KEGG   Acropora digitifera (stony coral): 107336605
Entry
107336605         CDS       T04352                                 
Name
(RefSeq) location of vulva defective 1-like
  KO
K04988  polycystin 1L2
Organism
adf  Acropora digitifera (stony coral)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:adf00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   04040 Ion channels [BR:adf04040]
    107336605
   04091 Lectins [BR:adf04091]
    107336605
Ion channels [BR:adf04040]
 Voltage-gated cation channels
  Transient receptor potential channel (TRP)
   107336605
Lectins [BR:adf04091]
 C-Type lectins
  Others
   107336605
SSDB
Motif
Pfam: REJ Polycystin_dom PKD_channel PLAT GPS Ion_trans
Other DBs
NCBI-GeneID: 107336605
NCBI-ProteinID: XP_015757158
LinkDB
Position
Un
AA seq 1970 aa
MSRDKYSPTVVKRATKSSQEAHLEGVPEEAVVVSSVLEWRLVSEAELALLESPKGTLVSQ
GTPEWVINRRSISVGMYQVKFVASITIVDQMSHTTLTAFDYGFIWVEKGPVKAIIDGGSS
VHWGSVDIVVVDGSLSYDADLGPGNRSGLAFSWSCRELVETVSLSDTCFGAFLSDGSKTN
VSIDPSRLTTGKIYILGLNVSKDIRSDLAEMKFEVVGGTIPQVTLRCFTDCGQVIAASNK
LRVTSECPNAPCNGSQYQWSLTSFNNDTQEWKKVPIFPHMTATEENATNIIFKPNSLTSS
TKYKLSLVIISKEGWEGYGELEFSTAGSPHSGRCKALTVEGIALSTQFVFECFDWQDKNQ
PLEYEFSSRDEVLSYGRSPKSVPIFLPAGTPNDNYELLIKVTIKNAVGVAVEEAISVKVM
PSSSMNLCLESFENVENHLNAYVIGDNNELDKFLWRGEIIQAAQLSLSILKALNQQSDCE
LQSSWDIQHLVSETVVQKFKAIQPQSLQLSRIVLSVIREASGENAKETCQGCSNTMVSTM
EMTGRVTNLLAATLNDPEEPFTVELDKTAKGVTGCLSNVLRTSNNGSQSNDSFKDNVQSA
FENLQNMSNAFMSRIVTGESFVIKTSELAVALTKVSPDQIKGLNMAEGDRRFNLPRNIGS
FGDVDINAKMTAFTYNPFTWDNSSEAIQSSVTSLELESGIGKKINVSNLEEDIVIVIPLP
NAVSNDTDTSTVTEHSFLKPSKLSFRSYHAQLKNVPVTFEITVEKPNVVLDFFVKSGTRP
TIEESDFKITLTFNSTCKNQTTDKLMNEPSSSCVVKNEFSVVPSNPGILYVGLLYMGAKN
SSEHSRKRRSCFGHGRQKRSCVGVKDPPLQGIFVKEVSQYEPTKDLNYTIRITQSGCLYW
SELLDKWTSDGCKVDKNSNLTHLVCRCNHLTSFGGSFLQSPNPIDFDKVFTEFANLRESG
NIAVLVTIVTIFLLYFVVLVFARRNDKRDEDKMCPPKCVVIAERGEYHYDMAIRTGVWKN
SGTTAKVTISIKGELNEHNCITLRSEGEPTEIFARGSINAFVLTTHGSLGPITNITLEHD
NSGQNPSWFVETVTIRDRQTEEQWTFSFNRWLALEKDDGEIHVTITDESVTLFLNHVRTQ
FARRVVDNHLWMSVFGKPCTNTFTRVQRASCCLSIMFSVMITNAMFYNIGGESEDTIRVG
PFKFSFKQIIIGVQSGLIVAPVNILVVFIFKSSKSKSKTSDTYDDTYQAQQLADQVAEAG
YMLPHFCVYLAWFLCLATTLTGATFSLFYSLMWEKEVAEQWLSSILISNGQDIFVVQPAK
VLLMVVVLSFFLTKSFHKSQAKDEESNEGSVSEIDIDFIYDSPQEFIKQTKLDAMRTRTK
