Arachis duranensis: 107465088
Help
Entry
107465088 CDS
T04300
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: phytochrome A-2
KO
K12120
phytochrome A
Organism
adu
Arachis duranensis
Pathway
adu04712
Circadian rhythm - plant
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
adu00001
]
09150 Organismal Systems
09159 Environmental adaptation
04712 Circadian rhythm - plant
107465088
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PHY
PAS
PAS_2
GAF
HisKA
PAS_9
PAS_4
HATPase_c
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107465088
NCBI-ProteinID:
XP_015939560
UniProt:
A0A6P4BGR1
LinkDB
All DBs
Position
9:20702176..20708713
Genome browser
AA seq
1098 aa
AA seq
DB search
MSSSRPSQSSSNSGRSRHSARIIAQTTVDAKLHASFEESGSSFDYSSSVRASGSADGENQ
PRTDKVTTAYLHHIQKGKMIQPFGCLLALDEKTCKVIAYSENAPEMLTMASHAVPSVGDH
PALGIGTDIRTIFTAPSASALQKALGFGEVHLLNPILVHCKTSGKPFYAILHRVTGSLII
DFEPVKPYEVPMTAAGALQSYKLAAKAITRLQSLPSGSMERLCDTMVQEVFELTGYDRVM
AYKFHEDDHGEVIAELTKPGLEPYLGLHYPSTDIPQAARFLFLKNKVRMIVDCHAKHVKV
VQDEKLPFDLTLCGSTLRAPHSCHLQYMSNMDSIASLVMAVIVNDSDEDADNSDAVQPQK
RKRLWGLVVCHNTTPRFVPFPLRYACEFLTQVFAIHVNREIELEYQITEKNILRTQTLLC
DMLMRDAPLGIVSQSPNIMDLVKCDGASLLYKNKVWRLGVTPTESHIREIALWLSEHHMD
STGLSTDSLYDAGFPGALSLGDVVCGMAAVRITEKDIVFWFRSHTAAEIRWGGAKHDPGE
KDDGRRMHPRSSFKAFLEVVKSRSLPWKDYEMDAIHSLQLILRNAFKEMDSMDITTNAIN
TRLNDLRIEGMQELEAVTSEMVRLIETATVPILAVDVDGLVNGWNIKIAELTGLSVGDAI
GKHLLTLVENSSVGIVKKMLEMALKGEEEKNVQFEIKTHGSKVDCGPIRLVVNACASRDI
HDNVVGVCFVAQDITAQKTVMDKFTRIEGDYKAIVQNPNPLIPPIFGTDEFGWCCEWNAA
MTKVTGWKREEVMDKMLLGEVFGTQMACCRLKNQEAFVNFGIVLNKAMTGLETAKVAFGF
FARSGKYVECLLSVSKKLDVEGVVTGVFCFLQLASPELQQALHVQRISEQTALKRLKALT
YMKRQIRNPLSGMMFSRKMLEATELGAEQKQLLHTSAQCQCQLSKVLDDSDLDSIIDGYL
DLEMAEFTLHDVLVASLSQVMTKSNTKAIRIVNDVKEQIVTETLYGDSLRLQQAIADFLL
ISINFTPNGGQVVVTATLTKEQIGQSVHLVNLELSITHGGSGVXILKLMNGDVRYVREAG
KSSFILSAELAAAHKLKD
NT seq
3297 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcatcctcaaggcctagccaatcttctagcaattcggggagatcaagacatagcgct
agaattattgctcagaccactgtagatgcaaagctccatgctagttttgaggagtctggt
agttcctttgactactctagttcggtgcgcgcctccggctcagctgatggagaaaatcaa
ccaagaacagataaagtaacaacagcttacctccatcacatacagaaaggcaagatgatt
caaccctttgggtgcttgctggccttggatgagaaaacatgcaaggtgattgcttacagt
gagaatgcaccagagatgctgaccatggcgagtcatgctgttcccagtgttggtgaccac
cctgcccttggcattggcaccgacataagaactattttcactgctccaagtgcttcggca
ttgcagaaagcactaggatttggagaagttcatcttcttaaccccatcctagttcattgc
aagacttctgggaaacccttctatgctattctccatcgtgttactggtagtttgattatt
gactttgagcccgtcaagccttatgaagttcctatgactgcagcaggtgctctgcaatcc
tacaagcttgctgcgaaagcaatcacccgattgcagtctttgcctagtgggagcatggaa
aggctatgtgatacaatggttcaagaagtttttgaactcacgggttatgacagggtgatg
