KEGG   Aliarcobacter faecis: AFAEC_1008
Entry
AFAEC_1008        CDS       T06664                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K19231  fibronectin-binding autotransporter adhesin
Organism
afc  Aliarcobacter faecis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:afc00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:afc02000]
    AFAEC_1008
Transporters [BR:afc02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   AFAEC_1008
SSDB
Motif
Pfam: PATR DeoRC
Other DBs
NCBI-ProteinID: QKF73176
LinkDB
Position
989148..996482
AA seq 2444 aa
MNSFRIKDLRFRILKGGKIGLAASLMMFGVMFQSTLSANTVTYDGNGNTGIFVGNIYGNY
SSLTNATANSQTNLTVGNSTDTTVFTNYYTEGGAGSGGGAGLGGVFFVDKGSTLTLNNTV
FKFNTSKGGEGGSLPAQVIEDTTININQLSLGLTGFEQLSITPTLTYSNGKYSFDTIKIA
TGTTLLNEGSSITFSELDNTSRKISSVDKSSVTLADKISINASDIKTITTNVTTNTGFSV
DGKSVTLNYNYTDSSNPTITYVDTALVNQVKDNITYGGQISFRDTNGNISTKTISKVDYN
TDGSIKSFELDSDIGSFTVNATTSLDVIPVSKFQTKPYEIAGNTIIVTGATRGFKAGMIL
YDEKGDSTGAKITAVSEQNGVYTLTVDNTTSKLTSATSITGKSSPFISDTQIKLSAPNPD
LVGASSININGTDYGISNYNKETGVITLSNAIDSASKSKVEDDGELLTLKVNTVSLSGNS
ITLLDKGQNFSTGMLIEGTDLTIEEVSSSNGKITLKLSGSTDSLSSDSKIFVVDTLETGG
SMNNLASKGTLGANGKNGIDANYYSSFFNEGEGKEGTRGYAAKDGDGAAGGKGGNGGNGS
DGLAVNPQLMTELWGATGDFQEAVNDLAVAFVPEGAPIPMPEIADIPGAIINVTTASIDL
ATAIANTVFWAKNLNAGLAGMGGEGGAGGKGGAGDEFFGGGAGGTGGNGGEGALDHTDGG
NGGEGGAGGDAGFGAGGGAGGAGGIAGSTGGAEDGEAGDGGKAGFGGGSGSDGDGLYGNG
GSGFGGAVFVRKGATLNITGNTLFEENSVMAGSSNNGGSAGESAGTALFIMKGSMVNLMP
GKGNTIIFNDTIADDSASSYGGASYASGAGADIYIKGNGGLVEFNGENTYSGKTYLQGAT
LSATLGIGINDNSKIVFNGAGTSSVTSPTVYADNLNLGTVGTLLLSEDLTSKRVGKRAID
VSWEGSGGIASGVEDGIVVNFGQITPSNGQSLVWGSNGFFESGASDKVLTFGSEHSLGSV
DFQNGVNIGSNIARVAVYNTNLEDNLGSSSAILSGNWIGNELLVGADNYDGNLILTGTNK
LNKLTILDGTTATSGSGKISDSSSKTVVKMYAGKLILSNSETLDSISINQGALFVSNKDL
SVDNTITNDGQLVVNTGTFEKDITNNGQFANGGNIIVNADIINDSIIDSTTTLWNQIGTI
SAYNIKNNGTWQQQDNITLTSRLTNDGIWYSGQQQIMNRVASFVNYEDSVKNTISLVTLT
GNGTFNIDNGDLEIEQSGDSKFEGDITGKGVFTKSGDGKLEISNAQTFTGGLNVTGGTFE
TLAAAVTLPGGTLADDLAIYISEASEFIAGIADTVGSVDNEGLFTMNKNITTEEDFTNNG
TLTLDADLTTGTNFVNNGITNLTDDRTITTTGGLSGTGTINVNGADTTLTLDQSGDETYS
GKILGAGNFVKTGKGNLTLNGTAGNIDLDEGVVVDEGTLTTTLANVLATDQDITVNTDGT
LHIKTGSQSVDTITNSGIVNLDDNLIVRILTNNVYAEFNQDADIRVINAIMNGNWNVVDG
TRVLNTETLTGDATVALGSNNLKINQSGISTFDGSIAGSGSVEKTGLGTLKISDAQTFTG
GLNVTGGTFETLAAAGTLPGGTLADILAIHVAKDSTFIAGVEDTVGSVLVDSIGTGSNAG
LFTMNENITTQGDFINNGTLALNANLTIGTDFVNNGTTTLTADRTITTESGLSGATIGTI
NVNNTGTTLTLNQSGDTTYSGKILGAGNFVKTGTGTLTLYGALVNIAGVLTIENGKIGLD
GHNIFDADLDVIVSKDGELELITGNQSIDSLGGKGLIDLGSNILYVNNGGEFTGTVTGSG
TLYIGSGRFNIVDNITSTTGTFDVAQGATTTIADNAELNFPKINVKEGGTLDIIGKASAS
DGLFVDKNGTLHLGDAANNIDGVVNTSNVSIYGKLNGTGTINGPTTVYSGGTIAPGNSPG
TLTLGSLDLQSGSITDMEIVTSGIAGVHFDQITTTGNFTIKEGSNLNISKYTADINAREL
