Entry |
|
Symbol |
notch3, notch2
|
Name |
|
KO |
|
Organism |
acs Anolis carolinensis (green anole)
|
Pathway |
|
Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:acs00001]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
100567900 (notch3)
04371 Apelin signaling pathway
100567900 (notch3)
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
Position |
2:complement(103174777..103238951)
|
AA seq |
2400 aa
MGRAGAPWLGLALLLGVCARVALAAGVQCLDGEKPCENGGSCVVYSNGIAACICQAGLIG
EHCQFQDPCHQSPCANGGSCESTLRDGTVHYQCTCLKGFRGQDCSLFDACSSSPCLNGGR
CTNWNGRYNCTCPSGYQGRNCRGDVDECRVLGLCQHGGTCLNTPGSFRCQCQAGYTGQHC
ESISTPCAPSQCLNGGTCRQTGELSYECACLPGFEGHNCEINIDDCPEHMCMNGGTCVDG
VNTYNCQCPPEWTGQFCTEDVDECQLQPNACHNGGTCFNTNGGHTCVCVNGWTGESCSEN
IDDCQTAVCFHGATCHDRVASFYCACPMGKTGLLCHLDDACVSNPCHEDAICDTNPMNGR
AICTCPPGFTGGACDQDVDECSIGANPCEHFGKCVNTQGSFQCQCGRGYTGPRCETDINE
CLSMPCQNDATCLDRIGEFTCICMSGFSGTYCEININECESNPCVNGGVCKDIVNGFSCT
CPSGFSGSMCQIDIDECASTPCQNGAKCVDRPNAYECRCTEGFEGTLCEKNIDDCLPDPC
HHGDCVDGIASFTCTCVAGYTGYRCENQINECHSNPCQHGGKCIDLVNKYLCHCQPGTSG
ANCEINFDDCASNPCDYGICRDGINRYDCICKPGFTGPLCNVEINECASNPCKNGGTCLD
GEDGFSCLCPEGFHDPHCYSEVDECSSSPCVHGACRDDINGYRCECEPGWAGTNCDVNRN
ECESNPCQHGGTCTDYVNGYRCKCKEGFQGTYCQTNVNDCASSPCLNKGTCIDGIASYEC
LCDLPYTGRNCETVLAPCSSNPCENNGVCDHTPDYEGFTCGCAPGWQGQQCHIDINECDQ
NPCRNRGTCTNTLGSYRCACRPGYTGTNCELDIDDCTPNPCLNGGSCQDGISSFTCTCLA
GFTGVRCATETNECFSNPCRNGATCTDYVNSYTCSCAPGWTGLHCEHNVQECTDSSCFNG
GTCLDGVNSYTCHCRAGFTGSHCQHEINECQSQPCLNGGVCQDGVQSYRCTCPQGYTGAQ
CQTLLDLCSRSPCQNGGRCVQTGTTVSCDCPGGWTGRYCDIPNVSCEVVARNRGVTKEQV
CHYGGRCVDAGNTHYCICKKSYTGSYCESEVNHCQHSLCRNGGTCRSFVGGYICECPLGF
EGKNCEYNIDECQSHPCQNGGTCIDLVGHYICSCPPGTLGVLCEINEDDCAMNPGSRIPK
CLNNGTCVDRVGGYRCSCPPGFTGERCEGDINECQSNHCHPRNTLDCVQEASDYHCICKP
GYTGRHCKNIVNACESQLCQNGGQCKLAVNLPLGYTCHCPRGYSGLNCERSVLSCRELLC
LNGGTCRTSVLGARCYCPPGWAGPDCRLRANSSCANLPCHNGGACHEISTPPYFQCLCLG
DFSGPRCQTPRYMRPPPAPEVRCPLEECAAKAGDSYCDKMCNTPICHWDGGDCSLLVDDP
WKQCENPQCWEYFNNSQCDELCNTVECLYDNFDCKNRERTCNPVYEKYCSDHFADGRCDQ
GCNNEECGWDGLDCAREVPEHLANGVLVITVLLHPDELIRTSTVFLQKLSAILRTSLRFR
LDENGNYMIKPYYGSGGRHRRELGQEIIGSEVTLEIDNRLCYQASDKCFPDAQSAADYLA
ALSAVERLEFPYPLKAVKGVKVEVPIDPLKLLPLLVVAALILLVILVLGVLVARRKREHS
TLWFPEGFSLKKENSNKNRREPVGQDALGMKNIGKGESLIPDSSEDWLEAECPEAKRLKL
QNCALSCQVEEPAIDCEDPVDCRQWTQHHLVAADIRMPPSMALTPPQGEFDTDCMDVNVR
GPDGFTPLMLASFCGGGMETDLAEEEEADDSSANIISDLICQGANLSAQTDRTGETALHL
AARYARADAAKRLLDAGADTNAQDNTGRTPLHAAVTADAQGVFQILIRNRSTDLDARMGD
GSTALILAARLAVEGMVEELIACHADVNAVDELGKSALHWAAAVNNVEATIALLKNGANK
DMQDSKEETPLFLAAREGSFEAAKILLDHFANREITDHMDRLPRDVAQERLHHDIVRLLD
DYNTVRSPQGGLPAGHSLSPLMCPPNSYLPSLKPTPQGKKSRRPSAKNVAAGSSASLARE
