Atta colombica: 108684365
Help
Entry
108684365 CDS
T11098
Name
(RefSeq) ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial
KO
K05661
ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 6
Organism
acoc Atta colombica
Pathway
acoc02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
acoc00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
108684365
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
acoc02000
]
108684365
Transporters [BR:
acoc02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB6, 7 subgroups
108684365
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
MTABC_N
ABC_membrane
ABC_tran
TMD0_ABC
SMC_N
AAA_22
RsgA_GTPase
AAA_21
AAA_16
AAA_30
AAA_29
AAA
Guanylate_kin
APS_kinase
MauE
AAA_24
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108684365
NCBI-ProteinID:
XP_018044127
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
845 aa
AA seq
DB search
MIIMRYCPPNITFNDIWIDHGMSKCFMHTICTSIIFLYLIIFGSIQLWIYHKYGTETDEN
TLPRSKLYKLQKFVLYLVPILSIIRIILQATVLDDGKVYGYMILTTVLTAIVYPYSIYIL
KVERHKLLPSVPPHGHGLVLLGFWTLAFVAENLVLINIGKLEWWFHLNSLTDQIEMALFI
LRYVSNLLIFALGLRAPGIANIFDSDYRVLNDDTVIRSRYYQQRRSDNTSTWRNLWYKIK
ILAPFLWPKSNYLLQLRVIFCFALLLFGRLINLYVPIYNKKIVDSVAIVPVKFRWDIVLI
YVTFKFLQGGGTGSMGLLNNLRSFLWIRIQQYTTREVELELFRHLHGLSLRWHLGRKTGE
VLRIMDRGTDSINNLLNYILFSILPTIIDIIVAVLFFISAFNKWFGLIVFVTMVLYIAAT
IVITEWRTKFQRRMNLADNAQKARSVDSLLNFETVKYYGAEAYEVESYRKAILDFQIQEW
KSMITLNILNILQNIIVSGGLLLGSLLCLHMVVFHQGLTIGDYVLFASYIVQLYVPLNWF
GTYYRAIQKNFVDMENMFELLREEQEVIDAPGAELLDVKCGQVEFSNVSFGYSSEKLVLK
NISFIVPSGKTMALVGPSGAGKSTIIRLLFRFYDVEQGAILIDGQNVKTVKQESLRSNIG
VVPQDTVLFNNTIRYNIQYGRIDAPEADIIAAAKHADIHERILTFPNGYETQVGERGLRL
SGGEKQRVAIARTILKAPKIVLLDEATSALDTQAERNIQAALSRVCAGRTTIIVAHRLST
IIHADEILVLKDGEIIERGKHEELISHSTTYHAMWQAQLQNNQKNSENEKNSVHESDSTI
SNKDE
NT seq
2538 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattataatgagatattgtccaccaaatataacttttaacgatatctggatagaccat
ggcatgtctaaatgtttcatgcatactatctgtactagtataatttttttatatttaatt
atatttggatcgattcaactttggatatatcataaatatggaaccgaaactgacgagaat
acattaccaagaagcaaactatataaattacaaaagtttgtattgtatcttgttcccatt
ttaagtataattagaataattctacaagctacagtcttggatgatggaaaggtctatgga
tatatgatattaacaacagtattgacagcaattgtttatccatactcaatttatatattg
aaagttgaaagacataaattgttgccaagtgtgccaccacatggacatggattagtgcta
ttaggtttttggacattagcatttgttgctgaaaatcttgttttgattaatattggaaag
cttgaatggtggttccacttgaattccttaacagatcaaatcgaaatggctctatttatt
ttgcgatatgttagtaacttgttgatttttgctcttggtttacgagctcctggcattgcc
aacatttttgattctgattatcgtgtgcttaatgatgacacagttatacgatcacgatat
tatcaacaaagaagatcagataatacttctacatggagaaatttgtggtataaaattaaa
attttagcgccgtttttatggccaaagtcaaattatttacttcagttaagagtaatattt
tgcttcgcattgctgctatttggacgtttgataaatctttatgtaccaatttacaataaa
aaaattgtagacagtgttgcaattgtccctgtgaaatttaggtgggatatagtattgata
tatgtaacatttaaatttctacaaggtggtggtactggaagtatgggtttgttgaataat
ttaaggtcttttctctggattcgcattcaacaatatactactcgtgaagtggagttagaa
ttattcaggcatttacatggattgagcttgcgctggcatcttggaaggaaaactggtgaa
gtattaagaattatggatcgtggcacagactcaattaataatttgctcaattatattctt
ttttcaattcttccaactattattgatattattgtagcagttttgtttttcatcagtgca
tttaataaatggtttggtctcatcgtttttgtaactatggttctttatattgctgccaca
attgtgattacggaatggcgtacaaaattccaaagacgtatgaatttggctgacaatgca
cagaaagcacgcagcgttgatagcttattgaactttgaaacagtgaagtattacggtgct
gaagcatacgaagtggaaagctatagaaaagcaattttagattttcaaatacaagaatgg
aaatcaatgattacactgaatatcttaaatattttgcaaaatataattgtctctggtgga
ttattacttggatcgttattatgtttacatatggttgtcttccatcaaggtttaacaatt
ggcgactatgtcttgttcgctagttatatagtacaactttatgtaccgttaaattggttt
ggtacatattacagagccattcaaaaaaatttcgttgatatggaaaatatgtttgaatta
cttcgggaagagcaagaagtaatagatgcaccaggagctgaattattggatgtcaaatgt
ggacaagtagaattctcgaatgtatcgtttggctatagttctgagaaactcgtgcttaaa
aatatcagctttattgtaccttcaggaaaaacaatggcgctagttggtccatctggtgct
ggaaagagtaccataatacgattactatttcgcttttatgatgtagaacaaggtgcaatt
ttaattgatggacaaaatgtaaagactgttaaacaggagtctctcagaagtaacataggc
gttgttccacaagacacagttttatttaataatactataagatataatattcaatatggt
cgtattgatgctccagaagcagatataattgctgctgcaaaacatgcagatatccatgag
agaattcttacatttccaaacggttatgaaacacaggttggcgaaagaggtcttcggcta
agtggtggtgaaaaacaacgtgtcgcaattgcacgcacaatattaaaggcgccaaaaata
gtattacttgatgaagctacaagcgctttggatacgcaggcggagcgtaatatacaagca
gcattaagcagagtatgcgctggacgaactactatcattgtagctcatagattatccaca
ataattcatgcggatgaaattctcgtcttaaaagatggtgaaatcattgaaagaggcaaa
cacgaagaactgatttcacatagtactacttatcatgcaatgtggcaagcacagcttcaa
aataatcaaaaaaatagcgagaatgaaaaaaattctgtacatgaaagtgattccacaatt
agtaacaaagatgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
