KEGG   Alysiella filiformis: H3L97_02335
Entry
H3L97_02335       CDS       T06725                                 
Symbol
cas3f
Name
(GenBank) type I-F CRISPR-associated helicase Cas3
  KO
K07012  CRISPR-associated endonuclease/helicase Cas3 [EC:3.1.-.- 5.6.2.4]
Organism
aff  Alysiella filiformis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:aff00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system [BR:aff02048]
    H3L97_02335 (cas3f)
Enzymes [BR:aff01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     H3L97_02335 (cas3f)
Prokaryotic defense system [BR:aff02048]
 CRISPR-Cas system
  Type I CRISPR-Cas system
   Type I signiture cas proteins
    H3L97_02335 (cas3f)
SSDB
Motif
Pfam: Cas3_I-F_Cas2 Cas3-like_C_2 DEAD Cas3_HD Cas3-like_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: QMT31746
LinkDB
Position
464178..467498
AA seq 1106 aa
MNVIFISQCQKKALSRTRKILDAYANRIGDNTWQTAITEEGLMMVKKLLRQTVSKNTAVS
CHRIVTRNRTQLVWIVGSKSQFNENGFVPVNRTQKDFSIYQDNHLWQNLPVIALASAIAG
LFHDFGKANDLFQQKLNPKIKTKNYEPYRHEWVSFQLFISFAKNKSNEQWLDLLANPKNI
DETAIIKNIDDKNNFKAFAQLSDFAKLVAWLIVSHHRLLHYPSHQDNNPSFDLLNKYNDI
YNLLDMNWNSSNYDKFDNNTKQLNWQFNNGLPFNSTKWQTKAQEIAKNALNHLSQLNDFH
WENDHLTTHLARLALMYADHHYSSQNANTYFQDLNYCVYANTDKNHQYKQTLDEHNIMVA
HHAHQFSQKLPLLISNLPYLHSNKTLENGLPTNPNETQNYEWQNQSYHLAKTLSIRANEC
GFFGINMASTGKGKTLANARIMYALADKQTGLRLSIALGLRTLSLQTGSALKSLLNIDDE
IATLIGSNAVLQLFNKNNETHNTKLLKQQQQLLEDLERTTLAYRGSESLDDDNELESFDI
DYDDVALDEKDPLYQLFKNKPKYQKLLHAPIVVSTIDYLMPATESLRGGKHIVPMLRLLS
SDLVLDEPDEFGIDDWFALTRLVHWAGMLGSKVLLSSATIAPAMAQTLFETYQNGRQIYQ
KNMSGHHQHKPIVCAWFDEFGVQSNEIGNNEEYKKQHGQFIKKRIGKLQQNQNISQRAKI
VPIIKENPNDTVFKAMADTIFKTILTAHQSHHQSNNDIYISFGVVRFANINPLVAVAQLL
ISKDLPQDYCVHYCIYHSQFTLAKRSLIENKLDRLLNRKDTNAIFEQPEINNAINQNPNA
KHHIFVVLATSVCEVGRDHDYDWAIAEPSSMRSLIQLSGRVQRHRKQAVNCENIFILNEN
IKALKGKSIAYHRPGFETKKYSLVHHQLDQLLKPEHYQNINAIVSIARVNPSPSPYQNLI
QLEHSVQWAYLAGENGENNCANIWFKQPVNWLGEIQRQQPFRQSSPEISMVYQDNSRGFL
SWFEYKYTDNNQLIESSKIIDIGDLNFGKNSHSWFEYDDGQIYDELVQLLNKPMAYIQKV
YGQIQVANNDKQLYYQPILGVFAKTE
NT seq 3321 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatgtcatctttatttcccaatgccagaaaaaagcgctttctcgcactcgtaaaata
ctggacgcttatgccaatcgtataggcgataacacttggcaaacggcaatcaccgaagag
ggcttaatgatggtcaaaaaattattacgccaaacagtgagtaaaaataccgccgtgagt
tgccatcgtattgttaccagaaatcgcacacaattggtttggatagttggcagtaaatca
caatttaatgaaaatggttttgtgcctgtaaatcgtacccaaaaagacttttctatctat
caagacaatcatttatggcaaaacttgcctgttattgcgttggcttcggcaatagcaggg
ctatttcacgattttggaaaggccaatgatttatttcaacaaaaattaaatccaaagatt
aaaaccaaaaattatgaaccctatcgccacgagtgggtctcttttcaattatttatcagc
tttgctaaaaataaaagcaatgaacaatggcttgatttattagccaatcccaaaaatatt
gatgaaaccgccatcatcaaaaacattgatgacaaaaataattttaaggcatttgctcaa
ttaagcgattttgctaaattggttgcttggttgattgtttctcatcatcgcttattgcat
