Acinetobacter sp. NyZ410: MTO68_06740
Help
Entry
MTO68_06740 CDS
T11536
Name
(GenBank) LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein
Organism
acny Acinetobacter sp. NyZ410
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LysM
SLT
LysM3_LYK4_5
LysM1_NFP_LYK
LysM_RLK
Fer2_4
LysM3_NFP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UOH19839
LinkDB
All DBs
Position
1443072..1446350
Genome browser
AA seq
1092 aa
AA seq
DB search
MFKPTTMVWQPTATVFFKLSLLTSAFAALGLTAGCSSTSTTSKVQTSKSAGMLDASSLDS
LEDLLSATDIRAVEGDRLLILKHGDVWKRMSVGFKMDENHWDPRIDAQRSWFVSRQPYID
RLSARASRYLYHTVKEAERRGLPTELALLPIIESSYDPAATSSAAAAGMWQFIPSTGKIY
GLRQTSLYDGRRDVVESTRAAYEFLGSLYNQFGSWELALAAYNAGPGRIQQAINRNQAAG
LPTDYWSLRLPQETMNYVPRFLAVAQIIKSPSKYGVSLPPIANRPHFREVAVPPGVQLNQ
IASITNLSRAELYALNPGHRGEFVDPSSTLRILIPADLSPTVDAKLRALKPGSDSGLWAS
NTAPTTATRTLTPTAVTSTVTQSITPSKATPPALTTAKTTTTATGSLSTLKNTPQGSDAL
AQFAANADIPSAPRIPVAVTNAANVKPVAAEPPISAREKAQILAAVKAEGEKETVKQVLE
PQATQAEKEEVVKEIKAIAPQGTEVLDPYDGKIKLTAIQTSQSVAEVQGKENTVGFSYPK
GLADTTPANSEEAKLNQDKNFKKTETEVVVEPPRGKRSTYTVLAGDTLATIALKNGVNWR
DIAKWNQVDPNGTLFVGATLYLYDAKPQIDTPVVSRKTTDSAPANYVVKPNDSLTSVANQ
FDLSVSQLANYNNLNTNSNLFVGQKLKLKDASDDKLSEINKAVVRADTSKPVAKIKTKAY
AVKRGEYLKVIADRYALSVHELADLTPGLDTSGSLFVGQKINVPLNEVNEPEAKLDSKVI
DQSKFKNVKAETNYKTENYKVQSGDSLSSIAVQSKLSLAELAELNKISTSKNLLVGQIIK
IPAGTTTPETYTVQSGDSLIALANKYNLQVNQIADLNGLKSTSGLFVGQKLKLTGTPETS
SKEKVQARNEAKSEGASKDIHVVKSGETLASVAKKYKLQLSYLSELNGLSRNQALDIGQR
LKLDGELPSKSTLSKEKEDLKATAKATAKASSKNTESYAVKSGESLNAIANRVGMSVQEL
AELNDLSPRAGLQRGQSIRIPKTVTEYKVKSGDSLIRLASKFGIDTSALAEMNELKPNAS
LRIGSIIKVPNL
NT seq
3279 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaaacctaccacaatggtgtggcaacctactgcgactgttttctttaaattatcc
ttattaacatctgcattcgcagcattagggttgactgcagggtgttcttcgacgtcgaca
acatcaaaagttcaaacatcaaagtcagcgggcatgttagatgccagcagtctggattct
ctagaagatctactttctgcaactgatatacgcgcggtagagggcgatcgcctactgatt
ttaaaacatggtgacgtatggaagcggatgtcagttggttttaaaatggatgaaaaccat
tgggatcctcgtatcgatgcgcaacggagctggtttgtttcacgccaaccctatattgac
cgtctcagtgcccgtgcatcacgctatctttaccataccgtgaaagaagctgaacgtcgt
ggtttacctactgaattagcactattgccgattattgaaagttcttatgacccagcagca
accagtagtgccgccgcagctgggatgtggcaatttatcccaagtacagggaaaatttat
ggtttaagacaaaccagtttatacgacgggcgtcgtgatgtggttgaatcaacacgtgcc
gcttatgagtttttaggtagtttatataatcaattcggttcttgggagttggctttggct
gcctataacgcaggccctgggcgtatccagcaagcaattaaccgtaaccaagctgcgggc
ttaccaacagactattggtcattgcgtttaccgcaagaaaccatgaactatgtaccacgc
tttttagccgtggcgcagattattaaaagcccatctaaatatggggtgagcttaccaccg