SKEAKARAKKLNLECQGTLLESSVTLSPVDSLDSPYVPNPASPGVFHAASASLSVPSTPM
VHGMMEAPFAVSLARLSDLGDGTLLSMNRLSVPPGRMGLSLGMVSPVAMPFDWHARVPTS
QCQPIIGVVHPAASHPNLHQPGQAFPPGLLLPNHMAMGHSSQGLPNPAPAQTKEAAQPMP
PPATTMRVNQPVSPQEGQGQGVPRAGPPQYLKSAGVEDYPTPPSQHSYTQGQDATPKHFL
HPTSEHPYLTPSPESPEQWNSPSPHSLSDWSESTPSPTVLGPSHTQLPSAEPSTKMQVFA |
NT seq |
7203 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgggccgggcgggggccccttggctgggcctggcgctgctgctgggcgtctgcgcgcgg
gtggccctcgcggcaggtgtacaatgcttggatggtgagaaaccctgtgaaaacggtggg
agttgtgttgtctactccaacgggattgctgcctgcatatgccaggctgggctgattgga
gaacactgccagtttcaagacccttgccaccaatctccttgtgctaatggaggctcatgt
gagagcaccctgcgtgatggcactgtccactatcagtgcacctgtcttaagggcttcaga
ggtcaagactgttccctgtttgatgcttgttccagcagcccttgtcttaatggtggccgc
tgcaccaactggaatggccgctacaactgtacatgcccatcaggctatcaaggccgcaac
tgccggggcgatgtggatgaatgccgggtgcttggtctttgccagcatggtggtacctgc
ctcaatacacctggttctttccgctgccagtgccaagctggctacacaggacagcactgt
gagagcatttccacaccttgtgccccctctcagtgtctcaacggaggcacttgtcgccag
acaggagaactcagctatgagtgtgcttgcctacctggcttcgagggacacaactgtgag
attaatatagatgactgtccagagcacatgtgcatgaatggaggcacttgcgtagatggc
gtcaacacctacaattgccaatgccctcctgagtggacaggtcagttttgcactgaggat
gtggatgaatgccagctgcaacccaatgcctgccacaatgggggcacttgcttcaacacc
aatggggggcatacatgcgtctgtgttaatggctggactggggagagctgcagtgagaat
attgatgactgccagactgctgtctgcttccatggtgctacctgtcatgaccgcgtggct
tccttctattgcgcatgccctatgggaaagacaggactcctctgtcacttggatgatgcc
tgtgtcagtaacccttgccatgaggatgccatttgtgataccaatcccatgaatggccgt
gccatctgtacctgccctcctggctttactggaggggcctgtgatcaggatgtggatgaa
tgttccattggagccaatccatgcgaacactttgggaaatgtgtcaatactcaaggctct
ttccagtgccagtgtggacgtggatacacaggtccacgctgtgagacagacatcaatgaa
tgcttatccatgccttgccagaatgatgctacctgccttgaccgcattggcgagtttacc
tgcatctgcatgtcaggtttcagtggtacttactgtgagatcaacatcaatgagtgtgag
agtaatccctgtgtcaacggtggtgtctgcaaggatattgtcaatggattcagctgtaca
tgtccctcaggcttctcaggctccatgtgtcagattgacattgatgagtgtgccagcacc
ccctgccagaatggtgccaagtgtgtggaccgccccaatgcctatgagtgccgctgtaca
gaaggttttgaggggactctgtgtgagaagaacattgatgactgtttaccagatccatgc
catcatggtgattgtgtggatggcattgctagcttcacttgcacttgtgtcgctggctat
actggataccgttgtgagaaccagatcaatgagtgccacagcaatccctgccagcatggt
ggcaagtgcattgacctggtcaacaagtacctgtgccactgccaaccaggaacctcaggt
gccaactgtgagataaactttgatgactgtgccagcaacccctgtgattatggcatctgc
cgagatggcatcaatcgttatgactgcatctgcaaacctggctttacaggtcctctgtgc
aatgtagagatcaatgaatgtgcatccaacccctgcaagaatggtggaacctgtttggat
ggtgaagatggtttctcttgcctttgccctgagggtttccatgatccacattgctattcg
gaggtggacgagtgcagcagcagtccctgtgtgcatggcgcatgccgtgatgatatcaac
ggttaccggtgtgaatgtgagccgggctgggctggcaccaactgtgatgtgaaccgcaat
