Adelges cooleyi (spruce gall adelgid): 126839146
Help
Entry
126839146 CDS
T09500
Name
(RefSeq) activating signal cointegrator 1 complex subunit 3 isoform X1
KO
K18663
activating signal cointegrator complex subunit 3 [EC:
5.6.2.4
]
Organism
acoo
Adelges cooleyi (spruce gall adelgid)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
acoo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
acoo03400
]
126839146
Enzymes [BR:
acoo01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
126839146
DNA repair and recombination proteins [BR:
acoo03400
]
Eukaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
Direct repair
126839146
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Sec63
DEAD
WHD_SNRNP200
ASCC3_N
ResIII
Helicase_C
Helicase_PWI
AAA_19
AAA_22
UvrD-helicase
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
126839146
NCBI-ProteinID:
XP_050430182
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2160 aa
AA seq
DB search
MAREKDKLPLHIGQLPRFTRALLTYSIGSIDDMDPINTWNYNLDVIKERITEEEKQLQKT
LSYSEICSVINESKNNIISKNLKTLYEIAKELSKDEQPEILSSAVLFFFKLLIGVSGLLM
KHILELRSMFGKVSNQNADQIFKLVKEIENLLQEDNIQKIKNLWEKIDTNKNREIEKKTN
EQNISLDHSFYKSRSKWVPPDFGKLPTPNVGLKSVLNSFSMRYNGEEKKHISATNFDKTW
LISQISKTSVINLGVSDEDYYNSITEALSSQKSDTELQDELFSLLGYTRLTLIETLLKHR
KDIIKQYLPTNEKKMGGISKDLRMDKRSRHMEMITIETEEDRQLRKEIRKEEKALHKLNR
KQDADSDDESVKIVSKTTSAPNVPMYIDPKSRKVPPAEKYPHVYDLNTELKVSNCYINGE
ACTIPLGAKRTDFKTHEEVYIPVTKLSEELTVGKNLIAITTLDEVGQKTFSGITNLNRIQ
SVVFDAAYNTNENLLVCAPTGAGKTNVALLTIVHQIKQHIRNNEINKNEFKIVYVAPMKA
LAAEMTANFSKRLSTLGIAVREFTGDMSLTKTEITNTQILVTTPEKWDVATRKGSGDIAL
TSLVKLLIIDEVHLLHGDRGPVLEALVARTLRQVESSQSMIRIVGLSATLPNYKDVARFL
RVNLHKGLFYFDSRFRPVPLVQTFIGVRGGKTIKLQQEMDSVCYEKVYDMVQKGHQVMVF
VHARNATVKTANVFRELATQKNHQTAFLPQDSNRIGIAKKAFERCHSKELSELLNSGFSV
HHAGLLRSDRNLVEKYFAEGAIKVLVCTATLAWGVNLPAHAVIIKGTELYDSKHGTFVDL
GMLDVLQIFGRAGRPQFDTSGHGMIITPHTKLHKYLSLLTNQIPIESCFVQHLVNNLNAE
VVLGTISNVEEAVLWLSYTYLFVRMRINPHVYGISLEEVELDPMLVNKRKEFIINAAMLL
DKAQMLRYNQRTGDLSSTDMGRTASHFYISYDSVEIFNQTLRPFMNLSEILNMIASAKEF
EQLQVRDDEVIELESLGRKYCQVECTGSAVNVNGKVNILLQTYLGRGRAKAFSLISDLVY
ISQNATRIARALFDMVLRRNNAMLTSKLLEVSQMFEMRQWDFESELRQFSEILPWEIIDK
IEQRRLTFNRIREMDSKELGIILRNQNVGVAVKKCAMQLPYMEATENIQPITRTILKINL
ELYPDFEWNDRIHGKTSVAFWIWIEDPETDQIYHWEQFLISKRQVLKKETQKLIFTIPLV
EPLPSQYILHCTSDRWLGTTYTIPLTFQHLILPHSHASVTDLLELQPLPLAALKNENYQN
LYSFTHFNPIQTQIFHCLYYTDNNVLLGAPTGSGKTIAAEIAMFRVFNEQPEAKVVYIAP
LKALVRERMIDWKVRLEEKLKKSVVELTGDVTPDIRAITSSSVIVTTPEKWDGVSRSWQT
RNYVRQVALVVLDEVHLLGEDRGPVLEIIISRINFISTHTGQRTRIVALTTALSTAADLA