attgccaatcgtccgcactttagagaagttgcagttccaccgggcgtacaactcaatcaa
attgcttcaattaccaatttaagtcgtgctgaattatatgctttaaaccctggtcatcgt
ggtgaatttgttgatccatcgagtaccttacgtattttgattcctgcggatcttagtcca
accgtcgatgcaaaactaagagcgttaaaaccgggttctgatagcggtttatgggcaagt
aatactgcaccaaccacagctacacggactttaacgcctacagcagtcacctcgacagtg
actcaatcgattactccaagtaaagcgacgccacctgctttaacaacagcaaaaaccacc
acgacagccacaggttcattgagcacgctcaaaaatacaccacaaggctcggatgcatta
gcgcaatttgctgccaatgctgatattccaagtgcgccacgtattcctgttgctgtgacc
aatgcagccaatgtgaaacctgttgctgcagagccgccaatttctgcacgtgaaaaagca
caaattcttgccgcagtaaaagctgaaggtgaaaaggaaacggttaaacaagttttagaa
cctcaagccacccaagctgaaaaagaagaagtggttaaagagattaaggcgattgcacca
caagggacagaagtgcttgacccgtatgatggtaaaattaagctgactgcaattcaaacc
agtcaatcggttgctgaggttcaaggtaaagaaaatacggttggattctcatatcctaaa
ggtttagcagataccacacctgcaaactcggaagaagccaaactgaatcaagataagaac
tttaagaaaaccgaaactgaagttgtggttgaaccaccaagaggtaaacgcagtacttat
actgttttggcaggggatactttagcaacgattgctttaaagaatggcgtaaattggcgc
gatattgccaaatggaaccaagttgatccaaacggaactttatttgttggcgcgactttg
tatttatatgatgccaaaccacaaattgatacccctgtggtttctcgcaaaaccacggat
tcagctccagccaactatgtggttaaaccaaatgacagtttaaccagtgtggcaaatcag
tttgatttatctgtttcacaattggcaaattataataatctgaataccaacagtaattta
tttgtcggtcagaaattaaagcttaaagatgcttcagatgataaattatctgaaatcaat
aaagcagtggttcgtgcagatacctctaagcctgttgcaaaaatcaagaccaaggcttat
gcagttaaacgtggcgaatatcttaaagtaattgccgatcgttatgctttatctgtacat
gaactcgctgatttgactccagggctagatacttcaggtagcttatttgtggggcaaaag
atcaatgtgccactcaatgaagtcaatgagccagaagctaaacttgactctaaagtgatt
gatcaaagtaagtttaagaatgtgaaagctgaaacaaactataaaactgagaactataaa
gttcaaagtggcgacagtttatccagtattgcggttcagtctaaattaagcttggcagaa
ttagccgagttaaacaaaatttcgacatctaaaaacttgctagtgggtcaaatcattaag
atccctgctggaacaacaacaccagaaacctatactgtgcaatctggtgatagcctgatt
gcgctggcaaataaatataatttgcaagttaaccaaatagccgatttaaatggtttaaag
agcacatctggtttgtttgttgggcagaaattgaagttgactggcacgcctgaaaccagc
agtaaagaaaaagtacaagcgagaaatgaggcgaaatcagaaggcgctagcaaagatatc
catgtggtcaaatcaggtgaaacactggcaagcgttgcaaaaaaatataaactgcaattg
tcttatttaagtgaattaaatggtttgtcgcgtaatcaggctttggatatcggacaacgc
ttaaagcttgatggggaattacccagtaaatccacgctatctaaagaaaaagaagaccta
aaggcgactgcgaaagcaacagctaaagcttcgagtaagaatactgaaagctatgcggtg
aagtctggtgagtcgttaaatgcgattgcaaatcgtgttggcatgtcagttcaagaactg
gctgaattgaatgatctgagcccacgtgcgggtttacaacgtggacaatctattcgtatt
cctaaaacagtgactgaatacaaagtgaaaagcggtgattcattgattcgtttagccagt
aagtttgggattgataccagtgcacttgctgagatgaatgaattaaaaccaaacgcatca
ttacgcattggcagcattattaaagttccgaatctttaa
DBGET
integrated database retrieval system