Alysiella crassa: LVJ80_15435
Help
Entry
LVJ80_15435 CDS
T08264
Name
(GenBank) calcium-binding protein
Organism
acrs
Alysiella crassa
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HemolysinCabind
HCBP_related
BapA_N
RTX_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XHH48585
LinkDB
All DBs
Position
complement(1410244..1414713)
Genome browser
AA seq
1489 aa
AA seq
DB search
MPSPPSNEDTPTPSQTPPSSDGGSPIPPDGLPPSSDGAPLPPDGSPSPTPTKYPNPADYP
GGRIPMPWEDPNHPRYPQMPRIKLPFPMPTAKKPTHHDDGSQCVPVALPWVRPNGPKYHI
VDPLVLDLDGNGIQAVAANGFSGSLFDFNGDGIRTATAWFAKGDGLLVRDLNGNGTIDNG
TEIFGDETRLKNGEKAAHGFEALADLDSNQDGKVDATDEAFGSLKVWKDDNQDGVSQADE
LHGLDTLGIAALNVAYKDVNEDLGNKNRLAQLGSYDKADGSQGKMGDLLFDTNPLYSQFK
DRVEMTLAQFLSANVQGMGRVRDLNQAAVGSETLAAVVKEYSAAETKSAQFGLLDKLLVE
WAKTDNRFGTYEIAFSSAWVQTQNEGIGLTPTQAAQIINQSVKVSDETKQALEVSREKIA
VLDALTGMDSQKLYITGNDDAKKVVDLANKTYADVSASVYQTLLFQTRLKPYVAEIALRL
EEGNQLVWDFSALQAAFEQVHASNPQKALVDLGEFLAYGNVPTWYAGRTLMKRYVDEARS
AGTLDSLLAELGKDTVALLSKTHGDKENNVLQNVGLQNSSYTYLSGNDGDDVLIASAGEN
SHLSGGYGSDVYVLGRDFKSVSISNGSRNQDDVDTIYFTDGIKQADLTFTRNSNNLLIQT
KEGDNQVTVSNFFYADDYQINRIIFEDGTTLTVDNIKEMVQQSTDGRDNLYAYDSGSLIS
AGAGDDYLYGAKGNDTLNGDDGNDYLYGRAGDDVLNGGAGNDNLSGEDGDDTLNGGAGSD
GLNGGQGHDTLNGGEGNDSLNAGDGSDVYVFAKNFGQDTIYNYDKSANRVDTIQFTDGIK
QTDLTFTRSNDNLLIKTKEGDNQITVSNFFYADDYQIDRITFEDGTVLDVAAIKEMVQQG
TDERDNLYAYDSGSLISAGAGNDYLYGAKGNDTLNGDDGSDQIYGRAGDDVLNGGAGNDS
LQGDAGNDTLNGGEGNDSLNAGDGSDVYVFAKNFGQDTIYNYDKSANRVDTIQFTDGIKQ
TDLTFTRNGDNLLIKTKEGENQVTVSNFFYADDYQIDRITFEDGTVLDVAAIKEIVQQGT
DSRDNLYAYDSGSLISAGAGNDYLYGAKGNDTLNGDDGNDYLYGRAGDDVLNGGAGNDNL
QGDAGNDTLNGGEGNDSLNAGDGSDVYVFAKNFGQDTIYNYDKSANRVDTIQFTDGIKQA
DLTFTRNGDNLLIKTKEGENQVTVSNFFYADDYQIDRITFEDGTVLDVAAIKEMVQQGTD
ERDNLYAYDSGSLISAGAGNDYLYGAKGNDTLNGDDGNDYLYGRAGDDVLNGGAGNDNLQ
GDAGNDTLNGGEGNDSLNAGDGNDMLNGGAGDDSLTGGEGNDTYVFTQGSGKDTIYNYDT
SANHQDTVRFEGMRAENVQFTKSGSDLVLTQQDGSSVRISNHFYHANYAVEHFAFDDQTI
SNPDFAKYVNSANQLIQAMSVFGQSSAVGSEVMNVVQNQNTPNLLVTNA
NT seq
4470 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccatctccaccatcaaacgaagataccccaacaccttcccaaactccaccatcatct
gatggtgggtcgccaataccgcctgatggtctcccaccatcgtccgatggtgcgccacta
cctcccgatggttcaccatctcccacgcccaccaaatacccaaacccagccgattatcca
ggtgggcgaattcctatgccttgggaagaccctaatcatccgcgctatccacaaatgccg