SWLHIGEMGLYNFRPSVRPVPLEVHISGYAGRNYCPRMATMNKPIYQAIRQHSPTQPVMI
FVSSRRQTRLTALDLIAYLGGEDNPKQWVRKSDHEMEQIIDNIKDSNLKLCLAFGLGLHH
AGLQDKDRKIVEDLFVNQHIQVLIATSTLAWGVNFPAHFVIVKGTEFYDGKLKRYVDMPI
TDVLQMMGRAGRPQYDNMGIALIMVHDIKKTFYKKFLYEPFPVESSLLDVLPDHFNAEIV
AGTIKTKQDAIEYLTWTYLIQRLMKNPEYYGLHSLEESSINTFLSDLVEQCIGTLYSSYC
LDIDEDQRSVKSTPLGHIASYYYLQHKTVKTFHDRLKGELTMEDLIKVLVDAEEFSLLPV
RHNEDLMNAELDKQCPLDIDGRPFECSHTKTLILLQAHFSHLKMPCTDYITDLKSVLDQS
IRILQAMIDICAEAGYLVLCLKLIQLMQMVIQARWVTEPSVITLPGVEKHLIPSHVLPSL
CLPHLCKVALKGYSQFAEIMLRTQLEPDEIDKIYKTIIEMPVVNVKLYIQGLWPDNSEIQ
KKLVETGKRMEIIANCEYTLLVEMKMLNRLVPTKAHAPKFSKSKDVGWFMVLGSAEKWEL
IALKRNANNRYRNTSSRLSFCTPKNPSYINWTFYMMSDCYLGLDQQYEIELNVIDQKLVT
NT seq
6483 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctagagaaaaagacaaattgcccttacacattgggcagttgcccaggttcacaagg
gctcttttgacatactctattggatcaatagatgatatggatccaataaatacgtggaat
tataatttagatgttattaaagaacggataactgaagaagaaaagcagttgcaaaaaact
ctttcatattcagaaatttgttctgttataaatgaatctaagaataatattatttcaaaa
aaccttaagacattatatgaaatagctaaagagctttcaaaagacgaacaacctgaaata
ttaagttcagcggtattattttttttcaagttgttaattggtgtatctggattgttaatg
aaacatattttagagcttagaagtatgtttggaaaagtgtcaaatcaaaacgctgatcaa
atatttaagttggtaaaagagatagaaaatttactacaagaagataatattcaaaagatc
aaaaatttatgggaaaaaatagatacaaataaaaatagggaaatagaaaaaaaaaccaat
gaacagaacatatcacttgatcattcattttataaatcaagatcaaaatgggtacctcct
gattttggaaaattacctacacctaatgtagggttaaagagtgttttaaattcattttcc
atgcgatataatggagaagaaaagaaacatattagtgcaacaaattttgataaaacatgg
ttaataagtcaaatttcaaaaacatcagttataaacttaggtgtgtctgatgaagattac
tataatagcattactgaagccctttcatcacaaaaatctgatactgagcttcaggatgaa
ctgtttagcctgctcggctatacaagacttacacttatagaaactcttttaaaacacaga
aaagatataataaaacaatatttacctacaaatgagaagaaaatgggtgggatttccaaa
gatttaagaatggataaaagatctagacatatggaaatgattacaattgaaacagaagaa
gatagacagttaagaaaagaaattagaaaagaggaaaaagcattgcataaattgaaccgc
aaacaagacgcagattctgatgatgaatctgttaagatagtctctaagactactagtgca
ccaaatgttccaatgtatattgacccaaagagccgtaaagtaccaccggctgaaaaatat
ccacatgtttatgatttgaatacagaattaaaagtgtccaattgttatatcaatggagaa
gcatgtactatccctttgggagctaaaagaactgacttcaaaacacacgaagaggtttat
ataccagtaacaaaattatcagaagaattaactgttggaaaaaatcttattgcgattaca
acattagatgaagttggccaaaagacttttagtggtattactaaccttaatagaatacaa
tctgttgtatttgatgctgcatataatactaatgaaaatcttctggtatgtgccccaact
ggagctggtaaaaccaatgttgctctattgactatagtacatcaaattaaacaacatatt
agaaataacgaaattaataagaatgaatttaaaattgtttatgttgctccaatgaaagct
ttagctgctgaaatgacagcaaatttctctaaacgcctttctacattaggcatagcagtt
