Aliarcobacter faecis: AFAEC_1424
Help
Entry
AFAEC_1424 CDS
T06664
Name
(GenBank) autotransporter domain-containing protein
Organism
afc
Aliarcobacter faecis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QKF73584
LinkDB
All DBs
Position
complement(1402746..1410254)
Genome browser
AA seq
2502 aa
AA seq
DB search
MSRFRVENARFRILKGGKIGLSLSIALLGMVVFSPINLYSQTFFDTAPISSTLTAPNSSN
PSKDISVEKLEDQNLSSTATYTENVNPEDIIFKPNKVESSFIGVRNKEFSGTSSVTISTD
GTVIGNSFDVLDGTITDSDGHIIKNNDSYYYENYSPSKNFTVILATDAVVNDIKKESSIY
HKVSSPNSYTTSSENYTANIIMSGNNTIAGITNLGSDGNINIQGDVEFQDSVTAGSIDMD
TTQTATFKKDVNLSDKLTFKQDGIVNLKDNFTGNITTDSGNKGTININGSQNQTITGDIS
NLKNLNVTNANNTTVSGNISATNTDILNNSTLNISNGKTITSIITSSDKSGNLTLLGSGT
VNGTVGDSTNSLNSVNAGTNGSSSTFNNNIFATNTNITGTGTVNLNGNLSGTNLNFQANG
VVNSKGNITADVTGTTGTLTMNGVTQTVTGNIGNITNLNISNGSNTTINGNINAINTNIN
NNSTLVLSDNSNINSTITTNANNTGTITFSGDSFINGIIGTNSNKLANINAGETGSIVDF
NNDIFVTNTNVTGTGTVNLNGNLSGTNLDFQTNGTVNSKGNITANIIGATGTLKMNGATD
QTITGNIGNIANFNIDNAGNKVTVTQNINATNTNISSSSTLNSKGNITSNINGATANSGT
LTMSGTNQTITGNIGNTNSLNSFNINSGTTIVSGNVNATNTAISSGATLNSKGNITSNIN
GATANSGILTMSGTNQTITGNIGNTNSLNQFNINSGTTTVSGNVNATNTNISTSSTLNSK
GNIVGNVNGAATNSGTLTMSGTNQTITGNIGNTNSLNQFNINSGTTTVSGNVNATNTNIL
NNSTLNISNGKTITSTITSSDKTGNLRILGSGIVDGTVGDSTNSLNSINAGVNGSTVDFN
NNIFATNTNVTGTGTINLNGNLSGTNLNFQANGVVNSIADIRVNVVGNSGTLNMNGANNQ
NIIGNVGNIDNLNLNGGKTVVVNGDINSKNTNINSNSTLDLVDGKNINSTINGNSGTLNL
LGSSTINKEIQSLKNLNVNADSSNSTFKDLVNSTNISSSGTGSSTFEKDTTTTNLNVNNG
TMTFNENLNATNTTIGAGKLNLDANLTGTNINFTATNGELNLSDDSNVTATITANSNNKG
NIKIAGDSIISGNIGTSANKIKDINIDGANNKTVNLKDDVNAIKTTVKDSTVNFNQNSGN
TNTNLVFSGSGTANLYEGITGDINFAGNNAIVNVKDSKNIAGNIETSTTNNSGIVNFEGD
GEVTGTIGNIAFGIKELNVNTKNEQDKDSNGNILPNHGLFLHRDIYADRINLQNNATLIM
DDGANITNTNLPDLIVLTTDKNNTGNIIFKGTSTISGEIGEDSKKLESITAGANNSTVTF
NDKVYVKDLNYSGNGEVILGGKDASNEAIKGNIDFNNNVSTLTLNDGVNLDTANTTFKNA
SNATLKFDGDSTISGVLGGNSSGKSTFDTIEAGKTGKTVTFQKDLYANNLEISEDGIVNL
GGNFTGTNLNYKDDGVVTLADKKAINSNITTNDAKGTLNLLGDSSVNGTVGTKDDKLKEV
NSSTTNKTSTLNGDTFAYDLNVGAGTLNLNANFTGDNLNFKDNGVVNLADNKKVDSKIVN
ATANDNQGTLNIIKNAEFTQEIGQIGHSLKEINGANGNSITTFKADVFAQNLNLNETGTI
NLGGNFTGETIDFKDDAILNIANNKNITSSIVAQDEDIGEINLAGSTIISGDIADSLNKI
RAVKLNGKNSNSTFEGNAYVKDLDLNEKLALNLNGNLQGQNLNYNANATVNLADDKNIDS
KINTKNNGEGTLNLLGSSTINKEVGSDTNRLKEISAGQNGSNSTFKDNVYAEKTTIKDNG
VVNFEEDLYSTVYFAGDGVVNIDDEKAIISKTQPFVTTIADGVGSLNYKGATTLTNDIGS
KDKRLNSVNFASDTNKELTQELGYNVYAKNTIIGNGNNKVTLDFIDDITFAGNLTITKDA
TLNIKDKKVDVKDNIKLSENSILNFDVQTTDLSSGSAVVGGKSGQIRADSLTMEDDARFN
IAYDGTWEGAGQYNLVVTQNDITTPYRATEKDGRVKDNSIIDSTVEVVGKNLVLKADRTT
DGEHKVEDLYIVKSQIGEDYSNGASQSLAKLANEKPREGALAQIIRDMEYLEDGQTITPA
KKQEMIEMQRKLAPNPSGVVTQNIKTATDVNKASIKGRLNELRTSNIEDSIQAYENRGIS
SGDSYSVGDSTLWLKTTASKTKQDTIGLYEGFDTKSYGFVAGLDKNIADSSIIGLSASYI
