Apis florea (little honeybee): 100863914
Help
Entry
100863914 CDS
T09140
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: activating signal cointegrator 1 complex subunit 3
KO
K18663
activating signal cointegrator complex subunit 3 [EC:
5.6.2.4
]
Organism
aflr
Apis florea (little honeybee)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aflr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
aflr03400
]
100863914
Enzymes [BR:
aflr01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
100863914
DNA repair and recombination proteins [BR:
aflr03400
]
Eukaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
Direct repair
100863914
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Sec63
DEAD
SNRNP200_wHTH
ResIII
Helicase_C
AAA_22
Helicase_PWI
AAA_19
UvrD-helicase
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100863914
NCBI-ProteinID:
XP_031775448
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2119 aa
AA seq
DB search
MPELPRITRSLRMFTNLGRIKSTKELEPNDLFRKEKEQHSKFKSEFNWQDLCKCVPKNVL
FHLNKLRQIATEALGECSFELINEFLMFTLQLLIDEKLLTQIKFKTLKEKAGNLKFHDAN
HMMKIIIEIREKLNEETLILIKNGKENIKVLENGLFDPKFEYKSARVLWPDTNALRSMSM
GNINQSTDNFSMKYKNEATKLFKTEFDKAAYKENLKSYHAKNFADMSLEKFEKIIITKLG
SKNSENELVDLLGCESIEFIQYIIQHQKSIITLSSAPKVQKKCNIQGPVISGQVTVQSEK
EKQLQKQIRKHEKKLNKTSKREGKGELEENGFEPLELTLKKNEALIEMHTPIFKKSVNTD
REKFPFVFDANMNSRNTTGYVSKQKIMLPQNVVRKDTETFEEIFIPIPESQPLDIDYKPI
MVSSLDDIGQMAFNGIESLNRIQSIVFNVAYHTNENLLICAPTGAGKTNVAMLTIVHQLK
QHIEHGQLMKNQFKIIYVTPMKALAAEMTANFSKKLHCLGISVRELTGDMQLTKSEIQQT
QMIVTTPEKWDVVTRKGTGDISLTSIVKLLIIDEVHLLHGDRGPVVEALVARTLRQVESS
QSMIRIVGLSATLPNYVDVARFLRVNSNIGLFYFDHRFRPVPLSQAFIGVKASSSLQEMN
YMDNVCYNNVVDMVRQGYQVMVFVHARNATVRMANTLKDLAIKHGTLKLFIPEGQTKFVN
KAFAKSRTKYLSELFNNGLSVHHAGLLRSERNLIEKYFADGLIKVLVCTSTLAWGVNLPA
HAVIIRGTEIYDAKHGSYIDLDILDVLQIFGRAGRPQFDVSGHAVIITSHNKLYHYLSLL
TNQIPIESNFIKYLADNLNAEIALGTISNVEEAIKWLSYTYLFVRMKLNFHFYGIPYRVI
LEDQNLEQKRRELIDQAAKALDEAKMIRYNINTGDLSTTNLGRIASHFYLKYDTIKIFNT
LLKPIMTEAEIFCMISYSQEFEQLKVRDDEMEELQYLFEEYCNITVQGGVENIYGKVNIL
LQTYLSHGRVNAFSLISDQAYIVQNAGRIFRALFEIMLGQNNAIMAGRLLEIAKVLEIQQ
WSDRSPLCQFSCLSLEIIDKIEQYDLTVERLNNMNVKEIGDILRNQKEAILVKKCCKELP
ALEMESNLQPITRTVLRIHLKIYPQFHWNDNIHGKTSEPFWIWIEDPDNNFXYHHEYFTM
TRKMVYNNLTQELVMTIPLHEPLPTQYIVRAISDRWLGSEYMLPLTFHDLILPEVYPPYT
DLLEIQPLPIKALKEPLFEKLYKFSHFNPIQTQIFHCLYHTDNNVLLGAPTGSGKTIAAE
IGMFRVFKQYPTQKIVYIAPLKALVRERIKDWKIRFEEQLGKKVVELTGDVSPDIKVIAN
ASIIITTPEKWDGISRSWQTRLYVKNVALIIIDEIHLLGEDRGPVLEVIISRTNFXSSHT
