Arcobacter ellisii: AELL_1030
Help
Entry
AELL_1030 CDS
T06558
Name
(GenBank) autotransporter domain-containing protein
Organism
aell
Arcobacter ellisii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXX94700
LinkDB
All DBs
Position
996982..1003650
Genome browser
AA seq
2222 aa
AA seq
DB search
MKSFRVVNAKFRILKGGKIGLSLSISLVVSSLILNQSAHAETFFDNEWTTGTTFTTPDVT
ATARSNTGTNTGTYNQISTTENIIFRPDRVAQSYTGVSDFEVFGTNSVSVASDGTTGTGT
NLIADGTYIDGGGGTATNNDRAFYQSLNPDTDFTVTLTSGSTVNNIVKETSTYYYVDSTT
GYTSSSDAYVANIVFSGSNTVYGTTNIDDGNIKLNDSVTFTGTVDAGSISVDTTNTIIFN
SDVDLTAGTTDAMNFSVDGEVLLNEDFTGNITSGGDNLGTVTIVGNGTGKEQIITGNIGT
STSSDIGILNIGSDTIDSNYSRTVIYGDVYANSTVLNNNGTTNSSTLVLADGSNITSTIT
TADANMGIITLDGSSTVSGSVGSSGALLKEINAGANGSSSTFSSDVYATNLDVEGTGTVN
LNGDYTGTAIRYNADGTVVLANGSDVNSAITTATTNTGTLTLNGSSTVSGSVGSSGALLK
EINAGANGSSSTFSSDVYATNLDVEGTGTVNLNGDYTGTAIRYNADGTVVLANGSDVNSA
ITTATTNTGTLTLNGSSTVSGSVGASGALLKEINAGANGSSSTFSSDVYATNLDVEGTGT
VNLNGDYTGTAIRYNADGTVVLANGSDVNSAITTATTNTGTLTLNGSSTVSGSVGSSGAL
LKEINAGVNGSSSTFSSDVYATNLDVEGTGTVNLNGDYTGTAIRYNADGTVVLANGSDVN
SAITTATTNTGTLTLNGSSTVSGSVGSSGALLKEINAGANGSSSTFSSDVYATNLDVEGT
GTVNLNGDYTGTAIRYNADGTVVLANGSDVNSAITTATTNTGTLTLNGSSTVSGSVGASG
ALLKEINAGANGSSSTFSSDVYATNLDVEGTGTVNLNGDYTGTAIRYNADGTVVLANGSD
VNSAITTATTNTGTLTLNGSSTVSGSVGSSGALLKEINAGANGSSSTFSSDVYATNLDVE
GTGTVNLNGDYTGTAIRYNADGTVVLANGSDVNSAITTATTNTGTLTLNGSSTVSGSVGS
SGALLKEINAGANGSSSTFSSDVYATTTNIGAGEIKFVSDVSTDIVALSTTEGVVTFVGD
VSGKSQAFTGDIGTAGSLINTLNIGESGTANYSTTTITGNVYATNTVLDNGTSSSTLILS
DGSNITSTIKTAQNGQGVLTFLGNSTVNGTIGTNTEKLEQINVANTGKTVTFNSSINSNN
LNILGDGEVILADNSNLNAPVTTTTNNEGTLTFEGTSNVSGQIGTSGALLKEITLQGSSG
EVVTFGNDVYVSNIVFESDGTANLDGNLTGNINFSGIDAIINIADGKGILDSGGGLLGSV
QTLANNTGILNYKGDGVIDGIIGSSGLGINELNVNTNDEQDKDGSGTVTSNGLLARREIF
ADIINLYNNATLTLADNTNVTNTDTSDSLIIATMTSNTGNVVFQGSSTVSGDVGTSTNNL
ESITAGVSGETVTFDGMVYATNLKYTDNGTVILNGDNGSNVEGMKGTVDFDSFAGTLEIG
DDVNLTTGTSGIQFANANNAILTFNGTSTIYGVLGGNTAGNSTFESIYAGVTAETVTFKN
DVYVKESTFHVSEDGVVNFEGNLYGDLVFENDGTVNVANTKSIIVSSTPLAITTANNGQG
TINFEGTTTLYTDIGEDLFRLKEVNFGTVGTASNSYTQNINKDIYANDITIGNSSNKTTA
NLTSDMTFYGNLNLSSNSVLDVNNNDITVEDEIVLASNSTLKFEIDTSDLIAGQAVANDT
SGSIDANSLNIQDDIKVHIDYNGTLAGKYEYSLIDANSSTGTYTEGTEANGKVSDNSIID
SKVILKDNNLVLVADRTNNGSFNPEDLYIEKSEIGEDYSNAASQALADYANGVDRAGALA
QIINELEYLEGGTVLSEAKKQEMIETQRKLAPIANSSNMQTSITASNLAMTTIKGRLSDI
RTGEMNNFTPTLYRTGLSSGDYYSFDTSFWLKGMAGKATQDQVDEYYGFDTSTYGFVGGM
DKISGDGTIFGAALAYSTTKTNQENAASDSSDTTSIQGTIYSSLAYENAYVDTYLSYAKH
