Aestuariibaculum sp. YM273: RBH94_12565
Help
Entry
RBH94_12565 CDS
T09314
Name
(GenBank) tetratricopeptide repeat protein
Organism
aest
Aestuariibaculum sp. YM273
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_12
HATPase_c
Response_reg
TPR_2
TPR_1
Guanylate_cyc
HisKA
SNAP
TPR_8
TPR_10
TPR_MalT
TPR_7
TPR_NPHP3
TPR_16
TPR_6
HATPase_c_3
RPN7
HATPase_c_2
DUF2808
TPR_11
Glutaminase
TPR_19
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WMI64888
LinkDB
All DBs
Position
2906586..2909999
Genome browser
AA seq
1137 aa
AA seq
DB search
MICKFFRIVLFLYFAVSFGQSTKLDSLKQALQLVTKDSVRVKILKDISWEYLNNRSNIPL
AKKYIDSFARLSSQSGIEWGQYLARYQYGVLERQKGNYDIALNHFNVYLEFAKKNNDSIQ
IANTQYQQAIIHDYRGQYDKSLEIYHKIYEIYQNAGDEYSAANILNSLGEILKRSNRIEE
ALENYNQALSIFTRLQAKADIANCLYNIGTTYQLQKNYSKALAYLNKALLLDEDIGSLWG
MAYDYEAIGEVYKLQGDYRKALDVHLKTLEIRQGLNQKRELSAIYVQIGQDYIKLKQNKQ
AEEYFLKALDLAEEVGATTELVNVYSGLSELYGETEDYQKALNFKEKLIAVKDSLFNETK
SKQIEELQERFNTEKKEAAILALEQDAEIQNLKLKRQTVFRNIFIAIILVGALLTFLLIR
RYKYKQRVRLELIERRRQIEEEQQKTEFEKQRVAQLEKIDHLKDQFLANTSHELRTPLNG
IIGLSESLKDGAAGPLSLKAIENLDMIVNSGKRLSNLVNDILDFSKLKNNDLQLSIHPVD
LYAITDLVLKVSESLIKGKSLQLINSVPKDIHLVEADENRLQQILYNLIGNAIKFTEKGT
VQVKAQLEENKIRISVSDTGIGIPVDKFESIFKSFEQVDGSVERAYGGTGLGLSVTKQLV
ELHGGTIHVESKVREGSTFMFTLPLSETNRKDIARIKIIATKDEVQKIKVDSEDDKIEVV
NSENKDIKILVVDDEPINRRVLENHLTVAGYSVVEAGSGQETLNLMKTENFNLILLDIMM
PNLSGYEVCEMIRKDYSASELPIVLLTAKNRVSDLVAGFNVGANDYLTKPFSKNELLSRI
KTHVNLNGIHKATSRFVPAEFLKSVGREAITDVVLGDHIEKHVTVLFTDIRDYTSLSESM
TPEQNFKFVNAYVGRMGPLIKKNKGFVNQYLGDGIMALFPEKASHALQATIDMQKVIIEY
NNRRVSEGFRPISVGMGLHTGELVMGIIGDVYRNDTAIIADTVNTASRMEGVTKYYGAKI
IISDSSLATIDNKEDFNFRYLGKVRVKGKYKTMGIYECFDGDDSENITLKQQTLNQFEKG
MTHFFAKEFPKASVAFDAILSLNPSDLVAKYFLTKSAEYTISGAPDDWDQVNTIPMK
NT seq
3414 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatatgcaagttttttagaattgtattatttctttattttgctgtttcttttggtcaa
tcgacaaaactagatagcttaaaacaggctttacaacttgtaactaaagattctgtacgg
gtaaaaatattaaaagacatttcgtgggagtatttaaataatcgttcaaatattcctttg
gcaaaaaaatatattgacagttttgcaaggttaagtagccaatcaggtattgaatggggg
caatatctggccaggtatcaatatggtgttttagaacgtcagaagggtaattatgatatc
gctttaaatcattttaatgtttatttagagtttgctaaaaaaaataatgatagtattcaa
atagcaaacacacaatatcaacaggccataattcacgactatcgaggtcagtacgataaa
agtctcgaaatctatcataaaatttatgagatataccaaaacgctggtgatgaatacagt
gctgcaaatattttaaatagccttggggagattttaaagcgttcaaatcgtattgaagaa
gctttagagaattataatcaggcgttatctatttttacacgtttacaagcaaaggctgat
attgctaattgtttgtataacataggtacgacgtaccaacttcaaaagaattattcaaaa
gctttagcctaccttaacaaagcgttactattagatgaagacataggaagtctttgggga
atggcttatgattatgaagctataggagaggtgtataagcttcaaggagattatcgaaag
gctttagatgtacatttaaaaacactggaaattaggcagggattaaatcaaaaaagagaa