cgcattaaattgcctttcccaatgcccaccgcaaaaaaacccactcatcatgatgatggt
agccaatgcgtacccgtagccttgccatgggtgcgcccaaatggaccgaaataccatatt
gtagacccgcttgtgttggatttagatggcaatggcattcaagcggtggcggcaaatggt
ttttcaggcagcctgtttgattttaatggcgatggcattcgcacggcaactgcttggttt
gccaaaggcgatggtttgctcgtgcgcgatttaaatggcaacggcacaattgacaatggc
acagaaattttcggcgatgaaacgcgcctgaaaaatggcgaaaaagccgcacatggtttt
gaagcattggcggatttggatagcaatcaagatggcaaagtggatgcgactgatgaagca
tttggcagcctgaaagtttggaaagatgataatcaagatggtgtgagccaagcagatgag
ttgcatggtttagacactttgggcattgctgcgctgaatgtggcgtataaagatgtcaat
gaagatttgggcaacaaaaaccgtttggcgcaattgggttcgtatgacaaggcagatggt
tcgcaaggtaaaatgggcgatttgttgtttgataccaatcctttgtatagtcagtttaaa
gaccgcgttgagatgactttggcacaatttttgtctgccaatgttcagggcatgggtcgt
gtgcgtgatttgaatcaggctgcggtggggtcggagacgttggctgctgtggtaaaagag
tatagtgcagcagaaaccaaatcagcacaatttggtttattagacaagttgttagtggag
tgggcgaaaacagataatcgttttggtacttatgagattgcgttttctagtgcatgggtg
caaacgcaaaatgaggggattggcttaacgcctacgcaggctgctcaaattattaatcag
tctgtaaaagtatctgatgaaaccaagcaggctttggaagtttcgcgtgaaaaaattgcg
gtattagatgctttaacaggcatggattcgcagaaattgtatattactggcaatgatgat
gcgaaaaaagtggttgatttggcaaataaaacatatgctgatgtcagcgcgtctgtgtat
caaaccttgctgttccaaactcgcttgaagccttatgttgctgaaattgccttaagattg
gaagaaggtaatcaattggtgtgggatttctctgcgcttcaggctgcctttgagcaagtt
catgccagcaatccacaaaaagcattggtggatttgggtgaatttttggcgtatggcaat
gtgccgacttggtatgcaggtcgcacattgatgaagcgttatgtagatgaagcacgcagc
gcaggtacgctggatagtctgttggctgaattgggtaaagacacagttgccctgttaagc
aaaacccatggcgataaagagaataatgtgttgcaaaatgtgggtttgcaaaatagctct
tacacctatttgtctggtaatgatggcgatgatgtgttgattgccagcgcaggggagaat
agtcatttgtcaggcggctatggttcagatgtttatgttttgggtcgtgattttaaatcg
gttagtattagtaatggcagtcgcaatcaggacgatgtggatacgatttattttaccgat
ggcattaaacaagccgatttaactttcacacgcaatagcaataatttattgattcaaacc
aaagagggtgataatcaagttaccgtatccaatttcttctatgccgatgattatcaaatt
aaccgtatcatttttgaagatggcacaactttaactgttgataatattaaagaaatggta
caacaaagcacagatggtcgcgataatttgtacgcttatgattcaggcagcctgatttct
gctggggctggcgatgattatttgtatggtgccaaaggtaacgacacattgaatggcgat
gatggcaatgactatttgtatggtcgtgctggtgatgatgtgttaaatggtggtgctggt
aatgataatttgtctggcgaagatggcgatgataccttaaatggtggtgctggtagtgat
