Amphiura filiformis: 140160775
Help
Entry
140160775 CDS
T10871
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein
KO
K24333
multiple epidermal growth factor-like domains protein 6
Organism
afil Amphiura filiformis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
afil00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04990 Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
afil04990
]
140160775
Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
afil04990
]
Laminin domain-containing proteins
Laminin EGF-like domain-containing proteins
140160775
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FXa_inhibition
EGF_laminin
cEGF
EGF_CA
EGF_3
hEGF
EGF_2
EGF_Teneurin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
140160775
NCBI-ProteinID:
XP_072040173
LinkDB
All DBs
Position
9:24279085..24546622
Genome browser
AA seq
1625 aa
AA seq
DB search
MALTFAILVLAFSQMAMAMQMTNGNSFSNTLGGQPNHGRQPYDPMMHSNQHYANTPGQPI
PYSSGNGQQGHGGENELGGGMPHVCPYQEMSMVGHRRPCVRAFTRMVKVWRPNCGYSANW
CVGYEQRTAYYTSYRLEYESSYVTKYKCCHGWARLNGETGCMYPTCSVGVCFNGGTCSGG
YSQMCQCPPGFQGPRCQYDTNECLFDNGGCXGSCCNTIGSYYCKCGMGYELTPDGNSCRD
INECQIQNGGCQDTCRNTQGSFQCDCPTGXRLASDGRTCIPEDGCRINNGGCQHQCLPYA
YGTFTCQCHAGFRISTDGKMCEASSPCNYNNGGCDHQCLNFGDKAMCQCHTGYKLQTDMR
TCIDIDECEMNGHSCSQTCINTEGSYRCECRPNYQLAGDGRTCELDVNIQIEVIDPCENH
DCQYNCTAANNMRKCTCPVGYVIGPDQRNCEDENECATGQNCCDPAANCVNFEGGYECKC
PQGYIQDDNGCQCLDVDECENNNGGCDRICHNEPGSFSCDCPANLVLASDGVTCIQRLRT
APPPAPTENPFFNPDIRPNDRNQLRKGEEQFVCAPGHFGPDCEFTCGISCHNGGPCNDEQ
TKCQCPSGFTGLLCNQTCPRNTFGENCERSCPCQNGGTCDHITGECSCPPGINGQYCEDG
CPVGLFGKDCDRFCRCPVGIACHRQWGTCHCKPGFFGPQCNSPCPDFYYGSGCSKECDCH
PHHASGCNPEDGTCICNPGHQGDRCQDECPVGMYGDQCRRVCQCNDVSACNKVSGECSAE
CPSGYMGEACEQPCQHGKYGVNCTFFCRCGGKPCNAITGACSCNAGKIGVDCAEDCPDGT
WGINCQQTCDCPGNRVCDKETGLCLCPLGSYGENCDDRCPPDYYGLMCRHACDCQNGATC
DAVTGDCTCTPGWRGSSCSEECRVGTYGQDCTEKCECLNSAGCDPILGDCICTPGWDGRH
CDHECQPTFFGQNCENVCVCMNNATCDHISGACTCGPGFTGAICDKACPDGFFGDGCQHV
CSCGNGARCNPVDGSCACAPGYAGENCQEACPDGWFGQDCIQQCSCLNGASCDRRTGRCI
CNNGWRGLRCSQECPNGFYGTNCAQRCICRNGGECDHVTGRCACPSGWIGRACEIPCANG
YYGVDCSQDCQCQHGGRCERFNGTCTCTSGWVGEMCQEACRPGFWGNRCESRCACKNMAG
CDHQTGECNCPNGWRGRQCDKPCLPGYYGAECQEVCRCGANTPCNHVTGECRCPPGYSGY
ECSLPCPSGSYGQDCDQVCNCGANTICNAVTGDCECKPGYRGHKCTKDCRKGQFGPNCQQ
FCDCLHEAPCNATDGTCQCPPGWVGARCEKACPSGYYGQFCQERCSCDNGASCHHVTGEC
ECQSGFTGALCEKSCYTGSYGVNCREVRECQNGGITDPLTGECYCNLGWTGEQCQYECDD
GHYGPNCALECLCQNGGRCDRMTGCCECSDGFYGQQCEFECPSSTFGPYCSRQCDCHKDA
ECDTVTGQCRCPLGRTGPECEQGCPLGYFGANCLSICECANMTQCNPVTGQCECSPGLTG
PRCEDECADDKYGPDCSFSCDCANGASCDSKSGACNCIDQWIGSTCEQGGPPHFTNRRSD
VLPDI
