Acinetobacter sp. 2019-01-05: SC192_13145
Help
Entry
SC192_13145 CDS
T11468
Name
(GenBank) LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein
Organism
aczq Acinetobacter sp. 2019-01-05
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
LysM
LysM_MltD
SLT
LysM3_LYK4_5
SLT_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XMB91827
LinkDB
All DBs
Position
complement(2757723..2760944)
Genome browser
AA seq
1073 aa
AA seq
DB search
MYKPTTFVWQPSAASLFKITVLSSALAALGITTGCSSTPQSAKTSKSKQVSGAGYLDASS
LDSLEDLLSATDMRAVEGDRLLILKHGDVWKRMAVGFKMDLNHWDSRIEAQRSWFISRQP
YIDRLSARASRYLYHTVKEAERRGLPTELALLPVIESSYDPAATSSAAAAGLWQFIPSTG
RIYGLQQTGMYDGRRDVVESTRAAYEFLGSLYNQFGSWELALAAYNAGPGRIQQAINRNQ
AAGLPTDYWSLKLPQETMNYVPRFLAVAQIIKNPRAYGVTLPPIANRPHFREVTLSAPLS
LNEIASVTGLSRAELYALNPGYRGETVDPASPMRILIPADISPSVDNKLKGMKAGGSTGW
WANVTSPSKPTTSPSSSVTIKTTPATQVQPVRPSTPAKTTSGSVTVKGSTPRGSDALAAF
AASADVPSAPRIPVAVTPATNVKPVRTEPPISATEREKILAAVRAEGEKETVEQALQPQA
TQAEKDQVVAELKAIAPQGTEIVDPYDGKIKLTAIQTSQSVAEQQGKELSKGFAYPKTLT
EDASVANSEDAKRNQDKPYIKTDTDVVVVPPKGKRSTYTIQPGDTLAIIAMKNGVNWRDV
AKWNQIDPEKTLFVGTSLYLYDAKPQEVESSSKSTTKPDVYVVQANDSLTGVANQFNLSV
KQLAEYNDLSVSDGLFVGQKLHLKEPKGNRNSAKTESKAVQASTRRIATKSYTVKRGEYL
KLIADRYALSNQELAELTPGLSAGSNLMAGQKINVPAKEVAAVDESDDNKTSGKYEKLAA
GPSYKTESYKVQRGDTLSSIATKSKISLAELAELNNLKASSHVQLGQNLKVPAGVSVPDH
YVVQSGDSLHAIAAKYNLQTSYLADLNGLSRTAGVRAGQRLKLTGEVEAPSKATTKNIKE
ETPDTYTVKSGDNLRSIASRYHLQLDYLTALNGLSRNSSVRVGQHLKLTGDVPTVETAKA
DTAKSSAKPVAAGKNTEKYTVKAGESLNAIASRAGISVRELAEMNALKANANLQRGQNIV
IPKTVVEYKVKRGDTLIGLASKYGLETTLLAELNNLTPSTQLRIGDIIKVPNL
NT seq
3222 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtataaaccaaccacatttgtgtggcagccatctgcagcatcattattcaaaattaca
gtacttagctctgctttagctgcgttgggtattacaacaggctgctcttcgactccgcaa
tctgcaaaaacctcgaaatcaaaacaggtcagtggagcaggctatcttgatgcaagcagt
ctagactcgttagaagatttactttcagcaacagatatgcgtgctgtagaaggcgaccgt
ttactcattttaaaacacggtgacgtctggaagcgtatggctgtgggtttcaaaatggac
ttaaaccattgggactctcgtattgaagcacagcgtagctggtttatttcacgtcagcct
tatattgaccgtttaagtgctcgtgcaagtcgctatttatatcatacggtgaaagaagca
gagcgccgtggtcttccaactgaactcgctttattgcctgtaattgaaagttcatatgac
cctgctgcaacaagtagtgcagcagcagcaggtttatggcagtttattccgagtacgggt
cgtatctatggtttacaacaaaccggtatgtacgatggtcgccgtgatgttgtcgaatct
acacgtgccgcatatgagtttttaggaagcttatataaccagtttggttcatgggaattg
gctttggcagcctataatgctggtccgggtcgtattcaacaagcgattaaccgtaaccaa
gcagctggcttaccaactgactattggtcattaaaacttccacaagaaaccatgaactat
gttccacgtttcttggcggttgctcaaattattaaaaatccgcgtgcttatggtgtgaca
