Actinidia eriantha (wild kiwifruit): 130770414
Help
Entry
130770414 CDS
T09464
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: pumilio homolog 1-like
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
aew
Actinidia eriantha (wild kiwifruit)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
Flg_hook
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
130770414
NCBI-ProteinID:
XP_057483876
LinkDB
All DBs
Position
28:complement(6084239..6096324)
Genome browser
AA seq
1039 aa
AA seq
DB search
MLSELERRPMLGVNEGSFGDELERDIGLLFREQERNQDADDCKNELNLYRSGSAPPTVEG
SLSAVGGLFNHGSVSGFASNKSGNGFMSEEELRSDPAYLSYYYSNVNLNPRLPPPLLSKE
DWRSAQRLQGGSSGLGGIGDGRKVNKNDSGSGGRSMFSMPPGFSSKKGESESESEKVRGS
AEWGVDGLIGLPGLGLGGKQKSLAEIFQDDLEYAPPAAGHPSRPASRNAFENGETVDSVE
AELAHLRSELAAADTVRASVNVKSSTAVQNSGPPASYSYAAVLGASLSRNTSPDPQVIAR
VPSPCLAPVGGERIATYEKRSVNSPNSFNSILTTMMESANLVTALSGMNLSNGLIVEEEN
LPLHIEQDVDDHKNYLFNLQSSQNNAKQHPYMKKSESERFDSSRNNGAGSDLSNSSLVSD
KQVDLRRSTTFTNKSNIKGFPASTLNSKGSLPSHYQHMDSSNSSLLNYGLGGYSINTAMP
SMMAGHIGASNLPPLYENVAAASAMAILGGLPSGLSLSPGASESQNLNRFGAHMEGXALQ
PPLVNPMYLEYLRMTEYAAAQAAALNDPSSMDRNYLGGNSQMDLLQNAYLGTLLSPQKSQ
YGIPMGTKSGGSNHHGYYGTPAYGIGLSYPGSPLASPIVPNSPGGPGSPMRHGEFSMRFP
SRVRNIAGGVMGPWHAGFSDEDSVASSLLDKFKSNKTKCFELSEIAGHVVEFSADQYGSR
FIQQKLETATTEEKNMIFDEIIPQALTLMTDVFGNYVIQKFFEHGMVSQRREVASKLLGN
VLTLSLQMYGCRVIQKAIEEVDLDQKIKMVEELDGHVTRCVRDQNGNHVIQKCIECVPEE
HIQFIVSTVFDQVVTLSTHPYGCRVIQRILEHCRDPKTQSKVMDEVLGSVSMLAQDQYGN
YVVQHVLEHGQPHERSTIIKELAGKIVQMSQQKFASNVVEKCLTFGGPSERQLLVSEMLG
LTDENEPLQAMMKDQFANYVVQKVLETCDDQQRELILSRIKVHLNALKKYTYGKHIVARV
EKLVAAGERRIAAQSLNPA
NT seq
3120 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgtctgaattggagaggaggccgatgcttggcgttaacgaagggtctttcggagac
gaattggagagagatattggtttgttgttccgtgagcaggagcggaatcaagacgccgat
gattgcaaaaatgagctgaatttgtacaggagtgggtctgccccacccactgtggagggt
tcactgagtgcagttggtgggttgtttaatcatggtagtgtttcagggtttgctagcaat
aagagtggtaatgggtttatgtctgaggaggagcttaggtctgatcctgcttatttatct
tactattattctaatgtgaatttaaaccctaggctgccaccgcctttgctgtctaaagag
gactggcgttctgcgcagagattgcaaggggggagttcggggctgggtggaatcggagat
gggaggaaagtgaataagaatgatagtggttctgggggaagatcaatgttttcaatgccg
cccgggtttagttcaaagaaaggagagagtgagagtgagtcggagaaagtccgtggctct
gcagagtggggtgttgatggactgattggcttgcctggtttaggacttggtgggaaacag
aagagccttgctgaaatatttcaggatgatttggagtatgcacctcctgctgctgggcat
ccttcccggcctgctagtcgtaatgcttttgaaaatggcgagactgtagattctgttgaa
gccgagctggctcatttgcgtagcgagttggcagcagctgatactgtgcgagccagtgtg
