Arachis duranensis: 107474590
Help
Entry
107474590 CDS
T04300
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: transcription initiation factor TFIID subunit 15b
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
adu
Arachis duranensis
Pathway
adu03015
mRNA surveillance pathway
adu03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
adu00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
107474590
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
107474590
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
adu03041
]
107474590
Spliceosome [BR:
adu03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
107474590
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107474590
NCBI-ProteinID:
XP_052114102
UniProt:
A0A9C6TPG3
LinkDB
All DBs
Position
1:6500868..6503887
Genome browser
AA seq
478 aa
AA seq
DB search
MSGAYGQEGGGGSAPLSYGATGGYGASGGYGGGGNYGGGGYGGGGSGGGGYGGGGDGGGG
YGGKGSGGGGDMXXXGYGSGGGDGGGYGGRSGGYGGNDGGGYGGRGGGGGGYGGRGGGGG
YGGRGGGGGYQGGGDRGGRGGGRGGRGGGGSGRDGDWRCPNPRFVIYQFFTNSLKFQXLN
YGGRGNDYTGGRGSNNDGRGGGGSRGGSYGGNQGREDGGYGQVPPPAAQTYGGSTGGNYP
PSYNSYDGNSNYGTDAGPPPTSYTGGPTSYPPSYGGNTGGYGGDNVTDARGGGRSGPPGG
YDSGYNAGAGGGGRGGYGGAPAEPAAPVKQCDENCDDTCDNSRIYISNLPPDVTTEELRE
LFGGIGQVGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDENGNNKGDACLAYEDPSAAHSAGGFYNNYD
LRGYKISVAMAEKSAPRPAYNHGGNRGGYGGDRRRDNYRDNSGPDRREHYGGNRSRPY
NT seq
1437 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctggagcgtacggtcaagaaggcggcggcggctctgcgccactgtcctatggagct
acaggaggctacggtgcttccggtggttatggaggcggtggtaattatggaggtggaggc
tatggaggaggcggctccggtggagggggttatggtggaggtggtgatggcggaggggga
tacggagggaaaggcagcggtggagggggtgatatgnnnnnnngtggatatggcagtgga
ggtggcgatggtggtggctatggtggaaggagcggaggatatggtggaaacgatggcgga
ggttatggtggaaggggaggcggcggtggtggttatggtggtcggggaggaggtggaggc
tatggtggtcgaggaggtggtggtggatatcaaggtggtggagatcgtggcggacgaggt
ggcggtcgtggtggccgcggtggcggtggtagtggcagagacggagattggcgttgccct
aacccaaggtttgtgatctatcaattctttaccaattctttaaaattccagtaactcaac
tatggaggcaggggtaatgactatactggtgggcggggtagtaataatgatggtagaggt
ggaggtggcagtagaggtggttcatatggtggtaatcaggggagagaggacggtggctat
ggtcaagttccccctcctgcagcccaaacttatggtggttctactggtggtaactaccca
ccctcctataattcttacgatggaaattcaaattatggaacagatgctggtcccccacct
acaagctatactggtggacctacttcatatcctccatcttatggaggtaacacgggtggt
tatggtggcgataatgtaaccgatgcacgtgggggtggtagaagtgggcccccaggagga
tatgacagtggttataatgctggcgctggcggtggtggtcgaggtgggtatggtggtgct
cctgctgagcctgcagctccggtgaagcagtgtgatgagaattgtgatgatacctgtgac
aactctagaatctacatttccaacctaccaccagatgtgactaccgaagaattgagagaa
ctttttggaggcattggtcaagttggtagaataaagcagaagaggggttataaggatcag
tggccctggaatataaaaatatacactgatgagaatgggaataacaagggtgatgcctgc
cttgcttatgaagatccctctgcagcacactcagccggcggtttctacaataattacgat
ttgaggggttataaaatcagtgttgcaatggcagaaaaatctgcaccacggcctgcatat
aatcatgggggcaatagaggtggctatggtggagataggcgcagagacaattatagagat
aattctgggcctgataggcgtgagcattatggtgggaaccggtcacgaccctactga
DBGET
integrated database retrieval system
