Antarcticibacterium flavum: FHG64_06030
Help
Entry
FHG64_06030 CDS
T06005
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
afla
Antarcticibacterium flavum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MBG_2
Por_Secre_tail
RebB
Ig_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QCY68999
UniProt:
A0A5B7X122
LinkDB
All DBs
Position
complement(1448984..1454431)
Genome browser
AA seq
1815 aa
AA seq
DB search
MAEFLLFKRAGLLNFTLTFITSIFLVTAGWGQSVTTDKLDYAPGEIAIISGSGWTGDSMI
DIHMDEDPPLHEDHEHDFDDVPVNADGTWSVEFPIEEYHLGVTFYVTVTGQQTGMTAEHV
FTDNGFFAITINPISSEASEIQKYIITIKNSENNSGNSVKFGSFQILLPGGYANPTAIEN
FKINNNSTTRFTTYNGGSYSNGYNSINRYIGITSIGNTSNNDNRLVKGEVLTFEVTTVNP
GAGDYTWTTGASNNLFSSFNNNGSIEGNQPVVKIISSCNAPTINENPENQTITYGENISF
SVDAEGDGLEYQWQVDTGDGFENVNNGGFYSGAESATLNIISPTVAMHEFKYRVVVSGDC
DADAVSEAAVLTVTPKALEVIASSDSKEYGSEYTFDGTEFTTEGLVNDDAVTSATITSTG
SGATAAVANYDINISAAQGTGLGNYTITYTKGNLEVTPKALEVIANSDSKEYGSEYTFDG
TEFTTEGLVNDDAVTSATITSAGSGATAVVDNYDIDISAAVGTGLGNYTITYTEGNLEVT
PKALEVIANSDSKEYGSEYTFDGTEFTTEGLVNDDAVTSATITSTGSAATAAVANYDINI
SAAQGIGLGNYTITYTKGNLEVTPKALEVIANSDSKEYGSEYTFDGTEFTTEGLVNDDAV
TSATITSTGSAATAAVANYDINISAAQGIGLGNYTITYTKGNLEVTPKALEVIANSDSKE
YGSEYTFDGTEFTTEGLVNDDAVTSATITSTGSAATAAVANYDINISAAQGIGLGNYTIT
YTKGNLEVTPKALEVIANSDSKEYGSEYTFDGTEFTTEGLVNDDAVTSATITSTGSAATA
AVANYDINISAAQGIGLGNYTITYTKGNLEVTPKALEVIANSDSKEYGSEYTFDGTEFTT
EGLVNDDTVTSATITSAGSGATAAVANYDINISAAQGTGLGNYTITYTEGNLEVTPKALE
VIANSDSKEYGFEYTFDGTEFTTEGLVNDDAVTSATITSAGSGATAVVDNYDIDISAAVG
TGLGNYTITYTEGNLEVTPKALEVIANSDSKEYGSEYTFDGTEFTTEGLVNDDAVTSATI
TSTGSAATAAVANYDINISAAQGIGLGNYTITYTKGNLEVTPKALEVIANSDSKEYGSEY
TFDGTEFTTEGLVNDDAVTSATITSAGSGATAVVDNYDIDISAAVGTGLGNYAITYAKGN
LEVTPKSLEVIANSDSKVYGSEYTFDGTEFTTEGLVNDDAVTSATITSTGSAATAAVANY
DINISAAQGIGLGNYTITYTEGNLEVTKKGLEVTAVADDITYGDAAPTVTVEYSGFVNND
DADDLDNTGFALGTDYTQFDAVGTYNTTITITTAEDNNYNFTPLTSSTFTVGQKELTITA
NDLSKYCGQTIIFGGTEFSQIGLVGGDVIESATISSNGAGASAEPAGSPYVIIIEDAIGT
GLSNYTITYETGELTVNPVSLDLTNAQNPRSINEDVIIKIGVSDGATQVSGALVTLKVEG
KGSFEATSSNGIATFNLGKLPAELYAVTVQAGGCETSAEVYLPIYDPNGGFVTGGGWIDS
PAGAMTGDYETAAGKANFGFNAKYKNGKNNTTEVDGSTNFQFKDGDFHFKSSKHEDESLI
ISGAKATFRGVGTVNGKGNHQFRIIAIDGDVSGGGGTDKFRIMVWDDNSSSTLIYDNKRG
IAESSDDATVLGGGSIVIHKPKGGNNKTAEVNEKITVAESKEEIVQLDILGNLAVAPNPV
RHEAKVRFSLIEDAGVTVRLYDFNGREIQTLYTGNAKAHQVYEAAFQRNNSMSGIYIVKL
TTDRGHSYNKQVIFE
NT seq
5448 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgaatttttactttttaaaagggcgggattgctaaatttcaccctaacatttatt
acctcgatcttcctggttactgcggggtgggggcagagtgtcaccacagataagctggat
tatgcaccaggggaaatagcgattatctccggttccgggtggaccggggattctatgatc
gacattcacatggatgaagatccgccgctgcatgaagatcacgaacatgactttgatgat
gttccagttaatgccgatggcacctggagtgtggaatttcctattgaggaatatcacctt
