVSSLDDINSILKSETNID
AIHILSHGNVGEISVGNDVLNQNTLNNFDTVLQTMKNSLSENGDILLYGCNVASDGTGQE
FIDTLALITEADVAASDDLTGSNSLNGDWDLEIVSGVIETQSLVLSEYSNTLDNDANGNF
NFSPIGTGSAGTSKYLSANLAGSGTGTITIVAYDVDYSQGERNAVYFKDANDTSERFLGY
LQGANNVNSTTIFNNVTFDTGGIATIRIYGEVSGWVYDIKSANFTTTGNAAPEFTSGTSA
TVAEDGSVNITVSGRDGMTLNDNVTLSLHSGPSHGTISGFATQSGSPTASDTFTYTPNAD
YNGSDSITFRLTDGIDTVYQTININVTAVADIVNDSISVNEDSSVTYNLLSNDSFEGNAS
ISSVTQGSYGNVTIVNASTGEVRYTPRTANWHGSDSFNYTVLSGGKYETATVYVTVLSVN
DAPTVTNNANLKLQAINEDVASADNKGSRIDSLFDPVFNDIDVGDSLSSIEVVTINANPV
TQGVYEFSSDNGTNWSLVTAGAILNDTYKIRFTPVANYFGTPGTITVKLRDQGNGIGGVL
TSSGTATLSVQVNSVNDIPVITSALGAATITETSADDVPSSLTPSSGSLTGTLSGTDVED
DISNTPLNFSIQGGTLSGDTYTLQGKYGVLSLDTTTNNWTYTPNKQEALNALAAGDTDTD
EFMFKIIDSNGAQANQSLVITLVGANDLPELSQAISDQTFSGNGNWIYQIPANTFLDREG
NGLTYTVQQVDSNGDIVGDGSLPTGVTFDEATRSFLGNKDTITNGNFYLKVTATDPEGAT
ATDTFQVTFTDVENSAPVVENPIDRVAIVEGTVADGTVNTTPIYTIPIGTGSDMFSDDID
NSSALTYSAVIIGTPNVNIDINDNANISDLSFNTTTREFLSDGSLAAGKYIIDLTATDSG
GKSITTQFVIYVDDGNPSTISAVTPIPDQTWNGSGEHTFKVPSNAFTFDDAGDTVTYSAE
LSNGDSLPFWLTLDPQTGVLSGNPPHDAAATYAIVITATETTGLEIATSGFNLTIGTPND
APILNGTTVAQDQLVTEGNDFSYNFGDLFIDPDGTANGTATTSTLTYSAEVWNGTAWVAA
PSWLTITGTTISGIPIGNVPFLDIKLVATDAGGATNETTFKLDLQDPASTSSVGAYTANN
PGVVTVGGTPTEGQTLTVTSVTDPDGDPLGGITYQWQVSSDGGTTWTDISNATNVNYTLT
NNEAGKQVRAKVFYTDGGNVAETQESDALSIANVDDTGNISLSGTWASGDVVLATINDSD
GLVGVEPTYTWYRGNSNTGPWTLINGATGSSYTLTNNDGNKYIRVVASYTDNQGTLNTPE
TVSPTTVQLGAVAPVAVNDTASVTEGGGLNNATAGGAISGNLFTNDTDLNPGDTKTLVEV
RVGSIEGAGSGVVSGDVNGIYTITGSYGTLTINEATGAYTYTLDETNSDVEALNVGDSLT
ESFNYTIKDSTNRNDIAVLNITINGANDNLVVTTDVNSADLIEAGGVNNDITGTTTANIT
FTAVDVDDAVSFDTTYLTDIRENVYDNNTQTTTSQQVWFLEGNQVSRTTQYGGIYFDTTT
GVMTYYISNSIPELQALKPGDSVTETVSIKVVSGSEEVIKTVSFVINGTNDNPIITIETG
DDETATINETNTTLTTSGTLTVTDVDIEQTVTVSVIDVIVSGVSTGLLADNTTLYEMLSV
NAGNVIDNISKTGTITWTFDSGSETFDYLASGETLTLTYTIKAMDDDSSNAFDEQTVTIT
IVGTNDTPNITVESTDVETVTINETNTTLTTTGSLSVVDLDRTDVITTSHSVSSVQKDAN
GNVMSTDSLEPINIDLANMLSITQTPIDGTNQTGTITWTFDSGSETFDYLASGETLTLTY
TIKAMDDDSSNAFDEQTVTITIVGTNDTPNMTVESTDVETVTINETNTTLTTTGSLSVVD
LDRTDVITTSHSVSSVQKDANGNVMSTDSLEPINIDLANMLSITQTPIDGTNQIGTITWT
FDSGSETFDYLASGETLTLTYTIKAMDDDSSNAFDEQTVTITIVGTNDTPNMTVESTDVE
TVTINETNTTLTTTGSLSVVDLDRTDVITTSHSVSSVQKDANGNVMSTDSLEPINIDLAN
MLSITQTPIDGTNQIGTITWTFDSGSETFDYLASGETLTLTYTIKAMDDDSSNAFDEQTV
TITIVGTNDTPIVSIENIDDKTPFGKEFSKEVAYLFSDLDTTDIFTFEADNLPRGLIIDS
KTGIISGRAKESGIFEITVNVKDSGTPTLSVSRTFSLLVIAPPQPDATKVSEAPKIGETN
TNNSEITLNSFNDNTQTLGVLNFSSSEGISTDTGNGFLGTEGSQNNNPADGTNDNTPSSN
TSNTNDSRGVLQANIDLNVLTNGQIVFNEANQDSFSIVGITIEDIKFENNYIEIKVVDTN
LSQNFIVTQIDGTALPTGLFFDPRTGSITGTIPEDLEKLEISIKAINQDGTTRVLNLKLD
LKELKKSQANQADADEKYMGLKEQIALENQKLDDYGSYLTRLFA
NT seq
7875 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagaaaaaattttaaaaaaccgatgataagtgctttagagcaaagaattcttttt