LKKLRVIGLSTALANAVDLANWLGIKEMGLYNFRPSVRPVPLDIHITGFPGKNYCPRMAT
MNRPTFQAIKQHAPSSPTLVFVSSRRQTRLTALDLIAYLAGEDNPKQWLHMKEEEMNNIL
SHIRDSNLKLTLAFGIGLHHAGFQEKDRKIVEELFVNNKIQVLITTATLAWGVNFPAHLV
VIKGTEYYDGKQHRYVDMPITDVLQMMGRAGRPQFDNSGVAVVLVHDLKKNYYKKFLHHP
FPVESSLLAVLPDHINAEIVANTIKNKQELLDYLTWTYFFRRLMKNPRYYNLTALEPYAI
NQYLSSLVDSTLKVLIDSYCVAFDEEEQILYPLSMGKIASFYYLSHHTMLMFIQSLQESL
TLEQCLHILCNSHEYNELPVRHNEELLNEELSKMCRYQVDNYSYNSPHTKAFLLLQAHFS
RLPLPCVDYFTDLKSVLDQAVRIIQAMIDAVADHGWLANTIMIMNILQMIVQARWIDESA
ITTLPCINSEHLELFSTFTLPELCFNMYNKDIRILRKVLNKSFSQEQIHQIYQVIKEMPM
LCIKLSLESYDEDNDDNKQKNQIFIPLKSDNFDYISIRKGQDYILNVIMKRKNKSNNLKA
HCPLFQKGKDEGWFLVLGNVSDKELLVLKRASAINEQRKYQLQFTAPSKLGQTTLTFYLI
SDCYLGLDQQYDIKINIIP
NT seq
6360 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccagaattacctcgaattacaagatcgttacgaatgttcacgaatcttggacgtata
aaaagtacaaaggaactagaaccaaatgatttatttagaaaagaaaaagagcaacatagc
aaatttaaaagtgaattcaattggcaagatttatgtaaatgtgttcctaaaaatgtttta
tttcatcttaataaactacgccaaattgctacagaagcacttggagaatgttcttttgaa
cttataaatgagtttttaatgtttactttacaattattaattgatgagaagttattaact
caaataaaatttaagactttaaaagaaaaggcaggaaatttaaagttccatgatgctaac
cacatgatgaagataattatagaaattcgagaaaaattaaatgaagaaactttaatactt
ataaaaaatggaaaagaaaatattaaagtattggaaaatggcttatttgatccgaaattt
gaatataaatctgcaagagtgttatggcctgatactaatgcacttcgtagtatgtctatg
ggcaacattaatcaaagtactgataatttctcaatgaaatataaaaatgaagctacaaaa
ttatttaaaacggaatttgacaaggcagcatataaagaaaacttgaaatcatatcatgca
aagaattttgcagatatgtctttagaaaaatttgagaagatcataattactaaattaggt
tctaaaaattcagagaatgaattagttgatttattaggttgtgaatctatagaatttatt
caatatattattcaacatcagaaaagtattataactctaagttctgctccaaaagtacaa
aaaaaatgtaatattcaaggacctgtaatcagtggtcaagtaactgttcaatctgagaaa
gaaaaacaattacaaaaacaaatacggaaacacgaaaaaaaattaaataaaacgagtaaa
cgagaaggaaagggagaattggaagaaaatggctttgagccattagaattgactttaaaa
aaaaatgaagcattaatagaaatgcacacacctatatttaaaaaaagtgttaatacagat
cgagaaaaatttccttttgtgtttgatgctaatatgaatagtagaaatacaactggttat
gtatcaaaacaaaaaataatgttaccgcagaatgttgtaaggaaagacacagaaacattt
gaagaaatttttatacctattccagaatctcaaccacttgatatagattataaacctatt
atggtatcttcattggatgatattggacaaatggcttttaatggcattgaatcattaaat
cgaatacaaagtattgtgtttaatgtagcatatcatactaatgagaatttattaatttgt
gctccaacaggagctggaaagactaatgttgctatgttaactatagtacatcaattaaag
caacatattgaacatggtcaattaatgaaaaatcaatttaaaataatttatgtaactcca
atgaaagctttagcagctgaaatgacagcaaattttagtaaaaaacttcattgtcttggt
atatctgttcgcgaattaactggagatatgcaattaactaaatcggaaattcaacaaaca