aatgtgaagagctcaactgcggtccaaaatagtggcccacctgcatcatattcttatgcc
gccgttttgggtgcttccttgtctagaaacacctcccccgatccccaagtcattgctagg
gttcctagtccttgccttgctcctgttggtggagagagaatagccacatatgagaagaga
agtgttaatagtccgaattcatttaacagtatcttgactaccatgatggagtctgcaaat
ttggtcactgctttgtctggcatgaacctctcaaatggtttgatagtcgaagaggagaat
ttgccactccacattgaacaggatgttgatgatcacaagaattacctctttaatttgcaa
agtagtcagaataatgctaagcagcatccatacatgaagaaatctgaatctgagcgtttt
gactcaagtaggaacaatggtgctggatcggaccttagtaattcttccttggtatcagat
aagcaagttgacctccgtagaagcaccacttttaccaataaatctaacataaaaggattt
cctgcttctactcttaacagcaaaggaagtttaccttctcactatcagcatatggacagc
tccaactcatcactattgaactatggccttggtgggtactccataaatacggcgatgcca
tcaatgatggcaggccatataggcgcttctaatttgccaccattatatgaaaatgttgct
gcggcgtcagctatggctatccttggaggtttgccttctggattaagcctaagccctgga
gcatcagaatcacagaatctgaacaggtttggggcccacatggaagganatgctcttcag
cctcctcttgtgaacccaatgtatcttgagtacttgaggatgactgagtatgctgcagca
caagctgcagctcttaatgatccctcctctatggataggaattacttgggggggaactca
caaatggatttactacagaacgcttatcttgggactttactatcacctcaaaaatcacag
tatggtattcccatgggcacaaaatccggtggttctaatcaccatggttactatggaact
cctgcatatggtattggtttatcatatcctggaagtcccttggctagtcccattgttcca
aattctcctggtggacctggtagtcctatgaggcacggtgaattcagtatgcgattccct
tctagagtgagaaacatagcagggggtgtaatgggaccctggcatgctggttttagtgat
gaagacagcgtcgcgtcctctttgttggacaaatttaagagcaataaaaccaagtgtttt
gaactttcagaaattgcaggtcatgttgttgaattcagtgctgatcagtatgggagccga
ttcatccaacaaaagcttgaaaccgccacaacagaagagaaaaacatgatatttgacgaa
atcattccacaagctcttactttgatgactgatgtgtttggtaattatgtgattcaaaag
ttttttgagcatggaatggtatcccagagaagagaagtggctagcaagcttttggggaat
gtgctgacacttagccttcaaatgtatggttgtcgagtgatccagaaggcaatagaagaa
gttgatctggaccaaaagataaaaatggtggaagagctcgacggtcatgtcacgcgatgt
gtgcgtgatcagaatgggaaccatgtcattcagaagtgtattgaatgtgttcctgaagaa
catattcagttcatcgtttcgacagtctttgatcaagttgtgaccctttccacccatcca
tatggatgtcgtgtgatacagagaatattggagcactgcagggatccaaagacacagagt
aaagtgatggatgaagttttgggatctgttagcatgttggcacaagatcagtatggcaat
tatgttgttcagcatgtactggagcatgggcagccacatgagcgttcgacgataatcaag
gaattagctgggaagatagttcaaatgagccagcagaagtttgcctccaatgttgtggag
aagtgtttaacttttggtggcccttccgaacgccagctcttggtgagtgagatgcttggc
ttgactgatgagaatgagcctcttcaggcaatgatgaaggatcaatttgcaaattatgtt
gtacaaaaagtactggaaacttgtgatgatcagcaacgtgaactgatcctgtcacgaatt
aaggttcatctcaacgcactgaaaaagtacacttatggaaagcatattgtcgctcgtgta
gagaagcttgttgcagctggagaaaggagaatcgctgctcaatctctaaaccccgcgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