ctatccgcaatttatgtgcaaatagggcaggactatataaaacttaaacaaaacaaacag
gcagaagaatactttttaaaagccttggatctggctgaagaagttggagctacaaccgaa
ttagtgaatgtttattcaggtttgtcagagttatatggtgaaactgaagactaccaaaag
gcattaaactttaaagaaaaactaatagcagtaaaagatagtttgtttaacgaaacgaag
tctaaacaaatcgaagaacttcaggaacgatttaataccgaaaaaaaggaagctgctatt
ctggctttagagcaggatgcagagattcaaaatttaaagctgaagcgtcaaacggttttc
cgaaatatatttatagccataattctagtgggagccttgttaacttttttactgataaga
cgctataaatataaacaacgcgtaagattggagcttattgaacggcgtagacaaatagaa
gaggaacagcaaaaaacagagtttgaaaaacaacgtgtagcacagcttgaaaaaatagat
catttaaaagatcagtttttagccaatacctcacacgaactgcgtacgcctttgaatggg
attatcggtttatcagaatctttaaaagatggtgctgccggtccgttgtcgttaaaagct
atcgagaatctcgatatgattgttaatagtggtaaacgtctatcgaatctggtaaacgat
attttagatttttcaaagttaaagaacaatgatcttcaattgtccattcatcctgttgat
ttatatgctattacagatttggttttgaaggtgtccgaaagtttaataaaaggaaaatcc
cttcagcttattaattctgttccaaaggacattcatttagttgaagcagacgaaaaccga
cttcagcaaatactttacaatttaatagggaatgccatcaaatttaccgaaaaaggcact
gttcaggtaaaggctcaactcgaagaaaacaaaataaggatttctgtttccgataccggt
attggtattccagtagataagtttgaaagcatttttaagtcattcgagcaggttgatgga
tcggtagagcgtgcctatggaggcacgggcttaggcttgtcggtgacaaagcagttggta
gagttgcatggtggaactattcatgtggaatctaaagttagggaagggtcaacgtttatg
tttactttacctttaagtgaaacaaatagaaaggatatagcaagaattaaaataatagcg
acaaaggatgaggttcagaaaattaaagtagattctgaagatgataaaatagaagttgtt
aattcagaaaataaagatattaagattttagtggtagatgatgaacctataaatcgtcgg
gttttggaaaatcatttaacggttgcagggtactcggttgtagaagcaggtagtggtcaa
gaaactttaaatttaatgaaaactgaaaattttaatttgattcttctagatatcatgatg
ccaaatctttccgggtatgaggtttgtgaaatgattagaaaagattattcagctagcgaa
ttacctattgttttgcttacggcaaaaaacagggtaagtgatttggttgctggttttaat
gtcggggctaacgattatttaacgaaaccattttctaaaaatgaattgcttagccgaata
aaaacccatgttaatttaaacggcattcataaagcgaccagccgatttgtaccagccgag
tttttaaaatctgttggtcgagaagcaattaccgatgtcgttttgggcgatcatatagaa
aagcacgttactgttttatttaccgatattcgagactatactagtttatcagagagcatg
acacccgaacaaaactttaaatttgtaaatgcttatgtagggcgcatgggacctttaata
aaaaagaataaaggttttgtaaatcagtatttgggagatggtatcatggcgctttttccc
gaaaaagcatctcatgctttacaagcaaccatcgatatgcaaaaggtaatcatagaatac
aataatcgaagagtttctgaaggatttagacccatttcagtagggatggggttacatacc
ggagagttggttatgggaattataggtgatgtttaccgaaatgatacagctattattgca
gatacagtgaatacggcttctagaatggaaggtgtaactaaatattatggagcaaaaatt
attattagtgatagtagtctggcaactatagataataaagaagattttaattttaggtat
ttaggtaaggtaagagtaaaagggaaatataaaaccatgggtatatatgaatgttttgat
ggagatgatagtgaaaatataacactaaaacaacagaccttgaatcagtttgagaaagga
atgactcacttttttgctaaagaatttccaaaagcctctgtagcttttgatgctattctg
tctttaaatccctccgacttagttgcaaaatatttcttaaccaagtcggcggaatatacc
atttcaggtgctcccgatgattgggatcaggttaatacaattccaatgaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