caaatgattgttactacaccagaaaaatgggatgttgttactagaaaaggtactggagat
atttctcttaccagtattgtaaaactattaattatcgatgaagtacatttgttacatggt
gatagagggcctgtagttgaagctttagttgctcgaactttaagacaagtagaatcttca
caaagtatgatcagaattgttgggctttctgcaacattgccaaattatgtagatgttgca
agatttttaagagtaaattcaaatataggactcttttattttgatcatcgatttcgacca
gtaccacttagtcaagcatttattggtgtaaaagcatcatcgtcattacaagaaatgaat
tacatggataatgtatgttataataatgttgtagatatggtacgtcaaggatatcaagta
atggtatttgtacatgcacgaaatgctactgttagaatggcaaatacactaaaagattta
gcaataaaacatggtacacttaaattatttatacctgaaggtcaaacaaaatttgtaaat
aaagcttttgctaaatcacgtacgaagtatttaagtgaattatttaataatggattatcg
gtacatcatgctggtttattacgttcagagaggaatttaattgaaaagtattttgcagat
ggtttaattaaagtattagtatgtacatcaacattagcttggggtgtaaatctacctgct
catgctgttattataagaggaacagaaatatatgatgctaaacatggctcatatattgat
ttagatatattagatgttttacaaatttttggtcgtgctggtagaccacaatttgatgta
tctggtcatgctgttattattacttcccataataaattataccattatttatcattatta
acaaatcaaatacctatagagagcaattttattaaatatttagctgataacttaaatgct
gaaattgcattaggtacaatatcaaatgtagaagaagcaataaaatggttaagctatact
tatttatttgttcgaatgaaattaaattttcatttctatggaattccttatcgagttatt
ttggaagatcaaaatttagagcaaaaaagaagagaattaattgatcaagcagctaaagca
ttagatgaagctaaaatgattcgatataatataaatactggagatctgagcacaacaaat
ttaggacgaattgcgagccatttttatcttaaatatgatactattaaaatttttaataca
ctgctaaaaccaattatgactgaagcggaaatattttgtatgatatcatactctcaagaa
tttgaacaattaaaagtgcgagatgatgaaatggaggaattacaatatttatttgaagaa
tattgtaatattacagtccaaggtggtgttgaaaatatatatggtaaagtaaatatatta
ttacaaacatatttatcacatggtagagttaatgcgttttcattaatatccgaccaagca
tatattgtacaaaatgcaggacgtatatttcgagcattgtttgaaattatgttaggacaa
aataatgcaataatggctggtcgtttattagaaatagcgaaagtacttgaaatacaacaa
tggagtgatagaagtcctctatgtcaattttcttgtttatctttagaaattattgataaa
atagaacaatatgatttgacagttgaaagattaaataatatgaatgttaaagaaattgga
gatattttgcgtaatcaaaaagaagcaatattagtaaaaaaatgttgcaaagaattacct
gcattagaaatggaatcaaatttgcaacctattactcgtacagttttaagaatacattta
aaaatatatcctcaatttcactggaatgataacattcacggtaaaacttcggaaccattt
tggatatggattgaagatccagataataattttnattatcatcatgaatattttactatg
acaagaaaaatggtttacaataatcttacacaagaacttgtgatgacaataccattgcat
gaaccattgcctactcaatacatagtaagagcaataagtgatcgctggttgggttctgaa
tatatgttgcctctaacatttcatgatttaatcttacctgaagtatatccaccatatact
gatttgttagaaatacaacctctgccaataaaagcattgaaagaaccattatttgaaaaa
ctttataaattttctcattttaatccaatacagacacaaatttttcattgtttatatcat
acagacaataacgtcctgttaggagctccaactggttcgggaaaaacaattgctgcggaa
attggaatgtttagggtatttaaacaatatccaacacaaaaaattgtatatattgcacca