gatggggctgctgttgctacagctgttgatgtattagatgaaagtagtttttcttcaaac
aataatacacaaactactacaaattcaaatgatgtgacacaaaataatgctgaaaattct
gtacacgaagcacaagcagttcaaggatttgaaagacctagaagagaagttgcatttgta
gatgtgacagttagtgattatcaaactttagttgatggtgtaggtgagggtgtagaagta
tatcttgtgagttcactagatgatataaactctatattaaaaagtgaaacaaatatagat
gcaatacatattttatctcatggtaatgtgggtgaaataagtgtaggaaatgatgtatta
aatcaaaatacactaaataattttgatactgttttacaaactatgaaaaattctctttca
gaaaatggagatatattactgtatggatgtaatgtagcaagtgatggaacggggcaagag
tttatagatactttagctttaataacagaggctgatgttgctgcttctgatgatttaaca
ggttctaatagtttaaatggagattgggatttagaaattgtttcaggggttattgaaaca
caaagtttagttttaagtgaatattctaatactttagataatgatgctaatggaaatttt
aattttagtccaattggtacaggaagtgcaggtactagtaaatatttaagcgctaattta
gcaggttcaggaactgggactataacaattgttgcttatgatgttgattattcacaaggt
gaaagaaatgctgtttattttaaagatgcaaatgatacaagtgaaagatttctaggttat
ttacaaggtgcgaataatgtaaattctactactatatttaacaatgtaacttttgatacg
ggtggaatagctactattagaatttacggagaagtttctggatgggtatatgatattaaa
tctgcaaattttactacaactggaaatgctgctcctgaatttacatcaggaacaagtgca
actgttgctgaagatggaagtgtaaatatcacagtttcaggtagagatgggatgacttta
aatgataatgtaactttatctttacactcaggtccatctcatggaactatttcaggtttt
gcaacacagtcaggaagtccaacagcaagtgatacctttacatatacaccaaatgctgat
tataatggaagtgattctataacttttagattaacagatggaatagatactgtgtatcaa
accataaatatcaatgtaacagctgttgctgatatagtaaatgattctataagtgtaaat
gaagattcttctgttacttataatcttttatcaaatgactcttttgaaggaaatgcatct
atttcatcagttactcaaggatcttatggaaatgtaactatagtaaatgcttcaacaggg
gaggttagatatactcctagaactgcaaactggcatggaagtgatagttttaattataca
gtattaagtggtggaaaatatgaaacagcaacagtatatgtaacagtactttcagtaaat
gatgctccaacagtaacaaataatgcaaatcttaaacttcaagctatcaacgaagatgta
gctagtgcagataataaaggtagtagaatagatagtttatttgatccagttttcaatgat
attgatgtaggagatagtttaagttcaattgaagttgtaactataaatgcaaatcctgtt
acgcaaggagtttatgagttttcaagtgataatggaacaaactggagtttagtgacagct
ggtgcgattttaaatgatacatataaaataagatttactcctgttgcaaattattttgga
acaccaggaacaataactgtaaaattaagagatcaaggaaatggaataggtggagtttta
acttcatctggtacagcaaccttatcagttcaagtaaactctgtaaatgatatacctgta
attacaagtgctttgggagctgcaacgataacagaaacatcagcagatgatgtaccttct
tctttaacaccaagttctggatctttaactggaactttaagtggaacagatgttgaagat
gatatttcaaatacaccattaaatttctcaattcaaggtggaacactatcaggagataca
tacactttacaaggtaaatatggtgtattaagcctagatacaactacaaataattggact
tatactccaaataaacaagaggctttaaatgcccttgcagctggtgatacagatacagat
gaatttatgtttaaaatcatagattcaaatggagcacaagcaaatcaatctttggttatt
actcttgttggagcaaatgatttaccagaattaagccaagctataagtgaccaaacattt
agtggaaatggtaattggatttatcaaattcctgcaaatacatttttagatagagaaggt
aatgggcttacttatactgttcaacaagttgatagtaatggtgatatagttggtgatggt
tcattaccaacaggtgttacatttgatgaagcaacaagaagttttcttggaaataaagat
actataacaaatggaaatttttatttaaaagttacggcgacagaccctgagggagcaact