DTNASQNLHDTDTTTVGLTLYGSKEFELGYIEAQTSYMQHSSDTSRTANSGNLTSKVKAD
ELNARVESGVHIPVDNGAYITPFAAVEYSNLKQKGYTEKGTPYQNDALKVDKFKQDRTTA
EVGIKATSRIELDNALILPQVSFSVAKDFGSSNRDIKAQFVGGGDKFVTPARELDDMMYK
VGAGVETRISNNTKLRLDLNYDRSKDGKFEGYSGNVTLGVSF
NT seq
7509 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtagatttagagtagaaaatgctagatttcgtatcttaaagggtggaaaaattgga
cttagccttagtattgctctacttggaatggttgttttttctcctataaatttatattca
caaactttttttgatacagctccaataagttcaactttaactgcaccaaatagttctaat
ccaagtaaagatatatcagtagaaaaattagaagatcaaaatttaagtagtacagcaaca
tatacagaaaatgtaaatcctgaagatataatttttaaaccaaataaagtagaatcatct
tttattggagttagaaataaagaatttagtggtacgagttcagtaactatttcaacagat
ggaacagttattggaaattcatttgatgtattagatggtacaataactgattcagatgga
catataataaagaataatgatagttattactatgaaaattactcaccaagtaaaaatttt
acagttattttagctacagatgcagtggtaaatgatattaaaaaagaatcgtcaatatat
cataaagtaagttcaccaaattcttatacaacttcaagtgaaaactatacagcaaatatt
attatgagtggaaacaatacaattgctggaataactaatcttggaagtgatggaaatata
aatattcaaggtgatgtagagtttcaagatagtgtaacagctggaagtatagatatggat
actacacaaacagctacttttaaaaaagatgttaatttaagtgataaattaacttttaaa
caagatgggatagtaaatttaaaagataattttacaggaaatattacaactgatagtgga
aataaaggtacaataaatataaatggctctcaaaaccaaacaataactggagatatctca
aatttaaaaaatttaaatgttacaaatgcaaataatacaacagtaagcggaaatataagt
gcaacaaatacagatattttaaataattctacattaaatatttcaaatggaaaaacaata
acttcaataataacaagtagtgataaaagtgggaatttaacacttttaggaagtggaaca
gtaaatggaacagttggagatagtacaaatagtttaaatagtgtaaatgcaggtacaaat
ggttcaagttcaacttttaataataatatttttgcaacaaatacaaatataacagggact
ggaacagtaaatttaaatggaaatttaagtggaacaaatcttaattttcaagcaaatgga
gttgtaaattcaaaaggtaatatcacagcagatgttactggaactactggaacattaact
atgaatggagtaactcaaacagttactggaaatattgggaatattacaaacttgaatata
tctaatggaagtaatacaacaataaatggaaatataaatgctataaatacaaatataaat
aataattcaactttagttttatcagataactcaaatataaactcaacaattacaacaaat
gctaataatacaggaactataacttttagtggagattcttttataaatggcataatagga
acaaattcaaataaattagcaaatataaatgcaggagaaactggttcaattgtagatttt
aataatgatatttttgtgacaaacacaaatgtaacaggaactggaacagtaaatttaaat
ggaaatttaagtggaacaaatcttgatttccaaacaaatggaactgtaaactcaaaagga
aatattacggcaaatataataggggctactggaacattaaagatgaatggagcaacagac
caaacaataacaggaaatattggaaatattgcgaactttaatatagataatgcaggaaat
aaagtaacagtaacacaaaatataaatgcaacaaatacaaatatttcgagtagttcaact
ttaaattcaaaaggaaatataacttcaaatattaatggagcaacagcaaatagcggaaca
ttaacaatgagtggaacaaatcaaacaataacaggaaatataggaaatacaaactcatta
aatagctttaatataaatagtggaacaacaatagtaagtggaaatgtaaatgcaacaaat
acagcaatttcaagtggagctactttaaactcaaaaggaaatataacttcaaatattaat
ggagcaacagcaaatagtggaatattaacaatgagtggaacaaatcaaacaataacagga
aatataggaaatacaaactcattaaatcaatttaatataaatagtggaacaacaacagta
agtggaaatgtaaatgcaacaaatacaaatatttcaactagttcaactttaaattcaaaa
