Acinetobacter equi: AOY20_10725
Help
Entry
AOY20_10725 CDS
T04103
Name
(GenBank) ATP-dependent RNA helicase HrpA
KO
K03578
ATP-dependent RNA helicase HrpA [EC:
5.6.2.6
]
Organism
aei
Acinetobacter equi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aei00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
aei03019
]
AOY20_10725
Enzymes [BR:
aei01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.6 RNA 3'-5' helicase
AOY20_10725
Messenger RNA biogenesis [BR:
aei03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
Other RNA degradation factors
Others
AOY20_10725
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DUF3418
OB_NTP_bind
Helicase_C
HA2_C
DEAD
AAA_22
AAA_19
nSTAND3
nSTAND_NTPase5
T2SSE
WHD_HA2
NACHT
AAA_30
PhoH
SLFN-g3_helicase
TsaE
AAA_25
Flavi_DEAD
NB-ARC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALH95965
UniProt:
A0A0N9W2X3
LinkDB
All DBs
Position
2246473..2250408
Genome browser
AA seq
1311 aa
AA seq
DB search
MLSHLNVDQLVLARDRHRLNRLRKGKEANEQQYQELFEKSNEKVKARFSRIPNIKLNQDL
PVTQYADKLIEAIEKHQVIIVAGETGSGKTTQLPQIAMLAGRGLTGLIGHTQPRRLAARS
VSQRIAEEVGEKLGESISFKVRFNEQGSQDSIVRLMTDGILLAELVNDRFLTKYDTIIID
EAHERSLNIDFIMGYLKQLLPRRKDLKVIITSATLDVNRFSNYFNGAPIFEVEGRSYPVE
LRYRPISEMNIGGSDDDEFDDFEENLPRAVVSAVEECLQDAQEKGHPEHADILIFASTEQ
EIRELQETLIKHGPKHTEVLPLYARLALAEQQKIFNPSGSGRRIIIATNVAETALTVPNI
RYVIDSGFARISRYNYRSRVQRLPIEAVSQAAANQRKGRCGRIAPGVCIRLYSEEDFLSR
PEFTEPEIKRTNLASVILQMQSLGLGTLEDFDFIEPPDHRLVNDGRKLLIELGAMVEKRN
QPTPVDEMNNPPKSSLVKGGFQGKADSLTKIGQQMAKMPIDPRLARMILGGAHFGVLNEI
LVIVAALAVQDPRERPADKQMQADQKHALFREADSDFLFYLKLWETLHENREGGMSENKR
RTFARQHFLSWLRLREWKKTHEQLVDLAQGLKLSFNTKKASYENLHRALLTGLLSFIANK
TDERNVFMAVRQQKARVFPASTLHKTNTPWVMAFEMVETSQVYLRTLAKIEPEWILLAAG
NLLKHHYFEPHWSKKAGVVNAYDQISLFGLIVEPKRQINYEKVDQLAAHEIFLRDALTTG
NLGITPPFLKHNLLKLEEVERVEDKLRRRDLVVDEETIYQFYASKVPEDVASRRSFEDWR
ATVEPKDPRCLFIEDDALWLDDRPTTQLFPDYLRNGELRLAASYRFDPSHDEDGATVKIP
VQALAQVDENIWSWGIPGWRQELIEALLKSLPKDKRRHFVPIPDTAKKLVKNIDAQHLQA
HILSYLAYQLRGDQITEKDFSFDRIEQYLIPLIKVSDEKGRIIEQGRNLSELKARCRTET
HSPVKQLKGEFKTFPDNFVFEASQKVTGVIVKQYQALVPSKKFVDLEQKDESGVVIQTFN
DQVEAVKQHREGIIRLVHMQLGDLVRQLKKQISKPLALAYSPLGDKAKLEQMLVYATLQM
AITELPVNAEEFQVLVENVRKSFLTHGQKALQNLSEIFIQWQEIRRKLLVLDDSIFGVSM
DDIEDQLDLMSLSDFVYVKPIDVWLEFSRYLKALILRLDRLPNNLQRDTSAIDQVDPWME
KLFKFKNDDRLKELYFMVEELRISLFSQPMKTKMPISPTRLQKLWEKLGIS
NT seq
3936 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgctgagtcatttaaatgtagatcaactcgttttggcgcgtgaccgtcatcgtttaaat
cgactacgtaaaggaaaagaggcaaatgaacagcagtatcaggagctttttgaaaagtcg
aatgaaaaagtaaaagcgcggttttctcgtatccctaatattaagctgaatcaagattta
cctgttactcaatatgcagataaactaattgaggcgattgaaaagcatcaagtcattatt
gttgcgggtgaaacaggttctggtaaaacaacgcagttacctcaaattgctatgttggca
ggtcgtggtttaactggcttaattggtcatactcagcctcgtcgtttagctgcacgaagt
gtgtcgcagcgtattgcagaagaagttggtgaaaaacttggggaatcaatttcttttaaa
gttcgttttaatgaacaaggttcacaagattcaattgtccgtttaatgacggatggtatt
ttattagcagaattagtgaatgatcgctttttaacaaaatacgatacgataattattgat
gaggcacatgagcgatcattaaatattgatttcatcatgggctatttaaaacagctattg
cctcgtcgtaaagatttaaaagtcatcattacttcagcaaccttagacgtaaaccgtttt
tcaaattattttaatggtgcgcctatttttgaagttgaagggcgtagttatcctgtggag
ttacgttatcgtccaatttcagaaatgaatattggtggtagtgatgatgatgaatttgat
gattttgaagaaaatcttccacgagcagttgtatctgctgtagaggaatgtttacaagat