NT seq
4878 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctttaacttttgccatactcgtactagccttttcacaaatggcaatggcaatgcag
atgaccaatggaaatagtttcagtaatactttagggggacaacctaaccatggacgtcaa
ccgtatgatcctatgatgcacagtaatcaacattatgccaacacacccggtcagcctatc
ccgtattcttcaggaaatggacaacagggacatggtggtgaaaatgaactgggtggtgga
atgcctcacgtttgtccataccaagaaatgagcatggttggtcacagacgaccgtgcgtg
cgtgcttttacgcgtatggttaaagtgtggcgtccaaactgcggctactcagccaattgg
tgtgttggctatgaacaaaggactgcgtactatacatcatatcgtctggaatatgaaagc
tcctatgtaaccaaatataaatgttgtcatggatgggcaagactcaatggagaaacagga
tgcatgtatccaacttgcagtgtgggagtatgttttaatggcggaacttgctcagggggc
tattctcagatgtgccagtgcccccctggatttcagggaccaagatgccagtatgatacc
aatgaatgcttatttgataatggcggctgtncaggttcttgctgcaacactattggtagt
tattattgtaaatgtggaatgggatatgaactcacaccagatggcaactcatgcagagat
attaatgaatgtcagatccaaaatggcggctgtcaagacacatgtagaaacacacaaggt
agcttccagtgtgattgtccaacagggnaaagactagctagcgatggcagaacatgcata
cctgaggatgggtgtcggataaacaatggcggatgtcaacatcagtgcttaccatatgca
tacggtaccttcacatgtcagtgtcatgcaggattcaggatatcaacagatggaaaaatg
tgtgaagcatctagtccttgcaactacaacaatggcgggtgtgaccatcagtgtctcaac
tttggagataaggcaatgtgtcaatgtcacactgggtacaaactacagacggacatgagg
acgtgtatagatattgatgaatgtgagatgaatggtcattcatgttcgcagacgtgtatc
aatacggaaggttcataccgctgtgaatgcaggcctaattatcaactagcaggagacggc
aggacttgtgaattggatgtaaacattcagatagaagtgattgatccatgtgaaaaccat
gactgccaatacaactgtacagcagccaacaacatgaggaaatgtacatgtccagtgggc
tatgtaatcggtccagaccaaagaaactgtgaggatgagaatgagtgtgcgacaggacag
aactgctgtgatccagctgccaactgtgttaactttgaaggaggctacgagtgcaaatgt
ccccaaggttatatccaagatgataatggctgccagtgcctcgacgtcgatgagtgtgag
aataataatggaggctgcgaccggatctgtcataatgagcccggttcattctcttgtgac
tgtccagctaatctagtactagcttcagatggcgttacatgtattcagagactaaggaca
gcgccacctccagcaccgacagaaaatccattcttcaatcccgatattcgacccaatgat
cgcaatcagttaagaaaaggagaggaacagtttgtctgtgctcctggacattttggtccc
gattgtgaatttacttgcggtattagctgtcacaatggaggtccgtgtaatgatgagcag
actaaatgtcagtgcccttctggatttactggactattatgcaatcaaacttgtccaagg
aatacatttggtgagaattgtgagcgaagttgcccatgtcaaaatggtggaacatgtgat
catatcactggcgaatgctcctgcccacccggtataaatggacagtactgtgaggacggt
tgtcctgttggtctcttcggcaaagattgcgacagattctgtcgttgtccagttggtatc
gcgtgtcacagacaatggggtacctgtcattgcaaacccggattctttggaccacagtgt
aactcaccatgtccagacttctactatggtagcggttgttccaaggagtgtgattgccat
cctcatcatgcatctggttgtaacccggaagacggtacctgtatatgtaaccctggacat
caaggagacagatgccaagatgaatgccctgttggtatgtacggtgaccagtgccgccgt
gtttgtcagtgcaacgatgtgtccgcttgtaacaaagtatcgggagagtgttcagcagaa
tgcccgtctggatatatgggagaggcttgtgaacaaccatgccaacatggaaagtacggt
gttaactgcacttttttttgccgatgcggcggaaaaccgtgcaatgcaatcaccggtgca