ggaaatattgtagggaatgttaatggagcagcaacaaatagcggaacattaacaatgagt
ggaacaaatcaaacaataacaggaaatataggaaatacaaactcattaaatcaatttaat
ataaatagtggaacaacaacagtaagtggaaatgtaaatgcaacaaatacaaatatttta
aataattctacattaaatatttcaaatggaaaaacaataacttcaacaataacaagtagt
gataaaacagggaatttaagaattttaggaagtggaatagtagatggaacagttggagat
agcacaaatagtttaaatagtataaatgcaggagtgaatggttcaactgtagatttcaat
aataatatttttgcgacaaacacaaatgtaacagggactggaacaataaatttaaatggg
aatttaagtggaacaaatcttaattttcaagcaaatggagttgtaaattcaatagcagat
attagagtaaatgttgtgggaaatagtggaacattaaatatgaatggagctaataaccaa
aatattataggaaatgtaggaaatatagataatttaaatttaaatggtgggaaaacagta
gtagtaaatggagatataaattctaaaaatacaaatattaactctaattcaactttagat
ttagtagatggtaaaaatataaattcaacaataaatggaaatagtggaactttaaatctt
ctaggaagctcaactataaataaagagatacaaagtttaaaaaatttaaatgtaaatgca
gatagttcaaactctacatttaaagatttagtaaactctacaaatataagttcaagcgga
actggaagttcaacttttgagaaagatacaacaactacaaacttaaatgtaaataatgga
actatgacttttaatgaaaatttaaatgctacaaatacaacaataggagctggaaaatta
aatttagatgcaaatttaactggaacaaatatcaattttacagcaactaatggagagtta
aatttaagtgatgattcaaatgtaacagcaactattacggcaaattctaataacaaaggt
aatataaagattgcaggagattctataattagtggaaatatcggaacttctgcaaataaa
ataaaagatataaatatagatggggcaaataataaaactgtaaatttgaaagatgatgta
aatgctataaaaacgacagtaaaagattcaactgtaaattttaatcaaaatagtggaaat
acaaatacaaatttggttttttctggaagtggaacagcaaatttatatgaaggtattaca
ggagatattaattttgcaggaaataatgcgatagtaaatgtaaaagatagcaaaaatata
gctggaaatatagaaacttctacaacaaataatagtggaattgtaaattttgaaggagat
ggagaagttactggaactattggaaatatagcatttggaataaaagagttaaatgtaaat
acaaaaaatgagcaagataaagattcaaatggaaatatcttgcctaatcatggactattt
ttgcatagagatatttatgccgataggataaatttacaaaataatgcaactttgataatg
gatgatggtgcaaatattacaaatacaaatttacctgatttaatagttttaacaacagat
aaaaataatacaggaaatattatttttaaaggaacttcaactattagtggagaaatagga
gaagatagtaaaaaattagagagtattactgctggggcaaataattcaactgttacattt
aatgataaagtttatgtaaaagatttaaattatagtggaaatggagaagttattcttggt
ggaaaagatgcttctaatgaagctataaaaggaaatatagattttaataataatgtttca
actcttactttaaatgatggtgtaaatttagatacagcaaatacaacttttaaaaatgct
tctaatgcaacactaaaatttgatggagattcaactatctctggagttttaggtggaaat
agttctggaaaatctacttttgatactattgaagctggaaaaacaggaaaaactgtaact
ttccaaaaagatttatatgcaaataatttagagataagtgaagatgggatagttaattta
ggaggaaattttacaggaacaaatcttaattacaaagatgatggagttgtaactttagcc
gataaaaaagctataaattcaaatataacaacaaatgatgctaaaggaactttaaatctt
ctaggggattctagtgtaaatggaacagtagggacaaaagatgataaattaaaagaggta
aatagttcaactacaaataaaacttcaactttgaatggtgatacttttgcatatgattta
aatgtaggagctggaactttaaatctaaatgcaaattttacaggagataatttaaatttt
aaagataatggagttgtaaatttagcagataataaaaaagttgattcaaaaatagtaaat
gcaacagcaaatgataatcaaggaactctaaatataataaaaaatgcagagtttactcaa
