KEGG   Acinetobacter cumulans: C9E88_008735
Entry
C9E88_008735      CDS       T06087                                 
Name
(GenBank) LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein
Organism
acum  Acinetobacter cumulans
SSDB
Motif
Pfam: LysM SLT LysM3_LYK4_5 NMB0315_dom_I LysM2_CERK1_LYK3_4_5 DUF6406 LysM2_NFP Fer2_4
Other DBs
NCBI-ProteinID: QCO21580
LinkDB
Position
complement(2454406..2457696)
AA seq 1096 aa
MYKPSKNWYELTLPALFKITVLGSALATLGLVGCASSTTATSAHKSKVAGSSGFLDANSL
DGLEDLLSATDMRAVEGDRLLVLKHGDVWKRMTVGFKMDLNHWDSRIEAQRGWFASRQPY
IDRLSARASRYLYHTVKEAERRGMPTELALLPVIESSYDPAATSSAAAAGLWQFIPSTGR
IYGLKQTTQYDGRRDVVESTRAAYEFLGSLYNQFGSWELALAAYNAGPGRIQQAINRNQA
AGLPTDYWSLKLPQETMNYVPRFLAVAQIIKNPNAYGVSLPPIANRPHFREVSVGAANLN
EISSVTGLSRAELYALNPGHRGDQIDAASPMKILIPADISPSVDAKLKKLSSASTGYWAG
GAASSLPKNNVTITPSKVTPPEMNTTVITPSKVAPPVITSTQASKTTPPALTASTVTKGK
PLSVTPQGSSALAAFAANTDIPSAPRIPVAVSPSKATTVKVTAEPPVSTKEREQIMAAIK
AEGENKTVDEVLKPVATQAEQAEVVKELKALAPQGTEIVDPYDGKIKLTAIQTSQSIADQ
QGKELTKGFAYPKSVAEQTGTDSDEAKRNQGKNVIKTDSEIVVVAPKGKRSTYTVQAGDT
LAVIAMKNGVNWRDVAKWNQMDADAKLYVGTSIYLYDAKPIVAEEPKAKVQPEHYVVKAN
DTLTGVASQFGLSVKQLADFNGLNTTSGLFVGQKLALKETPASKAKLAAEAKKAETESKV
QKVQTKVYTVKRGEYLKLIADRYALSNQELADLTSGLTAGSSLMVGQKINVPLNEVESAS
SNSNKVESKPETKSEPSFKTESYNVQRGDTLYSLANQSKMTVSDFANLNNIAATTSLRIG
QTLKIPALNKAPEQYTVQSGDTLSAIANRFELNMDDIASLNGFSRNASLRVGQRLKLTGE
VPVAVVKADPRKDSKSDTRVSSGEAKDTHVVKAGETLSAIAQKYQLQLSYLADLNGLSRN
STVRVGQRLKIDGDVPKVEVDTPKTSKVTTQASSSYSGSTESYTVKSGESLNAIANRTGV
SVADLAALNNLNARAGLRVGQKINVPKLVTEYRIKRGDTLIGLANRYGLDTAALADMNNM
QPSASLRIGDVIKVPN
NT seq 3291 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtataaaccaagcaagaactggtacgagttgactttgcctgcattattcaaaataacc
gttttaggatcggcactagcaaccctgggtttagtgggctgtgcatcctcgaccacagcg
acaagtgcgcataagtcaaaagtggcaggttcgtcaggtttcttagatgccaatagcttg
gatggcttagaagatttgttatctgcaacggatatgcgtgcagtggaaggtgatcgccta
ttggtgctcaaacatggtgatgtttggaagcgaatgacggtcggtttcaaaatggattta
aaccattgggattcgcgtattgaagcgcagcgtggttggttcgcatcgcgtcagccctat
attgaccgtttaagtgcgcgtgcgtcgcgttatttgtaccacactgtaaaagaagctgaa
cgccgtggtatgccaaccgagttggcgttattgccagtgattgaaagctcgtatgaccca
gcagctacatcgagtgcagcagctgcgggcttatggcagtttattccaagtacaggccgt
atttatggcttaaaacaaactacacagtatgatggccgtcgtgatgtggtggaatcaaca
cgtgcagcctatgagtttttaggtagcttatataatcagtttggttcttgggaattggct
ttggctgcttacaacgcaggcccaggtcgtattcagcaggcgattaaccgtaaccaagca
gcaggcttaccaacggattattggtcattaaaattaccacaagaaaccatgaactatgtg
ccacgctttttggccgttgcacaaattattaaaaatccaaatgcgtatggtgtgagtctt
ccgccgattgcaaaccgtccacactttagagaagtgagtgttggcgcggctaatttaaat