tatccatctcatcaagacaataatccttcatttgatttacttaataaatataatgatatt
tataacttgctagatatgaattggaattcatcaaattatgataaatttgataacaatacc
aaacaattaaattggcaatttaataatggcttaccttttaatagtacaaaatggcaaacc
aaagcccaagaaattgccaaaaatgccttaaatcatttaagtcagctcaatgattttcat
tgggaaaatgaccatttgacgactcatttggctcgtttggcattgatgtatgctgaccat
cattattcatcacaaaatgccaacacttattttcaagacctcaattattgcgtctatgcc
aatactgataaaaatcatcaatataaacaaactcttgatgaacataatattatggtggct
catcacgcccatcaatttagccaaaaattacccttattgatatccaatttgccctatctt
cattccaataaaacattagaaaatggcttaccaaccaatccaaatgaaacacaaaattat
gaatggcaaaatcaatcttatcatcttgccaaaactttaagcattcgtgccaatgaatgc
ggtttttttggtatcaatatggcttccacaggtaaaggtaaaacccttgccaatgctcgg
attatgtatgctttggcagataagcaaacaggattgcgattaagtattgcgttgggactt
cgcactttaagtctgcaaacaggcagtgccttaaaatctttattaaacattgatgatgaa
atcgccactttaattggttcaaatgcggttttgcaattatttaataaaaataatgaaaca
cacaatacaaagttattaaaacaacaacagcaattattggaggatttagaacgcaccaca
ttagcttatcgtggcagtgaaagtttagatgacgataatgaattggaatcatttgacatt
gattacgatgatgttgcattagatgaaaaagacccactttatcaactgtttaaaaataaa
ccaaaataccaaaagctattgcacgctcccattgtggtcagcaccattgattatttaatg
cctgctactgaaagtttgcgtggtggcaagcatattgtaccaatgcttcgtttactaagc
agtgatttggtgcttgatgaacctgatgaatttggcattgatgattggtttgctttaact
cgtttggtgcattgggcaggaatgctgggttcaaaagtattgttatccagtgccaccatt
gctcctgctatggcacaaactttatttgaaacctatcaaaatggtcgtcaaatttatcaa
aaaaatatgtcgggacaccatcagcataaaccgattgtatgtgcttggtttgatgaattt
ggtgtgcaaagcaatgaaattggtaataatgaagaatacaaaaaacaacacggtcaattt
attaaaaaacgcattggtaagttacaacaaaatcaaaatatcagccagcgtgctaaaatt
gtgcctatcattaaggaaaacccaaatgataccgtttttaaagcaatggcagacaccatt
tttaaaaccatattaaccgcccatcaatcacaccatcaatcaaataatgacatttatatt
tcttttggtgtggtgcgatttgccaatatcaatcctttggtagcagttgctcaattatta
ataagtaaagatttgccccaagattattgtgttcattattgcatctatcacagtcaattt
actttggcaaagcgttctttgattgaaaataaactagatagactattaaaccgcaaagat
accaatgctatttttgagcagcctgaaatcaacaacgccatcaatcaaaatcccaacgcc
aaacaccatatttttgtagtgttggcgacttcggtgtgtgaagtgggacgagaccacgat
tatgattgggcgattgccgaacccagctctatgcgttctttaattcaattatcagggcga
gtgcaacgacacagaaaacaagctgttaattgtgaaaacatttttattttaaatgaaaac
attaaggcattaaaaggcaaaagcattgcttatcatcgtcctggttttgaaactaaaaaa
tattcattggttcatcatcaattagaccaattattaaaaccagaacactatcaaaacatc
aatgccattgtttctattgcacgagtgaatcctagtccaagtccctatcaaaacttgatt
caattggaacacagcgtacaatgggcgtatttggcaggcgaaaatggcgagaataattgt
gccaatatttggtttaaacagcctgtcaattggcttggcgaaatacaaagacaacagcct
tttcgtcaatcctctcctgaaatttcaatggtctatcaagataattctcgtggtttttta
tcgtggttcgaatacaaatatactgataacaaccagttaatagaaagtagcaagattatt
gatattggtgatttaaattttggtaaaaatagccacagttggtttgaatacgatgatggg
caaatttatgatgaattggtacaactgcttaataaaccaatggcttatatacaaaaagta
tatgggcaaattcaagttgcaaacaatgataaacaattgtattatcaacctatattgggt
gtttttgcaaaaacagaataa

DBGET integrated database retrieval system