Amphiura filiformis: 140155805
Help
Entry
140155805 CDS
T10871
Name
(RefSeq) low-density lipoprotein receptor-related protein 2-like isoform X1
KO
K06233
low density lipoprotein-related protein 2
Organism
afil Amphiura filiformis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
afil00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
afil04131
]
140155805
Membrane trafficking [BR:
afil04131
]
Endocytosis
Clathrin-mediated endocytosis
Low-density lipoprotein receptor (LDLR) family proteins
140155805
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ldl_recept_a
Ldl_recept_b
FXa_inhibition
DUF5050
EGF_LRP2
SGL
cEGF
EGF_CA
OppC_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
140155805
NCBI-ProteinID:
XP_072034879
LinkDB
All DBs
Position
6:63909486..64008417
Genome browser
AA seq
2619 aa
AA seq
DB search
MWDFVSQDNYAQFRSGMATGLRVYNRDGPTSNACSTNNGGCQHLCLPNGVNSKTCKCTTG
FQLNDDGITCSNVTSFAVITLYYVIRGFGLDNGFQEAMVPCAGRQRHTLHVEPVMNLGYV
YFADLERNGEKRNAIRRVRPDGSGLEDLVVGSGRASLRGLAIDWIAGNMYFPDVHSFGTY
FTMSRLDGSHRMILWMTPTEMPRTMAVNPIKKFIYWADYGQTPSITRAFLDATNRTDLIT
TGVSVPRDICIDMSTHKVYWVDSVTSRLECIDWDGTNRQYLQEDLVNPHGLAIFMDWVYW
VDRTEGYVYRASKSINNQQPEILKRDLAILRDIAIYDSRVQPDAPDNPCRDNNGGCDSLC
VALPDGESQPRKCYCAYGQLGADGTSCEDVSSYLVFARTTDIFSIHMDENNHAMPVQPIT
GLSTAVALDFDYDSQRIFFTDVTEKKIMSISATGSGTPVDVVTEQIRNPEGIAVDYLHNR
LYWTDQGLDAIFTADFSGQNRVQLLTSSVPRAIVVDPCNGMMYWTDWGEAPKIEKSTMGG
RNRVTLVDTNVKWPNGLTIDYDERKLYWADGFYQVIERISLNGTMREVILDRASHPFAMT
LFGNYIYYTDWDLLAVIRAEKHTGANQVTMWRYTNAPRPMDIHVYDISRQQQCTESKCNN
GFNGGCSEGDVCTPRPGGNRECSCAREGTVLANDGRVCVPDDHPVCEQTEFTCANSDLCI
PLDWRCDMDDDCGDGSDEAPNLCYDHTCSSTQWPCDNGRCIPATYVCDYEDDCRDNSDEQ
QDCGFPTCASEDFTCPNSRCIPQDYVCDGEDDCRDGNMTDEQNCPETTCPPGYVSCPNNH
FCIFYTWACDGDNDCGDNSDEEPLFCHGQECPDSSIRCNSGSCIPGIWQCDGEADCDDGE
DEDPNVCTEDRTCPSGYFTCDNGNCIPLTWKCDTDNDCGDNSDEADDIGCEEHTCDPEYY
TCTENRPGRTRCIPRTWLCDGDSDCESADDESPDLHGCVRTTCAEGYFTCNNELCIPEAW
YCDHDNDCGDSSDEGNFCTYPACEDSEFACLNGRCIPGTWQCDGDNDCRDNSDELQCVTI
PPTCAPHEFQCASGQCINKDLLCNKQQDCNDRSDEDRCGINECEELVSNQCEYNCVDTTN
SYYCECLQGYTLNEDQKTCRDIDECTETMGTCSQECENTRGAFICKCADGYNKEPDGRTC
KEASGVTPFLIFTNRYYIRRLAIDGSDYQLIKDGFNNIVALEFDYKENKIYFCDNTNRLE
KVMRMNLDGSNVETVYDNHDDIPNIQGLGIDWVGRKMYWTDSDKDMIEVAELNGTNRRVL
YHKGMALPRAIAIDPRDKFLFWTDWGLNPYIGRIDLDGENPMKLDGITKLTWPNGLTIYY
PVRKLFWIDAHLNYIGYANYDGSGFNELTGTGDLAHPFAISIFDNEVFWTDWNDLAIHKA