NMGESIKIFNFTPGAISGNFGNVTSTYADDVILNLASGEVVGLGGVSSTDFENNVAKTKN
QKSMLNSLKVENNGGVSQFYGGNLVSRLAGAYGNNSEINRIFRLSSPEAYASLIDQARLS
VTDSIVKLPVNFKEAKEGLTVNTNFGSKSTSNSSDWSKYDMDNTSVKLEYLHLTKDTALA
VSVGKNDRKIKSDYLTADGSGYDVSIGLAKEVLAPGLSLRGHIGYMKDENDTKRETYTTD
SSASVNSDGIIGGLGLGYTKDHNSLTFDFSLDASYYNVNVDSFKESNTNKLDALSVDKQK
QNGMAYQAKASISSNVTEKLELKTGINALYMPDADNFNVKAKVSSEETMFNVENPGMGQT
SLGLDAGAKYKIKDNMSISVDAGVNEIGKSNVGYNTNLSFTYKF
NT seq 7335 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaattcatttagaattaaagatttaagatttagaattttgaagggtgggaaaatagga
cttgcagcatccttaatgatgtttggagtaatgtttcaatcaactttgagtgcaaataca
gtgacttatgatggtaatggaaatactggtatttttgttgggaatatttatggtaattac
tcttctttaactaatgcaacagctaattcacaaacaaatttaacagtaggtaactcaact
gatacaacagtatttacaaattactatacagaaggaggagctggttcaggtggaggagct
ggactaggaggagtattctttgtagataagggttcaacattgactttaaataatactgta
tttaaatttaatacttcaaaaggtggagagggaggatctttacctgcccaagttatagaa
gatacaactataaatataaatcaacttagtttgggattaactggatttgaacaattatca
attactccaactttaacttatagcaatggtaagtactcttttgatactataaaaatagct
acaggaacaacattactaaatgaaggttcaagtattacattttctgaattagataatact
agtagaaagatatcttcagttgataaatcatctgtaactttagctgataaaataagcata
aatgcttcagatattaaaacaataactactaatgtaactacaaatacaggtttctcagta
gatgggaagagtgtaactttgaattataattatacagattcttcaaatccaactattaca
tatgttgatacagctttagtaaatcaagttaaagataatatcacttatggtggacaaatt
tcatttagagatactaatggaaatatctctacaaaaacaatatcaaaagttgattataat
actgatggaagtataaaatcatttgaattagatagtgatattggtagttttacagttaat
gctactacatcactagatgttattccagtttcaaaatttcaaacaaaaccttatgaaata
gctggtaatacaattatagttactggagctacgagaggttttaaagctggaatgattctt
tatgatgaaaaaggagattcaacaggtgcaaaaattacagctgtttcagagcaaaatgga
gtttatactctaactgtagataatacaacttctaaattgacaagtgctacatcaattaca
gggaaaagttctccttttatatcagatacacaaattaaactatcagctccgaatcctgat
ttagttggagcaagttctataaatataaatggaacagattatggtatttctaattataat
aaggaaacaggtgttattaccttgtctaatgctattgattctgcatcaaaaagtaaagtt
gaagatgatggtgagttattaacattaaaagttaatacggtttctctttcaggtaactct
ataactttattagataaaggtcaaaatttttcaactggtatgctaattgaaggtacggat
ttaactattgaagaggtttcatcatcaaatggaaaaattactctaaaactttctggctct
acagattcattatcaagtgactcaaaaatttttgttgttgatacattagaaacaggtggt
tctatgaataatttggcttcaaaaggaacattaggagctaatgggaaaaatggaatagat
gcaaattattattcttcattttttaatgaaggggaaggaaaagagggaacaagaggatat
gctgctaaagatggtgatggagcagctggaggaaaaggagggaatggaggaaacggctct
gatggattagctgtaaatccacaacttatgactgaactttggggagcaacgggagacttt
caggaagctgttaatgatttagcagtggcttttgttcctgaaggagcacctattcctatg
ccagaaattgcagatatccctggtgctataattaatgttactacagcaagtattgattta
gcaacagcaatagcaaatacagtattttgggcaaaaaatctgaatgctggtcttgcagga
atgggaggagaaggaggagctggtggaaaaggaggagctggtgatgaattctttggtgga
ggagctggtggaactggtggaaatggtggagaaggtgctttagaccatactgatggagga
