Adelges cooleyi (spruce gall adelgid): 126841853
Help
Entry
126841853 CDS
T09500
Name
(RefSeq) 3'-5' RNA helicase YTHDC2-like isoform X1
KO
K20099
ATP-dependent RNA helicase YTHDC2 [EC:
5.6.2.6
]
Organism
acoo
Adelges cooleyi (spruce gall adelgid)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
acoo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
acoo03041
]
126841853
Enzymes [BR:
acoo01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.6 RNA 3'-5' helicase
126841853
Spliceosome [BR:
acoo03041
]
Other splicing related proteins
Spliceosome associated proteins (SAPs)
RNA helicase-like proteins
126841853
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
OB_NTP_bind
DEAD
Helicase_C
R3H
HA2_C
AAA_19
ResIII
nSTAND3
HA2_N
Ank_2
THEG4
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
126841853
NCBI-ProteinID:
XP_050434587
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1226 aa
AA seq
DB search
MRQSLGILQFKAMYYVIVLVYHYTMEYGKCLNKYYRKKNEVMSRKNDLSRDSIDYLSREL
DSFLSSELLEISFPTTLTSEERKYLHLKCAELGIKSKSHGQGPLRYITIYKKKTKNKFKK
KNKKLSIIDNAASVEISSISQEIITKTCDNIPITKQMYEELLPNPMKQFQRMAVANCKRN
LPLMCNKSMSIPRLATNENLLLIRKSLPIWDKRGEIIQAIENHPVVIITAETGSGKTTQI
PQFIIDNNAMKNRPCRVVCCQPRRIAAISMADRVSNERGENIGMSIGYQVRLESCVSHDA
TIIYCTTGVLTRTLMDRHQKDNEPVKGMLLNVSHIIVDEVHERDKHVDFLLIALRMILPK
NPHLKLILMSATADINLFSSYFDNCPVLKVEGKMFPVTEYFLEDILDDMNYESQSMLRIK
NRTKIDYWDNNIVLRETTEAIQNMHLTEPVTTLRSDQEWLKPELDDCMHQIWFNAEIEQI
DRMIYYIMSEGVPVDYQHSDTGVTLLMLVAVHGLNDYVIMLLNMGASPVIQTRVLNKDAA
TWAADFKQYETRDLILNYKGAISPKEQNEAHKELDMMERLELYKKSLPPSIHIDSYLIAH
LVKHIILTKKPGSILVFLPGFEDMSMVNKVITEELIAKDDFKIKMYMLHSMMQTSDQQRV
FLPVPKGYRKVILATNIVETSVTINDIVFVIDSGRVKQKGYNAFNGISCMNVNWISQSCA
KQRAGRAGRLCPGECYRLYSRENYSYMGTHDVPEILRMPLQELCMLAKVISSNMRILDFL
ALAIQPPPTLSIVAALEYLKTIEAMDINEDLTALGFFMLDLSIEPHYAKSLVFAVFLKCL
DPVLTIISCLANREPFNLTLNVNMKTSLGSIRKKLAGSTLSDHIILLRLYQAFNERSKVG
SELNNLVSQSVMGLITQTRTQLLGQLRALELIQMRPGPNDIRDVNSNSNNWAAVKACLLA
GLYPNLAKLDKSSPRPILKTKTEKSVVYHGSSILRENYSKDLPSEWIIFEEMCSFSTKKC
IKNCTVVSPMAVALFANAMKIPHDSVKNIEDLDDSDWDTNDETSLPIEQSGVLNLDGWTT
FVGNPDDITKILNIRLCLTLAYREFLKNKMITINSSYSNVVQSVVKILAAEDQAVGLEAP
DDVGKRPRENSNKGRHGRHNDNSSFTSFRKLQPQNQYSHGKGYPDNSSYLTGGNNCTMNG
SRGSSYRNQNNYSLPSTSQSSNNFKW
NT seq
3681 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgacagtctttaggtatcttacagttcaaagcaatgtactacgtgatagttttggtt
tatcattatacaatggaatatggaaaatgcttaaacaaatactacagaaaaaaaaatgaa
gttatgtcgcgtaagaatgatttgtctcgagattctattgattatctgtcacgtgaatta
gattcatttctgtcgtccgaattgctagaaatttcatttcctactacgttaacatcagaa
gaacgtaaatatttacatttaaaatgtgctgagttgggaataaaatcaaaaagtcatggg
caagggcctctccgttacataactatttataaaaagaaaaccaaaaataaatttaaaaaa
aaaaataaaaaattgagtataattgataatgctgcaagtgtagaaatctcttcaatttct
caagaaataattacaaaaacctgtgataatattcctattactaaacaaatgtatgaagaa
ttattgccaaacccaatgaaacagttccaaagaatggctgtggctaattgtaaaagaaat
cttccattaatgtgtaataaatccatgtctataccacgtcttgctactaatgaaaattta
ctattaataagaaaatctctacctatatgggataaacgtggagaaataattcaagcaatt
gaaaaccacccagtagtaattattacagcagaaacaggatctggaaaaacaactcagata
ccacagtttattatagacaataatgccatgaagaacagaccttgtcgtgttgtatgttgt
