Alicyclobacillus dauci: NZD86_16680
Help
Entry
NZD86_16680 CDS
T08679
Name
(GenBank) collagen-like protein
Organism
adau
Alicyclobacillus dauci
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WAH35888
LinkDB
All DBs
Position
complement(3284486..3286816)
Genome browser
AA seq
776 aa
AA seq
DB search
MSESCHRCGHRHCQCRKERCKQCGHRHCQCRKERCKQCGHRHCQCRKERCKQCGHRQCRC
EVKQEIKVIIKGITGPYGPTGATGATGPAGTTGATGATGPAGTTGATGATGPAGVTGATG
ETGATGATGPAGTTGSTGATGPAGATGATGATGPAGTTGTTGATGPAGTTGATGATGPAG
TTGATGATGPAGVTGATGETGATGETGATGETGATGATGPAGTTGATGATGPAGTTGATG
ATGPAGVTGATGETGATGATGPAGTTGSTGATGPAGATGATGATGPAGTTGTTGATGPAG
TTGATGATGPAGTTGATGATGPAGVTGATGETGATGETGATGETGATGETGATGETGATG
ETGATGETGATGETGATGETGATGETGATGATGPAGTTGATGATGPAGVTGATGETGATG
ATGPAGTTGSTGATGPAGATGATGATGPAGTTGATGATGPTGATGPAGATGPAGVTGATG
ETGATGETGATGETGATGETGATGETGATGETGATGATGPAGTTGATGATGPAGVTGATG
ETGATGATGPAGATGATGETGVTGATGPAGTTGATGATGPAGATGATGETGATGATGPAG
TTGATGATGPTGTTGATGPTGATGATGSTGATGATGVLSFADFYALMPPDNSATVAPGTD
VSFPEDGPTSGTTITRTGPSSFNLGAIGTYQVLFQVSVTEAGQLILTLNGADLAYTVVGR
ATGTSQIVEMALVTTTAVNSVLTVRNPAGESTALTITPLAGGTRPVSAHLVITQLA
NT seq
2331 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctgaatcctgccatcgttgcgggcacaggcattgtcaatgtagaaaggaacgttgc
aagcagtgcggacacaggcattgtcaatgtagaaaggaacgttgcaagcagtgcggacac
aggcattgtcaatgtagaaaggaacgttgcaagcagtgcggacacaggcaatgtaggtgc
gaagtcaaacaagaaattaaagtcataatcaaaggaattacaggaccttatgggcctaca
ggcgctaccggcgcaacaggacctgctggaacaactggcgctaccggtgcaactggaccc
gctggaacaactggcgctactggtgcaaccggacctgctggtgtaactggggctaccgga
gaaactggcgctaccggtgcaacaggacctgctggaacaactggctctaccggtgcaacc
ggacctgctggtgcaactggcgctaccggtgcaaccggacccgctggaacaacgggcact
accggtgcaaccggacccgctggaacaactggcgctaccggtgcaactggacccgctgga
acaacgggcgctactggtgcaaccggacctgctggtgtaactggggctactggagaaact
ggggctaccggagaaacaggcgctaccggagaaacaggcgctaccggtgcaaccggacct
gctggaacaacgggcgctactggtgcaactggacccgctggaacaacgggcgctactggt
gcaaccggacctgctggtgtaactggggctaccggagaaactggcgctaccggtgcaacc
ggacctgctggaacaacgggctctaccggtgcaaccggacctgctggtgcaactggcgct
accggtgcaaccggacccgctggaacaacgggcactaccggtgcaaccggacccgctgga
acaactggcgctaccggtgcaactggacccgctggaacaacgggcgctactggtgcaacc
ggacctgctggtgtaactggggctactggagaaactggggctactggagaaactggggct
actggagaaactggggctactggagaaactggggctactggagaaactggggctactgga
gaaactggggctaccggagaaacaggcgctaccggagaaacaggcgctaccggagaaaca
ggcgctaccggagaaacaggcgctaccggtgcaaccggacctgctggaacaacgggcgct
actggtgcaaccggacctgctggtgtaactggggctactggagaaacaggcgctactggt
gcaacaggacctgctggaacaacgggctctaccggtgcaactggacctgctggtgcaact
ggcgctaccggtgcaactggacccgctggaacaacgggcgctactggtgcaaccggacct
actggtgcaaccggacctgctggtgcaaccggacctgctggtgtaactggggctactgga
gaaactggggctaccggagaaactggggctaccggagaaactggggctaccggagaaact
ggggctaccggagaaactggggctaccggagaaacaggcgctaccggtgcaaccggacct
gctggaacaactggcgctactggtgcaacaggacctgctggtgtaactggggctaccgga
gaaacaggcgctaccggtgcaaccggacccgctggtgcaactggggctaccggagaaaca
ggcgttaccggtgcaaccggacctgctggaacaactggcgctaccggtgcaaccggacct
gctggtgcaactggggctaccggagaaacaggcgctaccggtgcaacaggacctgctgga
acaacaggggctaccggtgcaaccggacctactggaacaacaggagctactgggcctaca
ggcgccaccggagctacggggtctacaggtgctactggagcaacaggggtattaagcttt
gcagatttttatgcattgatgcctcctgataattcagcaacagttgctccaggtacagac
gtaagttttccggaagatggacctactagtgggactactattacccgtactggtcccagt
tcatttaacttaggtgcaattggcacctaccaggtcttgtttcaggtgagtgtgaccgaa
gcgggccaactgattttaactctcaatggtgctgacctagcctatacggtggtcggaaga
gcaaccggtacttctcagatagtagaaatggctcttgtgacaacgacagccgtcaattcc
gtactcactgtacggaatcctgctggcgaatcaacggccctaaccatcactcctctcgct
ggaggaacaaggcctgtgtcagcacaccttgttatcacacaactcgcatag
DBGET
integrated database retrieval system