ttaaaagccttggtcagagagcgaataaaggattggaaaattagatttgaagaacaatta
ggaaaaaaagtagtagaattaactggagatgtatcaccagatattaaagttatagcaaat
gcaagtattattataactacaccagaaaaatgggatggtattagtagaagttggcaaaca
agactttatgttaaaaatgttgcgcttattattatagatgaaatacatttattaggggaa
gatcgtggaccagtattagaagttattatttcaagaactaattttnattctagtcatact
ttaaaaaaattaagagttattggactttctacagcattagctaatgcagtagatttagct
aattggcttggtattaaagagatgggcctttataattttcgtccatctgtacgacctgta
ccattagatattcatataactggatttccaggaaaaaattattgtcctcgaatggcaaca
atgaatagaccaacttttcaagcaattaaacaacatgccccatctagtccaactttagta
tttgtttcatcacgtagacaaacacgtttaactgcattagatttgattgcatatcttgca
ggagaagataatcctaagcaatggttacatatgaaagaagaagaaatgaacaatattcta
agtcatatacgagattcaaatttgaaactcacacttgcttttggaattggacttcatcat
gctggttttcaagaaaaggatagaaaaattgtcgaagaattatttgttaacaataaaatt
caggtattgattacaacagctactttagcttggggtgttaatttccctgctcatttagtt
gtaataaaaggaacagaatattatgatggcaaacaacaccgttatgtagacatgccaatt
acggatgtattacaaatgatgggtcgtgcaggaaggccccagtttgataattcaggagta
gcagtagttttagtacatgatttaaaaaaaaattattataagaaatttttacatcatcca
ttcccagtagaatcaagtttattagctgttctgccagatcatataaatgctgaaattgta
gctaatacaattaaaaataaacaagaattattagattacttaacatggacatattttttt
agaagattaatgaaaaatcctagatattacaatttaactgctttagaaccttatgctatt
aatcaatacttatcttctttggtggatagcacattaaaagtattaatagattcatattgt
gtggcgtttgatgaggaagaacaaattttatatccactttcaatgggtaaaatagcatca
ttttattacttatcgcatcatactatgttaatgtttatacaatcacttcaggaatctctt
acattggagcaatgtttacatattttatgtaattctcatgaatataatgaattaccagta
agacacaatgaagaattattaaacgaggaattaagtaaaatgtgccgttatcaagtagat
aattactcatataattctcctcataccaaagcatttttattacttcaagcacatttctca
agacttcccttaccttgtgtagattattttactgatttaaaatcggttcttgatcaggca
gttaggattatacaagcaatgatagatgcagttgcagatcatggatggttagcaaataca
attatgataatgaatatacttcaaatgattgtccaagctcggtggattgatgaatcagca
attactacattgccatgtataaattcagaacatttagaattattttcaacatttactctt
cccgaattatgtttcaatatgtataataaagatattagaatacttagaaaagtacttaat
aaaagtttttcgcaagaacaaatacatcagatatatcaagtgataaaagaaatgccaatg
ctctgtattaagttaagcttagaaagttatgatgaagataatgatgataataaacaaaaa
aatcagatatttatacctctaaaatctgataattttgattatataagtattcgcaagggt
caagattacatactaaatgttataatgaaaagaaaaaataaatctaataatttaaaagca
cactgtcctttgtttcaaaaaggaaaggatgaaggttggtttttagttttaggtaatgtt
tctgataaagaattattagttttaaaacgagcatctgcaataaatgaacaacggaaatat
caattacaattcacagctccatcaaaactaggacaaacaactctaacgttttatttgatt
tccgactgttatttggggctagatcaacagtatgatataaaaataaatataataccttaa
DBGET
integrated database retrieval system