DKWTLANKTVLAEILHRPMDIHVYHPYRQDQSIANPCGTNNGGCSHLCLLSTNNNGYTCK
CPNNFMMNRDGKTCTANCNVHEFLCADMKQCIPIQYKCDGESDCADGSDEPSGCPVRHCD
RGLLQCDNLDCTYPQYMCDGDMDCVDGTDERDCENKHCQDWEFLCSNGQCIPHFRVCNQQ
NDCADGSDEDSQTCSSRTCSPGFFQCDNGFCIPELWFCDLDDDCGDNSDEPHRTCQSQSA
TCQPGWERCATNYRCIPSWAFCDGNDNCRDNSDESNCHQRTCSTGEFQCDNNRCIPGRWV
CDHDNDCGDGSDEQDCTFRACSESEWRCPLTGKCIRNTWVCDHDDDCGDGSDEIACLSHV
CQGENRFQCASGHCINNDYVCDGDRDCQDTSDELNCGTRLPGGLYCPNHEFTCNNHLCIP
MGWVCDGDGDCGDDTGDGVSSDETLSICATRDCDLDVSYHCDNGKCIDRWRLCDGIDNCG
DGSDENAHDICSSPAECTEYEFKCANGRCVSDDLVCNDLDDCGDQTDERGCHKDRGDCTT
AGCEQRCTDIDGGFYCSCDVGLNITDDRTGCEDIDECEQNKCVQMCRNLKGSFSCECSRG
YTDTGTDGQDCKANGKFKQMLFTDGPEIRVFNYENKDYNDVIEHEGRIDALDYADNTLYW
LDAALRALKRAPMSPVGGQSISDNLRIDDINRPQDISLDWIAQNIYWTDQGDDDFNRRVR
RDSEYAGPRISVAKTDGRYVRMLVTENLDKPGAIAVNPRRGVMYWTDYGETPKIEQAYMD
GSHRKVIVDDRLATPTGLSIDFASNDKVYFCDMKESLIWVMNWDGTSRQIILSKDLQNPF
RVEVFETQLYWTTGAADDSGKIIKQDKLGRGIPTVEIRNINLPQGIVMFQDQRYNLDSTV
SNPCEDSKCSHLCLLKPGRTGNSVTEGFACACPDNDEFQSGSSTYCRGAKEEARPLPSTG
ACQNGGLPDENGNCNSTETCQCKNDGFCNGLDECVCPKGFSGATCERNGPGARTGGSGGL
SGGALAGIFVIIIIILVAVIALMFYYIRRRSKYSVKENGEGPVSYRGGTNIDLPGPVAAM
AENGTSGNDFAQPGFQNPVYETSSPQLQAVAAEPEKTGLPFNEVAVDVPEKMGPPEGGID
ASQPVPEVQLSPPNGVEPPTYTATEEEADTNVLVTKDKM
NT seq
7860 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtgggattttgtgtcccaagataactatgctcaatttagaagtggtatggctactgga
ctacgggtttataatagagatggacctacctcaaatgcatgttccaccaacaatggtggt
tgtcaacatctttgcttgcccaatggtgtcaactcaaaaacatgtaaatgtactaccggg
tttcaactcaatgatgatggaataacatgctccaatgtgacatcatttgcagtgatcaca
ctctattatgtgatcagggggtttggtcttgacaatggatttcaagaagcaatggtacca
tgtgctggacgccaacgtcacactctacatgttgaacctgttatgaacctgggatatgtt
tattttgctgacttggaaagaaatggtgagaaacggaatgccatacggcgtgttagacca
gatggctctggtctggaggacttggttgtaggaagtggcagagctagcttacgaggactt
gccattgactggattgcaggaaatatgtatttccccgatgtgcatagtttcggcacatac
ttcactatgagtcgtctagatggatcacatcgaatgatattgtggatgacgcctacggaa
atgcctcgcaccatggctgtaaaccccatcaaaaaattcatatattgggctgattatggc
cagactcccagtatcacacgtgcatttttggatgctactaatcgcactgatctcatcact
accggcgtctctgtgccacgtgatatctgtattgatatgtctacacataaggtatactgg
gtagattctgtcaccagtagactggaatgcatagattgggatgggacaaataggcagtac
ctacaagaagatcttgtcaatccacatggacttgccatattcatggattgggtatattgg
gtagatcgtactgaaggatatgtctacagagcaagcaagagcattaacaaccaacaacca
gagattctaaagcgagatttagccatactaagagacatagctatatatgactccagagtt
caaccagatgcaccggacaatccatgtagggacaacaatggtgggtgtgacagcttgtgc