KTDGTRTANSGKLTSSVDAEQISAKVETGYTIPVNDGVSLTPFASLEYSLLNQKGYTEKG
TAYQNDALKVDSLKLNRGTVELGAKLTSNIELEETLIIPQLSVSAYNSFGDNSADIKAQY
IGGGKEFVTPVSELNKTMYNVGLGLETKISDSTSVIFDMDYDRSKDGKFQGYSGSVTFGI
SF
NT seq
6669 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatcatttagagttgttaatgctaaatttcgtattctaaaaggtggaaagattgga
ttatcattatctatctctttagtagttagttcattaattttaaatcaatctgctcatgct
gaaacattttttgataatgaatggactacaggtacaacttttactactcctgatgtaaca
gcaactgcaagaagcaatactggtacaaatacgggtacttataatcaaatatcaacaaca
gaaaatataatttttagacctgatagagtagcacaatcttatacaggtgtttcagatttt
gaagtttttggaactaatagtgtttcagttgcaagtgatggaacaacgggaacaggtact
aatttaattgctgatggaacatatattgatggtggtggtggaactgcaactaataatgat
agagcattttatcaatctcttaatccagatacagactttacagttactttaacttctggt
tcaacagttaataatatagttaaagagacttcaacttattattatgtagatagtacaaca
ggctatacatcctcaagtgatgcctatgttgcaaatattgtattcagtggttcaaataca
gtttatggaacaactaatattgatgatggaaatattaaactaaatgatagtgtaactttt
acaggaacagttgatgctggttctatttctgttgatacaacaaatactattatttttaat
tcagatgttgatttaacagctggaacaacagatgctatgaatttttcagtagatggagaa
gttttacttaatgaagattttacaggtaatatcacatcaggtggagataatttaggtact
gtaactattgttggtaatggaacaggaaaagaacaaataattactggaaatatagggact
tcaacttcttctgatataggtattttaaatattggaagtgatactattgattcaaattat
tcaagaactgtaatttatggtgatgtttatgcaaatagtacagttttaaataataatgga
acaacaaatagttcaacattagttttagctgatggaagtaatattacatcaactattaca
actgcagatgcaaacatgggaataattactttagatggaagttcaacagtaagtggaagt
gtaggatcaagtggagcattactaaaagagataaacgcaggagcgaatggatcaagttca
acgtttagtagtgatgtttacgcaacaaacttagatgtagaggggactggaacagtaaat
ctaaatggggattatacagggacagcaataagatataacgcagatggaacagtagtatta
gcaaatgggagtgatgtaaactcagcaataacaacagcaacaacaaatacaggaacattg
acgttaaatggaagttcaacagtaagtggaagtgtaggatcaagtggagcattactaaaa
gagataaacgcaggagcgaatggatcaagttcaacgtttagtagtgatgtttacgcaaca
aacttagatgtagaggggactggaacagtaaatctaaatggggattatacagggacagca
ataagatataacgcagatggaacagtagtattagcaaatgggagtgatgtaaactcagca
ataacaacagcaacaacaaatacaggaacattgacgttaaatggaagttcaacagtaagt
ggaagtgtaggagcaagtggagcattactaaaagagataaacgcaggagcgaatggatca
agttcaacgtttagtagtgatgtttacgcaacaaacttagatgtagaggggactggaaca
gtaaatctaaatggggattatacagggacagcaataagatataacgcagatggaacagta
gtattagcaaatgggagtgatgtaaactcagcaataacaacagcaacaacaaatacagga
acattgacgttaaatggaagttcaacagtaagtggaagtgtaggatcaagtggagcatta
ctaaaagagataaacgcaggagtgaatggatcaagttcaacgtttagtagtgatgtttat
gcaacaaacttagatgtagaggggactggaacagtaaatctaaatggagattatacaggg
