Actinomyces sp. zg-332: HCQ94_05145
Help
Entry
HCQ94_05145 CDS
T08424
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
actm
Actinomyces sp. zg-332
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SpaA
SdrD_B
CarboxypepD_reg
bMG3
Ig_DR_A0283-like
Y_Y_Y
CarbopepD_reg_2
DUF2606
DUF4198
MG4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QPK93958
LinkDB
All DBs
Position
complement(1275978..1280714)
Genome browser
AA seq
1578 aa
AA seq
DB search
MRKILSVLLILALGVITYIAPAYADIKNDTLKVDIKIINIEGDNSTNDRSEYWVNENINA
AADINISGEGASLSEPWARITVPKLRGKVYKPQFVDSQKAYQTTHTQDGNNWYVTYKFKE
LSGGNRLTFPFPFKFNETPTRNGDSVDVKFEILDGNSSNPKNVLYSTTKTYTAKIEEVEY
NNSILKFPHATRNTYTNKYSFSYYVTDPSQKDTGNNARENKLNAISYYDLPSLTTGSVRY
ITPENIKTIITIPEGITFDTEKNPGWTYDENTRTAVQTVVKPKTTDVYVKDGNDKKLGYK
AEPIITFKNTPFGTYTINAKYIVDSGLETERELPSRDVVFDVGVKTFQQYGGMYIYKTGH
ELNSENHAYSYVNDKYYVTDEEYSDMQYVSRFSAYNNGSSPTDSTNGIVTNLYKLTDTLD
DERIHYTGFKINFDSATSEVKGDKTEWLEKHKARFNAANFKLYGVKDNGDRVLVASNIQM
DTRVDVTDSNREFVKLELESDNPFMLDNVFGRICTYVAINDKDKAKWDNGEYTTPQKITS
GIEATIKIAKEPDMDTANLIVRKDLSNKENSYLNVGAISPQARIFSTADTTVVYKKSGST
TYRFLEGSFGFGTWGPLNKLENVKYVTLLPPGVEYVRRASVAPSSLTPPAPTVIPNYKNT
GKTAVITEMGDLDFEVLKTKTVNVRYELELTVHASKGNNEVVDYITYDNNALVKPLYASE
GEADRLDLDDDGDRDEVFLARSSNINFIPPLELVVTKQVSNNKNNFSFSSGVDFGSEFFY
RIRISNNTISDARIVDVLDVLPYVGDHVIVANDAGKYVNRGSVFATTLSNSVESVPENAE
ALELYDVFYQLTPQGADLESVRDGAWVSATDVPNGDFSTVKSIKLTLKPGKKIASNQEVG
IIVPVRMPVDKSLTEKDFAYNTSAISTDRILFSEGNKTSVTPNKYSISGTYFKDFNADGL
IGDTDDKVAGRQVELIDATTGNVATDIDGTPIPSVTTDENGKYSFTVYKQGEYIVRFAKE
NTETFTSVNNKKANNSNIETSADDHGDSYRINLTPLMSKATVNAGLLSDKRDVVISKVSS
VAGENGIKPGLENVEFKLYSMADDSLVATTTTNEVGRAVFANIPFGEYKIVESRPLPGYE
VLEPNGRVINLTNGDFPIQIFENAPIKGTVTVTKTDSDTNSPIANVVFALKQGDNEVATA
TTDAQGVVTFSNVKYGEYTLVEKTPLEGYVASTRTETVNIDSNGKSVVFADWKNTKIKGS
VSVLKHDGDTNSPLAGVVFALMQNGQEVATATTGQDGVATFSSVVYGAYTVVEKSTLDSH
VLNTETVYNADVRTDGENVFVNENDPLLNYEKKGTVTVTKTDSDTNEAISGVVFALKQGD
KEIATATTGQDGVATFSNVKYGEYTLVEKTPKVGYVASTRTETVNIDTNGKSVAFADWTN
TKVKGSVVVSVTDKVAGAPISGALVELREKETGKVVSRGKSDSAGKVIFADVPYGDYEVV
QVASTDKYIFSTDPISVSITENGSVNKVFITNTLKVELKKVSRKRLVNTGVETSALYLMG
IFGILGLALIVSRKKQSE
NT seq
4737 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcggaaaatattatcagtgttgctgatattggctttaggagtaataacttatattgct
ccagcttatgccgatattaaaaatgacactttaaaagtagatataaaaattatcaatatc
gaaggtgataattcgactaatgaccgatcagagtattgggtaaatgaaaatattaatgct