gaatgcgaatccaatccatgccaacatgggggcacctgcacagactatgtcaatggctac
cgctgcaaatgcaaagaaggcttccagggaacctactgccagaccaatgtaaatgactgc
gcctccagcccctgcctcaacaagggtacctgcattgatgggattgctagctatgaatgc
ctctgtgacttgccttacactggccgtaactgtgagactgtgttggccccctgctcttcc
aatccatgtgagaacaatggtgtctgcgatcacacaccagactatgaggggtttacctgt
ggctgtgcaccaggctggcaaggacagcaatgccacattgacattaatgagtgtgatcag
aacccatgtcgaaacaggggtacctgcaccaacacacttggcagctaccgatgtgcctgc
cgccctggctacaccggcaccaactgtgagctggatattgatgactgcacacctaatcct
tgcctgaacggtggctcctgccaggatggtatcagttcttttacatgtacctgcctggct
ggcttcacaggagtacgctgtgcaaccgagaccaatgaatgctttagcaatccatgccgc
aatggggccacctgcacagactacgtcaacagttacacttgctcttgtgcaccaggatgg
actggtcttcactgtgagcataatgtacaggaatgcacagatagctcctgcttcaatggt
ggaacctgcctggatggagtgaattcatatacgtgtcactgtcgagctggcttcacaggc
tcccactgccagcatgagattaatgagtgccagtcacagccctgcctcaatggcggtgtg
tgtcaggatggtgtgcagtcctatcgctgtacctgcccacagggttacacaggggctcaa
tgccagaccctgctggatttgtgcagtcgctctccatgtcagaacggtggccgctgtgtg
cagacagggactactgtatcttgtgattgtcctggaggctggactggtcgttactgtgac
atacccaatgtttcctgtgaagttgtggccaggaacagaggtgtaaccaaggagcaagtg
tgtcattatggtggccgttgtgtggatgctggaaatacccactactgcatttgcaagaaa
agctacacaggcagttactgtgaaagtgaagtcaaccactgccagcacagcctgtgccga
aatgggggcacttgtcgcagttttgtgggaggctacatctgtgagtgtccgctaggcttt
gaagggaagaactgtgaatataacattgatgagtgtcagtcacatccttgtcagaacgga
gggacttgcattgaccttgtgggtcactacatttgttcctgtccaccaggaactctgggt
gtcttgtgtgaaatcaatgaggacgattgtgctatgaatcctggcagtcgcatccccaag
tgcctcaataatgggacctgtgtggacagagtgggtggctaccgatgcagctgcccacca
ggctttacgggtgagcgttgtgagggggacataaatgagtgccagtccaaccactgccac
ccacgcaacacactggactgcgttcaggaagccagtgactaccactgtatttgcaagccc
ggctatactggccgacactgcaagaatattgtgaatgcctgtgagtctcagctttgccaa
aatggtggacagtgcaagctggcagtaaacctgcctctaggatatacctgccactgcccc
cggggctactcgggcttaaactgtgagcgcagtgtcctgtcctgccgggaactcctctgc
ttaaacggtggcacctgccggacctcagtcctgggtgctcgctgctactgccctcccggg
tgggctggacctgactgccgcttgcgtgccaatagtagctgtgcaaacctgccctgtcac
aatgggggtgcctgccatgagatttctactcctccttatttccagtgcctttgtctcggg
gacttctcaggcccacgctgccagactccacggtacatgcgtccccctccggcccccgaa
gtccgttgtccactggaagagtgtgctgccaaggctggagactcctactgtgacaagatg
tgtaacaccccaatctgtcactgggatgggggtgactgttccctgttggtggatgaccct
tggaagcaatgcgagaacccacagtgttgggagtacttcaacaacagccagtgtgatgag
ttatgcaacactgttgagtgcctttatgataactttgactgcaaaaaccgagagcgtacc
tgcaaccctgtttatgaaaaatattgttctgaccattttgctgatggacgctgtgaccag
ggttgtaacaatgaagaatgtggctgggatggtcttgattgcgcccgagaggtgcctgag
catttggccaacggcgttctggtcatcacagtgctgcttcatcctgacgaattgatccgc
acaagcactgtcttcctccagaagctgagtgccatcttgcgaacttcactgcgcttccgc