acagcaataagatataacgcagatggaacagtagtattagcaaatgggagtgatgtaaac
tcagcaataacaacagcaacaacaaatacaggaacattgacgttaaatggaagttcaaca
gtaagtggaagtgtaggatcaagtggagcattactaaaagagataaacgcaggagcgaat
ggatcaagttcaacgtttagtagtgatgtttatgcaacaaacttagatgtagaggggact
ggaacagtaaatctaaatggagattatacagggacagcaataagatataacgcagatgga
acagtagtattagcaaatgggagtgatgtaaactcagcaataacaacagcaacaacaaat
acaggaacattgacgttaaatggaagttcaacagtaagtggaagtgtaggagcaagtgga
gcattactaaaagagataaacgcaggagcgaatggatcaagttcaacgtttagtagtgat
gtttatgcaacaaacttagatgtagaggggactggaacagtaaatctaaatggagattat
acagggacagcaataagatataacgcagatggaacagtagtattagcaaatgggagtgat
gtaaactcagcaataacaacagcaacaacaaatacaggaacattgacgttaaatggaagt
tcaacagtaagtggaagtgtaggatcaagtggagcattactaaaagagataaacgcagga
gcgaatggatcaagttcaacgtttagtagtgatgtttacgcaacaaacttagatgtagag
gggactggaacagtaaatctaaatggggattatacagggacagcaataagatataacgca
gatggaacagtagtattagcaaatgggagtgatgtaaactcagcaataacaacagcaaca
acaaatacaggaacattgacgttaaatggaagttcaacagtaagtggaagtgtaggatca
agtggagcattactaaaagagataaacgcaggagcgaatggatcaagttcaacgtttagt
agtgatgtttatgcaacaactacaaatattggagcaggtgagataaaatttgtatctgat
gtctcaactgatattgttgctttatcaactacagaaggagtcgtaacttttgttggagat
gttagtggtaaatcacaggcatttactggagatattggaacagcaggttctttaataaat
actttaaatattggtgaaagtggaacagctaattattcaacaacaacaattactggtaat
gtttatgcaacaaatactgttttagataatgggacaagtagttcaactttaattttatca
gatggttcaaatataacttcaactataaaaactgcacaaaatggacaaggagttttaact
ttcttaggtaattcaactgtaaatggaacaataggaacaaatactgaaaaattagaacaa
attaatgtagcaaatactggtaaaactgttacttttaattcttcaataaatagtaataat
ttgaatattttaggtgatggagaagtaatattagctgataattctaacctaaatgcacca
gtaactacaactacaaataatgaaggaactttaacatttgaaggaacttcaaatgtgtct
ggacaaataggaacgagtggagctttattaaaagagataacattacaaggttcatcagga
gaagttgtaacttttggaaatgatgtttatgtttctaatatagtgtttgaaagtgatgga
actgcaaatttagatggaaatttaactgggaatatcaacttctcaggaatagatgcaata
ataaatatagctgatggaaaaggaattttagattcaggagggggacttcttggttctgta
caaactttagcaaataatacaggaatattaaattataaaggtgatggtgtaattgatggt
attattggaagttcaggtttaggtataaatgaattaaatgtaaatacaaatgatgaacaa
gataaagatggaagtggtacagtaacttcaaatggtttattagcaagaagagaaattttt
gcagatattataaatttatataataatgcaactttgacattagctgataatacaaatgta
acaaatactgatacaagtgatagtctaattattgcaacaatgacatcaaatacaggaaat
gtagtattccaaggtagttctactgtatcaggagatgtaggaactagcactaataattta
gaaagtataacggctggtgttagtggtgaaacagtaacttttgatggtatggtttatgca
