Apis dorsata (giant honeybee): 102673062
Help
Entry
102673062 CDS
T09121
Name
(RefSeq) spatacsin isoform X2
KO
K19026
spatacsin
Organism
adr
Apis dorsata (giant honeybee)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
adr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
adr03400
]
102673062
DNA repair and recombination proteins [BR:
adr03400
]
Eukaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
Other HR factors
102673062
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Spatacsin_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
102673062
NCBI-ProteinID:
XP_006615215
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1435 aa
AA seq
DB search
MYGIFVKKEQQDVKLLLARIFGNAISISEFNTILSYKSCNINRNEFMSRIDKELCLARCL
NQINIQEDEIKIAELYDALTKMCESQDQNMLIEGIFKTIYYLSDDTIEYLKENYLIVLLL
IFSYLSKENTMYNQNKSATMKQNILRDIFINKNGLQLCNYNISNEILQNTLEQISILKSI
IEKKQKKEVTIYELLDGYKNLNIKRLYKWRFNNESMPYFSNETLVKKYGYTEALTYEYYL
KEARPNMAIFSLKHSQGKLIGNISCRRKHKAALYAHIFALRNLNKPEILHTCISFIEMLN
IDSENLRLHITVANYIDKEINISIGNLLENIIYGNENDLKSVMDYLENSFQKNFVESLID
DSQQFINILKIWDVIVRFARMHNFSLPISLLKFLANQNFWFEFVLVCHIFNYSLNQVLEN
TKHFEDTILREHLLTCLCNVQLTKSQLAVYSEQKIKSRDVRQSLYYKIGVKQNESIYGSP
VLTDSASTSESHDMYEYAISDNICSPDDDLWLIILKCHQSPDPPGALINSSRLTLRPFLA
VLATCYEPSSITAYCYSWMVISTTDKEILSNYNECLEQQIWTANQVSNLLEQMVKNGYID
ILNKAYKIFMPENLFNLFFEFLEQCAIYGNFKDYQQNLLDFKTQCIDLKCNDAMDWNCSD
ITYLNNLYWIATVTIKCVIATLAYRLKSSHLQIKFLEILIKCNFHKNFPVFVPNFQSFLQ
IIKILQKTNVTLNFAAFTVSDNIYSFDAEIHRCIDDLIRIENYTSALELSNVMGFSSSEI
ILAQYRSKFKYYIHKNEKIEDNFWYECAQNFKKYNIPYKEVVEFFVEHAEKVTSHKERYE
ILKLAFETLKNIETEQQDIYTLEMAMWKSCILAGPENVQLDNGPYIFNKLKTELLSGLNK
LKFSYTLNNIQERNAAKILIDILIDLGRLDTALRITTIFNYKHKDLQILILCLSLAEGEI
LPNDLTIEQQNLLKEENKNKQQKYSVLKNRSLQRFSSSSSLITSININEMSKDKTNIQME
CLLIIQKLLDILEHGLDICLRIVLCYKLAMQLEKSYQILLILNNPIQFLQEVTESNIKDK
SEIINDIIIAYKIDNDTVATFLAENITLSITSAVKGGYENNICLWEYSLNTNFRIIMELC
NDVSLLGWKLLKTANKLLGHSHGEKTNGNKIALLDFLKHHCPENKELFTLVALHFRLYHE
LALMWENEAKDLIKTIISNATKEYNKLQSNVHEIKFIKTEYIQKQLQLIITNYTHATEYY
LQANKLNLASQCSDQVQLVTLQLSLFNTTSYNQQVICILNLKPEDIDKVLCHNLSFSQSF
IIVHAYNHHVDWANLIYNHCILNGETKYLKDFITVNKLTPSLVQDCVRRYRLEKSITHTM
TNNMKILISELSDVECKYVLASQLGFKNIVETMLNNPMIGAYLKDTVWKKGYNAT
NT seq
4308 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatggtatatttgttaaaaaagaacaacaagatgtaaaattattattggcacgtatt
tttggaaatgcaatatcaatatcagaattcaacacaatattatcatacaaatcttgtaat
attaatagaaatgaatttatgagcagaattgataaagaattatgtctggcacgttgcttg
aatcaaataaatattcaagaagatgaaattaaaattgctgaattatatgatgcattaaca
aaaatgtgtgaaagtcaagaccagaatatgttaatagaaggaatttttaaaacaatttat
tatctttctgatgataccattgaatatttgaaagaaaattatttaatagttttactatta
atattttcatatttgtctaaagaaaatacaatgtataatcaaaataaaagtgcaactatg
aaacaaaatatactaagagatatatttataaataaaaatggtttacaattatgtaattat
aatatttcaaatgaaattcttcaaaatacattagaacaaatatcaattcttaaatctatt
atagaaaaaaaacaaaagaaagaagtgacaatatatgaattattggatggttacaaaaat
ttaaatataaaacgtttatataaatggcgttttaataatgagtctatgccttatttttct
aatgaaactcttgttaaaaaatatggatatacagaagcattaacatatgaatactacttg
aaagaagcccgtcctaatatggctatatttagtttaaaacattctcaaggaaaactaatt
ggaaatatttcttgtagaaggaaacataaagcagctctatatgcacatatttttgcctta
cgaaatttaaataaaccagaaatattacatacttgtatttctttcattgaaatgttaaat
attgattcagaaaatttaagacttcatataactgtggcaaattacattgataaggaaatt
aatatttctattggaaatttactagaaaatataatttatggaaatgaaaatgatttaaaa
tctgtaatggattatcttgaaaatagttttcaaaaaaattttgttgaaagtttaattgat
