Aestuariibaculum sp. YM273: RBH94_13375
Help
Entry
RBH94_13375 CDS
T09314
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
aest
Aestuariibaculum sp. YM273
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Por_Secre_tail
Cu-binding_MopE
GBD_T9SS_assoc
Arch_flagellin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WMI65044
LinkDB
All DBs
Position
3113218..3116913
Genome browser
AA seq
1231 aa
AA seq
DB search
MKKITVLAFILLNISLMYPQDCRSNTEIENAYVAINNGYTEIVTQYIIPNEYVTVSNILE
NEYTFTSAITNVNDYITIRDSSGDNILAQGTSPLTYQFQPGQVDDNTIQIHIHLNSGCSS
IDNGNHTISLINLDNLPTCYEPLTNSARISYLSNTRLDFYWQAPASGDNPVDYEWEIVPS
GNTQGEGVVASGNTGGSTNASTGENALSPNTAYIVFIRSKCDANTYSIWYETPVVTTLSV
GPPSNDFCSGAISILQETGISSVNLSENTIQGSVAGGAGTDIIAESCNGQANARDDIWYS
FLAQTTDINITVNSSFDAILTLFSGDCNNLTQISCSDINGGVTTLEQISYTGLTVGDTYY
FRVYSQPFTVPNPNFTMNLWSPTATTDFDDDGYSDEVDCDDSNPSIYEPQLYYEDKDEDG
YGSSVVAMRCELTPSPGFSTNSEDCNDDDPNINPDTVWYRDFDEDGYGDINSTLTQCDQP
LGYVLDNTDCNDSKLEISPETVWYEDSDQDGYGDINSTLTQCTQPVGYVLDNTDCDDNNG
AINADTVWYRDFDEDGYGDINTTLTQCTKPVGYILNPTDCDDTDPDINPDTVWYRDSDED
GYGDINSTLTQCDQPLGYVLDNTDCNDSKLEINPETVWYEDSDQDGYGDINSTLTQCTQP
QGYVLNSEDCDDAVAEINPNANEIPGNSIDENCDGSDSFVWYEDADDDGFGNLNVSLEEP
SQPAGYVLDNSDCDDTNPAIHEPIIYYVDNDGDGYGTDVMVEFCLTSAPEGYSTISGDSN
DADDTINPSATEVCDGVDNDSDGEIDEGFSDTDGDGIADCVDTETCDGVDNDGDGDVDEG
FPDTDGDGIADCVDTETCDGIDNDGDGDIDEGFQDTDQDGVADCVDDCPNDPNKVDSGSC
GCGVADTDSDGDGTPDCNDLCPSDPNKTDPGNCGCGVADADSDGDGTPDCNDLCPSDPNK
TDPGSCGCGVADTDSDGDGTPDCNDLCPSDPIKTDPGNCGCGVVDTDSDGDGTPDCTDLC
PSDPNKNDPGSCGCGVSDIDSDQDGTPDCDDNCPDDPNKTDPGSCGCGVSDIDTDQDGTP
DCDDNCPNDPNKTDQGSCGCGVSDIDTDQDGVADCDDVCPGFDDAVDSDNDGIPDGCESL
SVEKSLLNELFVKPNPFNSMISVMIPKIFVNTDFEITIFDLNGRLILNRNVKNVNQQIQI
EHLEAFQQGMYLIKIKSLENNQSIVRQIVKF
NT seq
3696 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaattactgttttagcatttattctacttaatatcagtttgatgtatccgcaa
gattgcagaagtaatacagaaattgaaaatgcttacgtggcaattaataatgggtatact
gaaattgtaacacaatatattattccaaatgagtatgtaacagtttctaatatcctagaa
aacgaatatacatttacatctgctataactaatgtaaacgattatattaccataagagat
tcttctggcgataatattttagctcaaggaacatcgcctttaacatatcaatttcagcca
gggcaagttgatgataataccattcaaatacatattcatttaaattcagggtgtagttca
attgataatggaaatcacactatttcactaataaatttagataacctgcccacgtgttac
gagcctttaactaatagtgccagaattagttatttgtcaaacacgcgtttagatttttat
tggcaggctccagcatctggagataatcctgtagattatgaatgggaaattgttccgtct
ggaaatactcaaggggagggagtagtggcttcaggtaacactggcggaagcacaaacgct
tcaacaggagaaaatgcattgtcgccaaatacggcatatatcgtttttattaggtcaaaa
tgtgatgcaaatacttatagtatttggtatgaaacacctgttgttacaacactttctgta
ggtccgccatctaatgatttttgtagtggagcgatatcaatattgcaagaaactggaatt
tcatctgttaatttatcggaaaacacaattcaaggtagtgttgcgggaggtgctggtaca
gatattatagcagaatcctgcaatggacaagctaatgcgagagatgacatttggtattcg
tttttagcacaaacaacagatataaacatcactgttaattcctcttttgatgctatttta
actttgttttcgggagattgcaataatttaactcaaatatcctgtagtgatattaatgga