gctgctgatattaatatatcgggtgaaggagctagtttatctgaaccttgggctagaatt
actgttccaaaacttagaggtaaagtttacaaacctcagtttgttgattcgcaaaaagct
tatcaaactactcacacacaagatggcaataactggtatgttacttataagtttaaggaa
ttatccggtggtaatcgtctgactttcccatttccttttaaatttaatgaaacccctaca
cgtaatggtgactccgtagatgtaaaatttgagattttagatggaaatagtagcaatcct
aaaaacgtattgtattcaacgactaagacttatactgctaaaatagaagaagttgaatat
aataattcaatattaaaatttccacatgctacaaggaatacatataccaataaatatagc
ttctcatattatgtaaccgacccgtctcaaaaagatacaggtaataatgctcgcgagaat
aaacttaacgctatttcttactatgatttaccatctttaacaacaggtagtgttaggtat
attactcctgaaaatataaagactattattacgataccagaaggtattacttttgatacg
gaaaagaatcctggttggacttatgatgagaatactcgtactgctgttcaaacagttgta
aaacctaagacaactgatgtttatgttaaagatggcaacgataaaaaattaggatataag
gcagaacctattattacatttaaaaacactccttttggtacttacactattaatgcaaag
tatattgttgattctggtttagaaacagaacgtgaattgccttcaagggatgttgtattt
gatgttggggttaagactttccaacaatatggcggtatgtatatttataaaactggtcac
gagttaaactcagaaaaccacgcttacagttatgtaaatgataaatactatgttactgat
gaagagtattctgatatgcagtatgtatcaagattctcagcgtataataatggttcttct
ccaaccgatagcacaaatggtattgttactaatctttataagcttacagatacattagat
gacgaacgtatacattacactggttttaaaatcaactttgattcagctactagtgaggtt
aaaggggataaaactgagtggcttgaaaaacataaggctcgttttaatgctgctaacttt
aaactttatggtgtaaaagataatggtgatcgtgtattagttgcatctaatatacaaatg
gatacacgtgtagatgttactgattctaatcgagagtttgtaaaactagagctagaatcc
gataaccctttcatgctcgataacgtgtttggtagaatttgcacttatgttgctataaat
gataaagataaagctaaatgggataacggagaatatacgactcctcagaaaattacttct
ggaattgaggctactataaagattgctaaggaacctgatatggatacagcaaaccttata
gtgcgcaaagatttgtctaacaaagaaaattcttatttaaatgtcggtgcaataagtcct
caagcaaggattttctctactgcagatacgacagttgtatataaaaagagcggaagtaca
acatatcgttttcttgaaggctcatttgggtttggtacttggggacctctaaataaacta
gaaaatgtaaagtatgttactttacttcctccaggtgttgaatatgtgagacgtgcttct
gtcgctccatcaagccttacccctcctgcccctacagttattcctaattataagaatact
ggtaaaacggctgttataactgaaatgggtgatttagactttgaagttctaaaaaccaaa
accgtaaatgttaggtatgaattagagcttactgttcatgctagtaaaggtaataacgaa
gttgtagactatataacttatgataataatgctttagtgaaacctttatatgcttctgaa
ggggaagctgataggttggatttggatgatgacggtgatcgtgatgaagtattccttgca
aggtcatctaatattaactttatccctccactagaacttgttgtcactaagcaggtttca
aataataagaataactttagttttagttcaggtgttgattttggatcagaatttttctac
agaataaggatttccaataacactatttctgacgctagaattgttgatgttcttgatgtt
ttgccttacgtaggtgaccatgtcattgttgctaatgatgcgggtaaatacgtaaaccgt