gctactgatactttccaagtaacatttacagatgttgaaaatagtgctccagttgtagaa
aatccgattgatagagttgctattgttgaaggaacagttgctgatggaactgtaaatact
acacctatttatactattccaattggtactggttcagatatgtttagtgatgatattgat
aatagttcagcattaacttattcggctgtaataattggaacaccaaatgttaatatagat
ataaatgataatgctaatatttcagatttaagttttaatacaacaacaagagaattttta
agtgatggaagtttagctgctggaaaatatattattgatttaacagcaactgatagtggt
ggaaaatcaattacaactcaatttgttatttatgtagatgatggtaatcctagtacaatt
tcagcagttacaccaattccagaccaaacatggaatggttcaggagaacatacttttaaa
gtaccatcaaatgcatttacatttgatgatgcaggtgatactgtaacttatagtgcagaa
ttatcaaatggtgattccttacctttttggttgactttagacccacaaactggagtatta
tcaggaaatccacctcatgatgcagctgctacttatgcaatagtaataacagcaactgaa
actacaggattagaaattgcaacaagtggatttaatttaactattggaacaccaaatgat
gcaccaattttaaatggtacaacagttgctcaagaccaattagtaacagaaggaaatgat
tttagttataactttggtgacttatttattgatccagatgggactgcaaatggaacggca
actacttcaactttaacttatagtgcagaagtttggaatggtacagcttgggtagcagca
ccttcttggcttacaataacaggtacaacaatctcaggaataccaataggaaatgttcca
tttttagatataaaattagttgcaacagatgcaggtggagcaactaatgaaacaacattt
aagttggatttacaagatccagcttcaacaagttctgttggtgcatatacagcaaataat
ccaggagttgtaacagttggaggtactccaacagaaggacaaacattaactgtaacttct
gtaacagacccagatggagatccattaggtggaataacttatcaatggcaagtaagtagt
gatggtggaactacttggacagatattagtaatgcaacaaatgtaaattatactttgaca
aataatgaagcaggtaaacaagtaagagctaaggtattctatacagatggtggaaatgtt
gctgaaactcaagaatcagatgctttatcaattgcaaatgtggatgatacaggaaatatt
agcttatcaggaacttgggcatcaggtgatgttgttcttgctacaataaatgatagtgat
ggtttggttggggttgaaccaacttatacttggtatcgtggaaattcaaatactggacct
tggacactaataaatggtgcaacaggaagttcttatacattaacaaataacgatggaaat
aaatatattagagttgtagcttcatatacagataatcaaggtactttaaatactcctgaa
acagttagtcctacaacggttcaattaggtgctgttgcacctgttgctgtaaatgataca
gcaagtgttacagaaggtggtggattaaataatgcaacagctggtggagcaattagtgga
aatttatttacaaatgatacagatttaaatccaggtgatacaaaaactttagttgaagtt
agagttggaagtattgagggtgctggaagtggtgttgtttcgggtgatgttaatggaatt
tatacaataacaggaagttatggtacattgactataaatgaagcaacgggtgcttatact
tatacattagatgaaacaaatagtgatgttgaggcattaaatgtaggagactcattaaca
gaatcatttaattatacgattaaagatagtacaaacagaaatgatattgcagttttaaat
atcacaataaatggagctaatgataatttagtcgttacaacagatgttaactctgctgat
ttaattgaggcaggtggagttaataatgatattactggaacaactaccgctaatataact
tttacagctgttgatgttgatgatgcagtatcttttgatacaacttatctaacagatatt
agagaaaatgtttatgacaataatactcaaacaacaacttctcaacaagtttggttttta
gaaggtaatcaagtttcaagaacaacacaatatgggggaatatattttgatactactact
ggtgtgatgacatattatatttcaaacagtattcctgaactacaagctttaaagccaggt
gatagtgtaacagaaacagtttctataaaagtagtttcaggtagtgaagaagttataaaa
acggttagttttgttattaatggaacaaatgataatcctattataaccatagaaacaggt
gatgatgaaacagcaacaataaatgaaacgaatacaactttaacaacttctggaacattg
