Acropora digitifera (stony coral): 107356268
Help
Entry
107356268 CDS
T04352
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 1-like
KO
K02599
Notch 1
Organism
adf
Acropora digitifera (stony coral)
Pathway
adf04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
adf00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
107356268
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
Ank_2
Ank
Notch
Ank_5
Ank_3
Ank_4
EGF_CA
EGF_2
NODP
NOD
EGF_3
Ank_KRIT1
cEGF
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107356268
NCBI-ProteinID:
XP_015778390
LinkDB
All DBs
Position
Un
AA seq
1971 aa
AA seq
DB search
MWNLLNIVCFLTIFINGKTAVGRVYKRLKSHEGRKNECRPRLAASVFKIHCAEYTRCDND
KACKKPKEICVCDESCGKVCVDPTSTCRVDYCKNGGTCVESGGSANCSCPANVTGATCEH
DVDECAVLVGPCKNGGTCSNHMGGYVCRCISGWVGFDCAVNVDDCASSDGLPKCNNGGTC
FDRVGSFFCSCTANYTGLTCQHEDQCKTLKPCHGGICRTGPYGGYSCRCSAGWTGQNCSV
DIDECGVAARGGMPVCHHGATCVNTPGSFSCNCIPGYTGMRRLTISCHSYGVVAKNSNYY
SVKYIYCTMFVQAELFHLFSGTLCEHNIDDCLQVTCQNGGTCLDGLNEYLCNCHPGFLGR
HCDTNINECSSSPCRNGGTCLDGVAQYHCQCQAGFTGKSCETRIDSCLGHFCGNGGTCHS
QANGYTCSCLPGYTGRFCEIDVNECISNPCMNGSCLDGINKFTCDCYPGFTGLRCEQNIN
DCQHSPCLHGSTCHDGINDFACTCPQGFSGRRCEHHVNECLSQPCQNGATCVDEIGSYSC
YCKPGYTGQHCQTTIDWCQRRPCKNGGTCRQTGTDFQCVCLEGFTGVICDVENITCSQAK
MKPGVSAVCQNGGTCSDVNNILSCHCPPGFTGSYCEVNVNDCARGPCKNGANCIDGVANY
TCSCIKGFTGRNCSINIDDCAGNPCQNGGKCTDLVAGFICSCPSGYVGNTCEINPDDCMK
NACFNGGFCQDGLKSFTCQCPPGFSGLRCEVNIDECSSNPCSRLGTEKCFSLVNDYRCKC
KCGFLGKNCEININECLSNPCKNNGQCQDGSCQHTCFCPHGFSGVNCERNVSSCDHDPCL
NSGTCQTLSNGSYACTCMPGVTGRHCEMNIDECDSSPCHNDAVCVDGYASYSCICPLGYT
GKTCLLKTNECASSPCLNGGTCEDLMGYYKCKCPATHSGDHCQTEAPCPVKDCATEFNGK
QCNEKCNNHACNYDGTSCSLGQEPWKSCSNMTSSGQYCYGEFKDKKCDPECSTEKCLFDG
FDCINKSICTNEEYCKKHFGDAQCDRSCNTQGCLFDGLDCSTTEPQLAEGSLILVLRVTP
QLFREGARKFMRQLSKVLEIVAFIRMKDGSQMIYPFDLSALGRARREVHRAAHVIVRRAS
EGTKVHVSLDTRGCTNKDMCIDNSAFAARYLGALQSSNKLDLPYEVQQVTVGRIPPTTPP
PPTSPVPALYIAMLCVGIPLFIVGVLAGAKRVYAKLWVPDGFPRHRNRRQQSTRREPVGQ
EVSLRSISKGSEIEENSASADGESSRSDLTPPREAKRAKHDDKGEDSRQWTRLHHQVADV
TARSCQLALTPPQEGSGERGASAIDVDAKGPGGMTALHLAACRGTYGDGSSLEDDKDSDD
SGAAMVSDLLNLGAKYGAKTDETEETPLHLAARYSRADVAKRLLDSGADANSRDRLNRTP
LHLAIGADAQGVFQILLRNRATDLEAKMDDGTSPLILASRHDLPELVRHLVKAGVKVNGA
DNQGRTALHWAASVNSLEVTKELLRNGAKKDAQDEKGQTPLFLGCREGSNQTVRHLLVNY
ANRKLADNMDMTPEDIAKQRHHHDIVELLTDWSLGCNSPKAVPAPTSPPEGHQSPLTSMA
SPPATSPSAVEILTGNGPPMVARFQAARPKTTAVSRSQGAPRQRSNAQGNNSNAKRKRKK
ARNDEESYPAMTSVTKLSPTASLSPIANHPVTSCATGPSFSPSCVPMANGLSPLGSVGIS
PADSTTFSPVHGGPNPLDSPLEMLSPEDLKDLEIDVWDGLDDIVPFDDPTDMSLCGFPPT
TVTLGNLDVMDHIVPTTSDCMYLPNNAPPVRRVDPPQGQRLHSVHSTPDLNLLQQDSRPI
VFNGRTCSSAQKAPPTPSQLASYHALTNSNMYPGGVNLMPPSKDFSSNDYLLHQHPQLQD
QLYVRGQPTPTLCTFLRGGYDCVSPQKPLSFPTPSPDSPGQWSSSSSSSSC
NT seq
5916 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtggaatttactaaatatcgtgtgttttttgacaattttcattaatggaaagacagca
gtcggaagagtgtacaaacgccttaagtctcacgaaggacgaaagaacgaatgccggccg
agacttgccgcaagcgtgttcaagattcactgcgcagagtatacgcgctgcgataacgac
aaagcgtgtaaaaaaccaaaagagatttgcgtttgcgatgagagttgcggaaaggtctgc