ttaccaccaattgctaacagaccccatttccgtgaagttactttatctgcacctttatca
ttaaatgaaattgcatcggtaacagggcttagccgtgctgagttatatgcattaaaccca
ggttatcgtggtgaaacagtagaccctgcaagtccgatgcgtattttaattccggctgat
ataagcccatcagttgataataagctaaaaggcatgaaagcaggtggaagtacaggctgg
tgggcaaatgtcacttcgccatctaaacctacgaccagtccttcaagctcagttacaatt
aaaactactcctgcaactcaagttcagccagtaagaccatcgacacctgctaaaacaacc
agcggttctgtgactgtaaaaggttcaacaccgcgtggttctgatgctttagctgctttt
gcagcctcagctgacgtaccaagtgcaccgcgtattccggttgcagtaacaccagcgacc
aatgttaagcctgtacgtacagaaccaccaatttcagcaactgagcgtgagaagatttta
gcggcagtacgtgctgaaggtgagaaggaaacagttgaacaagctctacagccacaagct
actcaagctgaaaaagaccaagtggttgctgagttaaaggcaattgcacctcaaggtact
gaaattgtcgatccttatgatggcaaaattaagttaacggcgattcagacaagtcagtcg
gttgctgaacaacaaggtaaagagttaagtaaaggctttgcttatccgaaaactttaact
gaagatgcaagcgttgcgaactctgaagatgcaaagcgtaatcaagataagccttatatt
aaaactgatactgatgttgtagttgtgccgcctaaaggtaaacgtagtacctacaccata
caaccaggtgataccttagctattattgcaatgaaaaatggtgtcaactggcgtgacgta
gcgaagtggaaccagattgatcctgaaaagactttatttgtaggaactagcctatatctt
tatgatgccaagcctcaagaagtagagtctagttcaaaatcaacaactaaacctgatgta
tatgttgttcaagcaaatgacagtttaactggtgtggcaaatcaatttaatttgtctgtg
aaacagcttgctgaatataacgacctatctgtaagtgatggtctatttgttggtcaaaaa
ctgcatttgaaagagcctaaaggcaaccgtaattcggctaagacagagtctaaagctgtt
caggcaagtacacgtcgtattgcaacaaagagctatacggttaaacgtggcgaatattta
aaattaattgcagatcgttatgcgttatcgaaccaagaattggcagagctaacaccaggc
ttgtcagctggtagtaatttaatggctggtcagaagattaatgtacctgcaaaagaagtt
gccgctgttgacgaatctgatgacaacaaaacttctggtaaatatgaaaaacttgccgcg
ggtccgtcgtataagactgaaagttataaagtacagcgtggtgataccttatcgagtatt
gcgactaagtctaaaattagcttagcggaacttgccgaactgaataacttaaaagcgagt
agccatgtacaacttggtcaaaacttgaaagtacctgcaggcgtaagtgttccagaccac
tatgtggtgcagtcaggcgatagtttgcatgcgattgcagctaaatataacctgcagaca
agttatttggctgatttaaacggtttatctcgtacagcaggtgttcgtgctggtcagcgt
ttaaaattgacaggtgaggttgaagcaccaagcaaggctactactaaaaatatcaaagaa
gaaacaccagatacctataccgttaaatctggcgataacttacgaagtatcgctagccgc
tatcatttacagttagattacctgactgcattaaatggcttgtctcgtaacagcagtgtg
cgtgtcggtcagcatttaaagctaacaggtgatgttcctactgtagaaacagcgaaagct
gatacagcaaaatcatcagctaaacctgttgcagcaggcaaaaatactgaaaagtatacg
gttaaagcgggtgagtcgttaaatgcgattgcgagtcgcgcaggtatttcagttcgtgag
cttgctgaaatgaatgcattaaaagcaaatgctaacttacaacgcggtcaaaatattgtg
attccaaaaactgtagtggaatacaaagttaaacgtggtgataccttaattggtcttgca
agtaaatatggtctagaaacgactttactggcggaactcaataatttaacaccgtcgacg
caattacgtattggcgatatcattaaagtgcctaatttatag
DBGET
integrated database retrieval system