KEVKLAGMVKDIILHLTFVFFLLIVCYDNKSSYRYVMTKTLMNPFTKFDKVTDRGKLFEW
FHQIFLPNIYNQPWYNGHEDRDVFIGNKMSILIGMPWIRQTRIKQSPCQALPRFNSSCFY
AYSGDTEDTTPMSLPGWKPLPPNSSWPRVLMLCPKPWRYQSADELYTDSIRGKFNYYKGG
GYVAVMGYDEKTAKRVLDETFTHGWVDRRTRAVILEFAVFNANTNLLGIATYLFEALASG
GAYTVRTVDTLELYNTESESLMFYLVCQFLFFAMVFYYLIVLLLHLYKQRLRFLGSVWNM
VDLFMIVFSVLSVSFYMIRAKSILKSVKEIQNNPYSIVNFHRAIYWYSLENASIALSIFF
VTLKLLNLIRFNPYVIFFFSSFRQSVGCQISYAAFFLMIFNAFAISGRLMFGSTVFEYAS
YMQAIISQFQFLLGRAVPLADLRSNNPFLGPSFAFTHNIIMTILLINMLVSLLNESYSEA
KSNADESAEELEMARFISERFLELFKEGQRSNDMKLYCDQFVFGNMCHSDVEPYCLNSEI
IAECSDVRLEKLDKRLASLSRRIVNMETDEETEESDFVILTFYSAKTITE
NT seq 5913 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcaagggacaagtacagccctactgttgtcaagcgggccactaaaagttctcaggag
gcccaccttgaaggtgtaccagaggaggctgtggtagtaagtagtgttcttgagtggcgt
ttggtcagtgaagcagagctggcgctcctagagtcacccaaaggtacgttagttagccaa
ggtacacctgagtgggtcataaacagaagatcaataagtgttgggatgtaccaagtcaag
tttgtcgcatcaatcactattgttgatcaaatgtcccacacgacactgacagcttttgac
tatggattcatttgggttgagaagggccctgtgaaagccataattgatggcgggagcagt
gttcactgggggtctgtagatatcgttgttgtggacggctcgttgagttacgacgcagac
cttggtcccggaaatcgcagtggactggccttttcttggtcctgtcgcgagttggtagaa
actgtgtcattgagtgatacgtgcttcggggcgtttctctctgatggaagtaaaacgaat
gttagcattgatccttcgcgtctaacgactgggaagatttatatcctaggattaaatgtc
tccaaagacattagaagtgatcttgctgagatgaagtttgaggttgttggtggaactata
ccacaagtgacattaaggtgttttacagattgtggacaagtaattgcggcctcgaacaaa
ttgcgcgtcacatcagagtgtccgaatgcaccatgcaatgggtcacaataccagtggagt
ctaacaagctttaacaacgatacacaagagtggaagaaggttccaatcttccctcacatg
acagcaaccgaagaaaatgcgaccaacataattttcaagccaaactctctcacatcaagc
acaaaatataagctctccctggtcattatatctaaagaaggatgggaaggttatggagaa
ctagaattttccaccgctggatccccacatagtggacgctgcaaggctttaacagttgaa
ggcattgcattatcaacacaatttgtatttgagtgctttgactggcaagataagaaccaa
ccacttgaatatgaatttagtagcagggatgaagtactgtcatatgggagatctccaaag
tctgtaccaatttttttaccagctggcacgccaaatgacaactacgagttactaataaaa
gtcacaataaagaatgctgttggggttgcggttgaagaggccatatccgttaaggtgatg
ccctcgtcctcaatgaacctttgtctcgagtcattcgagaatgttgagaatcacttgaac
gcatatgtgataggagacaacaatgaattagacaagtttttatggagaggagaaatcatt
caagctgcacagctgtctttgtctatcctgaaggcattaaatcaacagtcggattgtgag
cttcaatcaagttgggatatacagcatttggtttccgaaacagtggtccaaaagtttaag
gccattcagccacaaagtcttcagttgtcacgcatagttttatccgtcattagagaggcc
