Antarcticibacterium flavum: FHG64_13555
Help
Entry
FHG64_13555 CDS
T06005
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
afla
Antarcticibacterium flavum
Pathway
afla02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
afla00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
FHG64_13555
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Laminin_G_3
Ig_7
Ig_3
I-set
Ig_2
V-set
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QCY70347
UniProt:
A0A5B7X4M1
LinkDB
All DBs
Position
complement(3135250..3141318)
Genome browser
AA seq
2022 aa
AA seq
DB search
MSLLQWMLITKNGSPNYQWRFRPPNGNWTPIEGEVGTNLLLENVQLSQLGDYDVEINPTY
FECQKGFSGIATINVYNPPTVVTANDFSICSTAAEIPLSAEADNYSSLEWTVISGSGSFT
DATVLNATYVPGAAESGDVVLQLQANGYGTCGSVTDQITINIIPIPEITIHPLATVLTCE
SDDDPIVLSINATGPIAEYRWRKNGVPLSDGGNISGATTAELTISNQTPDDSGSYDVVIS
SPAETCSQIISTPSAVSVNPAPVIDSIGADIEICSVGEEVNITTGVAVSNESSIEWSVPA
GQGTISNATQLTGATYTPNGASGNITLILKVQGLDGCSEISSTKTITIIPQPVITEFSYI
TGNNTAVSGEFCETDNTTYMPHINGDNLGNNGNGNFTVDKNDFTLNASNGSFSPEGKVPG
DYIITYTFTANSSSGVCQVASRNFTVTIGEKPIADFSYENTTFCNDSGNPLPIMATNAVK
GTFSSTLSGLVFASTSTGEIDIAGSTPGTYTITNTIAPAEGCAEVKATTEIKINAKPSAP
QIANLVYCLNEENAAGFFATPVNGGSINWYATVDATTAMGAAPVINTGEAKVTSYWTSQT
SAEGCESERAAITVTINELPEVTITTEENPEGENVSICQGTAINLVGNGATTYSWRAGSL
ESAILGEESTLNVIPTETTTYFVVGKNNFECEDISQITIEVDEPTLGGVASEDANVCYGT
NSGLLNLTSHRGNVIRWESSIDDWETIIKFPENNSTSFAYNNLTETTKFRAVVQNGVCGE
KFSEEATITVDALSVGGTITFGNSSDTNILLCHMANDDSVVAMNLSGITGEVVRWEYRTH
SSTQWTEAPNSDGKTTYSDYSGIDITRIYRAIIKNGSCNEASSEIAIVSIIPNIAPSVDQ
DKTVVCLGKSVRLEATSNFTWQANMIRDGGFPSANPKNGWNADGCENCLNTGGSSTSPTS
FVLTQSTPNNRTFSNVDYYGGPGNRFAIVHGITDDSYLETPIFNTLGLATTFLTFNHAYR
LLEGASARVELSLDEGATYTIVLAEYSGTLSPFASSFPEERINLSEYFGMTGLRLRFYYV
GKGGSSWAIDNIAVPDAPIEEEIAWVDPNTGVVISNNQNETFTPTHLGWNRYAVVSMING
CISTGEGGTTYVDVYAYDSFIAEINISPEQNIDEEGNLQCGNTSINLEGKIFSQYQKDQG
EVGEISTLPHPGVSNGKWTVDGLSDEASRQLLGDDLTKRNIIFNAPAGTYTINWTITPAN
ISAAEGEPAIPLNNCEPFVDSFTVTIKGCENLIFDGVDDLVDLGDVNVKNSFSYEAWIKA
EKLNGTILSGPGFELSLDEGKPRFNSVISSHSIDTVRWYHIAASSSGNLYIDGIKVATGT
ISSSGVGKSFIGAKVADSASNHFKGWIEEVRFWDKSLKVEQIRFMMNQRLQDNVHLGVEI
PMPLNDLSFNNLAGYYQLIVANINPVDGTTPNEADNSKPGRLINMTHDQENTAPLPYTSF
ENGSWCNNQGTWTHHTVWDPPYSKGIKDSLITWNIVRTSHNILSGMKDIKVLGLISETGI
LDMEGYNPTSWINGTGGTGNELFISHYLKLNGIINLNGESQLLQPEGSIVDDASMGILYR
DQQGTANSFNYNYWSSPVSPGTKNAAYQVKLVMKDGTNFNSDGTPKDIEFEDSYAFADGG
LSNPRKISNYWINTFNGNADDYGSWNFRHGSEKDIQVGEGYTMKGTSGGVGLAAAQNYTF
AGIPNNGTIRLVSSPERNYLIGNPYPSALDAREFIKDNIKSIKDSTGTTVGRGDYDLFDG
NLYFWDHFGEKNSHYLEDYVGGYASLNLTGGVGGISNDNRIDSTDQKSNRKPGYYIPVGQ
SFFINSANKGNGNYSIISGVIQFKNSQRGYEKEGTESIFLRPEVHTKRPKNENIEKIRIS
YRSPLGYNRQILVGATPAASNDFDLGYDAPIFDYQEEDMYWLQGNNWLVIQGVGHFNEDQ
VLPLGVVLKEEGKFTIQIDSLENFAELPNVYINVSTPQSAYC
NT seq
6069 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcactcttacagtggatgctaattaccaaaaatggttctcctaattatcaatggagg
ttcaggccgccaaatggaaactggactccaattgaaggggaagtgggcaccaatctctta
ttagaaaatgttcaattgagccaattgggtgattatgatgtggaaattaaccctacctac
tttgaatgtcaaaaaggattttccggtatagcgacaattaatgtttacaatcctcctact
gttgtcactgcaaatgatttttcgatttgtagcacagcggcagaaatacccttaagcgca