gcgcaggaaaaagggcatcctgaacatgcggatattcttatttttgcgagtacagaacaa
gaaattagagaattacaagaaacattaattaaacatggtcctaaacatacagaagtttta
ccactgtatgcacgtttagctttagcagaacagcagaaaatttttaatccatctggtagt
gggcgacgcattattattgcgacaaacgttgcagaaacggcattgactgtgccgaatatt
cgttatgtgattgatagtggttttgcacgtatttcacgttataactatcgttctcgtgta
cagcgtttacctattgaagcggtatcgcaagcagcggcaaatcagcgtaaaggtcgttgt
ggtcgtattgcaccaggtgtatgtattcgtttgtattcggaggaggattttttaagtcgt
cctgagtttacagaacctgagattaaaagaacgaatttagcttctgtcattctacaaatg
caaagtttaggtttaggtacattagaagattttgattttattgaaccacctgaccatcgc
ttagtaaatgatggtcgtaagcttcttattgagcttggggcaatggttgagaagagaaat
caacctacgcctgttgatgaaatgaataatccacctaaatcttccttggttaaaggagga
tttcaaggcaaggcagattccctcaccaaaattggtcaacaaatggcaaaaatgccaatt
gacccacgtcttgcacgtatgattttaggtggagcacattttggtgttttgaatgaaatt
ttggtgatagtcgctgcacttgctgtacaagatcctcgtgaacgtcctgctgataagcaa
atgcaagcggatcaaaagcatgcattattccgagaagcagattcagactttttattttat
ttgaaattatgggaaaccttacacgaaaatcgtgaaggtggaatgagtgaaaataaacgt
cgtacttttgcacgccagcattttttaagttggttacgtttgcgtgaatggaaaaaaaca
catgaacaattggttgatttagcacagggattaaagctgtcttttaataccaagaaagcg
agctatgaaaatctacatcgtgctttattgacgggtcttttatcttttattgccaataag
accgatgaacgtaatgtttttatggcagtacgtcagcaaaaggcacgtgtgtttccagca
tcgactttacataagaccaatacaccttgggtgatggcttttgaaatggtggaaacatct
caggtttatttacgtacacttgcgaaaattgaaccggaatggattttattggcagcagga
aatttactaaaacatcattattttgaaccacattggtcgaaaaaagcgggtgtggtaaat
gcttatgatcaaatttcattgtttggtctaattgttgagcctaagcgtcaaattaattat
gaaaaagtagatcagcttgcagcacatgaaattttcttaagagatgctttaactacgggt
aatttaggtattacaccaccatttttaaagcataatttacttaaattagaagaagtagaa
cgtgttgaggataaattacgtcgtcgtgatttagtggttgatgaagaaacgatttatcag
ttttatgcttctaaagttcctgaagatgttgcaagtcgccgtagttttgaagattggcgc
gcaacggtagaaccaaaagacccaagatgtttattcattgaggatgatgctttatggtta
gatgatcgtccgacgactcagttattccctgattatttacgtaacggtgagttgcgatta
gcagcatcttatcgatttgatccaagtcatgatgaagatggtgcaacagttaaaattcct
gtgcaggcattagctcaggttgatgaaaatatttggtcttggggaattcctggatggcgt
caagaattaattgaggcattactcaaaagcttaccaaaagataaacgtcgtcattttgtt
ccaattcctgatacagcaaagaaacttgtgaaaaatattgatgctcaacatttacaagca
catattttaagttatttggcttatcaattacgtggtgatcaaattacagaaaaagatttt
tcttttgatcgaattgaacaatatttgattccactgattaaagtgagtgatgaaaaaggt
cgaattattgagcaaggtcgaaatttatctgagttaaaagcacgttgtcgtacagaaaca
catagtcctgtaaaacaattgaagggtgagtttaaaacattccctgataactttgtgttt
gaagcatcacaaaaggtgactggtgttattgttaagcaatatcaggcattagttccttct
aagaaatttgtagatttagagcaaaaagatgaatctggtgttgtaattcaaacctttaat
gatcaggttgaagcagttaagcagcatcgtgaaggcattattcgtttggtgcatatgcag
cttggagatttggttcgtcagttgaaaaaacagatttctaaaccattggctttggcttat
tcaccacttggagataaagcaaagctagagcaaatgttagtttatgccacattacaaatg
gcaattactgaacttcctgtgaatgctgaagagtttcaagtacttgtggaaaatgtaaga
aaatctttcttaactcatggtcagaaagcattacaaaatttaagtgaaatttttattcaa
tggcaagaaatacgtcgaaagttattggttttagacgattctatctttggcgtaagtatg
gatgatattgaagatcagcttgatttaatgagcttatctgactttgtttatgtgaaacca
attgatgtttggttagagttttcacgttatttaaaggcattaattttacgtttagaccga
cttccaaataatttacaaagggatacttctgccattgatcaagtagacccatggatggaa
aaattatttaagttcaaaaatgatgatcgccttaaagaattatatttcatggttgaggag
ttacggatctctttattttcacaaccaatgaaaacaaagatgccaatttcaccaacccgt
ttgcaaaaactatgggaaaaacttggaataagttaa
DBGET
integrated database retrieval system