ggtgttactacattggaacaaataagttatactggattaacagtaggcgatacctattat
tttagagtgtattctcaaccctttacagtccctaatccaaattttacaatgaatttatgg
tcaccaacagccactacagattttgatgacgatggttatagtgacgaagtagattgtgat
gatagtaacccttctatttatgaacctcaattgtattatgaagataaagatgaagatggt
tatggttcttctgtggttgcaatgcgatgcgaattaacaccttctccaggtttttctact
aacagtgaagattgtaatgatgatgatccaaatattaatccagataccgtttggtataga
gattttgatgaagatggttatggcgatatcaattcaactttaacccaatgtgatcaacca
ctgggttatgttttagataacaccgattgtaatgattctaaattagaaataagccctgaa
acggtttggtacgaagattccgatcaagatggttatggtgatataaattcaactttaaca
caatgtacgcagccagtaggttatgtgttagataatacagattgtgatgataataatgga
gcaattaacgcagataccgtttggtatagagattttgatgaagatggttatggtgatata
aatacaactttgacacaatgtactaagccagtaggctatattttaaatcctactgattgt
gatgatactgatccagatattaatcccgataccgtttggtatagagattccgatgaagat
ggttatggtgatatcaattcaactttaacacaatgtgatcaaccactgggttatgtttta
gataacaccgattgtaatgattctaaattagaaataaaccctgaaacggtttggtacgaa
gattccgatcaagacggttatggtgatataaattcaactttaacacaatgtacccaacca
caaggttatgttttaaatagtgaggattgtgatgatgctgtagcagagattaatccgaat
gcaaatgaaatccctggaaatagtatagatgaaaattgtgatgggtcagattcctttgtt
tggtatgaagatgctgatgatgatggatttggaaatctaaatgttagtttagaagaaccg
agccagccagcaggttatgttttagataactcagattgtgacgacacaaatccggctatt
catgaacctattatctattatgtcgataatgatggtgatggatatggaacagatgtgatg
gttgaattttgcttaacaagtgctcctgaagggtattctactatttcaggagattctaat
gatgccgatgacactattaacccaagtgctacggaggtttgtgatggtgttgataacgat
tcagatggagaaatagatgaaggcttttctgatacagatggcgatggaatagctgattgt
gtagatacagaaacttgtgatggagtggataatgatggagatggagatgtagatgaaggc
tttcctgatacagatggtgatggaatagccgattgtgtagatacagaaacttgtgatgga
attgataatgatggagatggagacattgatgaaggttttcaggatacagatcaagatggt
gtagccgattgtgttgatgattgtcctaatgaccccaataaagtcgattctggtagttgt
ggttgtggagtagcagataccgattcagatggagatggtactccagattgtaatgattta
tgtccttccgaccctaataaaaccgatccgggtaattgtggttgtggtgtagcagatgcc
gattcagatggtgatggtactccagattgtaatgatttatgtccttccgaccctaataaa
accgatccgggtagttgtggttgcggggtagctgataccgattcagatggtgatggtact
ccagattgtaatgatttatgtccttccgaccctattaaaaccgatccaggtaattgcggt
tgcggagtagtagacacagattcagatggagatggcactcctgactgtactgatttatgc
ccttccgatcctaataaaaatgatcctggaagttgtggttgtggcgtttcagatatagat
tctgatcaagatggcactccagattgtgatgataattgtcctgatgatcctaataaaaca
gacccaggaagttgtggttgtggcgtttcagatatagataccgatcaagatggtactcca
gattgtgatgataattgtcctaatgatcctaataaaacagatcagggaagttgtggttgt
ggtgtttcagatatagataccgatcaagatggtgtagcagattgtgatgatgtttgccct
ggatttgatgatgctgtagattctgacaatgatggtatacctgatggttgcgaaagttta
agtgttgaaaaatctttattaaatgaattgtttgtaaaaccaaacccatttaactcaatg
atatcagtaatgattccaaaaatctttgtgaatacagattttgaaattactatttttgat
ttaaatggaaggctaattcttaacagaaatgttaaaaatgtcaatcagcaaatccaaata
gagcatcttgaagcttttcaacaaggaatgtatttaattaaaatcaagagcttagaaaat
aatcaatcaattgtaaggcagattgttaaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system