gcttataaatttcatgaggatgatcatggggaagtgattgctgagttaacaaagccagga
cttgaaccatatcttgggttgcactatccgtccactgatattccccaggctgcacgtttt
ttgttcttgaagaacaaggtccgtatgattgttgattgtcatgcaaaacatgtaaaggtt
gttcaagatgagaagctgccattcgatttgactttgtgtggttcaaccttaagagctcct
catagttgccatttgcaatacatgtcaaacatggattcaattgcttccctagttatggca
gttatagtcaatgacagcgatgaagatgcggacaactctgatgctgttcagccacaaaag
agaaagcgactctggggcttagttgtttgtcataacactactcccaggtttgttcctttt
cctctaaggtatgcttgtgagtttctgacacaagtatttgccatccatgtcaacagagaa
atagagttagaatatcagattactgaaaagaatatccttcgcactcagacgctcttgtgt
gatatgctgatgcgagatgcacccctaggaattgtatcacaaagccctaatataatggac
ctagttaaatgtgatggggcttccctcttgtataaaaacaaggtatggagattaggagta
acacctactgaatctcatataagagagatagctttgtggttgtctgagcaccatatggat
tccacaggtcttagtacagatagcttgtatgatgccgggttcccaggggctctgtctctt
ggtgatgtagtatgtggaatggcagcggttagaataactgagaaagacatagttttctgg
tttcgatcacacacagctgcagaaatcagatggggtggtgcaaagcatgaccctggtgaa
aaggacgacggcaggaggatgcatccacggtcatctttcaaggctttccttgaagttgtt
aagtcaaggagcttaccgtggaaagactacgagatggatgctattcattcattgcaacta
atactaagaaatgcattcaaagagatggatagtatggacataaccacaaatgcaataaat
acaaggctgaatgatttgaggattgaagggatgcaggaactggaagccgtgacaagtgag
atggttagattaattgaaactgcaacagtacctattctggctgtagatgttgatgggctg
gttaatggatggaatataaagattgccgaattgactggcctttcggttggtgatgctata
gggaagcatcttctcacgctcgttgagaactcttcagttggtatagtcaagaagatgctt
gagatggcattgaaaggtgaagaagagaaaaacgtccaatttgagatcaaaacacatggg
tctaaagttgattgtggtcctattagattggtagttaatgcttgcgcaagccgggatatt
catgataatgttgtgggggtttgttttgtggcccaagacatcacagctcagaagactgtc
atggataaatttacccgaattgaaggtgattacaaggcaattgtacagaatcccaaccca
ttgatccccccaatatttggaactgatgaatttggctggtgttgtgagtggaatgcagct
atgacaaaggtgaccggatggaagagagaagaggtgatggataaaatgcttttaggagag
gtttttgggactcagatggcttgttgtcgtcttaagaaccaagaagcttttgttaatttt
ggtattgtacttaataaagccatgaccggtttggagacagcaaaggttgcttttggtttc
tttgctcgtagtgggaagtatgtagaatgcctgctttcggtgagtaaaaaattggacgtc
gaaggtgtagttactggggtcttctgcttcttgcagctagctagtccagagctgcaacaa
gcattgcatgttcagcgaatatctgaacaaactgccttgaagagactgaaagctttaact
tatatgaagaggcagatcaggaatcctttatccgggatgatgttttcgcggaaaatgttg
gaggccactgagttgggagcggaacaaaagcaactcctacacaccagtgctcagtgccag
tgccagcttagcaaagttcttgatgactcagatcttgacagcatcattgatggttacttg
gatcttgagatggctgaattcactctgcatgatgtattggttgcttcccttagtcaagta
atgacaaagagtaacaccaaagctatccgaatagtcaacgatgtcaaagagcaaattgtg
acagaaaccttatacggtgatagtcttaggcttcagcaggccatagctgacttcttattg
atttccataaacttcacacccaatggaggtcaagttgtagtaacagccactctgaccaaa
gaacaaatagggcaatctgtccatcttgttaatttggagctcagcataacacatggtggt
agtggggtgnccattctaaagctgatgaatggagatgtgcgttatgtaagggaagcaggc
aaatcatcttttatcctatctgctgaacttgccgcagctcataagttgaaagattag
DBGET
integrated database retrieval system