cgtgaatttaccggtgatatgtcattaactaaaacagaaattactaacactcaaatatta
gtaacgacgcctgaaaaatgggatgtagctactcgtaaaggctctggtgatatcgcatta
actagtttagtaaagttactaattattgatgaagtgcatttattgcatggcgaccgaggt
cctgttctagaagctcttgtagctcgaacactaagacaagttgagtcttctcagagcatg
attcggattgtcggattatcagcaacattaccaaactacaaagatgtagctcgttttcta
agggtgaatttgcataaaggattattttactttgatagccgttttcgtccggtgcctcta
gttcagacatttattggtgttcgcggaggtaaaactattaaattgcaacaagaaatggat
tcagtttgctatgaaaaagtttacgatatggttcaaaaaggtcatcaagttatggtgttt
gtgcatgctcgtaatgctactgtcaagacagctaacgtatttagagaacttgcaacccaa
aagaatcatcaaaccgcttttttgccacaagattccaacagaatagggattgccaaaaaa
gcatttgaacgttgccattccaaagaactcagcgaattgttgaacagtggattttctgtt
catcatgcaggtcttttgagatccgatagaaatcttgtggaaaaatattttgcggaagga
gctattaaagttttagtatgtacagcaacattagcttggggtgtgaatcttcctgctcat
gcagttatcattaaaggtactgagctttatgattccaaacatggaacatttgtagactta
ggtatgcttgatgtattgcaaatatttggacgagctggtcgtcctcaatttgatacttct
ggacatggaatgatcatcactcctcatactaaacttcacaaatatttatctttacttaca
aatcagataccaattgaaagttgctttgtacaacatcttgttaacaatttaaatgctgaa
gtggttttaggaacaatatcaaatgttgaagaagcagttctatggctaagctatacttat
ttgtttgttagaatgcgtataaatcctcatgtatatggcatatctcttgaagaagttgaa
ttagatcctatgttagttaacaaaaggaaagagttcattattaatgctgcaatgttgttg
gataaagcacaaatgttacgttacaatcaaagaactggagatctctcatcaactgatatg
ggacgaactgctagtcatttttacattagctatgatagtgttgaaatatttaatcaaaca
ctgcgaccgtttatgaatttatcggaaattttgaatatgattgctagtgctaaagagttt
gagcaacttcaagttcgagatgatgaagtaattgaacttgagtcattaggtcgtaaatat
tgccaagtcgaatgcactggatccgctgtaaacgtgaatggaaaagttaacatcttgttg
caaacttacttaggccgaggcagagctaaagcattttcattaatatctgatcttgtttat
atttcacaaaatgctacaagaattgcacgagccttatttgacatggtattgcgtcgtaat
aatgctatgttgacatccaaattattagaagttagtcaaatgtttgagatgagacaatgg
gattttgaatctgaacttaggcagttttcagaaattctaccatgggaaataattgataaa
attgaacagagaaggctaacgtttaatcgtataagggaaatggattctaaagaattgggt
attattttgagaaaccaaaatgtaggagtagctgtgaaaaaatgtgccatgcaactgcca
tatatggaagctactgaaaacattcaacccattaccagaactattttaaagataaatctt
gaactttaccctgactttgagtggaatgatagaattcacggaaaaacttctgttgcattt
tggatatggattgaagatccagaaactgaccaaatttatcactgggaacagtttttaatt
tcaaaaagacaggtactgaaaaaagaaacacaaaaattaatttttacaataccattagtt
gaaccactaccgtcccagtacatattacattgtacttcagatagatggttgggtacaaca
tacactatacctttgacttttcaacatcttatattgccacatagtcacgcatcagtaaca
gatttacttgaactacagccattaccattagctgctcttaaaaacgagaattatcaaaat
ttgtattcatttacacatttcaatccaattcaaacacaaatatttcactgtttgtattat
accgacaacaatgtacttttaggggcacctactggatctggtaaaaccatagctgcagaa