ggttcagtttttgcaaccactctttctaatagtgtagagtctgtgcctgaaaatgctgaa
gctttggaactatacgatgttttctatcagctaacaccacaaggagctgacttagaaagc
gttcgtgacggagcatgggttagtgcaactgacgttccaaacggagacttctcaacagta
aaaagcataaagctaaccttaaaaccaggcaaaaaaattgcttctaaccaggaagtaggc
attattgttcctgttagaatgccagtcgataagtctttgactgagaaagattttgcttac
aatacatcagctatttcaactgaccgaatactattctcagaaggaaataaaaccagcgta
acacctaataagtacagtatcagtggtacttatttcaaagatttcaatgcagatggactc
attggtgatactgatgataaagttgctggacgtcaagttgaactaattgatgctacaact
ggtaatgtagctactgatattgatggcacacctattcctagtgttactactgatgaaaac
ggtaaatattcgttcacggtttacaagcagggtgaatatattgttcgtttcgctaaagaa
aacacagaaacattcacatctgtaaataacaaaaaggcaaataacagcaatattgagact
tcagctgatgaccacggagattcctaccgtattaacctgacaccattaatgtcaaaagct
actgtgaatgctggtttgctttctgataagcgtgatgttgttattagtaaggtttcttct
gttgctggtgaaaatggtattaaaccaggccttgagaacgttgaattcaaactttactca
atggctgatgattctttagttgcaactacaaccactaatgaagttggtagggctgttttt
gcaaacattcctttcggtgaatacaagattgttgaatctcgtcctttaccaggatatgaa
gtattagaaccaaatggtagagttatcaatttgactaatggagatttccctatacagatt
tttgaaaacgctcctataaaaggtacagtcacagttacaaagactgatagcgatactaat
agcccaattgctaatgtcgtatttgctttgaagcagggtgataacgaggttgctactgct
acaactgatgctcagggcgttgttactttcagtaatgtcaagtacggtgagtatactttg
gttgagaagactccacttgagggttatgttgcttcaacacgtactgaaacagtgaacatt
gatagtaatggtaagtctgttgtttttgctgattggaagaatactaagattaagggtagt
gttagtgttctaaaacatgatggtgatactaatagtcctcttgctggtgttgtttttgct
ctaatgcaaaacggtcaggaagttgctactgctacaactggtcaagatggtgttgctact
ttcagtagtgttgtttacggtgcttacactgtagttgaaaaatcaactcttgactctcac
gttttgaatactgagactgtttataatgctgatgttcgcactgatggtgagaatgttttc
gtgaatgaaaacgatcctcttctaaactatgagaagaagggtacagtcacggttaccaag
actgacagtgatactaatgaagctatcagtggtgttgtctttgctttgaaacaaggtgat
aaggagatagcaactgcaactactggtcaagatggtgttgctactttcagtaatgttaag
tatggtgagtatactttggttgagaagactcctaaggttggttatgttgcttcaacacgc
actgaaacagtgaacattgataccaatggtaagtctgttgcttttgctgattggactaat
actaaggttaaaggttcggttgttgtttctgttactgacaaggttgcgggtgctcctatt
tctggtgctttagttgagttgagggaaaaggaaactggtaaggttgtttctaggggtaag
tctgattctgctggtaaagttatttttgctgatgtgccttatggtgactatgaggtagtt
caggttgcttctactgataaatatatatttagtactgatccgatttcagtttcaattact
gaaaatggttctgttaataaggtatttattactaatactcttaaggttgagttgaagaaa
gtttcacgtaagaggttggtaaatactggtgtagagacatctgctttgtatctgatgggt
atctttggaattttagggcttgctcttattgtttcgaggaaaaagcagagtgagtag
DBGET
integrated database retrieval system