agtggagaaaacgccaaagaaacatgtcaaggctgcagtaataccatggtctcgacgatg
gaaatgacaggacgtgttacgaatcttcttgcagcaacgctcaatgaccccgaggaacca
ttcactgttgaattggataagacagctaagggtgtgacaggatgcctatcgaacgttctg
aggacctcaaataatgggagccaatcaaacgattcctttaaggataacgtacaaagtgcc
tttgaaaatctacaaaatatgagcaatgcattcatgagtcgcattgttacgggtgaaagc
tttgttataaagacaagtgaactagcagtagcgttaactaaagtttctcctgaccaaatt
aaaggacttaatatggcagaaggtgacaggaggtttaatttaccaagaaacattggtagc
tttggtgatgtggacataaacgccaagatgacagctttcacgtacaatccttttacttgg
gataacagtagcgaggcgattcaatcaagtgtaacgagtctggagcttgagagtggaatt
ggaaaaaaaatcaatgtctcaaatcttgaagaggacattgtcattgtcatccctctcccc
aatgcggtttcgaatgatacagataccagcactgtaactgagcactcctttcttaagccg
agcaagttgtcgttccgtagttaccatgcccagttaaaaaatgtaccagtgacctttgaa
attactgtagaaaaaccgaacgttgtcttagatttttttgtcaaatctggaacaaggcca
acaattgaagaatctgactttaagataacactaacattcaattcgacttgtaaaaaccaa
actaccgataaattgatgaatgaaccgtcttcaagttgtgtcgtaaaaaacgagttcagc
gttgtcccatcaaatccagggatactttatgtcggacttttgtatatgggggcaaaaaat
tcttctgaacactctaggaaaagaaggtcatgctttggacatggtcgacagaagcggtcg
tgtgttggcgttaaggatcctccacttcaagggatatttgtaaaggaagtttctcagtat
gaaccaaccaaggatctaaactacactataagaataactcaatcgggctgcctttactgg
tctgaacttttagacaagtggacatcggatggatgcaaggttgacaaaaattcgaatctc
actcaccttgtttgccgttgcaatcacttgacttcgtttggtgggagtttcttacaatca
ccaaatcctatagacttcgacaaagtttttacagaatttgccaacctcagagagagtgga
aacattgcagtgttggtcactatagttaccattttcctgctttactttgtggtgttggtc
tttgccagaaggaatgacaaaagagatgaggacaagatgtgcccgccgaaatgtgttgtc
attgctgaaagaggagagtaccactatgacatggcaattagaactggtgtttggaaaaac
tctggcactacagctaaagtgacaatcagcataaaaggcgaattgaatgaacacaattgt
attacacttcgaagcgaaggagagcccactgaaatatttgcacgaggaagcatcaatgca
ttcgttcttactacccatggctccttaggaccaataaccaatataactctggaacacgac
aactctggtcagaacccttcctggtttgtagaaacagtgacaataagggataggcaaact
gaagaacaatggacattttcatttaatcgttggctggctctggaaaaagatgatggcgaa
atccatgttacgattactgacgaaagtgtaactttatttttgaatcatgttcgcacgcaa
tttgcacgaagggtggtcgacaatcatctctggatgtccgtctttggaaaaccatgcacc
aatacatttacacgagtacagcgagcgtcgtgttgcttatcaattatgtttagtgtcatg
ataaccaacgctatgttttataatattggtggggaatcagaggatacgattcgagttgga
ccgtttaagttctctttcaagcaaataattattggggtccagagtgggctcatagttgcc
ccagttaacattctcgtagtttttattttcaagtcgagcaagtcgaaaagcaagacgtca
gatacatacgatgatacttatcaagcccagcagctcgctgaccaagtcgctgaagccgga