cagcctagaagaattgctgcaatatcaatggcagatagggtatctaatgagcgaggtgaa
aatattggaatgagcatcggttatcaagttcgacttgaaagctgcgttagccacgatgca
acaataatttattgtacaactggtgttttgacaagaacacttatggatcgacatcagaaa
gataacgaacctgtcaaaggaatgttactgaatgtttctcatataatagtagatgaagtc
catgaacgtgataagcatgtagactttctacttattgccttgcgaatgattttgcccaaa
aatccacacttaaagcttattcttatgtctgcaacagctgatataaatttattttcatct
tacttcgacaactgccctgttttaaaagttgaagggaaaatgtttccagtaacagaatat
tttttagaagacattctagatgatatgaactacgaatctcagtcaatgttaagaataaaa
aatagaacaaaaattgactactgggataacaacatagtactaagagaaacaacagaagcc
attcaaaacatgcaccttacagaaccggtaactactttgagatctgatcaagaatggtta
aagccagaattagatgattgtatgcatcaaatttggttcaatgcggaaattgaacaaatt
gatagaatgatttattatataatgtctgaaggagtacctgtggattatcaacattctgat
acgggtgtgacattgttaatgttagttgctgttcatggtcttaatgattatgtcattatg
cttttaaacatgggagctagtccggttatacaaactagagtacttaataaagatgcagca
acttgggcggctgactttaaacaatacgaaactagggatttaattctcaactataaagga
gctatttcacccaaagagcaaaatgaagcacacaaagaattagatatgatggaaagatta
gagttgtataaaaaaagcttgccaccaagtatccacattgattcttatttaatagcccat
cttgttaaacatataattttaacaaaaaaaccaggttctatattagtgtttttaccaggg
tttgaagatatgtcgatggttaacaaagttataacggaagaacttattgctaaagacgat
tttaaaataaaaatgtatatgttacactctatgatgcagacatccgatcaacaaagagtt
tttttaccagtgccgaaaggatatcgaaaagtcatattggctacaaatattgttgaaact
agtgttactattaatgacattgtttttgttattgattcaggcagagtaaaacaaaaaggt
tataatgcttttaatggaattagttgcatgaatgtaaattggatatcacaaagttgtgct
aagcagagagctggacgcgctggaagattatgtccaggtgaatgctaccgtctatattct
cgagaaaattatagttatatgggaactcatgatgtacctgaaattcttaggatgccttta
caagaattgtgtatgttggctaaagtgatctctagtaatatgagaatattggatttctta
gcattagctatacaaccacctccgacattatctatagtggcagctctagaatatttaaaa
acaattgaagcaatggatattaatgaagatttaacagctcttggatttttcatgttggat
ttgtcaatagagccgcattatgccaagtctttggtttttgcagtatttttaaagtgtctt
gatccagtattaactataattagctgtttagctaatagagaaccttttaacctgactctt
aacgttaacatgaaaacttcacttgggtcaatacgtaaaaaacttgctggtagtacatta
agcgatcatattattctcttacgcctttatcaggcatttaatgaaagaagtaaagttggc
agtgagttaaacaatcttgtatctcaatctgtaatgggtttaattacacagactagaact
caattacttggccaactaagggcattagaacttattcaaatgcgccctggaccaaacgat
atacgagatgttaattcaaactcaaataattgggcagcagttaaagcttgtttattagcc
ggattatatccaaatttggccaaactagataagtctagtccaagaccaattttaaaaact
aaaacggaaaagagtgtggtttatcatggatctagtattttacgcgaaaattattctaaa
gatttaccttctgaatggataatttttgaagaaatgtgttcattcagcacaaaaaaatgt
ataaaaaattgtacagtagtatcaccaatggctgttgctttgtttgcaaatgcaatgaaa
attccccatgattctgtaaaaaacattgaagatttagatgatagtgattgggatactaat
gatgaaacgagtttgccaatagaacagtctggagtattaaacttggatggctggactacg
tttgtagggaatcctgatgatataactaaaattttgaacattcgtttatgccttacgtta
gcatatcgagaattcctgaaaaataaaatgataactattaacagttcctatagtaatgtt
gttcagtcggtagtaaagatcttagctgccgaggatcaagctgtgggccttgaagctcct
gacgatgttggtaagaggcccagagaaaatagtaacaaaggtcgtcatggtagacataac
gacaattcctcatttacctcttttcgtaagcttcaacctcaaaatcaatattctcatggt
aaaggttatccggacaacagctcatacttaactggtggaaacaattgcaccatgaatgga
agtagaggttccagttacagaaaccaaaataattactcgctgccaagtacatctcagtcg
agtaataattttaaatggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