gtcgacccaacctccacgtgtagggttgactactgcaaaaatggtggaacttgtgtagaa
tccgggggaagcgcaaactgcagttgtcctgcaaatgtcactggtgccacatgcgagcat
gatgttgatgaatgtgctgtactagttggtccgtgcaagaatggaggaacatgcagtaac
cacatgggtggctatgtctgccgctgtatcagtggttgggttggttttgactgcgctgtt
aacgtggatgattgtgcgtcatctgatggtctccctaaatgtaacaatggtggcacctgt
tttgatagagtggggtcatttttttgcagttgcactgcaaattatactggcctgacctgc
cagcatgaggatcagtgcaagactttgaaaccctgtcatggaggtatatgtcgaactggt
ccatatggtggctactcttgtagatgctcagctggttggactggacaaaattgcagtgtt
gatattgatgaatgtggtgttgctgcccgtggtggcatgccagtatgtcatcatggagcc
acttgtgtaaatacacccgggtcattcagttgtaactgcattcctggatatacaggtatg
cgccgtctaaccatatcatgccattcatatggtgtggtggctaaaaattcaaattattac
tcagtaaaatacatctactgtactatgtttgtacaggctgagttattccatctgttttca
ggaacattatgtgagcataatatagatgactgtctgcaagttacttgccagaatggtgga
acttgtcttgatgggctcaatgagtatttgtgtaattgtcatcctgggtttcttggacgc
cattgtgacacaaacattaatgagtgcagctcatcaccttgtaggaatggtggaacttgt
ttggatggcgtcgcccagtatcattgccagtgccaagcaggcttcacaggtaaaagttgt
gaaaccagaattgatagttgtcttggtcatttttgcgggaatggaggaacttgccactcc
caagcaaatggatacacttgtagctgcttgccaggctacactggtcggttttgtgaaatt
gatgtcaatgaatgcatctcaaacccatgtatgaatggatcttgccttgatggtatcaat
aagtttacatgtgactgttaccctggcttcactggccttcggtgtgagcagaatataaat
gattgtcagcacagcccttgcctgcatgggtcaacatgccatgatggaattaatgatttt
gcatgtacatgccctcaaggattttctgggaggaggtgtgaacatcatgtaaacgagtgt
ctttcgcaaccctgtcagaatggagccacttgtgtggatgaaataggatcctacagctgt
tactgtaaacctggctatacgggacaacattgtcaaaccacaattgattggtgccaaaga
aggccttgtaaaaatggtggcacatgtagacaaactggaactgatttccagtgtgtatgt
ctagaaggatttacaggtgtcatttgcgatgttgagaatataacgtgttcccaggcaaag
atgaagccaggtgtaagtgctgtttgccaaaatggtggaacatgcagcgacgtgaacaat
attctatcctgccattgcccaccagggttcacagggagctattgtgaagttaacgtcaat
gactgtgccaggggaccttgtaagaatggtgctaattgcattgatggagtggcaaactac
acttgtagctgtattaaagggttcactggaagaaactgcagcattaacattgatgactgt
gcaggaaacccctgtcaaaatggcggaaagtgtactgaccttgtggctggatttatctgc
tcctgtccctcaggctatgttggtaacacttgtgagatcaacccagatgattgtatgaaa
aatgcctgctttaatggcggattctgccaagatggtctcaaaagcttcacttgtcagtgc
cctccaggattctcagggcttcgctgtgaagttaatatagatgaatgctcatctaacccc
tgctcccgactgggtactgaaaagtgtttttcactggttaatgattaccgctgtaagtgc
aaatgtggatttttgggaaaaaactgtgaaattaatatcaatgagtgcttgtcaaatcca
tgtaaaaataatggccagtgtcaggatggctcctgccagcacacttgcttttgccctcac
ggattttctggggtgaactgtgagcggaatgtctcttcatgtgatcatgacccttgtctc
aacagcggcacttgtcaaaccctttctaatggcagctatgcatgcacctgtatgcctggt
gtcactggaagacactgcgagatgaacatagatgaatgtgattcgtcaccttgtcataat
gatgcagtctgcgtggatggatatgcttcttactcttgtatatgtcccttggggtacact
ggaaagacatgcttgttgaaaacaaatgaatgtgctagttcaccatgcttgaatggtggt
acatgtgaagatctcatgggttattacaagtgtaaatgtccagccactcattcgggagac
cactgccaaacagaggctccttgccctgttaaagactgtgctacggagtttaatgggaaa
caatgcaatgaaaagtgcaacaaccatgcttgtaattacgatggtactagctgttcgctc
ggccaggagccctggaagagctgctccaacatgacgtcatccgggcagtattgttatggt
gaattcaaggataaaaagtgcgacccagaatgcagcactgagaaatgcctatttgatggc
tttgattgtatcaacaaatccatatgcaccaatgaagaatattgtaagaaacactttggc