actgtaactgatgttgatatagaacaaactgttacagtaagtgtaatagatgtcattgtt
agtggggttagtactggattacttgcagacaatactacattatatgaaatgttgagtgtg
aatgcagggaatgttatagataatatttcgaaaacagggacaattacgtggacatttgat
tcagggagtgaaacatttgattatttagcaagtggagagacattaacattaacatataca
ataaaagcgatggatgatgatagttcaaatgcttttgatgaacagacagtgactattaca
attgtagggacaaatgatactccaaatataacagttgaaagtacagatgtagaaacagta
acaataaatgagacaaatacaactttgacaactacaggaagtttaagtgtagtagattta
gatagaacagatgtaataacaacaagtcatagtgtaagttcagtacaaaaagatgcaaat
ggaaatgtaatgagtacagattcattagaaccaataaatattgatttagcaaatatgttg
agtattacacaaacaccaattgatggaacaaatcaaacagggacaattacatggacattt
gattcagggagtgaaacatttgattatttagcaagtggagagacattaacattaacatat
acaataaaagcgatggatgatgatagttcaaatgcttttgatgaacaaacagtgacaatt
acaattgtagggacaaatgatactccaaatatgacagttgaaagtacagatgtagaaaca
gtaacaataaatgagacaaatacaactttgacaactacaggaagtttaagtgtagtagat
ttagatagaacagatgtaataacaacaagtcatagtgtaagttcagtacaaaaagatgca
aatggaaatgtaatgagtacagattcattagaaccaataaatattgatttagcaaatatg
ttgagtattacacaaacaccaattgatggaacaaatcaaatagggacaattacgtggaca
tttgattcagggagtgaaacatttgattatttagcaagtggagagacattaacattaaca
tatacaataaaagcgatggatgatgatagttcaaatgcttttgatgaacaaacagtgaca
attacaattgtagggacaaatgatactccaaatatgacagttgaaagtacagatgtagaa
acagtaacaataaatgagacaaatacaactttgacaactacaggaagtttaagtgtagta
gatttagatagaacagatgtaataacaacaagtcatagtgtaagttcagtacaaaaagat
gcaaatggaaatgtaatgagtacagattcattagaaccaataaatattgatttagcaaat
atgttgagtattacacaaacaccaattgatggaacaaatcaaatagggacaattacgtgg
acatttgattcagggagtgaaacatttgattatttagcaagtggagagacattaacatta
acatatacaataaaagcgatggatgatgatagttcaaatgcttttgatgaacaaacagtg
acaattacaattgtagggacaaatgatactcctatagtttctattgaaaatattgatgat
aaaactccatttggaaaagaattctcaaaagaagtagcttatttatttagtgatttagat
actactgatatttttacttttgaagcagataatcttcctagaggattaataatagactct
aaaactggaattatttctggtagggctaaagaatcaggaatatttgaaataacagttaat
gtaaaagattctggaacaccaactttaagtgtttcaagaacattcagtttattagttatt
gcacctcctcaaccagatgcaacaaaagtgtcagaagctccgaaaattggagaaactaat
actaataatagtgaaattacattaaatagttttaatgataatacacaaactttaggtgta
ttaaactttagttctagtgaagggattagtacagacacaggtaatggatttctaggaaca
gaaggttcacaaaataataatccagcagatggaactaacgataacactccttcttcaaat
acatcaaatacaaatgattcaagaggagtattacaagctaatattgatttaaatgtatta
acaaatggacaaattgtatttaatgaagcaaatcaagactctttttcaatagttggaatt
acaattgaagatataaaatttgaaaataactatatagagataaaagttgtagatacaaat
ctttctcaaaacttcatagttactcaaatagatggtacagcacttccaactggattgttt
tttgatccaagaacaggtagtattacaggaacaattccagaagatttagagaaattagaa
ataagtataaaagcgattaaccaagatggaacaacaagagttttaaatctaaaacttgat
ttaaaagagttgaaaaaatctcaagcaaatcaagctgatgcggatgaaaaatatatggga
ttaaaagagcaaatagctttagagaatcaaaaacttgatgattatggttcatatcttacg
agattatttgcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