gttgccctcccagatggtgagagccagccacggaaatgttattgtgcttatggacaactt
ggtgctgatggtactagctgtgaagatgtttccagttatctggtgtttgcacgcactaca
gatatattcagtatacatatggatgagaacaaccatgccatgcccgtccagccaatcaca
ggactttcaacggcagtggcactcgattttgactacgactcacagcgcatatttttcaca
gatgttactgagaagaaaatcatgtccatatctgcaactggatcagggactccagtagat
gttgtgaccgaacaaatccgcaatccagaaggcatagcagtggattatttgcacaacaga
ctatactggacggatcaaggattggatgccatattcacagcagatttcagtggacaaaat
agagtacaacttctcacttcttctgttccaagggcaattgtagttgacccatgcaatggc
atgatgtattggactgactggggtgaagctcccaagatagagaaatccaccatgggaggc
cgaaatagagtgaccttggtggacaccaatgttaaatggccaaatggactcacaattgat
tatgatgagaggaaactctactgggcagatggcttctatcaagttatcgaaagaataagt
ttgaacggaacaatgcgtgaagtgattttggaccgtgcctcacatccatttgccatgacc
ttgttcggtaattacatctactacactgactgggatctgttagcagtgatcagagcggag
aaacatacgggagcaaatcaagtgactatgtggcggtatactaatgcaccaaggccaatg
gatatacatgtgtatgatatcagtagacaacagcaatgtactgagagtaaatgtaacaat
ggatttaatggtgggtgtagtgaaggtgatgtatgcaccccacgtcctggaggtaataga
gagtgtagttgtgctagagaaggaacagtcctagccaacgatggcagagtttgtgttcct
gacgatcatcctgtatgtgagcaaactgaatttacctgtgcaaatagtgatctttgtata
ccattggattggcggtgtgatatggacgatgactgtggtgatggtagtgatgaagcacca
aacctttgttatgatcatacttgtagctctacccagtggccctgtgacaatggccgttgc
atacctgctacctatgtctgcgactatgaggatgattgcagggacaattcggatgaacaa
caagactgtggtttccctacttgtgcatccgaggattttacatgtcccaacagtcgctgt
attcctcaggactatgtgtgtgatggggaggatgattgtcgtgatggcaacatgacagat
gagcaaaactgccctgaaacaacatgtccaccaggctatgtgtcatgcccaaacaaccac
ttctgtatattctacacatgggcatgtgatggagataacgactgtggggataatagtgat
gaagaacccttattttgtcatggccaggagtgtcctgattcgtccatccgatgcaatagt
ggttcatgtattccaggcatctggcagtgtgatggtgaagcagattgtgatgatggtgag
gatgaagacccgaatgtctgcactgaagatcgtacatgtccttctggttacttcacgtgt
gacaatggcaattgtatcccactgacctggaaatgtgacacagacaatgattgtggagat
aactctgatgaggctgatgatataggatgtgaggagcatacatgtgacccagagtattac
acctgtactgagaatagacccggcagaacacgatgcatcccacgtacttggttatgtgat
ggtgatagcgattgtgagagcgccgatgatgaaagcccagacctccatggttgtgtgcgt
acaacgtgtgctgaaggttattttacatgcaacaatgagctttgcatcccagaggcctgg
tattgtgaccatgacaacgactgtggtgacagctcagatgaaggaaacttctgtacttat
ccagcgtgtgaggatagtgaatttgcatgcctgaatggtcgctgtataccaggtacctgg
cagtgtgatggagacaatgattgtagagataactctgatgagcttcagtgtgtcaccata
cctccgacgtgtgcacctcatgaattccaatgtgcaagtggacaatgcattaacaaggat
ttattatgtaacaagcaacaagattgtaatgatagatccgatgaggatagatgtggtatt