gatgcccagtgtgaccgctcgtgcaacactcaaggatgtttatttgatggattggattgt
tccaccactgagccacaattggcggaaggaagccttattcttgtgctgcgtgtgaccccg
caacttttccgggaaggtgcaaggaaattcatgaggcagctgtctaaagtgttggaaatc
gtcgcattcatcagaatgaaagatggaagccaaatgatttacccttttgatctcagtgct
ttaggacgtgcgagacgagaagttcaccgagcagcacatgtcattgttcgaagggctagt
gagggcaccaaagtccatgtgagtcttgacaccagaggatgcaccaataaagacatgtgt
attgataactctgctttcgcggcacgttacctgggtgcattgcagtcctccaataagttg
gatttaccatacgaagtacagcaagttacagtgggaaggatcccgcccacaacacctcct
cctccaacctccccagtgccagctctctacattgctatgttgtgtgttggaattccgctt
ttcatcgttggggtgctggcgggagccaagagggtgtacgccaaattatgggttccagac
ggattcccaagacaccggaaccggcgacaacaatccacaaggagggagccggtgggacag
gaagtctctctaaggtcaataagtaaaggttcagaaattgaagaaaatagcgccagtgcc
gatggtgaaagcagccgatcagatcttactccacccagggaagccaaacgagcaaagcac
gatgataagggagaagactcgcgtcagtggacgaggctacatcatcaagttgcagacgtg
acggcaagaagctgccagctggctctaaccccaccccaggagggaagcggcgagcgaggt
gcttcagccatcgacgttgatgcgaaaggccctggtggcatgacagccttacacctggcc
gcttgccgtgggacttatggtgatggaagtagcctggaagatgataaagacagtgatgat
agcggggcggctatggtatccgacctgctgaatctcggggcaaagtatggggcaaaaacg
gacgaaacggaggagacacctttgcatctagctgcgcgctactcaagagctgatgtggcc
aagcgcctgctggattctggagcagacgctaattcacgtgaccgactcaataggacgcct
cttcaccttgcgataggggctgatgcacagggcgtgttccagatcttactcagaaatcgt
gcaactgacctggaggcaaaaatggacgatggcacctctcctttaattctggcttcaaga
cacgacttgcctgagctggtgcgacacctcgttaaagcgggagtcaaagtcaacggtgca
gacaatcaaggtcgaacagcactacactgggcagcctcagttaatagtttggaagtaact
aaagaactgttgcggaatggtgccaaaaaagatgcgcaagatgaaaagggtcaaacacca
ttgttcctaggctgcagagagggaagcaaccagactgtgcgtcatttgttggtgaattac
gccaaccgcaaactcgcggataatatggatatgacaccggaggatatcgcgaaacaaagg
catcatcatgacattgtggagttactcacagactggtctcttggttgcaactctcccaag
gccgttccagcgccgacatcacccccagaggggcaccaatcgccccttacaagcatggcc
tcgcctcccgctacatctccttcagcggttgagattcttactggtaatgggcctccgatg
gtggctcgtttccaggcagcgcgtccaaagacaacggcagtaagcagatcgcaaggggcg
ccacgtcaaagatccaacgctcagggaaataacagtaatgctaaacgaaagaggaagaaa
gcgaggaatgacgaagaaagttatccagctatgacttcagtcactaagttatcgccaacg
gcgtctttatcgcctattgccaatcacccggtgacgtcttgtgccactgggccaagtttt
tcgccgagctgcgtgccaatggcaaacggattgtctcccttgggaagcgttggcatttct
cccgccgattcgacgacgttttcgcccgttcatggagggcctaatccgcttgattcgccg
ctcgaaatgttatctccagaggacctgaaagacttagagattgatgtttgggatggtctg
gatgatatcgttccgtttgatgatcctacggacatgtctttgtgtggctttccgcctacc
actgttactctaggcaacttggatgtaatggatcatattgtaccgaccacctcagactgt
atgtacctcccaaataatgcgcctccggtaaggcgcgttgacccgccacagggtcaaaga
ctccattcagttcatagcacgccggatttgaatttattacaacaagattcccggcctatt
gtatttaatggcagaacttgtagctcggcccagaaggcgccccctacgccttcgcaattg
gcctcgtatcatgcccttacgaactccaatatgtatccgggcggcgtaaacttgatgccg
ccaagtaaagacttctcaagcaatgattatttattacaccagcatccgcagttacaagac
caactctacgtcagagggcagccaactcctacgttgtgtacattcctgcgtggtgggtat
gactgtgtatcgcctcaaaagccactatcattccccaccccctcccctgactcgcctggt
cagtggtcgtcatcatcgtcttcatcctcttgttaa
DBGET
integrated database retrieval system