gaagctgacaattattcctcactggaatggacagttatttccggttcaggatcttttaca
gacgctacagttttaaatgcgacatacgtccccggggctgctgaatctggtgatgtcgta
ctgcaactgcaagccaatggatatggcacctgcggctctgtaacagatcaaattacaata
aatattatacctatacctgaaattaccattcatccactagcaaccgtgttaacctgtgag
agtgatgatgacccgatcgtattatctattaatgctaccggtcctattgctgagtatcgc
tggagaaaaaatggtgttccactttctgatggtggcaatatttctggggctactacagct
gagctaactatttcaaatcaaactcctgatgattcgggtagctatgatgtggtaattagc
agcccggcggaaacatgctcacagattatttccactccgtcagcagtcagtgtaaatcca
gcaccagtaatagactcaataggtgcagacattgaaatctgctcggtaggtgaagaggta
aatattacaaccggagtagcagtttcaaacgagtcttcaattgaatggtctgttcccgca
gggcaaggaacaatttcgaatgctacccaattaacgggtgcaacatacaccccgaatggt
gcaagcggtaacataacccttatacttaaggttcagggcctagacggctgttcagaaatt
tcgtcaactaaaactatcaccattatcccacaaccggtaattactgaattcagctatatt
acaggtaataacacggcggtttccggtgaattttgcgaaaccgacaataccacctatatg
cctcatataaatggagacaatctgggaaataatggtaacggtaattttactgtagataaa
aatgattttacattaaatgcttcaaacggatccttttctcctgaaggtaaagtgcccggt
gattacatcatcacctatacttttactgcaaattccagttcgggggtttgccaggtggct
tcacgcaattttaccgtaactattggtgaaaaaccaatagcagatttctcctatgagaat
accacattttgcaatgattctggcaatcccctgcctataatggctaccaatgctgttaaa
ggcaccttcagttctacactatctggattggttttcgctagtacctctaccggggaaatt
gatatagcaggcagtactcctgggacttatacgattacaaacactatagcccctgctgaa
ggatgtgctgaggttaaagccactactgaaatcaaaattaatgctaaaccgtcggctcca
caaatcgcaaatttggtttactgccttaatgaagagaatgcagccggtttttttgcaact
ccagttaacggaggttcaattaattggtatgcaactgtggatgcaacaacagccatgggt
gctgctcctgtgataaataccggggaagcaaaagtaacttcatattggacaagtcaaact
tcagctgaaggatgtgagagtgagcgagcagcaattactgtaactattaatgaattacct
gaagtaacaattaccactgaagaaaacccggaaggggagaatgtttcaatttgtcaaggt
actgcaattaatcttgttggaaatggtgcgacaacatatagctggagagctggctccctt
gaatctgctattttaggtgaagaatctactttaaacgtgatcccgacggaaacaactaca
tattttgttgtagggaaaaataattttgaatgtgaggatatatcccaaataacaattgaa
gtagacgaaccgactctgggaggagttgcaagtgaggatgccaatgtttgttatggcacc
aattctggtcttcttaatttaacaagtcatcgtggcaatgtaatacggtgggaatcttca
attgatgattgggaaacgattataaaattcccggagaacaacagcacctcatttgcttat
aataacttgacagaaacaacaaaatttcgcgcggttgttcaaaatggagtttgcggtgag
aaattttcggaagaagctacgataactgtagatgctttaagtgtgggtggaacaataacc
tttggaaactccagtgatactaatatattgttatgccatatggccaatgatgattctgtt
gtcgctatgaacctaagtggaataactggcgaggttgttagatgggagtaccgtacccat
tcaagcactcaatggactgaagcacctaattctgatggaaaaacaacttattcagattat
agcggaattgacataacgagaatttatcgtgccattattaaaaatggtagttgtaatgaa
gcctcctcagaaatagcaatagttagtattattccgaatattgccccctcagtagatcag
gataaaactgtagtctgcttagggaaaagtgtccgccttgaagctactagtaattttacc
tggcaagctaatatgatcagggatgggggatttccaagtgcaaatccaaaaaatggatgg
aatgcagatgggtgtgaaaattgtttaaatacaggaggcagttctacaagccctacatct
ttcgtgctaactcaatccactccaaataacagaactttttcgaatgttgattattatggt
ggtcctggtaatagattcgcaatagttcacggaattaccgatgatagctatctagaaact
ccaatttttaacacattaggattagcaactacctttttaactttcaatcatgcttatcgg
ttattggaaggcgcctctgcgcgagtagagctgtctttagatgaaggagccacttatacc
attgttttagccgaatattctggaactctaagcccttttgcttcatcttttccagaagag