acaaatttaaaatatacagataatggaacagtaattttaaatggagataatggttctaat
gtagaaggaatgaaaggaacagttgattttgactcatttgcaggaactcttgaaattgga
gatgatgtaaacttaacaactggaacatcaggaattcaatttgcaaatgcaaataatgcg
atacttacatttaatggaacttcaactatatatggagttttaggtggaaatacagctgga
aactctacatttgaaagtatttatgcaggagttacagcagaaacagttacctttaaaaat
gatgtttatgtaaaagagagtacttttcatgttagtgaagatggagttgtaaattttgaa
ggtaatttatatggggatttagtttttgaaaatgatggaacagtaaatgttgcaaataca
aaatctataatagtttcatctactcctcttgcaattacaactgctaataatggacaagga
actataaactttgaaggtacaacaactctatatacagatatcggagaagatttatttaga
ttaaaagaggtgaattttggaacagttggtacagcttcaaattcatatactcaaaatata
aataaagatatttatgcaaatgatataactataggaaatagctcaaataaaacaactgca
aatttaacatcagatatgacgttctatggaaacttaaatttaagtagtaattcggtttta
gatgttaataataatgatattacagttgaagatgaaatagttttagcttcaaactctaca
cttaaatttgaaattgatacctctgatttaatagctggacaagctgttgcaaatgataca
tcaggaagtattgatgcaaatagtttaaatattcaagatgatataaaagttcatatagat
tataacggaactttagcaggtaaatatgaatatagtttaattgatgcaaatagttcaacg
ggaacatatacagaaggaactgaagctaatggaaaagtatcagataacagtattatagat
agtaaggttatattaaaagataataatttagttttagttgctgatagaacaaataatggt
tcatttaatccagaagatttatatattgaaaaatctgaaataggagaagattattcaaat
gcagcttctcaagcacttgcagattatgcaaatggagttgatagagcaggggcattagct
caaattatcaatgaattagagtatttagaaggtggaacagttttaagtgaagctaaaaaa
caagagatgattgaaacacaaagaaaacttgctcctattgcaaacagttcaaatatgcaa
acatcaattacagcatcaaatttagcaatgactactataaaaggaagattatctgatatt
agaacaggggaaatgaataattttactccaactttatatagaacaggattatcatctgga
gattattatagttttgatacctcattttggttaaaaggaatggctggaaaagcgacacaa
gatcaagttgatgagtattatggatttgatacttcaacttatggttttgtaggtggtatg
gataaaatttcaggagatggaacaatttttggagcagcacttgcttattctacaacaaaa
acaaatcaagaaaatgctgcatcagatagttcagatacaacaagtattcaagggactatt
tattcatctttagcatatgaaaatgcttatgttgatacttatttatcttatgcaaaacat
aaaacagatggaacaagaactgcaaattctggtaaattaacttcaagtgttgatgctgaa
caaatctctgcaaaagttgaaactggttatacaattcctgttaatgatggtgtatcatta
actccgtttgcttctttagaatatagtttactaaatcaaaaaggttatactgaaaaagga
acagcatatcaaaatgatgctttaaaagttgatagtttaaaactaaatcgtggtacagtt
gaacttggagcaaaacttacttcaaatatagaattggaagaaactttaattattcctcaa
ttatctgttagtgcttataactcatttggagataatagtgcagatataaaagcacaatat
attggtggtggaaaagagtttgttacacctgttagtgagttaaataaaacaatgtataac
gttggattaggacttgaaacaaaaatttctgattcaacaagtgtaatatttgatatggat
tatgatagaagtaaagatggtaaatttcaaggatattctggaagtgtaacatttggaatt
agtttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