gaaatttcttctgtaacaggactcagccgtgcggaactctatgcattgaacccaggtcat
cgtggggatcaaattgatgcagcaagtccaatgaagattttaattcctgcagatattagc
ccgtcagtggatgcaaaactgaaaaagttatcttcagcatcgacaggttattgggcaggt
ggtgcagcttcaagcctgccaaagaacaacgtgaccatcacaccgtctaaagtgacaccg
cctgagatgaacacgacagtcatcacaccgtctaaagtagcaccaccggtgattacgtca
actcaagcaagcaaaactacgccaccagcgctaactgcaagtacagtaactaagggcaaa
ccgttgtcggtaacgccacaaggttcatctgctttggcagcctttgcagcaaatacagat
attccaagtgcaccgcgtattcctgttgcggttagcccaagtaaagccacgacagttaaa
gtgactgctgagcctcctgtaagcaccaaagagcgtgaacagattatggcggccattaag
gccgaaggtgaaaataaaacggttgatgaagttttaaaacctgttgcgactcaagcagag
caagctgaggtggttaaagagttaaaagctttggcgccacaaggaacagaaattgttgat
ccctatgatggcaaaattaagctgacagcgattcaaaccagccaatcgattgcagatcaa
caaggcaaagagctgaccaaaggcttcgcttatccgaagagtgttgcagagcaaactggc
actgactcggatgaagcaaaacgcaaccaaggcaaaaatgtcattaaaactgattctgaa
attgttgtcgtagcacctaagggcaaacgcagtacatataccgtgcaggcgggtgatacc
ttagcggtcattgccatgaaaaatggtgtgaactggcgtgatgtcgcgaagtggaaccaa
atggatgctgatgccaaattgtatgttggtacaagtatttatttatatgacgcaaaaccg
attgttgctgaagagccgaaagcaaaagtacaacctgagcattatgtggtgaaagccaat
gatacgttgacaggtgttgcaagccaatttggcttgtcggtaaaacagctggcagatttc
aatggtttaaatacgactagcggtctatttgtaggtcaaaagttggcactgaaagaaaca
ccagcatcaaaagcaaaattagctgctgaagctaaaaaagctgaaaccgaaagcaaagta
caaaaagtacaaaccaaagtctatacggtgaagcgtggtgaatatttaaaactaattgct
gaccgctatgctttatcaaatcaggaattagcagacctaacctcgggcctcacagcaggc
agtagtttaatggttggacagaaaattaatgttccattaaacgaagttgaaagtgcttca
agcaattcaaataaagttgagtcgaagccagaaacaaagtctgaaccaagctttaaaact
gaaagttataacgtccaacgtggcgataccctgtatagcttagccaaccaaagcaagatg
actgtttcagattttgccaatttaaataatattgctgcaacaacctctttacgtattggt
cagacgcttaaaatccctgcattaaataaagcaccagagcaatatacggtgcaatcaggt
gatacgctcagcgcgattgcaaatcgctttgaactcaacatggatgatattgcgagttta
aatggctttagccgtaatgcatctttgcgagtaggtcagcgtttaaaactcactggtgaa
gtgccagtggcagtagtgaaagcagatccacgtaaagacagcaaatcggatacacgtgta
agtagtggcgaagccaaagatacgcatgtagtgaaagcgggtgaaacattgtctgcgatt
gcgcaaaagtaccagctacagttgagctatttagcggatttaaacggattgtcacgtaat
agcacagtacgtgttgggcaacgcttgaagattgatggtgatgtgcctaaagtagaagtc
gatacacccaaaacgagtaaagtaacgacacaggcgagctcatcgtatagcggaagcact
gaaagctatacagtgaagtcaggcgaatcactgaatgcgattgcaaatcgtacgggtgtg
agtgttgcagacttggctgcgttgaataacctaaatgcgcgtgcaggtttacgtgtcgga
caaaaaattaatgtaccaaagttagtcacggaataccgtattaaacgcggtgataccttg
attggcttggcgaatcgctatggtttggatactgctgctttggctgatatgaataatatg
caaccgagcgcatcattacgcattggtgatgtgattaaagtacctaactaa

DBGET integrated database retrieval system