aatggtggagaaggaggagctggtggtgatgctggatttggagctggaggaggagctgga
ggagctggtggaatagctggttcaacaggtggagctgaagatggtgaagccggagatggt
ggaaaggctggatttggtggaggatctggtagtgatggagatggactatatggaaatggt
ggttctggatttggtggagctgtttttgttagaaaaggtgctacattaaatattactggt
aatactttatttgaagaaaatagtgttatggcagggtcaagtaataatggtggttcagca
ggagaaagtgctggaacagcactttttattatgaaaggatctatggttaatttaatgcca
ggaaaagggaatactattattttcaatgacacgatagctgatgatagtgcatcaagttat
ggtggtgcatcttatgcttctggagctggagctgatatatatattaaaggtaatggtgga
ttagtagaatttaatggggaaaatacatattcagggaaaacatatttacagggtgctaca
ttaagtgctacattaggtatagggataaatgataattctaaaattgtttttaatggagca
ggtacatcatctgtaacaagtccaactgtatatgcagataatttaaatttaggaacagtt
ggaactttattactttctgaagatttaacaagtaaaagagtaggaaaaagagctatagat
gtttcatgggaaggttcaggaggtattgcttctggagttgaagatggtatagtagttaat
tttggtcaaataactccatctaatggacaatcattggtatggggaagtaatggtttcttt
gaatcaggagcttctgataaagttttaacttttggatctgaacactctttaggttctgtt
gattttcaaaatggtgtaaatattggttcaaatattgcaagagttgctgtttataataca
aacttagaagataatcttggttcaagtagtgctattttatctggtaattggattggaaat
gagctacttgtaggagctgataattatgatggtaatttgatattaacaggaactaataaa
ttaaataagttaactattttagatggaactacagctacatcaggaagtggaaaaattagt
gatagtagttcaaaaactgttgttaaaatgtatgctggaaaattaattttatcaaattct
gaaactttagatagtatctcaattaatcaaggtgctttatttgttagtaataaagattta
agtgtagataatacaataacaaatgatgggcaacttgtagtaaatacaggaacttttgaa
aaagatattacaaataatggacaatttgcaaatggtggaaatattatagtaaatgcagat
attataaatgatagtattatcgattcaactactacattatggaatcaaataggaacaatt
tctgcttacaatataaaaaataatggtacttggcaacaacaagataatataactttaact
tctagattaacaaatgatggaatttggtattctggtcaacaacaaattatgaatagagta
gctagttttgtaaattatgaagattctgtgaaaaatacaatctctttggtaacactaact
ggaaatggaacatttaatattgataatggtgatttagaaatcgaacaaagtggagactca
aaatttgaaggggatattactggtaaaggtgtatttacaaaatcaggagatggtaaatta
gaaatatcaaatgcacaaacattcacaggtggattaaatgtaacaggtggaacatttgag
acattagccgctgctgtaacattacctggtggaacattagcagatgatttagcaatatat
atatctgaagcttcagaatttatagcaggaatagcagatacagttggttctgtggataat
gaaggtctgtttactatgaataaaaatataacaactgaagaagattttacaaataatgga
acattgactttagatgcagatttaacaactggtactaattttgtaaataatggaataaca
aatctaacagatgatagaacaataacaacaactggtggattatctggaacaggtactatt
aatgtaaatggtgcagacacaactttaacattagatcaatcaggagatgaaacatatagt
ggtaaaattttaggagcagggaattttgttaaaacaggaaaaggtaatttaacattaaac
ggaacagctggaaatattgatttagatgaaggagtagttgtagatgagggaacattaaca
acaactttagcaaatgtacttgctacagatcaagatattacagtaaatacagatggaaca
ttacatattaaaacaggttctcaaagtgtagatactattacaaatagtggaattgtaaac
ttagatgataatcttatagttagaatattaacaaataatgtatatgcagagtttaatcaa
gatgcagatataagagtaataaatgcaattatgaatggaaattggaatgttgtagatggt
acaagagtattaaatacagaaactttaacaggtgatgcaactgtagcattaggttcaaat