tatatgttgcctcacttttgtgtatacctcgcctggtttctttgccttgcaacaacacta
acaggggcaacgttttcgttgttttatagtttgatgtgggaaaaggaggtcgctgagcag
tggctttcctctattctaatatcaaatggtcaggatatctttgtggtgcagccagcaaaa
gttttgttgatggttgttgttttatcattttttctcacgaagtccttccacaaaagccaa
gccaaggatgaagaaagtaatgaagggtctgtcagcgagattgatattgactttatttat
gacagtcctcaagagtttattaaacagacaaaactggacgctatgcgaacacgaaccaaa
aaggaggtcaagttggcagggatggttaaagacattattcttcacctgacctttgtgttt
tttctgttgattgtatgttatgataacaagagcagttatcgctatgtaatgactaaaaca
ttgatgaatccgttcactaaattcgacaaggtcacagacagggggaagctattcgaatgg
tttcatcaaattttccttccgaatatttacaaccagccatggtataatggacatgaggac
agagatgtttttattggcaataagatgtcgatattgataggcatgccctggataaggcaa
acaaggattaaacaaagcccctgtcaggcgctgccaagatttaattcaagctgcttctat
gcatattctggtgacactgaggacactacaccaatgagtcttccggggtggaagccgctt
cctccaaactcttcatggccaagggttctcatgctctgtcccaaaccatggcgataccaa
tcagcagatgagctctatactgactcaatacgtggaaaatttaactattataaaggtggt
ggctatgttgctgtcatggggtacgacgagaaaactgcaaaacgtgtccttgacgagacc
tttacccatggatgggtcgaccgacgtactcgagcagtgatactagagtttgctgtattt
aacgctaataccaatctcctcggtattgctacctatttgtttgaggcactggcctctggt
ggtgcttatacagtcagaacagttgacaccctcgagttgtacaacacagaatcagaatcc
ctcatgttctacctcgtttgccagttccttttctttgccatggtattttattacttgata
gtgttacttctccatctctacaaacaacgtcttagatttctcggatcggtctggaatatg
gtagatttgtttatgatcgtgttttccgtgttgtctgtatcattttacatgatcagagca
aagagtatattaaaaagcgtaaaagaaattcagaacaatccgtactctattgtaaacttt
cacagagccatttattggtacagtttggaaaatgccagtattgcattatcaatttttttt
gtcacgctgaaactgcttaatcttattcgttttaacccttatgttatcttctttttttca
agttttcgtcagtcggtaggctgtcaaatctcttacgctgcttttttcttaatgatattc
aacgcctttgctatatcagggaggcttatgtttggctcgacagtttttgaatacgccagc
tatatgcaggcaataatctctcagttccagtttctgttaggtagggcggtccccttagct
gatcttcgaagtaataacccattcctcggaccttcctttgcgtttactcacaacataatc
atgactatacttctaataaatatgcttgtgtctttgctgaatgagtcttattctgaggca
aagtcaaatgctgacgaaagcgcagaagaacttgaaatggcacgatttataagtgagcgt
tttttggaattgtttaaagaaggtcagagaagtaatgacatgaaattgtattgtgatcag
tttgtgttcgggaacatgtgccactccgatgttgagccgtactgtttgaattcggagatc
attgcagagtgcagtgacgtaagactcgagaaacttgacaagaggctggcttctctctct
cgccgcattgtaaacatggaaacagatgaagagacagaggagtctgactttgtcattcta
actttttattctgctaagacaataactgaatga

DBGET integrated database retrieval system