gatagtcagcaatttataaatatattgaagatatgggatgttattgtacgatttgcaagg
atgcacaatttttctttgccaattagcttattaaaatttttagcaaatcagaacttctgg
tttgaatttgtgttagtttgtcatatatttaattattctttgaatcaggtattggaaaat
acaaaacattttgaagatacaattctcagagaacatttgttaacttgtttgtgcaatgtt
caacttacgaaatctcaattagctgtttacagcgaacagaagataaaatcacgagatgtt
aggcaatcattatattataaaattggtgttaaacaaaatgaatcaatttatggttctcca
gtattaacagattcagcaagtacttctgaatctcatgatatgtatgaatatgctataagt
gataacatttgttctccagatgatgatttatggttaattattctaaaatgtcatcaaagc
ccagatccacctggtgctttaataaattcatctcggttaaccttaagaccttttcttgca
gttttagcaacctgttatgagccatcttcaataacagcatattgttattcttggatggta
atatctactacagataaagagattctttctaattataatgaatgtttagaacaacaaata
tggacagccaatcaagtttctaatttattagagcaaatggtaaaaaatggatatatcgat
attcttaataaagcttacaaaatttttatgcctgaaaatctttttaatttattttttgaa
tttctcgaacaatgtgcaatttatggtaatttcaaagattatcaacaaaatttattggat
tttaaaacacagtgtatagatctcaaatgtaatgatgcaatggattggaattgttcagat
attacatatttgaataatttatattggattgctactgttacaattaaatgtgttattgca
acactcgcttatagattaaaaagttcacatttgcaaataaaattccttgaaattttaata
aaatgtaattttcataaaaatttcccagttttcgttccaaattttcagtcttttctacaa
attataaaaattcttcaaaaaactaatgtcacattaaattttgcggcatttacagtatca
gataatatttatagttttgatgcagaaattcatagatgtattgatgatttaataagaatt
gaaaattacactagtgctttagaattatcaaatgttatgggattcagttcatctgaaata
attttagctcagtatcgaagtaaatttaaatattatattcataaaaatgaaaaaattgaa
gataatttttggtatgaatgtgcacaaaattttaaaaaatataatattccatataaggaa
gtagtagaattttttgttgagcatgctgaaaaagttacttctcataaagaaagatatgaa
atattaaaactagcttttgaaactttaaaaaatattgaaacagaacaacaagatatttat
acactggaaatggcaatgtggaaatcatgtatattagcaggtcctgaaaatgtacaatta
gataatggaccttatatttttaataaactaaaaacagaattattatcaggattaaataaa
ttgaaattcagctatacattaaataatatacaagaaagaaatgcagctaaaattttaatt
gatatattaattgatttaggtagattagatactgcattgagaataactacaatttttaat
tataaacataaggatttacaaattttaatattatgtttaagtctagcagaaggagaaatt
ttaccaaatgatttaactattgaacaacaaaatcttctaaaagaagaaaataagaataaa
caacaaaaatatagtgtcttaaagaatcgtagcttacaaagattttcttcatcttcttca
ttaatcacctcaattaatataaatgaaatgtcaaaagataaaacaaacatacaaatggaa
tgtttattaattatacaaaaattacttgatattctggaacatggcttagacatatgtctt
agaattgtcctatgttataaattagcaatgcaattagagaaaagttatcagatattatta
atattaaacaatccaattcaatttttacaagaagttacagaaagtaatattaaagataaa
tctgaaattattaatgatataattattgcatataaaatagataatgatactgttgcaaca
tttttggctgaaaatattacactaagcattacttctgctgtaaaaggtggatatgaaaat
aatatttgtttatgggaatattctttaaacacgaattttcgtattattatggaattatgt
aatgatgtttcactccttggttggaagcttttaaaaacggcaaataaattgcttggtcat
tctcatggtgaaaagacaaacggtaataaaatagcacttttggattttcttaaacatcat
tgtcctgaaaataaagagctttttactctggtagccttacattttcgattatatcatgaa
ctagcacttatgtgggaaaatgaagcaaaagatttaatcaaaacaataatatcaaatgct
acaaaagaatataataaattacaaagtaatgttcatgaaataaaatttattaaaactgaa
tatattcaaaaacaattacaattaattataactaattatactcatgcaacggaatattat
ttacaggctaataaattaaatcttgctagtcaatgttctgaccaagtacaattagttact
cttcaactttcactttttaatacaacatcttacaatcaacaagtaatttgtatacttaat
ttaaaacctgaagatatcgataaagtattatgtcataatttaagcttctctcaaagtttt
attattgttcatgcttataatcatcatgtagattgggctaatttgatttataatcattgt
atattaaatggagaaacaaaatatttaaaagatttcataactgtaaataaactcactcca
agtcttgtacaagattgtgtacgcagatataggttagaaaagagtattacacatactatg
acaaataatatgaaaatattaatttctgaattatcagatgtggaatgtaaatatgtgtta
gcaagtcaattaggatttaaaaatattgtagaaacaatgcttaataatcctatgataggt
gcatatcttaaagatactgtatggaaaaaaggatataatgctacttaa
DBGET
integrated database retrieval system