aatgaatgtgaagagctggtctctaatcaatgcgaatacaactgtgttgataccaccaat
agctactactgtgaatgtctacaaggatataccctcaatgaagaccaaaagacgtgtaga
gatatcgatgaatgtactgaaacaatgggaacttgcagtcaggaatgtgagaacacccgt
ggagctttcatatgcaaatgtgctgatggttataataaagaaccagatggcaggacatgt
aaagaagcatcaggagttaccccattcttgatctttacaaatcgttactacatccggcgg
ctggcaatagatggctcagactaccaactcatcaaggatggtttcaacaacattgtggca
cttgagtttgattacaaagaaaacaagatatacttctgtgataacacaaataggttagag
aaggtgatgagaatgaatctggatggtagtaatgtggagaccgtatatgataaccatgat
gacattcctaatattcaaggattgggcattgattgggtaggaagaaaaatgtattggact
gattctgacaaagatatgatagaagttgctgaattgaatggcacaaatcgtcgtgttctc
taccacaagggcatggcactacccagagctatagcgattgacccacgggataagttcctg
ttctggactgattggggtctgaatccctacattggaaggattgatcttgatggagagaac
ccaatgaaactagatggcatcactaaattgacttggcctaatggactcactatatactat
cctgtgaggaaactcttctggattgatgcacatctcaactatattgggtatgcaaactac
gatggttcaggcttcaatgaattaacaggaacaggagacctagctcatccgtttgccatc
tccatatttgataatgaagtgttctggacagattggaatgacttggctattcacaaggca
gataaatggacgcttgctaacaagacagtactagcagagatcttgcaccgacccatggat
attcatgtgtaccatccatataggcaagatcagtcaattgccaacccatgtggcacaaac
aacggtggctgctctcatctttgcctgctgtcaactaacaacaatggatacacctgtaaa
tgtcccaacaactttatgatgaatagagatggcaagacctgcactgctaactgcaatgtc
catgagttcctatgtgcagacatgaagcaatgtatccctatacaatacaaatgtgatggt
gaatctgattgtgctgatggctctgatgaaccttcaggctgccctgtacgtcattgtgat
cgaggtctgctacaatgtgacaatctggactgtacataccctcaatatatgtgtgatgga
gacatggactgtgttgatggaactgatgaaagggattgtgaaaataagcactgtcaggat
tgggagtttctgtgcagtaacggccagtgcattccacacttcagagtatgcaatcaacag
aatgactgtgcagatggttctgatgaagactcacaaacttgttcatcccgaacatgttct
cctgggttctttcaatgtgataatggtttctgcattcctgagttgtggttctgtgattta
gacgatgactgtggagataatagtgatgaaccacatcgtacttgccaatctcaatcagcc
acctgccaacccggctgggagagatgtgctaccaattacagatgtattccatcatgggcg
ttttgtgatggcaatgataactgcagagataacagcgatgagtcaaattgccatcaacgc
acctgtagcacaggggaattccagtgtgataataataggtgtattccaggacgttgggtt
tgtgaccatgacaacgactgtggagatggctccgatgaacaggattgtactttcagagcc
tgcagtgagagtgaatggcgttgtcctctgactggcaaatgtatccggaacacatgggtt
tgtgatcatgatgatgactgtggagatggatcagatgaaatagcttgtcttagtcatgtg
tgccagggagagaaccgattccaatgtgctagtggacattgtattaataatgactatgtg
tgcgacggagacagggactgtcaagatacgtcagatgaactcaactgtggtactcgccta
ccaggaggtctgtactgtccaaaccatgaattcacttgtaacaaccatctatgtatacca
atgggatgggtatgtgatggtgatggtgactgtggagatgacactggagatggtgttagc
