Aliarcobacter cryaerophilus: ACRYA_0973
Help
Entry
ACRYA_0973 CDS
T06825
Symbol
lptD
Name
(GenBank) lipooligosaccharide transport system, OM translocon component LptD
KO
K04744
LPS-assembly protein
Organism
acre
Aliarcobacter cryaerophilus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
acre00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
acre02000
]
ACRYA_0973 (lptD)
Transporters [BR:
acre02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
ACRYA_0973 (lptD)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AYJ80101
UniProt:
A0AAD0TSI6
LinkDB
All DBs
Position
complement(976992..979145)
Genome browser
AA seq
717 aa
AA seq
DB search
MHKIVISLALASFLIQVNAQELNMEKLQLVAKDVDTKNNIITAIGDVVAYSATYYLSSDK
MVYDKEKEILELFDNVLIIKDNKIQTQSNYAYVDMKNDIINQDPVFLMDNTSNIWSNSKE
ANKDKDVITLENSILSSCDCIDPIWSIRSSSSDYDTEAMWMNTYNPRLYVKNVPVFYLPY
FGFPTDTTRRTGLLLPTMGYSSSEGFLYSQPIFIAPADDYDIELIPQIRTQRGYGSYANF
RYADSPDSMLNVKTGYFKEFDNYRKEEKLENSEHYGLDIDYERKNIFATKKEHQDGVFTS
IRYLNDIEYITLKEQEDNLGTDKKVESKINYFYNTPEYYGGVYGKYYVDASRKTNDNTLQ
ELPQIQLHSYNKELFLENLIYSIDTKAQNFTRKEGLNAKIYDITVPISYTKNILDDYMYL
GVENKTILTQYDYSNSLYNNLRYENGTLIQNTTSFIVGTDLIKPYNDYIHTLNLNASYDV
PENIRKDGDLYNITVKENQPLKYDELSVFPTLQSQKTIKLSLNQSIYDKDNLKQFINHKM
SQSILYNSFDEPKFQDLDNYVKINHDYGSISGKVVYNMNDNKVVEGSFDNSLSYEDLTFS
AGYYYTKKTDNEFNTRDDLESYRLSTSYKLAKDYSIKYYENYDLQEKTRNRQGIGLNIDD
SCWNLDLLLEKEITPRSRYVESTRSYDSHEQTIVYAVLMLKPIGGIRQKSIVKDSDK
NT seq
2154 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcataaaatagttatttcattagctttagcttcatttttaattcaagtaaatgcacaa
gaattaaatatggaaaaattacaacttgttgcaaaagatgttgatacaaaaaataacatt
ataactgcaattggtgatgttgttgcatactctgcaacatattatttaagttctgataag
atggtttatgataaagaaaaagagattttagaactttttgataatgtattaattatcaaa
gataataaaattcaaactcaaagtaactacgcttatgtagatatgaaaaatgatattata
aatcaagacccagtatttttaatggataatacttcaaatatttggtcaaactcaaaagag
gcaaataaggataaagatgtaataactcttgaaaactctattttatcttcttgtgattgt
attgatccaatttggagcattaggtcatcaagtagtgattatgatactgaagctatgtgg
atgaatacttataaccctagactttatgtaaaaaatgtccctgttttttatcttccatat
tttggttttccaacagatacaactagacgaacagggcttttacttccaactatgggatat
tcaagtagtgaaggttttttatattcacaaccaatatttatagctcctgctgatgattat
gatattgagttaattcctcaaataagaacacaaagaggatacggaagctacgcaaatttt
agatatgccgatagtcctgatagtatgcttaatgtaaaaacaggatattttaaagagttt
gataactatagaaaagaagaaaaacttgaaaatagcgaacattatggtttagatattgat
tatgagagaaaaaatattttcgcaacaaaaaaagagcatcaagatggagtttttacttca
attagatacttaaatgatattgaatatataacattaaaagaacaagaggataatttaggg
actgataaaaaagtagagtctaaaataaactatttttataatacacctgaatattatggt
ggagtttatgggaaatactatgtagatgcttcaagaaaaacaaatgataatactttgcaa
gagttgccacaaattcagcttcactcatataacaaagagttgtttttagaaaaccttata
tactctatagatacaaaagcacaaaatttcacaagaaaagagggcttaaatgcaaaaatc
tatgatataactgttcctattagttatacaaaaaatattttagatgattatatgtattta
ggcgttgaaaataaaactatcttaactcagtatgattatagtaactctttgtataataat
ttaagatatgagaatggaactttaatccaaaatacaacctcttttattgttgggacagac
ttaataaagccatataatgactatattcatactttaaacttaaatgctagttatgatgta
cctgaaaatataagaaaagatggagacttgtacaatataacagtaaaagaaaatcagcca
ctaaaatatgatgaattaagtgtttttccaactctacaaagtcaaaaaacaataaaatta
tctttaaatcagtcaatttatgataaggataatttaaaacagtttataaatcataaaatg
tcgcaatctattttatataacagttttgatgaaccaaaatttcaagatttagataactat
gtaaagataaatcatgattatggttcaatatctggaaaagttgtttataatatgaatgat
aacaaagttgttgaaggaagttttgataactcattaagttacgaagatttaacttttagt
gctggttattattatactaaaaaaacagataatgagtttaacacaagagatgatttagaa
tcatatagattatcaacttcttataaattagcgaaagattactctataaaatattatgaa
aactatgatttacaagaaaaaacaagaaatagacaaggaatagggttgaatatagatgat
agttgttggaatttagatttactacttgaaaaagagataactcctagaagtagatatgtt
gaaagtacaagaagttatgatagtcatgaacaaactattgtatatgcagttttaatgcta
aaaccaattggtggaataagacaaaaatctatagttaaagatagcgataagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