cttgatgaaaatggcaattacatgatcaagccatactatggttctggtggtcgacatcgc
agggaactgggtcaggagatcattgggtctgaggttactctggagattgataaccgtctc
tgctatcaagcatcagacaagtgcttccctgatgcccaaagtgctgctgactaccttgct
gctctgtcagctgtagagcgccttgagttcccataccccctcaaggctgtaaaaggtgta
aaggtggaagttccgattgacccactcaagctgctgccattgcttgtggtagcagccctg
atcctcctagtgattctggtgttgggcgtgctggtagcacgacgcaaaagagagcatagc
accctctggtttcctgaaggcttcagcttgaagaaggagaatagcaacaagaaccggcgt
gagcctgtgggccaggatgcccttggcatgaagaatattggcaaaggggagagcctcata
ccagacagctcagaagactggttggaagcagaatgcccagaggccaagagactaaagtta
cagaactgtgctctttcctgccaggtggaggagccagctatagactgtgaagaccctgtg
gactgccgccaatggacacagcaccatttggtagcagcagacatccgcatgcccccttct
atggcccttacgccaccccagggtgaatttgacactgactgtatggatgtcaacgttcgt
ggaccagatggtttcacgccacttatgctggcctccttctgtggtggaggcatggagaca
gatctggctgaggaagaggaggcagatgattcttcagccaacataatctcagacctaata
tgccagggggctaacctaagtgcccagacagaccgcactggcgagactgcattgcacttg
gctgccagatatgccagggctgatgctgccaaacgtttgctggatgctggtgcagacacc
aatgcacaggacaacacagggcgaacaccacttcatgccgctgtgactgctgatgcccag
ggagtctttcagatcctaatccgaaatcgatctacagatttggatgcccgaatgggggat
ggctcgacggcactgatactggcagccaggctggctgtggagggcatggtggaggaactg
attgcttgtcatgctgatgtcaacgctgtggatgagttgggtaaatcagccctgcattgg
gcagcagctgtcaacaatgtagaggccacaattgcactgctgaagaatggtgctaacaag
gacatgcaagatagcaaggaggagacgcccctgtttttggcagcccgggagggcagtttt
gaggcagccaaaatcctgctggaccacttcgctaaccgtgagatcacagaccatatggat
cggctgccgcgtgatgtggctcaggagcgcctgcaccacgacattgtccggcttttggat
gactacaacactgtgcgcagcccacaaggggggctacctgctggtcattccctttcccca
ctcatgtgcccccctaacagctacttacccagcctcaagcccactccacagggcaagaag
agccgacggcctagtgccaagaatgtggctgcaggcagcagtgccagcctggcccgggag
agcaaagaggccaaagcacgtgccaagaagctcaacctggagtgccaaggtactctcctg
gaaagttctgtcaccctgtctcctgttgactcgctggactccccctatgtgcccaaccct
gcttcgccaggggtttttcatgcagctagtgcctcgctgtcagtcccctccactcccatg
gtccatggcatgatggaagccccttttgctgtcagcttagcacgcctcagtgacctaggg
gacggtacccttctctccatgaaccgcctctcagtgccacctggccgcatggggctcagt
ctgggcatggtgagccctgtggccatgccttttgattggcatgcccgtgtccctacttcc
cagtgccagccaatcataggagttgtgcacccggctgcctcccatcctaatctacaccag
cctggccaagctttcccacctgggctgcttctgcctaaccacatggccatgggtcacagt
tcacaggggctgcccaacccagctccggcacagaccaaggaggcggcccaacccatgccc
ccgccagcaaccaccatgcgcgtcaaccagccggtctcaccccaggagggccagggccaa
ggggtgccgcgtgcagggcccccgcagtacttaaagtcagcaggagtggaggattaccca
acacctccctctcaacacagttacacacagggtcaggatgcgacacccaagcacttcctc
caccccacaagtgagcacccttacctgaccccctccccagagtccccggagcagtggaat
agtccttctccacactccttgtccgattggtctgaatccacacccagccccactgttttg
ggcccaagccacacccagcttccttcagcagagccatctactaaaatgcaggtgtttgca
tga |