agtgatgaaaccctatcaatatgtgcaacacgagattgtgatttggatgtgagctaccat
tgtgacaacggcaaatgtattgataggtggcgtctgtgtgatggtattgacaactgcggt
gatggaagtgatgaaaacgcccatgatatttgttcatctcctgccgaatgcactgagtat
gaattcaaatgtgcaaatggtcggtgtgtgtcggacgacttggtatgcaatgatttagat
gactgtggagatcagacagatgaaagaggatgtcacaaagaccgtggagattgtacaact
gcaggctgtgaacaaaggtgtactgatatagatggtggcttctattgctcctgtgatgtt
ggtctgaatatcactgatgaccgcactggctgtgaagatattgatgaatgtgaacagaat
aagtgtgtacaaatgtgtagaaatctcaaaggctccttctcctgtgaatgtagcagaggt
tataccgacactggaacagatggacaagattgcaaagctaatggaaagtttaagcagatg
ttattcactgatggtccagaaatccgagtttttaattatgagaataaagactacaatgat
gttatagaacatgaggggcggatagatgctttagactacgcggataacacattatattgg
ctagatgccgcattgagggcattaaagagagctcctatgtctccagtcggtggccaatca
atatccgataacctaaggattgatgatatcaacagaccacaagatatatcattggattgg
attgctcagaacatctactggactgatcagggtgacgatgattttaatcggcgtgttaga
cgtgatagcgaatatgcaggacctcgcatctctgttgctaagacagatggtcgctatgta
cgcatgctcgttaccgagaacttggataaaccaggtgcaattgcagtcaatccaaggaga
ggtgtgatgtactggacagactatggtgaaacaccaaagattgagcaagcttacatggat
ggctcacacagaaaagtaattgttgatgacaggctagcaacccctacaggattaagcatt
gattttgccagcaatgataaggtgtatttctgtgatatgaaggagagcttgatttgggtt
atgaactgggatggaacaagcagacaaataattctttcgaaagatcttcagaatccattc
agagtggaagtgtttgaaacccagctgtactggacaacaggagctgcagacgactcagga
aaaatcattaaacaagacaaactgggcagagggataccaaccgttgagatccgcaacatc
aatctccctcagggtatcgtcatgttccaggaccaacgttacaatctagactcaactgtg
agtaatccatgtgaggatagcaagtgtagtcatctgtgcttactgaaaccaggcaggaca
ggaaacagtgtaacagaagggtttgcatgcgcatgtccagataacgatgagtttcaatca
ggaagctctacatattgtaggggagcaaaagaagaagctcgacctttgccctctacagga
gcttgtcagaatggtggccttccagatgaaaatggaaactgcaattctacagaaacctgt
cagtgtaagaatgatggattctgcaatggtctggacgagtgtgtgtgtcctaaaggattt
agtggtgctacatgtgagaggaatggccctggagcaagaacgggaggaagcggaggacta
agtggtggagctctggcaggtatctttgttattataatcatcatactagtagctgtcatt
gcattgatgttttactacatcagaagacgatcaaagtacagtgtcaaagaaaatggagaa
ggtccagtgagctacagaggaggcactaatatagatctaccaggacctgtagcagcgatg
gctgaaaatggaacttcagggaatgactttgctcaaccaggctttcaaaacccagtgtat
gagacctcatctcctcagctacaagcagtagctgctgaaccagagaaaacaggcctgcct
tttaacgaggttgcagttgatgtacctgagaaaatgggaccacctgaggggggtatagat
gcatcacaacccgtaccggaagtacaactttcaccaccaaatggtgttgagccaccaaca
tacacagcaacagaagaagaagcggacacaaatgtattagtaacgaaagataaaatgtag
DBGET
integrated database retrieval system