agaattaatttaagtgaatattttggtatgacaggccttcgtttacgattttattatgtg
ggaaaaggaggaagttcttgggctattgataatattgctgttcccgatgcgccaattgaa
gaagaaattgcttgggttgatcctaatacaggcgtagttattagtaacaatcaaaatgaa
acattcacacctactcatcttggatggaatagatacgcggtagtatctatgatcaatggt
tgcataagcacaggcgaggggggtactacatatgtagatgtatatgcttatgacagtttc
attgcagagattaatattagtcctgaacagaatatcgatgaggaaggaaatctccaatgc
ggaaatacctccatcaatctagaaggaaaaatcttttctcaataccagaaggatcaagga
gaggttggagaaatttcaaccttacctcaccccggagtttcgaatggaaagtggactgta
gatgggttaagtgatgaagcttctagacaactcctcggagatgatctcacaaaacgaaat
atcatatttaacgcgcccgcaggcacatatacaataaattggacaataacaccggctaat
attagcgctgcagaaggagaacctgcgataccacttaataattgtgaaccatttgttgat
agctttactgttactattaaaggttgtgagaatctcatctttgatggtgtagatgactta
gtagacctaggtgatgtaaacgttaaaaatagctttagttatgaagcctggattaaagca
gaaaaattaaatggaacaattttaagtgggccaggatttgaactttcacttgatgaaggt
aaaccaagattcaattctgttatttccagtcattctattgatactgttaggtggtatcac
attgcagccagttcaagtggcaatttatatattgatggaataaaagtagccacgggcact
attagcagcagcggtgttggcaaatcatttattggagcaaaagtcgcagatagtgccagc
aatcattttaaaggctggattgaggaggtgagattctgggataaaagtctaaaggtagag
caaattcgatttatgatgaatcagcgtcttcaggacaatgtacatttaggggtggaaatt
ccaatgcctctaaatgatttaagttttaataatttagcaggatactatcaattaatcgtt
gcaaatattaacccggtagatggtactacccctaatgaggctgataattcaaaaccaggt
cgacttataaacatgacccatgatcaagaaaatactgctcccctgccctatacatctttt
gaaaatggaagttggtgtaataatcaaggcacctggactcatcatactgtttgggatcca
ccttacagtaaaggaattaaagattctttgatcacctggaacatagttagaacctcccat
aatatcttatccggtatgaaggacattaaagtattaggtttaatttctgaaaccggaatt
cttgatatggaaggttataacccaaccagttggataaatggaacaggaggtacaggaaat
gaattatttatatcacattatttaaaattaaatggcattattaatttaaatggtgaatcc
caacttctgcaacccgaaggcagtattgtagatgatgctagtatgggaatattgtataga
gatcaacaaggaacagctaacagttttaattataactattggtcatctcctgtaagtcct
ggtacgaagaatgctgcctaccaagtaaaattagtgatgaaagatggaactaattttaat
agtgacggcactccaaaagatattgagtttgaagatagttacgctttcgcagatggaggg
ctatctaatccaaggaagataagtaattattggataaatacatttaatggaaatgctgat
gattacggttcttggaattttagacacggtagtgaaaaggatatccaagtgggagaaggt
tatacaatgaaaggtacatcaggaggagtaggccttgctgcagcacaaaattatactttt
gcaggaattccaaataatggaacaattaggctggtaagttctcctgagcgtaattattta
attggaaatccttacccatctgcattagatgcaagagaattcataaaagataatattaaa
agtataaaagattcgactggaacaactgtaggcaggggcgattatgatttattcgatgga
aatctatatttctgggatcattttggtgaaaaaaactcccattatctcgaagattacgtt
ggaggttatgcttcactaaatttaacaggtggtgtaggtggcatctccaacgataacaga
attgatagtacagatcaaaaaagtaatagaaaacctggatactatattcctgtgggtcag
tccttttttattaattcagcaaataagggaaatggaaattatagtattataagtggggta
attcaattcaaaaatagtcaaagaggatatgaaaaagagggaacagaatcaatctttctg
agaccagaggttcatacaaaaagacctaaaaatgagaatatagaaaaaataagaatttcc
tatcgatcccctttaggatataaccgccaaattttggttggagctaccccagcggcctcc
aatgattttgacctcggttatgatgcacctatttttgattatcaagaagaagacatgtac
tggctacagggaaataattggcttgtcatacaaggagttggtcattttaatgaagatcag
gtactacctttaggtgtagtattaaaagaagaaggtaagtttaccatacaaattgattcc
ctcgaaaattttgctgaattaccaaatgtctacatcaacgtatccaccccacaaagtgca
tattgctaa
DBGET
integrated database retrieval system