ggtttgaacggtggtcaaggtcatgacacgctcaatggtggcgaaggcaacgacagcctg
aatgctggcgatggtagtgatgtctatgtttttgctaaaaactttgggcaagataccatt
tacaactacgacaaatccgccaaccgtgtggataccatccaatttaccgatggtattaaa
caaactgatttaaccttcacacgaagcaatgataatttgttgattaaaaccaaagagggc
gataatcaaattaccgtatccaatttcttctatgccgatgattatcaaattgaccgtatt
acttttgaagatggcacggtactggatgttgctgcgattaaagaaatggtgcagcaaggt
actgatgagcgcgataatttgtacgcttatgattcaggcagcctgatttctgctggagct
ggtaatgactatttgtatggcgcaaaaggcaatgacaccttaaacggcgatgatggcagc
gaccaaatctatggtcgtgctggcgatgatgtgttaaatggcggtgcgggcaatgatagt
ttgcaaggcgatgcgggtaatgacacgctcaatggtggcgaaggcaacgacagcctgaat
gctggcgatggtagtgatgtctatgtttttgctaaaaactttgggcaagataccatttac
aactacgacaaatccgccaaccgtgtggataccatccaatttaccgatggtattaaacaa
actgatttaaccttcacacgcaatggcgataatttgttgattaaaaccaaagagggcgag
aatcaagttaccgtatccaatttcttctatgccgatgattatcaaattgaccgtattact
tttgaagatggcacggtattggatgttgctgcgattaaggaaatcgtacagcaaggcaca
gacagtcgcgataatttgtacgcttatgattcaggcagcctgatttctgctggagctggt
aatgactatttgtatggcgcaaaaggcaatgacaccttaaacggcgatgatggcaatgac
tatttgtatggtcgtgctggcgatgatgtgttaaatggcggtgcaggcaatgataatttg
caaggcgatgcgggtaatgacacactcaatggtggcgaaggcaacgacagcctgaatgct
ggcgatggtagtgatgtctatgtttttgctaaaaactttgggcaagataccatttacaac
tacgacaaatccgccaaccgtgtggataccatccaatttaccgatggtattaaacaagct
gatttaacattcacacgcaatggcgataatttgttgattaaaaccaaagagggcgagaat
caagttaccgtatccaatttcttctatgccgatgattatcaaattgaccgtattactttt
gaagatggcacggtattggatgttgctgcgattaaagaaatggtgcagcaaggtactgat
gagcgcgataatttgtacgcttatgattcaggcagcctgatttctgctggagctggtaat
gactatttgtatggcgcaaaaggcaatgacaccttaaacggcgatgatggcaatgactat
ttgtatggtcgtgctggcgatgatgtgttaaatggcggtgcaggcaatgataatttgcaa
ggcgatgcgggtaatgacacactcaatggtggcgaaggcaacgacagcctgaatgctggc
gatggtaacgatatgctcaatggcggtgcaggtgatgatagtttaactggtggggaaggt
aacgacacttatgtatttacacaaggttcgggtaaagataccatctacaattatgataca
tctgcaaatcatcaagatactgtgcgttttgaaggtatgcgtgcagaaaatgttcaattt
acaaaatctggttctgacttagttttaactcaacaagatggtagtagtgttcgtatcagc
aatcatttctatcatgcaaattatgctgttgaacattttgcttttgatgaccaaaccatt
agtaatcctgattttgccaaatatgtaaattcagcaaatcaattaattcaagctatgtca
gtatttgggcaaagttctgcagttggtagtgaagtgatgaatgtggtgcaaaatcaaaat
acgcctaatttactggttacaaatgcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