gaaatagggcaaataggacatagcttaaaagagataaatggtgctaatggaaactctata
actacatttaaagcggatgtttttgctcaaaatctaaatttaaatgagactggaactata
aatttaggtggaaattttacaggtgaaacaatagattttaaagatgatgctattttaaat
atagcaaataataaaaatataacttcaagtatagttgctcaagatgaagatattggagag
ataaatctagcaggaagtacaataataagtggagatatagctgatagcttaaataaaata
agagctgtaaagttaaatggtaaaaactctaactctacatttgaaggtaatgcttatgta
aaagatttagaccttaatgaaaaactagctttaaatttaaatggaaatttgcaaggtcaa
aatttaaattataatgcaaatgcaacagttaatttagcagatgataaaaatattgattca
aaaataaatacaaaaaataatggtgaaggaactttaaatcttcttggaagttcaactata
aataaagaagttggtagtgatacaaatagattaaaagagataagtgctgggcaaaatggt
tcaaattcaacatttaaagataatgtctatgccgaaaaaacaactataaaagataatgga
gttgtaaattttgaagaggatttatactcaactgtttattttgcaggtgatggagttgta
aatattgatgatgagaaagcaattatttctaaaactcaaccttttgtaacaacaattgct
gatggagttggaagcttaaactataaaggtgctacaactttaacaaatgatattggttca
aaagataaaagattaaatagtgtaaattttgcaagtgatactaataaagagctaactcaa
gaactaggatataatgtctatgctaaaaatacaattataggaaatggaaataacaaagtt
actttagattttatagatgatataacttttgcagggaatttaactatcacaaaagatgca
actttaaatattaaagataaaaaagtagatgtaaaagataatataaaattatcagagaac
tctattttaaactttgatgtgcaaactactgatttaagttctggaagtgcagttgttggt
ggaaaatctggacaaataagagctgatagtttaactatggaagatgatgctagatttaat
atagcttatgatggaacttgggaaggagcagggcaatataatttagtagttacacaaaat
gatataacaacaccatatagagcaactgaaaaagatggaagggtaaaagataatagtatt
attgactctactgttgaggttgtaggaaagaatttagtattaaaagcagatagaacaaca
gatggagaacataaagttgaagatttatatattgtaaaatcacaaattggagaagattat
tcaaatggagcttcacaatctttagctaaattggcaaatgaaaaaccaagagagggggct
ttagctcagattattagagatatggagtatttagaagatgggcaaacaataactcctgct
aaaaaacaagagatgatagaaatgcaaagaaaattagccccaaatccaagtggtgttgta
acacaaaatattaaaacagcaacagatgtgaataaagcttctataaaaggaagattaaat
gaacttagaacttcaaatattgaagactctattcaagcttatgaaaatagaggtatctct
tcaggagactcatatagtgtaggggattcaactttatggttaaaaacaacagcttcaaaa
acaaaacaagatactattggtctatatgaaggttttgatacaaaatcttatggttttgtt
gcagggcttgataaaaatatagcagatagctcaattataggacttagtgcatcttatata
gatacaaatgcttcacaaaatctacatgatacagatactacaacagttggtttaactctt
tatggttcaaaagagtttgaattaggatatatagaagctcaaacaagttatatgcaacac
tcaagtgatacaagtagaacagcaaactctggaaatttaacttcaaaagtaaaagcagac
gaattaaatgcaagagttgaatcaggggttcatattcctgttgataatggagcttatatt
acaccttttgcagcagttgagtatagtaatttaaaacaaaaagggtatactgaaaaaggg
actccttaccaaaacgatgctttaaaagttgataaatttaaacaagatagaacaacagca
gaagttgggataaaagcaacaagtagaatagaacttgataatgctttaattcttcctcaa
gttagcttctcagttgcaaaagattttggttcaagtaatagggatattaaagcacaattt
gttggtggtggagataaatttgtaactccagcaagagagttagatgatatgatgtacaaa
gttggagctggagtggaaactagaatttcaaacaatacaaaattaagattagatttgaat
tatgatagaagtaaagatggtaagtttgaaggttatagtggaaatgttacacttggtgtt
agtttttaa
DBGET
integrated database retrieval system