ggggtaacattttatgttacggtgacggggcagcagactggtatgacggcggagcatgtt
tttacggataatggtttttttgcaattacaattaatccgattagtagtgaagcttctgag
attcaaaagtatattattacaataaagaattcagagaataattcaggaaattccgttaag
tttggatcatttcaaattcttttaccaggaggatatgctaatccaacagctatagagaat
tttaaaattaataataattcaaccaccagattcaccacttataatggaggctcttactct
aatggatataactccatcaatcgttatattggaatcacctcaataggtaacaccagtaat
aatgataacagactagtaaaaggagaagttttaacttttgaagtaactactgtgaaccct
ggggctggagactatacttggacgactggagcatcaaacaaccttttttcatcttttaat
aataatggttccattgaaggtaaccaacctgtggtaaaaataatatcttcatgtaatgct
ccaacaattaatgaaaatccagaaaatcagactataacttatggggaaaatatctctttt
tctgttgatgctgagggtgatgggttagaatatcaatggcaggtagatacaggtgatggt
tttgaaaatgtaaataatggtggattttattctggggcagaaagtgcaactttaaatata
attagcccaactgttgcaatgcacgaatttaaatatcgtgtggttgtttctggagattgt
gatgcagatgctgtgagtgaggctgctgttttaactgtaactccaaaagcacttgaggtt
atagccagcagtgacagtaaagaatacggttctgaatatacatttgacggaacagagttc
actaccgaaggtcttgttaatgacgatgcagttacatctgctacgattacttccaccgga
tcaggtgctactgctgcagttgcaaactacgacatcaatatcagcgccgcgcagggtaca
ggacttggaaactatacgatcacttatactaaaggtaacctggaggtgactccaaaagca
ctagaagttatagccaacagtgacagtaaagaatacggttctgaatatacatttgacgga
acagagttcactaccgaaggtcttgttaatgacgatgcagttacatctgctaccattact
tccgccggatcaggtgctactgccgtagttgacaattatgacattgatatcagtgctgcg
gttggaacaggacttgggaactataccatcacttatactgaaggtaatctggaggtgact
ccaaaagcacttgaggttattgccaacagtgacagtaaagaatacggttctgaatatact
tttgacggaacagagttcactaccgaaggtcttgttaatgacgatgcagttacatctgct
accattacttccacaggctcagccgctactgctgcagttgcaaactacgacatcaatatc
agcgccgcgcagggtataggacttggaaactatacgatcacttatactaaaggtaacctg
gaggtgactccaaaagcactagaagttatagccaacagtgacagtaaagaatacggttct
gaatatactttcgacggaacagagttcactaccgaaggtcttgttaatgacgatgcagtt
acatctgctaccattacttccacaggctcagccgctactgctgcagttgcaaactacgac
atcaatatcagcgccgcgcagggtataggacttggaaactatacgatcacttatactaaa
ggtaacctggaggtgactccaaaagcactagaagttatagccaacagtgacagtaaagaa
tacggttctgaatatactttcgacggaacagagttcactaccgaaggtcttgttaatgac
gatgcagttacatctgctaccattacttccacaggctcagccgctactgctgcagttgca
aactacgacatcaatatcagcgccgcgcagggtataggacttggaaactatacgatcact
tatactaaaggtaacctggaggtgactccaaaagcactagaagttatagccaacagtgac
agtaaagaatacggttctgaatatacttttgacggaacagagttcactaccgaaggtctt
gttaatgacgatgcagttacatctgctaccattacttccacaggctcagccgctactgct
gcagttgcaaactacgacatcaatatcagcgccgcgcagggtataggacttggaaactat
acgatcacttatactaaaggtaacctggaggtgactccaaaagcactagaagttatagcc
aacagtgacagtaaagaatacggttctgaatatacatttgacggaacagagttcactacc
gaaggtcttgttaatgacgatacagttacatctgctaccattacttccgccggatcaggt
gctactgctgcagttgcgaactacgacatcaatattagcgccgcgcagggcacaggactt
gggaactataccatcacttatactgaaggtaatctggaggtgactccaaaagcacttgag
