Aliarcobacter faecis: AFAEC_1251
Help
Entry
AFAEC_1251 CDS
T06664
Symbol
polA
Name
(GenBank) DNA polymerase I, 5' --3' polymerase, 5' --3' and 3' --5' exonuclease
Organism
afc
Aliarcobacter faecis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol_A
5_3_exonuc_N
5_3_exonuc
DNA_pol_A_exo1
RNase_H_2
HHH_2
DASH_Dad1
HHH_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QKF73416
LinkDB
All DBs
Position
complement(1224091..1226775)
Genome browser
AA seq
894 aa
AA seq
DB search
MKKTITIIDTFGFLFRSYYALPPLRSNDGFPTGLLTGFMNFIAGIGKDFKTDYIVFALDA
KGDTFRNELYSNYKAQRPDVPEDLLIQLPIAVSWVEEMGFKIAIKTGYEADDMVASIAKD
AVSKGLEVRIVSHDKDLYQLISDENGVYLFDPTKKQIIDESKCIEKYGVLPSEFIDYQAL
VGDTADNIPGVKGVGAKTAEGLIKEFKNIENIYDNLEKISKPRIQNLLLEAKENAFLSKK
LVTLKDDCHYIDNLEEFLLPIENPILRIATSLEKYDMNKVLDRVNKNGLNYKTKIPEKQE
EKNLEYILLNDESSLSLVINKIPRDAIVAFDTETSGLDTLKAKIVGFSFCYEENRAYYVP
IAHNYLGVEKQISFEVAKKTIEILNRYKLVLQNFKYDWQIIKNNFDIELKLYADTMILSW
ILDTDSKVGIDYQIKKYFNIDMISFGEVVKKGEDFSSVELEKATQYAAEDALMTLKLFNK
QLELFKEKREEDLLNIAFELEFNFIYVLASIEQRGIKVDVELLKKYKEISSNFLNSLTIQ
IYELCGESFNINSPKQLGVILFEKLGLQASKKTKTGYSTDESVLESLKDEHIVIQLLLKY
REAFKLHSTYIEPLLELGLKDKDNRIFTSFLQTGTTTGRLSSKSPNLQNIPTFGANGVEI
RKAFIPKTGYKLVGVDYSQIELRLLAHFSQDEALVEAFKNDLDIHLQTAIKIFGEDEAKS
KRSIAKSINFGLLYGMGAKKLAETLGISQKEAKFYIDSYFNAFKSVKSYLKSIEDKVVES
GFVTTLLNRKRFFDFQGVSPLLKAAYLREAVNTQFQGSAADLIKLAMIKIEHKYKDDENV
KMLLQIHDELIFEIKEEFVEEITKNIKNIMESIFVLNVPLKVSLAVGNSWQDLK
NT seq
2685 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaactattactattattgatacatttggatttttatttagaagctactatgcc
ttaccaccacttcgttcaaacgatggctttccaacagggcttttaacaggatttatgaat
tttattgcaggaattggaaaagattttaaaacagattatatagtttttgctcttgatgca
aaaggtgatacctttagaaatgagctctatagcaactataaagctcaaagaccagatgtt
ccagaagatttattaattcaacttcctattgctgtttcttgggttgaagagatgggattt
aaaatagctattaaaactggatatgaagctgatgatatggttgctagtatagcaaaagat
gcagtttcaaaaggattggaagtaagaattgtatctcatgataaagatttgtatcaatta
ataagtgatgaaaatggtgtatatttatttgacccaacaaaaaaacagataatagatgaa
tcaaaatgtatagaaaaatatggagtacttccaagtgaatttattgactatcaagctttg
gttggagatacagctgataatataccaggagttaaaggagttggtgcaaaaacagctgag
ggtttaataaaagagtttaaaaatattgaaaatatctatgataatttagaaaaaataagt
aaacctagaattcagaacttactacttgaagctaaagagaatgcttttttatcaaaaaaa
ttggtaactttaaaagatgattgtcactatatagataaccttgaagagtttttacttcct
attgaaaatccaattttaagaattgcaactagcttagaaaaatatgatatgaataaagtt
cttgatagagtaaataagaatggcttaaattataaaactaaaattccagaaaaacaagaa
gagaaaaatttagagtatattttattaaatgatgaatcaagtttaagtttagttataaat
aaaattccaagagatgctattgttgcttttgatacagagacttctggtttagatacttta
aaggctaaaattgtaggtttctctttctgttatgaagagaatagagcatactatgtacca
atagcacataactatttaggagttgaaaaacagatctcttttgaagttgcaaaaaaaaca
atagagattttaaatagatataaattggttttacaaaattttaaatatgattggcagatt
ataaaaaataattttgatatagagttaaaactttatgctgatactatgattttatcttgg
attttagatacagatagtaaagtaggaattgattatcaaataaaaaaatattttaatata
gatatgatatcttttggtgaagttgtgaaaaaaggtgaagatttttctagtgttgaatta
gaaaaagctacacaatatgctgctgaagatgctttaatgactctcaaattatttaataaa
cagctcgaactttttaaagaaaaaagagaagaagatcttttaaatattgcatttgagtta
gagtttaattttatttatgtcttagcttctatcgaacaaagaggtataaaagttgatgtt
gaattactgaaaaaatataaagagataagttcaaactttttaaactctttaactattcaa
atttatgaactttgtggagagagttttaatataaattctccaaaacagttgggagttatt
ttatttgagaaattaggattacaagcttctaaaaagacaaaaactggttatagtacagat
gaatctgttttggaaagtttaaaagatgagcatattgtaattcagcttcttttaaaatat
agagaagcttttaaacttcattctacatatattgaaccacttttagaattaggtttaaaa
gataaagataatagaatttttacatcatttttacaaacaggaacaacaacgggaagactt
agttcaaaatctccaaatcttcaaaatattccaacatttggagcaaatggagttgaaatc
agaaaagcttttattccaaaaactggctataaacttgtaggtgtggattattctcaaatt
gagttaagacttttagctcacttttctcaagatgaggctttagttgaggcttttaaaaat
gatttagatatacatcttcaaacagcaattaaaatttttggagaagatgaagcaaaaagt
aaaagatctattgctaaatctataaattttggacttttatatggaatgggtgcaaaaaaa
ttagctgaaactttagggattagccaaaaagaggcaaaattttatatagattcttatttt
aatgcttttaaaagtgtaaaaagctatttaaaatctattgaagataaagtagttgaatct
ggttttgtgacaactttattaaatagaaaaaggttttttgattttcaaggagtaagtcct
cttttaaaagctgcatatttaagagaagctgtgaatacacagttccaaggaagtgctgct
gatttaataaaacttgcaatgataaaaattgaacataaatataaagatgatgaaaatgta
aaaatgcttttacaaattcatgatgaacttatttttgaaataaaagaggagtttgttgaa
gaaataacaaaaaatataaaaaatataatggagagtatttttgtattgaatgtgccttta
aaggtatctttagcagttggaaactcttggcaagatttaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system