tgttcctgcaatgccggcaagattggagtggactgcgcagaggattgcccggatggtaca
tggggcattaactgccagcagacgtgtgattgtcctggtaaccgtgtttgtgacaaggag
actggactctgcctttgccctcttggatcctatggagagaattgtgatgatcgttgccca
ccggattactatggtctaatgtgtcgtcacgcatgtgattgtcagaatggcgccacctgt
gatgctgtgactggggattgtacatgtacaccaggatggaggggatcatcatgtagtgaa
gaatgcagagtaggaacttacggacaagattgtacagagaaatgtgaatgtttaaacagc
gctggttgtgatcctatactcggtgattgtatatgcacaccaggctgggatggcagacat
tgtgatcatgaatgccaaccaaccttttttggccagaactgtgagaatgtctgtgtatgt
atgaacaatgccacttgtgatcacatcagcggtgcgtgtacgtgcggaccaggatttaca
ggggctatctgtgataaagcatgtcctgatggtttcttcggtgatggttgtcagcatgtt
tgttcttgtggtaatggagctaggtgtaatccagtagatggctcatgcgcttgtgcacct
ggatatgctggagaaaattgccaggaagcctgccctgatggttggtttggtcaagattgc
atacagcaatgcagttgcttgaatggtgctagctgtgataggaggactggaagatgtatc
tgtaataatggatggaggggactcagatgttcacaggaatgcccaaatggtttctatggg
accaactgtgctcaacgttgcatatgtcgaaatggcggtgaatgtgatcatgtgactggc
agatgcgcttgcccatcaggatggattggaagagcgtgcgagataccatgtgctaacgga
tattatggagttgactgcagtcaagactgccagtgccaacatggaggtagatgtgagaga
ttcaatggaacctgtacttgtacatcaggatgggtaggagaaatgtgtcaagaagcttgc
cgacctggtttctggggtaacaggtgcgaatcacggtgtgcttgtaagaacatggccggt
tgtgatcatcagacaggtgaatgcaattgtcctaatggatggagaggaagacagtgtgac
aaaccttgcctgccaggatattatggtgcagaatgtcaagaagtctgtcggtgtggagcc
aatacaccatgtaatcatgtgacaggagaatgcagatgtcctcctggatacagcggatat
gagtgcagcttaccttgtccttctggctcatacggtcaggattgtgaccaggtttgcaat
tgtggtgcaaataccatatgtaatgcagtcactggtgactgtgaatgtaagccaggatat
agaggacacaaatgtaccaaagattgtagaaagggccagtttggtccaaactgtcaacag
ttctgtgattgtctacacgaggcaccatgcaatgcaacagacggcacatgccaatgccca
cctggatgggtgggagcaagatgcgaaaaagcttgtccatcagggtactatggtcagttc
tgccaggagagatgcagctgtgataacggtgcttcctgtcatcatgttactggggaatgt
gaatgccagtcaggattcacaggagcactatgtgaaaagagttgttacacaggaagctat
ggggtgaattgcagggaggtgagggaatgtcagaatggaggtataacagacccactgaca
ggagaatgctattgtaatctaggatggactggtgaacaatgccaatatgaatgtgatgac
ggtcattatggtccaaactgtgccttggaatgcctctgtcagaacggtggccgctgtgat
aggatgacaggctgctgtgaatgctcagatgggttttatggtcaacaatgtgaatttgaa
tgtccatctagtacatttggtccatactgcagtagacaatgtgactgtcacaaagatgca
gaatgcgacacagtcacagggcagtgtagatgtccgctaggcagaacaggacctgaatgt
gaacaaggttgtcctttgggttactttggagccaactgtttgagtatttgtgaatgtgcc
aatatgacccagtgcaatccagttacaggccagtgtgagtgctcgccaggtctcacaggc
ccaagatgtgaagatgagtgtgccgatgacaaatatggccctgactgttcatttagttgt
gattgtgcaaatggggcatcttgtgactctaaatcaggagcatgtaattgtatagaccaa
tggattggatccacatgtgaacaaggtggtccaccacattttacaaataggcggagtgac
gtactacctgacatctaa
DBGET
integrated database retrieval system