gttattgccaacagtgacagtaaggagtacggttttgaatatacttttgacggaacagag
ttcactaccgaaggtcttgttaatgacgatgcagttacatctgctacgattacttcagcc
ggatcaggtgctacagccgtagttgacaattatgacattgatatcagtgctgcggttgga
acaggacttgggaactataccatcacttatactgaaggtaatctggaggtgactccaaaa
gcacttgaggttattgccaacagtgacagtaaagaatacggttctgaatatacttttgac
ggaacagagttcactaccgaaggtcttgttaatgacgatgcagttacatctgctaccatt
acttccacaggctcagccgctactgctgcagttgcaaactacgacatcaatatcagcgcc
gcgcagggtataggacttggaaactatacgatcacttatactaaaggtaacctggaggtg
actccaaaagcactagaagttatagccaacagtgacagtaaagaatacggttctgaatat
acttttgacggaacagagttcactaccgaaggtcttgttaatgacgatgcagttacatct
gctaccattacttcagccggatcaggtgctacagccgtagttgacaattatgacattgat
atcagtgctgcggttggaacaggccttgggaactatgcgatcacttatgctaaaggtaac
ctggaggtgactccaaaatcacttgaggttattgcgaacagtgacagtaaagtttacggt
tctgaatatactttcgacggaacagagttcactaccgaaggtcttgttaatgacgatgca
gttacatctgctaccatcacttccaccggctcagccgctactgctgcagttgcaaactac
gacatcaatatcagcgccgcgcagggtataggacttggaaactataccatcacttatact
gaaggtaacctggaggtgactaaaaagggtcttgaggtaactgctgttgcagatgatatc
acttatggtgatgctgcaccaacagtaacggttgagtacagtggatttgtaaacaatgac
gatgctgatgatcttgacaacacaggttttgctcttggcacagattatacccagttcgat
gctgttggaacttataacacgaccatcactattacaacagccgaagacaacaactacaac
tttactccgctaacatcaagcacttttacagttggacaaaaagagttgactataaccgct
aatgatctttcaaaatattgcggccaaacaataatctttggtggtacagagtttagccaa
attggtcttgtgggcggggatgtaattgaatctgctaccatttcttctaatggtgcagga
gcttcagctgaaccagcaggttctccctatgttattatcattgaggatgctattggaaca
ggattaagcaattatactattacttatgaaacaggtgaattaacagttaatcctgtcagt
ctcgacctaaccaatgcccaaaacccacgcagtatcaatgaagacgtgataattaagatt
ggagtaagcgatggtgcaacccaagtttctggagcactggtaactttaaaagtagaggga
aaaggctctttcgaggcaacttcttccaatggaatagcaactttcaaccttggaaaatta
ccggcagaactttatgcggtaactgtacaagccggaggatgtgaaacaagtgctgaagtt
tatcttcctatttacgatcccaatggtggattcgtaactggtggaggatggatagattct
cccgcaggtgctatgacgggtgattatgaaacagcagccggaaaagccaatttcggattc
aacgctaaatacaaaaatggtaagaacaacacgactgaagtagatggaagcacaaacttc
cagttcaaggatggggacttccactttaaaagctcaaagcacgaagatgaatcattgatc
atctccggggctaaagcaactttcagaggggtgggaactgttaatggaaaaggaaatcac
cagttcaggatcattgcaatagatggcgatgtaagtggaggtggaggaactgataaattc
cgaatcatggtttgggatgacaattcttcaagcactcttatctacgataacaaacgcgga
attgcggaaagctccgatgacgctactgttcttggcggtggttccattgtgatccacaaa
ccaaaaggtggtaacaacaaaacggctgaagtcaatgagaaaataaccgttgctgaaagc
aaagaggagatcgtacaactggatatcctgggcaatcttgccgtggcgccaaacccggtg
agacatgaagcgaaggttaggttcagcttgatcgaggatgcgggagttactgtaagactc
tacgactttaacggcagggagatacaaaccctctataccggaaatgcaaaggcacaccag
gtatatgaagcagccttccagcgtaataactcaatgagcggaatttatattgtgaagcta
acaacagatcgtggccactcttataataagcaggtgatatttgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