aacctaaaaatcaatcaaagtggaatatcaacatttgatggaagtattgcaggttcaggt
tcagtagagaaaacaggattaggtacattaaaaatatcagatgctcaaacattcacaggt
ggattaaatgtaacaggtggaacatttgagacattagccgctgctggaacattacctggt
ggaacattagcagatatattagcaatacatgtagctaaagattcaacatttatagcagga
gtagaagatacagtaggttcagtgttggttgattctataggaacaggaagtaatgcaggt
ctgtttacaatgaatgaaaatataacaacacaaggtgattttataaataatggaacattg
gctttaaatgcaaatttaacgatagggactgattttgtaaataatggaacaacaacttta
acagcagatagaacaataacaacagaaagtggattatctggtgcaacaataggtactatt
aatgtaaataatacaggtacgactttaacgttgaatcaatcaggagatacaacatatagt
ggtaagattttaggagcagggaattttgttaaaacaggcacaggtactttaactttatat
ggagcattagttaatattgctggtgtattaactattgaaaatggtaaaataggactagat
ggtcataatatatttgatgctgatttagatgtaattgtatctaaagatggtgaattggaa
cttattactggaaatcaatcgattgatagtttaggtggaaaaggtttaattgatttaggt
tcaaatattctttatgtaaataatggtggagaatttacaggaactgtaacaggaagtgga
acattatatattggaagtggtagatttaatattgttgacaatattacttcaacaacagga
acttttgatgttgcacaaggagctacaacaactattgctgataatgctgagcttaatttc
cctaaaattaatgtaaaagaaggtggaactctagatattattggtaaagcttctgcttct
gatggtttatttgttgataaaaatggaacacttcatttaggagatgcagctaataatatt
gatggtgtagttaatacttcaaatgtttcaatttatggaaagttaaatggaacaggaact
ataaatggtccaactactgtttatagtggaggaacaattgctcctgggaattctcctggt
actttaacacttggttcattagatttacaatctggttcaattactgatatggaaatagtt
acatcaggaatcgcaggtgttcattttgaccaaattactacaacaggaaattttacaatt
aaagaaggaagtaatcttaatatatcaaaatatacagcagatattaatgcaagagaactt
aatatgggagaaagtatcaaaatatttaatttcacaccaggagctatcagtggtaatttt
ggaaatgtaacttctacttatgctgatgatgttattttaaatcttgcaagtggtgaagtt
gtaggtttaggtggtgtttcatctactgattttgaaaataatgttgctaaaacaaaaaat
caaaaatcaatgcttaatagtttaaaagttgaaaataatgggggagtatctcaattttat
ggaggtaatttagtatcaagattagcaggtgcatatggaaataattctgaaattaataga
atttttagattatcatcaccagaagcttatgctagtttaattgatcaagctagattatca
gtaactgatagtatcgtaaaacttccagttaattttaaagaagcaaaagaaggattaact
gtaaatacaaattttggttctaaatcaacaagtaatagtagtgattggtctaaatatgat
atggataatacttcagttaaattggaatatctacatttaacaaaagatactgctttagct
gtttctgtaggtaaaaatgatagaaaaattaaaagtgattatctaacagcagatggaagt
ggatatgatgttagtataggtttagctaaagaagttttagcaccaggattgagcttaaga
ggtcatattggatatatgaaagatgaaaatgatactaaaagagaaacttatacaacagat
tcaagtgcaagtgtaaactctgatggaataattggtggattaggattaggctatacaaaa
gatcacaattcattaacttttgatttttcacttgatgcttcatattataatgtaaatgta
gattcatttaaagagagtaatactaataaacttgatgctttatctgttgataaacaaaaa
caaaatggaatggcatatcaagcaaaagcatcaatttcttcaaatgttactgagaaatta
gaattaaaaacaggtataaacgcactatatatgccagatgcggataattttaatgtaaaa
gcaaaagtatcatcagaagaaacaatgtttaatgttgaaaatccaggaatgggacaaact
tctttaggattagatgcaggagcaaaatataaaattaaagacaatatgagtatatcagtt
gatgcaggtgttaatgaaataggtaaatctaatgtaggatataatacaaacttatcattt
acatacaaattttaa

DBGET integrated database retrieval system