attgcaatgtttagagtttttaatgaacaaccagaagcaaaagttgtgtacattgctcca
ttaaaagcacttgtacgagagcgcatgattgactggaaagtaagacttgaggaaaaatta
aagaaatctgttgtagaattaacaggtgatgttacaccggacattagagctattactagt
tcgtcagtgatagtcactacaccagaaaaatgggatggtgtttcgcgtagctggcaaact
cgaaattatgtacgccaagtggctttagttgttcttgatgaggttcatttattaggtgaa
gaccgaggtcctgtattagaaattatcatttctcgtataaacttcatatctacacatacg
ggtcaacgtactcggattgttgccctaacaactgcattatcaacggctgctgatctagcc
tcatggctacatattggtgaaatgggactctacaatttccgtccatctgtacggccagtt
ccacttgaggtgcatattagtggttacgcaggaagaaattattgtccaagaatggcgacc
atgaacaagcctatttatcaagcaattcgtcaacactctccaactcaacctgttatgatc
tttgtgtcatcaagaagacaaactagattaactgcactagatcttattgcatatttgggt
ggtgaagataaccctaaacaatgggttcgcaaaagtgaccatgaaatggaacaaattatt
gataatatcaaagattcaaacttaaagctttgtcttgcatttggactaggtctacatcat
gctgggttacaagataaagatcgtaaaatcgttgaagatttatttgttaatcaacatatt
caggttcttattgcaacttcaacgttagcttggggagttaattttcctgctcattttgta
atagttaaaggaactgaattttatgatggtaaactaaaaaggtacgtggacatgcccata
acagatgtattacaaatgatgggtcgtgctgggcgacctcaatatgacaatatgggtatt
gcccttataatggttcatgatataaaaaaaacattttacaagaaatttttgtatgaacca
ttcccagtagagtcatcattattagatgtattgcctgatcattttaatgcggaaatagtt
gctggaacaataaaaacaaaacaagatgctattgaatatctgacttggacgtatctaatt
caaaggctaatgaaaaatcctgaatattacggactacatagtttagaagaaagttccata
aatacctttctttcagacttggttgaacaatgcattggaacattgtattcaagttattgt
ttagatattgatgaggatcaacgtagtgttaaatcaacaccattaggtcatatagcatcc
tattactatttacagcacaaaactgtaaaaacattccatgatagattaaaaggggaactt
actatggaggatttaatcaaagttttagttgatgctgaagaattcagtctattgcccgtt
agacataatgaagatctaatgaatgctgaactagataagcaatgtccattggatattgat
ggtcggccatttgaatgttcacatacaaaaactttaatcttactccaagctcatttttca
catttaaaaatgccatgtacagattacataactgaccttaaatcagttcttgatcaatct
attcgtatattacaagcaatgattgatatctgtgcagaagctggttacttggtattatgt
ttaaaattgatacagctcatgcaaatggtcatacaagcccggtgggtgacagaaccatct
gtaattacattgcctggtgtggaaaaacatttgataccatcccatgtactgccatctctt
tgtttacctcatttgtgtaaagttgctcttaaaggttacagtcagtttgcagaaattatg
ttgcgaacccaattagaaccagatgaaattgacaaaatttataaaacaataattgaaatg
cccgttgtaaatgttaaattgtacatacaaggactctggcctgacaatagtgaaattcaa
aagaaactagttgagactggaaaacgaatggaaattatagccaactgtgaatacacttta
ttagttgaaatgaaaatgttgaatcgtttggtcccaacaaaagcacacgcaccaaaattt
tctaaatccaaagatgtgggttggtttatggtgcttggttcagctgaaaaatgggaattg
attgctttaaaaagaaatgcaaataatcgttatagaaacacctcaagtagattatctttc
tgtacgcccaaaaacccaagttacattaattggacattttatatgatgtccgattgctat
cttggtttggatcaacaatacgaaattgaacttaatgtgattgaccaaaaattagtaaca
taa
DBGET
integrated database retrieval system
